FuNGI

Q6CDW3

Protein Details

Accession

Q6CDW3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
115-140	NKSIYNRANDYKRKRLDRQEADDDEK	Hydrophilic
208-230	EDSGERGRKRKSRWDVPDEKEAE	Acidic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
190-220	PPRVGPRVRKGRSDKPVTEDSGERGRKRKSR

Subcellular Location(s)

plas 11, cyto 6, mito 5, cyto_nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	yli:YALI0B20724g -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MSTCSIFSILHKMHLVALPHYLRSELDLYFYALRFLTTNTPTHNSMDEIKRLREDRQKPFFEDDDAVMADVSEMQALNDDERQNLPQDSYTAPQEFLNETVSLQAVDELQANESNKSIYNRANDYKRKRLDRQEADDDEKDLSYKERLALRDLERDEKRVQEAIRKKEEANGTSQKEQDELRKFERAQTPPRVGPRVRKGRSDKPVTEDSGERGRKRKSRWDVPDEKEAETSTTSKITDEFLASVLPSEGYIVLTPPASYKPLIKSKVTVKIEGYSIPGGSTETAVDRALAIQAAVPSADAIPGVGDLAYFKESDMKYFGALIKQQDAEEQGLLSAREMKERQVMRLILKIKNGSPQMRKQAMRQLTDSARSLGPEALFSQIIPLFRERSLEDTERHWLVKVVDRVLFKLGDLVRPYTPRLLSVIEPLLIDEDYFTRVEGRELVANISKAAGLPHMISTLRPNVGHADEFVRNTTARSFAIVASALGVPALVPFIKAVCKSKKSWEARHTGAKIVQQIAILIGCTVLPYLGSLVDCIGDGLTDDNPKVRQMTAQALAALAEAAAPYGIESFENVLEPLWLGVREQRGKHLVAFLKAIGYIIPLMNPDYADYYTKEVMAVVLREFYSPDEEMKRVVLEVVTQCARSEGVTARYIRVEVLPTYFKCFWTRRMASDRVCYKLILSTTVELANKVGTAEIVDRVANHLKDESDHFRRLTMETIDKVVANLGIADIEAGSKLETRLVDGILTAFQLQSPAANANRADSIVMLRGFGTVIQALDTRAAPYFSQITSSVLFRLSNKSPIVRSQAADLIGQIAGVMKNCGEDEALNKLGQILYEQLGEEYPEALGSLLGALKAIVAVVGLASMTPPIRDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPEYVSAREWMRICFELIDLLKAHKKTIQKAANNTFGYIAKAIGPQDVLATLLSNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPEINVQNGVLKAMTFMFEYIGDMAKDYIYAVAPLLEDALTDRDHVHRQTAATVVRHLAINCVGLGAEDAMVHFLNLLIPNIYETSPHVIVRILDAIEGIRLCLGPGLVLNYIWAGLFHAARKVRDPFWKAYNSAYIDNVDAMTPYYPDMPEDDEFYRHELDLWV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.31
3	0.23
4	0.3
5	0.28
6	0.28
7	0.28
8	0.26
9	0.22
10	0.23
11	0.25
12	0.17
13	0.18
14	0.18
15	0.2
16	0.23
17	0.22
18	0.2
19	0.17
20	0.18
21	0.16
22	0.17
23	0.22
24	0.22
25	0.25
26	0.29
27	0.33
28	0.35
29	0.36
30	0.36
31	0.31
32	0.36
33	0.38
34	0.42
35	0.42
36	0.43
37	0.48
38	0.49
39	0.54
40	0.57
41	0.6
42	0.62
43	0.68
44	0.7
45	0.68
46	0.72
47	0.65
48	0.59
49	0.53
50	0.43
51	0.36
52	0.31
53	0.26
54	0.19
55	0.17
56	0.12
57	0.1
58	0.08
59	0.06
60	0.05
61	0.05
62	0.08
63	0.09
64	0.11
65	0.16
66	0.17
67	0.18
68	0.2
69	0.22
70	0.23
71	0.23
72	0.23
73	0.2
74	0.22
75	0.22
76	0.23
77	0.27
78	0.25
79	0.25
80	0.24
81	0.25
82	0.24
83	0.22
84	0.22
85	0.16
86	0.15
87	0.15
88	0.15
89	0.12
90	0.11
91	0.1
92	0.08
93	0.09
94	0.11
95	0.1
96	0.12
97	0.15
98	0.17
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.18
103	0.21
104	0.24
105	0.25
106	0.3
107	0.37
108	0.45
109	0.54
110	0.6
111	0.66
112	0.72
113	0.76
114	0.79
115	0.81
116	0.83
117	0.84
118	0.84
119	0.84
120	0.84
121	0.8
122	0.78
123	0.7
124	0.61
125	0.51
126	0.41
127	0.32
128	0.23
129	0.2
130	0.15
131	0.16
132	0.2
133	0.23
134	0.25
135	0.28
136	0.35
137	0.37
138	0.43
139	0.44
140	0.48
141	0.45
142	0.48
143	0.47
144	0.43
145	0.42
146	0.39
147	0.38
148	0.39
149	0.46
150	0.5
151	0.56
152	0.55
153	0.52
154	0.54
155	0.59
156	0.51
157	0.51
158	0.51
159	0.48
160	0.49
161	0.5
162	0.44
163	0.39
164	0.39
165	0.4
166	0.39
167	0.4
168	0.4
169	0.46
170	0.45
171	0.52
172	0.58
173	0.56
174	0.56
175	0.59
176	0.62
177	0.6
178	0.67
179	0.66
180	0.61
181	0.64
182	0.67
183	0.68
184	0.65
185	0.69
186	0.71
187	0.73
188	0.79
189	0.78
190	0.72
191	0.67
192	0.69
193	0.62
194	0.57
195	0.49
196	0.43
197	0.44
198	0.46
199	0.43
200	0.44
201	0.5
202	0.53
203	0.59
204	0.65
205	0.66
206	0.71
207	0.77
208	0.8
209	0.82
210	0.8
211	0.82
212	0.74
213	0.65
214	0.56
215	0.46
216	0.37
217	0.29
218	0.26
219	0.18
220	0.17
221	0.16
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.09
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.08
244	0.1
245	0.11
246	0.12
247	0.16
248	0.22
249	0.31
250	0.35
251	0.35
252	0.39
253	0.44
254	0.53
255	0.52
256	0.48
257	0.41
258	0.39
259	0.39
260	0.35
261	0.3
262	0.21
263	0.18
264	0.15
265	0.13
266	0.11
267	0.1
268	0.1
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.13
300	0.13
301	0.15
302	0.17
303	0.16
304	0.16
305	0.18
306	0.19
307	0.16
308	0.19
309	0.19
310	0.2
311	0.2
312	0.2
313	0.19
314	0.2
315	0.18
316	0.15
317	0.13
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.09
322	0.13
323	0.12
324	0.17
325	0.17
326	0.19
327	0.26
328	0.27
329	0.29
330	0.29
331	0.31
332	0.28
333	0.34
334	0.37
335	0.32
336	0.35
337	0.35
338	0.3
339	0.34
340	0.38
341	0.39
342	0.4
343	0.45
344	0.5
345	0.55
346	0.56
347	0.53
348	0.57
349	0.56
350	0.53
351	0.48
352	0.44
353	0.39
354	0.41
355	0.38
356	0.31
357	0.25
358	0.22
359	0.22
360	0.18
361	0.15
362	0.12
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.1
367	0.11
368	0.11
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.13
373	0.14
374	0.16
375	0.14
376	0.17
377	0.21
378	0.23
379	0.23
380	0.23
381	0.27
382	0.27
383	0.27
384	0.23
385	0.2
386	0.19
387	0.24
388	0.25
389	0.23
390	0.26
391	0.26
392	0.27
393	0.26
394	0.24
395	0.17
396	0.19
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.2
401	0.2
402	0.21
403	0.23
404	0.21
405	0.21
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.16
410	0.18
411	0.17
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.12
416	0.1
417	0.09
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.09
427	0.09
428	0.1
429	0.1
430	0.12
431	0.13
432	0.13
433	0.12
434	0.11
435	0.1
436	0.08
437	0.08
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.13
447	0.14
448	0.13
449	0.14
450	0.15
451	0.16
452	0.16
453	0.14
454	0.15
455	0.15
456	0.16
457	0.16
458	0.15
459	0.13
460	0.14
461	0.14
462	0.12
463	0.1
464	0.11
465	0.11
466	0.1
467	0.11
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.04
477	0.04
478	0.03
479	0.03
480	0.03
481	0.04
482	0.06
483	0.08
484	0.14
485	0.19
486	0.23
487	0.25
488	0.33
489	0.42
490	0.48
491	0.55
492	0.57
493	0.57
494	0.58
495	0.64
496	0.57
497	0.5
498	0.45
499	0.39
500	0.34
501	0.29
502	0.26
503	0.18
504	0.16
505	0.14
506	0.11
507	0.08
508	0.06
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.02
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.07
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.08
536	0.09
537	0.11
538	0.15
539	0.15
540	0.15
541	0.15
542	0.14
543	0.14
544	0.12
545	0.09
546	0.05
547	0.03
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.03
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.06
569	0.11
570	0.15
571	0.15
572	0.18
573	0.21
574	0.22
575	0.22
576	0.25
577	0.22
578	0.2
579	0.2
580	0.17
581	0.15
582	0.14
583	0.13
584	0.07
585	0.06
586	0.05
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.09
598	0.11
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.08
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.07
612	0.09
613	0.09
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.12
618	0.13
619	0.12
620	0.09
621	0.09
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.1
626	0.1
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.1
633	0.09
634	0.12
635	0.15
636	0.16
637	0.17
638	0.17
639	0.17
640	0.15
641	0.14
642	0.12
643	0.09
644	0.11
645	0.14
646	0.14
647	0.2
648	0.2
649	0.2
650	0.24
651	0.25
652	0.28
653	0.34
654	0.36
655	0.36
656	0.42
657	0.47
658	0.45
659	0.51
660	0.49
661	0.42
662	0.41
663	0.35
664	0.29
665	0.26
666	0.23
667	0.18
668	0.15
669	0.12
670	0.13
671	0.15
672	0.15
673	0.12
674	0.12
675	0.09
676	0.08
677	0.08
678	0.06
679	0.04
680	0.05
681	0.05
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.1
687	0.14
688	0.13
689	0.13
690	0.13
691	0.12
692	0.13
693	0.18
694	0.22
695	0.24
696	0.27
697	0.26
698	0.26
699	0.28
700	0.28
701	0.26
702	0.22
703	0.2
704	0.18
705	0.2
706	0.2
707	0.18
708	0.17
709	0.14
710	0.11
711	0.07
712	0.06
713	0.04
714	0.04
715	0.03
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.04
723	0.04
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.08
731	0.09
732	0.07
733	0.07
734	0.06
735	0.05
736	0.05
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.06
741	0.09
742	0.09
743	0.12
744	0.12
745	0.12
746	0.13
747	0.13
748	0.12
749	0.09
750	0.1
751	0.11
752	0.11
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.08
758	0.08
759	0.05
760	0.05
761	0.06
762	0.06
763	0.07
764	0.08
765	0.08
766	0.08
767	0.08
768	0.09
769	0.08
770	0.1
771	0.12
772	0.1
773	0.13
774	0.12
775	0.14
776	0.14
777	0.14
778	0.13
779	0.12
780	0.13
781	0.12
782	0.18
783	0.18
784	0.22
785	0.23
786	0.25
787	0.26
788	0.29
789	0.35
790	0.32
791	0.3
792	0.27
793	0.29
794	0.27
795	0.25
796	0.21
797	0.15
798	0.12
799	0.11
800	0.09
801	0.07
802	0.06
803	0.06
804	0.07
805	0.05
806	0.06
807	0.06
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.08
812	0.13
813	0.15
814	0.14
815	0.14
816	0.14
817	0.14
818	0.13
819	0.12
820	0.09
821	0.08
822	0.09
823	0.09
824	0.08
825	0.08
826	0.09
827	0.08
828	0.07
829	0.06
830	0.05
831	0.05
832	0.05
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.04
841	0.04
842	0.03
843	0.03
844	0.02
845	0.02
846	0.02
847	0.02
848	0.02
849	0.02
850	0.02
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.05
855	0.06
856	0.07
857	0.09
858	0.12
859	0.17
860	0.21
861	0.22
862	0.25
863	0.27
864	0.31
865	0.37
866	0.45
867	0.45
868	0.49
869	0.51
870	0.57
871	0.61
872	0.63
873	0.61
874	0.6
875	0.57
876	0.52
877	0.5
878	0.41
879	0.35
880	0.27
881	0.23
882	0.14
883	0.11
884	0.08
885	0.07
886	0.08
887	0.09
888	0.1
889	0.1
890	0.13
891	0.16
892	0.17
893	0.17
894	0.19
895	0.19
896	0.23
897	0.23
898	0.2
899	0.22
900	0.22
901	0.21
902	0.19
903	0.18
904	0.18
905	0.18
906	0.19
907	0.15
908	0.18
909	0.22
910	0.22
911	0.23
912	0.23
913	0.28
914	0.32
915	0.42
916	0.47
917	0.49
918	0.58
919	0.64
920	0.68
921	0.63
922	0.57
923	0.49
924	0.41
925	0.36
926	0.27
927	0.21
928	0.13
929	0.15
930	0.14
931	0.13
932	0.13
933	0.11
934	0.11
935	0.1
936	0.09
937	0.07
938	0.07
939	0.07
940	0.08
941	0.09
942	0.1
943	0.1
944	0.13
945	0.15
946	0.17
947	0.25
948	0.31
949	0.36
950	0.39
951	0.42
952	0.41
953	0.4
954	0.38
955	0.3
956	0.25
957	0.18
958	0.15
959	0.11
960	0.09
961	0.08
962	0.07
963	0.07
964	0.05
965	0.05
966	0.05
967	0.06
968	0.06
969	0.07
970	0.09
971	0.09
972	0.11
973	0.12
974	0.16
975	0.16
976	0.18
977	0.18
978	0.18
979	0.19
980	0.18
981	0.19
982	0.2
983	0.23
984	0.25
985	0.26
986	0.24
987	0.25
988	0.25
989	0.23
990	0.17
991	0.14
992	0.11
993	0.1
994	0.1
995	0.08
996	0.08
997	0.08
998	0.08
999	0.1
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.08
1008	0.08
1009	0.07
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.08
1016	0.06
1017	0.06
1018	0.07
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.11
1023	0.15
1024	0.2
1025	0.22
1026	0.24
1027	0.24
1028	0.25
1029	0.26
1030	0.3
1031	0.31
1032	0.28
1033	0.29
1034	0.27
1035	0.26
1036	0.27
1037	0.25
1038	0.22
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.15
1042	0.14
1043	0.12
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.08
1047	0.07
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.07
1051	0.07
1052	0.07
1053	0.06
1054	0.06
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.1
1058	0.09
1059	0.1
1060	0.11
1061	0.13
1062	0.13
1063	0.11
1064	0.13
1065	0.18
1066	0.2
1067	0.2
1068	0.19
1069	0.19
1070	0.19
1071	0.21
1072	0.22
1073	0.16
1074	0.13
1075	0.14
1076	0.13
1077	0.14
1078	0.14
1079	0.11
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.09
1084	0.09
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.1
1090	0.11
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.09
1095	0.07
1096	0.09
1097	0.11
1098	0.12
1099	0.19
1100	0.24
1101	0.26
1102	0.32
1103	0.36
1104	0.39
1105	0.47
1106	0.52
1107	0.51
1108	0.55
1109	0.59
1110	0.55
1111	0.54
1112	0.55
1113	0.5
1114	0.46
1115	0.42
1116	0.35
1117	0.3
1118	0.29
1119	0.25
1120	0.17
1121	0.13
1122	0.12
1123	0.11
1124	0.1
1125	0.1
1126	0.12
1127	0.12
1128	0.12
1129	0.14
1130	0.18
1131	0.18
1132	0.23
1133	0.23
1134	0.23
1135	0.25
1136	0.27
1137	0.27
1138	0.22

Q6CDW3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer