FuNGI

Q6CA46

Protein Details

Accession

Q6CA46

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-28	TPSKAPCKSTQAKMKSPNVKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR036691 Endo/exonu/phosph_ase_sf IPR005135 Endo/exonuclease/phosphatase IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0003824 F:catalytic activity
KEGG	yli:YALI0A07238g - yli:YALI0D05973g -
Pfam	View protein in Pfam PF03372 Exo_endo_phos PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd09076 L1-EN cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MSFTSTTTPSKAPCKSTQAKMKSPNVKVITANIGGFKMAEALNRLPDTIVNIIRTTHYPDLVLLQETNWVDSSLQTAQQIISNSPYPGGRHYTLLGSTAGVSNRSVGVGLVYSDNVTITNFTTVFEYFPALDNRLCLADVHIKGTDRHLSLINVYAPNEQGASPFTNRQFYQSLDDYLRLHPCQYPLIAAGDWNAVASNDGRIGEKVTTHLKDFLANWDLLDTYTLISKHRKGLYTHTNNSRGAGRRLDQLHISSTLSQWIKSTQLVTNKQGHNITKSSHHAVQFVFNFGNLTQRQDRGPGTWRMPWWVFDTEYIAWLKFHVKSILKRYGPLKPSLKLQCLKENIKVTIQQEAKNRALRDSNHPDNRRREALMATASDWQAYPANEPYPMLHARVEQSKQQMEIHSLRNHQGRVKTDTSSLCDISARYFDNIFDRAADINDTDDSAFLDLFPEETRRVNTANPSLDSSFTKEEIFDTIKASTHNSAPGPDGIPYRFYRDCWDELGDLMTDVYNEAGADSPISTERNTAIIKLLYKSGDQADISNYRPISLINTEVKIYTQLINKAIQNILPDSIHGAQNGFVPGRHITNNLDTMDHFCNAYSQLNMGWVVGSLDFRKAYDTISQSWVIKTLRNVGVSELMINRILAVQQNAVTRINIRGVLSRPVRIKIGVRQGCPLSPTLFIIAVDALVRRLDREMFGLAPGLPLSHHHTTGHRPPQPPTHPEAVAAGHMKVSAFADDIAVFLNNIQDVATVGRVLCLFQRVSGLTLNPSKTVLQKIGPPDCFVPLTFIDAEWQRTIDATWPTDNNTRQAPTLRTSDNIFRYLGVHFGNRERLDTHYAQIKEDLKESLRRLSLWGLPYYSKAWMINIYFFSKLNFLGPYVSQIDNTFIRELNELACDKINKLSPDKTRKTFSNGFIQTPVGRGGLNLRDMGRFMVCLKAARAYRFFHGSSPALWDCTFQFYSRTHSLTQEKPHQRVDCRFPTGQAWGYAASPTMRDAIRASFELNKPLTAEHANPREDHEPSTTDTVNHRIWERNQVNVRAAESFREAHVDIAAARRYHPVRMVSTAEIDHLRWSMGPLTLKNFMFHKTSSPDLPNFPHTLARPKKWTQRSDYGGIADDMVWQEVMHDLRKHYIADANKAQVLHLMRISRLPLVKWRYPDDHVFTKKNPGCGLCDKAIIQDLHEHIFCKCEVLLSMLTRMKIPSVDSLKDWIFTESKCGVLPSFPGHVNSDAPRKHQQVKTRKYLRELAYGIWKMERSLRYSGDDATLGHVQQGLLQFLKEAQMCFYDGQPPALHDERE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.61
3	0.67
4	0.73
5	0.73
6	0.76
7	0.79
8	0.82
9	0.82
10	0.78
11	0.78
12	0.72
13	0.66
14	0.58
15	0.53
16	0.49
17	0.42
18	0.39
19	0.3
20	0.27
21	0.23
22	0.22
23	0.17
24	0.14
25	0.12
26	0.13
27	0.15
28	0.17
29	0.23
30	0.24
31	0.24
32	0.22
33	0.22
34	0.24
35	0.25
36	0.26
37	0.22
38	0.23
39	0.23
40	0.25
41	0.27
42	0.3
43	0.28
44	0.25
45	0.24
46	0.24
47	0.26
48	0.26
49	0.26
50	0.19
51	0.16
52	0.21
53	0.2
54	0.21
55	0.18
56	0.17
57	0.15
58	0.15
59	0.19
60	0.15
61	0.17
62	0.16
63	0.16
64	0.16
65	0.19
66	0.21
67	0.18
68	0.2
69	0.2
70	0.2
71	0.21
72	0.23
73	0.21
74	0.24
75	0.29
76	0.26
77	0.26
78	0.28
79	0.29
80	0.27
81	0.28
82	0.24
83	0.17
84	0.17
85	0.18
86	0.17
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.14
91	0.13
92	0.12
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.09
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.14
113	0.14
114	0.12
115	0.16
116	0.18
117	0.19
118	0.19
119	0.19
120	0.2
121	0.19
122	0.18
123	0.15
124	0.16
125	0.22
126	0.23
127	0.25
128	0.26
129	0.27
130	0.27
131	0.32
132	0.34
133	0.26
134	0.28
135	0.27
136	0.26
137	0.26
138	0.29
139	0.29
140	0.24
141	0.25
142	0.24
143	0.22
144	0.21
145	0.21
146	0.16
147	0.13
148	0.14
149	0.16
150	0.17
151	0.23
152	0.26
153	0.31
154	0.31
155	0.35
156	0.34
157	0.33
158	0.36
159	0.33
160	0.35
161	0.31
162	0.33
163	0.3
164	0.32
165	0.35
166	0.29
167	0.28
168	0.26
169	0.27
170	0.27
171	0.26
172	0.23
173	0.19
174	0.21
175	0.19
176	0.17
177	0.16
178	0.14
179	0.13
180	0.11
181	0.1
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.11
190	0.14
191	0.13
192	0.14
193	0.16
194	0.22
195	0.23
196	0.24
197	0.27
198	0.25
199	0.27
200	0.28
201	0.3
202	0.26
203	0.24
204	0.22
205	0.19
206	0.19
207	0.16
208	0.16
209	0.1
210	0.07
211	0.1
212	0.11
213	0.13
214	0.19
215	0.22
216	0.29
217	0.33
218	0.37
219	0.37
220	0.46
221	0.54
222	0.58
223	0.63
224	0.64
225	0.65
226	0.61
227	0.61
228	0.58
229	0.52
230	0.46
231	0.43
232	0.37
233	0.39
234	0.41
235	0.41
236	0.37
237	0.34
238	0.32
239	0.29
240	0.28
241	0.21
242	0.19
243	0.24
244	0.22
245	0.2
246	0.18
247	0.18
248	0.19
249	0.2
250	0.22
251	0.2
252	0.28
253	0.33
254	0.38
255	0.45
256	0.44
257	0.48
258	0.5
259	0.48
260	0.44
261	0.41
262	0.38
263	0.35
264	0.39
265	0.4
266	0.39
267	0.38
268	0.36
269	0.34
270	0.39
271	0.34
272	0.31
273	0.25
274	0.2
275	0.2
276	0.17
277	0.24
278	0.17
279	0.22
280	0.22
281	0.24
282	0.25
283	0.28
284	0.29
285	0.26
286	0.32
287	0.32
288	0.33
289	0.36
290	0.36
291	0.38
292	0.38
293	0.36
294	0.34
295	0.31
296	0.28
297	0.24
298	0.27
299	0.21
300	0.23
301	0.22
302	0.17
303	0.14
304	0.15
305	0.17
306	0.15
307	0.17
308	0.21
309	0.25
310	0.32
311	0.4
312	0.49
313	0.46
314	0.49
315	0.5
316	0.52
317	0.5
318	0.52
319	0.49
320	0.42
321	0.5
322	0.52
323	0.55
324	0.52
325	0.52
326	0.52
327	0.54
328	0.56
329	0.54
330	0.53
331	0.47
332	0.45
333	0.46
334	0.38
335	0.4
336	0.39
337	0.37
338	0.38
339	0.43
340	0.45
341	0.46
342	0.45
343	0.4
344	0.42
345	0.41
346	0.44
347	0.47
348	0.51
349	0.56
350	0.61
351	0.66
352	0.68
353	0.71
354	0.65
355	0.57
356	0.49
357	0.41
358	0.4
359	0.35
360	0.28
361	0.23
362	0.23
363	0.21
364	0.19
365	0.17
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.14
370	0.13
371	0.15
372	0.15
373	0.15
374	0.14
375	0.17
376	0.18
377	0.17
378	0.15
379	0.16
380	0.18
381	0.24
382	0.26
383	0.25
384	0.29
385	0.29
386	0.3
387	0.31
388	0.29
389	0.28
390	0.31
391	0.33
392	0.32
393	0.33
394	0.36
395	0.38
396	0.39
397	0.38
398	0.38
399	0.36
400	0.39
401	0.39
402	0.35
403	0.36
404	0.36
405	0.36
406	0.34
407	0.29
408	0.23
409	0.21
410	0.2
411	0.17
412	0.17
413	0.15
414	0.13
415	0.13
416	0.13
417	0.15
418	0.16
419	0.15
420	0.13
421	0.13
422	0.12
423	0.12
424	0.12
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.08
440	0.08
441	0.1
442	0.12
443	0.13
444	0.14
445	0.16
446	0.2
447	0.24
448	0.26
449	0.26
450	0.27
451	0.26
452	0.26
453	0.25
454	0.24
455	0.2
456	0.18
457	0.17
458	0.14
459	0.14
460	0.16
461	0.17
462	0.14
463	0.13
464	0.13
465	0.14
466	0.14
467	0.16
468	0.15
469	0.14
470	0.16
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.16
475	0.15
476	0.15
477	0.16
478	0.13
479	0.17
480	0.16
481	0.21
482	0.2
483	0.2
484	0.24
485	0.25
486	0.27
487	0.25
488	0.26
489	0.2
490	0.2
491	0.2
492	0.15
493	0.11
494	0.09
495	0.07
496	0.05
497	0.05
498	0.04
499	0.03
500	0.03
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.11
513	0.12
514	0.12
515	0.12
516	0.13
517	0.14
518	0.14
519	0.16
520	0.13
521	0.13
522	0.14
523	0.13
524	0.13
525	0.12
526	0.12
527	0.13
528	0.15
529	0.17
530	0.18
531	0.17
532	0.15
533	0.15
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.16
538	0.15
539	0.16
540	0.15
541	0.15
542	0.15
543	0.14
544	0.14
545	0.13
546	0.14
547	0.15
548	0.17
549	0.19
550	0.19
551	0.2
552	0.19
553	0.17
554	0.15
555	0.13
556	0.13
557	0.1
558	0.1
559	0.11
560	0.12
561	0.12
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.11
566	0.12
567	0.09
568	0.08
569	0.09
570	0.09
571	0.11
572	0.11
573	0.11
574	0.12
575	0.15
576	0.18
577	0.16
578	0.16
579	0.14
580	0.18
581	0.18
582	0.16
583	0.14
584	0.11
585	0.11
586	0.12
587	0.13
588	0.08
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.07
594	0.06
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.05
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.09
606	0.13
607	0.14
608	0.15
609	0.18
610	0.19
611	0.19
612	0.18
613	0.21
614	0.17
615	0.16
616	0.15
617	0.19
618	0.2
619	0.21
620	0.21
621	0.18
622	0.19
623	0.18
624	0.18
625	0.11
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.07
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.1
640	0.1
641	0.11
642	0.11
643	0.1
644	0.1
645	0.11
646	0.13
647	0.19
648	0.2
649	0.23
650	0.23
651	0.23
652	0.24
653	0.22
654	0.23
655	0.22
656	0.31
657	0.31
658	0.31
659	0.32
660	0.32
661	0.31
662	0.3
663	0.25
664	0.16
665	0.13
666	0.12
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.08
671	0.07
672	0.06
673	0.05
674	0.05
675	0.04
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.08
683	0.08
684	0.08
685	0.08
686	0.09
687	0.08
688	0.07
689	0.07
690	0.05
691	0.04
692	0.06
693	0.12
694	0.12
695	0.13
696	0.14
697	0.16
698	0.22
699	0.31
700	0.38
701	0.38
702	0.38
703	0.4
704	0.49
705	0.52
706	0.5
707	0.47
708	0.42
709	0.37
710	0.35
711	0.34
712	0.25
713	0.21
714	0.18
715	0.14
716	0.09
717	0.09
718	0.08
719	0.08
720	0.07
721	0.06
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.04
730	0.04
731	0.04
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.03
736	0.04
737	0.05
738	0.05
739	0.05
740	0.05
741	0.05
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.08
746	0.08
747	0.08
748	0.1
749	0.09
750	0.11
751	0.11
752	0.11
753	0.12
754	0.16
755	0.16
756	0.15
757	0.16
758	0.16
759	0.17
760	0.19
761	0.18
762	0.16
763	0.19
764	0.25
765	0.3
766	0.29
767	0.28
768	0.26
769	0.26
770	0.25
771	0.21
772	0.18
773	0.12
774	0.14
775	0.13
776	0.12
777	0.13
778	0.13
779	0.15
780	0.12
781	0.12
782	0.1
783	0.1
784	0.1
785	0.12
786	0.13
787	0.13
788	0.15
789	0.15
790	0.18
791	0.24
792	0.25
793	0.23
794	0.23
795	0.23
796	0.22
797	0.26
798	0.25
799	0.23
800	0.26
801	0.24
802	0.23
803	0.25
804	0.3
805	0.29
806	0.28
807	0.25
808	0.21
809	0.21
810	0.2
811	0.2
812	0.14
813	0.13
814	0.13
815	0.15
816	0.21
817	0.2
818	0.21
819	0.19
820	0.21
821	0.26
822	0.26
823	0.25
824	0.26
825	0.26
826	0.26
827	0.29
828	0.3
829	0.25
830	0.25
831	0.25
832	0.2
833	0.25
834	0.27
835	0.27
836	0.24
837	0.24
838	0.24
839	0.25
840	0.27
841	0.24
842	0.24
843	0.2
844	0.2
845	0.21
846	0.21
847	0.19
848	0.16
849	0.14
850	0.13
851	0.15
852	0.16
853	0.17
854	0.18
855	0.18
856	0.18
857	0.18
858	0.18
859	0.15
860	0.14
861	0.13
862	0.11
863	0.1
864	0.11
865	0.11
866	0.13
867	0.15
868	0.15
869	0.14
870	0.14
871	0.17
872	0.16
873	0.18
874	0.16
875	0.13
876	0.14
877	0.14
878	0.14
879	0.12
880	0.14
881	0.12
882	0.12
883	0.14
884	0.14
885	0.14
886	0.17
887	0.2
888	0.2
889	0.24
890	0.3
891	0.38
892	0.47
893	0.54
894	0.55
895	0.56
896	0.56
897	0.6
898	0.6
899	0.54
900	0.54
901	0.5
902	0.46
903	0.43
904	0.41
905	0.34
906	0.28
907	0.25
908	0.15
909	0.12
910	0.11
911	0.14
912	0.15
913	0.16
914	0.16
915	0.16
916	0.16
917	0.16
918	0.18
919	0.14
920	0.11
921	0.11
922	0.12
923	0.12
924	0.13
925	0.14
926	0.18
927	0.21
928	0.24
929	0.27
930	0.26
931	0.28
932	0.32
933	0.31
934	0.27
935	0.29
936	0.26
937	0.23
938	0.27
939	0.24
940	0.22
941	0.21
942	0.21
943	0.17
944	0.22
945	0.22
946	0.16
947	0.18
948	0.18
949	0.25
950	0.28
951	0.29
952	0.25
953	0.31
954	0.36
955	0.39
956	0.46
957	0.49
958	0.53
959	0.55
960	0.61
961	0.6
962	0.61
963	0.62
964	0.63
965	0.6
966	0.59
967	0.55
968	0.5
969	0.47
970	0.44
971	0.39
972	0.32
973	0.25
974	0.2
975	0.19
976	0.18
977	0.16
978	0.12
979	0.1
980	0.1
981	0.12
982	0.11
983	0.11
984	0.13
985	0.14
986	0.16
987	0.17
988	0.18
989	0.22
990	0.23
991	0.28
992	0.28
993	0.26
994	0.24
995	0.23
996	0.24
997	0.2
998	0.23
999	0.25
1000	0.31
1001	0.32
1002	0.32
1003	0.36
1004	0.37
1005	0.35
1006	0.34
1007	0.28
1008	0.24
1009	0.25
1010	0.29
1011	0.25
1012	0.23
1013	0.25
1014	0.28
1015	0.27
1016	0.27
1017	0.27
1018	0.29
1019	0.31
1020	0.4
1021	0.39
1022	0.42
1023	0.46
1024	0.47
1025	0.49
1026	0.44
1027	0.43
1028	0.36
1029	0.35
1030	0.28
1031	0.25
1032	0.22
1033	0.18
1034	0.2
1035	0.19
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.14
1039	0.12
1040	0.16
1041	0.19
1042	0.16
1043	0.17
1044	0.23
1045	0.24
1046	0.26
1047	0.3
1048	0.3
1049	0.29
1050	0.33
1051	0.36
1052	0.31
1053	0.32
1054	0.29
1055	0.27
1056	0.24
1057	0.21
1058	0.18
1059	0.15
1060	0.14
1061	0.11
1062	0.13
1063	0.13
1064	0.15
1065	0.18
1066	0.18
1067	0.22
1068	0.28
1069	0.28
1070	0.29
1071	0.28
1072	0.27
1073	0.27
1074	0.26
1075	0.27
1076	0.25
1077	0.29
1078	0.32
1079	0.36
1080	0.36
1081	0.37
1082	0.4
1083	0.39
1084	0.37
1085	0.35
1086	0.35
1087	0.32
1088	0.39
1089	0.43
1090	0.46
1091	0.49
1092	0.55
1093	0.64
1094	0.68
1095	0.74
1096	0.72
1097	0.74
1098	0.73
1099	0.7
1100	0.65
1101	0.56
1102	0.49
1103	0.41
1104	0.33
1105	0.23
1106	0.19
1107	0.15
1108	0.12
1109	0.1
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.1
1113	0.12
1114	0.15
1115	0.17
1116	0.18
1117	0.22
1118	0.24
1119	0.25
1120	0.23
1121	0.28
1122	0.27
1123	0.33
1124	0.37
1125	0.36
1126	0.37
1127	0.36
1128	0.34
1129	0.33
1130	0.31
1131	0.26
1132	0.24
1133	0.23
1134	0.21
1135	0.24
1136	0.26
1137	0.26
1138	0.25
1139	0.25
1140	0.3
1141	0.36
1142	0.4
1143	0.43
1144	0.48
1145	0.48
1146	0.51
1147	0.56
1148	0.54
1149	0.56
1150	0.58
1151	0.59
1152	0.55
1153	0.6
1154	0.59
1155	0.56
1156	0.53
1157	0.46
1158	0.45
1159	0.46
1160	0.5
1161	0.41
1162	0.41
1163	0.36
1164	0.35
1165	0.38
1166	0.32
1167	0.26
1168	0.27
1169	0.27
1170	0.27
1171	0.28
1172	0.26
1173	0.2
1174	0.23
1175	0.21
1176	0.17
1177	0.15
1178	0.13
1179	0.13
1180	0.16
1181	0.2
1182	0.19
1183	0.26
1184	0.27
1185	0.27
1186	0.27
1187	0.26
1188	0.24
1189	0.21
1190	0.22
1191	0.24
1192	0.27
1193	0.29
1194	0.29
1195	0.34
1196	0.33
1197	0.34
1198	0.33
1199	0.27
1200	0.24
1201	0.22
1202	0.27
1203	0.23
1204	0.24
1205	0.22
1206	0.23
1207	0.2
1208	0.19
1209	0.22
1210	0.19
1211	0.22
1212	0.22
1213	0.24
1214	0.26
1215	0.27
1216	0.3
1217	0.32
1218	0.37
1219	0.36
1220	0.4
1221	0.46
1222	0.5
1223	0.57
1224	0.6
1225	0.65
1226	0.66
1227	0.73
1228	0.78
1229	0.8
1230	0.79
1231	0.76
1232	0.79
1233	0.74
1234	0.72
1235	0.64
1236	0.57
1237	0.57
1238	0.54
1239	0.48
1240	0.43
1241	0.38
1242	0.31
1243	0.36
1244	0.36
1245	0.3
1246	0.34
1247	0.36
1248	0.37
1249	0.39
1250	0.39
1251	0.34
1252	0.31
1253	0.27
1254	0.26
1255	0.26
1256	0.2
1257	0.19
1258	0.19
1259	0.16
1260	0.18
1261	0.2
1262	0.18
1263	0.16
1264	0.16
1265	0.16
1266	0.15
1267	0.21
1268	0.2
1269	0.17
1270	0.16
1271	0.18
1272	0.2
1273	0.21
1274	0.21
1275	0.24
1276	0.23
1277	0.26
1278	0.25
1279	0.24
1280	0.3

Q6CA46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer