FuNGI

Q6CHX6

Protein Details

Accession

Q6CHX6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
300-320	LFKYGPNRKRDKKVPICYKCS	Hydrophilic
437-463	IEYTSKDKCLRCKKRGHRDIDCPEPNT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR025829 Zn_knuckle_CX2CX3GHX4C IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0043229 C:intracellular organelle GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003727 F:single-stranded RNA binding GO:0045182 F:translation regulator activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:2000767 P:positive regulation of cytoplasmic translation
KEGG	yli:YALI0A03751g -
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag PF00098 zf-CCHC PF13696 zf-CCHC_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MHDLGSPTWLHFHPSVRMTASGSFHPIMTEQDIIFTAGTPATELTTAQRHYVQYMIQQVQIDQQATFSGGEKDTQAILKWVRDMEEHFYGLFVQPELWVILAAVRLKGEARSWFAEVEKEHIFGDWNRFKTAFIEKWSPDYFHKVITAYHGIRQDEEETVDDFYAKFRLLRDNLPERDPESIAKVLFVNALRPGLHEIVVRQFHDSVESTYKTARLVMVLQDSVESSTRATGSQTQKATENFGDQNSQKANKATRTNKTIGVKACFLCNQTGHLVRDCPQYQAKFCLHCRTNDHSTADCLFKYGPNRKRDKKVPICYKCSESGHIARDCTYSPFGITYVRGQSTAGRSSCSPPKAAVEKGSDTSYAESSGSLEGAIETASDADRQAQSDGDDKLSEMLGYGHGTDYSPPSPITKCFRCREFGHLTQECTAPLEMSHIEYTSKDKCLRCKKRGHRDIDCPEPNTAETESLEAETHETNSVASADSVEPVDLIENQPVEISQGEVHSTEDLGFASE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.35
3	0.33
4	0.34
5	0.32
6	0.34
7	0.33
8	0.28
9	0.3
10	0.27
11	0.25
12	0.24
13	0.22
14	0.21
15	0.21
16	0.21
17	0.16
18	0.17
19	0.17
20	0.17
21	0.16
22	0.14
23	0.12
24	0.09
25	0.09
26	0.09
27	0.08
28	0.08
29	0.09
30	0.09
31	0.11
32	0.18
33	0.19
34	0.2
35	0.24
36	0.24
37	0.25
38	0.27
39	0.25
40	0.24
41	0.31
42	0.31
43	0.3
44	0.29
45	0.28
46	0.31
47	0.32
48	0.28
49	0.19
50	0.18
51	0.16
52	0.16
53	0.17
54	0.13
55	0.13
56	0.12
57	0.14
58	0.14
59	0.15
60	0.15
61	0.16
62	0.15
63	0.17
64	0.19
65	0.2
66	0.22
67	0.22
68	0.21
69	0.22
70	0.24
71	0.25
72	0.26
73	0.25
74	0.22
75	0.21
76	0.2
77	0.2
78	0.18
79	0.12
80	0.08
81	0.08
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.07
86	0.06
87	0.07
88	0.09
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.1
94	0.11
95	0.13
96	0.14
97	0.18
98	0.2
99	0.21
100	0.22
101	0.22
102	0.25
103	0.22
104	0.23
105	0.2
106	0.19
107	0.17
108	0.16
109	0.18
110	0.17
111	0.26
112	0.28
113	0.29
114	0.3
115	0.3
116	0.3
117	0.32
118	0.37
119	0.32
120	0.31
121	0.36
122	0.34
123	0.4
124	0.41
125	0.4
126	0.34
127	0.37
128	0.33
129	0.27
130	0.28
131	0.23
132	0.22
133	0.25
134	0.29
135	0.23
136	0.26
137	0.29
138	0.28
139	0.27
140	0.29
141	0.25
142	0.19
143	0.2
144	0.16
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.11
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.08
154	0.09
155	0.17
156	0.19
157	0.23
158	0.3
159	0.38
160	0.4
161	0.41
162	0.41
163	0.34
164	0.35
165	0.32
166	0.25
167	0.2
168	0.19
169	0.17
170	0.17
171	0.16
172	0.13
173	0.15
174	0.14
175	0.11
176	0.1
177	0.12
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.12
182	0.13
183	0.12
184	0.12
185	0.17
186	0.19
187	0.19
188	0.18
189	0.17
190	0.16
191	0.18
192	0.18
193	0.14
194	0.16
195	0.17
196	0.16
197	0.16
198	0.17
199	0.15
200	0.15
201	0.12
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.08
218	0.15
219	0.19
220	0.24
221	0.25
222	0.25
223	0.28
224	0.28
225	0.31
226	0.23
227	0.22
228	0.18
229	0.18
230	0.2
231	0.17
232	0.2
233	0.19
234	0.2
235	0.18
236	0.2
237	0.22
238	0.25
239	0.34
240	0.37
241	0.4
242	0.44
243	0.45
244	0.48
245	0.47
246	0.46
247	0.4
248	0.36
249	0.34
250	0.28
251	0.27
252	0.23
253	0.22
254	0.19
255	0.16
256	0.15
257	0.15
258	0.19
259	0.19
260	0.18
261	0.18
262	0.19
263	0.25
264	0.24
265	0.24
266	0.24
267	0.25
268	0.25
269	0.29
270	0.3
271	0.29
272	0.3
273	0.36
274	0.34
275	0.35
276	0.4
277	0.41
278	0.44
279	0.43
280	0.44
281	0.35
282	0.36
283	0.35
284	0.3
285	0.23
286	0.19
287	0.14
288	0.14
289	0.21
290	0.28
291	0.34
292	0.41
293	0.51
294	0.58
295	0.66
296	0.72
297	0.76
298	0.76
299	0.8
300	0.82
301	0.8
302	0.8
303	0.74
304	0.7
305	0.64
306	0.55
307	0.47
308	0.41
309	0.39
310	0.38
311	0.37
312	0.34
313	0.3
314	0.29
315	0.27
316	0.24
317	0.2
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.15
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.18
330	0.21
331	0.26
332	0.23
333	0.2
334	0.21
335	0.26
336	0.32
337	0.31
338	0.28
339	0.23
340	0.29
341	0.31
342	0.32
343	0.33
344	0.3
345	0.31
346	0.32
347	0.32
348	0.27
349	0.23
350	0.22
351	0.18
352	0.14
353	0.12
354	0.1
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.07
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.04
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.12
375	0.16
376	0.17
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.12
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.16
397	0.18
398	0.23
399	0.31
400	0.35
401	0.43
402	0.48
403	0.52
404	0.55
405	0.55
406	0.58
407	0.58
408	0.57
409	0.58
410	0.55
411	0.54
412	0.5
413	0.48
414	0.4
415	0.34
416	0.27
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.12
421	0.14
422	0.15
423	0.13
424	0.14
425	0.15
426	0.2
427	0.2
428	0.25
429	0.29
430	0.32
431	0.42
432	0.53
433	0.63
434	0.67
435	0.74
436	0.79
437	0.84
438	0.9
439	0.9
440	0.88
441	0.88
442	0.87
443	0.86
444	0.82
445	0.73
446	0.65
447	0.57
448	0.48
449	0.41
450	0.34
451	0.25
452	0.19
453	0.18
454	0.17
455	0.16
456	0.16
457	0.13
458	0.14
459	0.13
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.1
467	0.09
468	0.11
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.11
476	0.1
477	0.11
478	0.13
479	0.13
480	0.13
481	0.13
482	0.13
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.1
487	0.11
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.13
493	0.12
494	0.11

Q6CHX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer