Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TRR4

Protein Details
Accession A7TRR4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-67SAKPVSKSVKDKLKRRELRRHSKRKADARKPASSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-63SKSVKDKLKRRELRRHSKRKADARKP
Subcellular Location(s) mito 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002143  Ribosomal_L1  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG vpo:Kpol_392p3  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MLSRSFGILSRRCEYHSGRVLLAEAVAASETASAKPVSKSVKDKLKRRELRRHSKRKADARKPASSYPLYMPISQALRYLRAAEVGQPISQQIITITTDVVSERGNLNLNGNISYNTPIKDVKIAVFSNDPEKLAKIKEEHNCHLIGGTDLVEKIKSGKQPVDFDKAFATPDISPMLTSQLARVLGPRGVLPTIKKGTVSEDVSSLIKGSIGLMPFRQTGNSISVSVGRCNFSDKQILENIIAVRSAYNTTLSSQKSKKPSLLGKTTITSTHGPGITIDFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.51
4 0.48
5 0.43
6 0.42
7 0.41
8 0.35
9 0.29
10 0.19
11 0.1
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.09
20 0.09
21 0.11
22 0.12
23 0.17
24 0.22
25 0.27
26 0.34
27 0.41
28 0.51
29 0.58
30 0.66
31 0.71
32 0.77
33 0.8
34 0.83
35 0.86
36 0.86
37 0.89
38 0.92
39 0.92
40 0.9
41 0.91
42 0.91
43 0.91
44 0.91
45 0.9
46 0.9
47 0.86
48 0.85
49 0.79
50 0.73
51 0.68
52 0.59
53 0.51
54 0.43
55 0.44
56 0.37
57 0.33
58 0.3
59 0.27
60 0.28
61 0.25
62 0.25
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.19
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.14
78 0.11
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.06
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.13
102 0.13
103 0.12
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.12
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.12
122 0.14
123 0.13
124 0.19
125 0.25
126 0.31
127 0.32
128 0.32
129 0.32
130 0.29
131 0.27
132 0.21
133 0.14
134 0.09
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.07
142 0.1
143 0.12
144 0.14
145 0.18
146 0.22
147 0.27
148 0.31
149 0.37
150 0.33
151 0.32
152 0.31
153 0.28
154 0.24
155 0.19
156 0.17
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.19
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.2
184 0.23
185 0.28
186 0.29
187 0.22
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.21
192 0.17
193 0.11
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.17
208 0.18
209 0.16
210 0.16
211 0.2
212 0.21
213 0.23
214 0.23
215 0.21
216 0.19
217 0.24
218 0.25
219 0.23
220 0.29
221 0.27
222 0.29
223 0.31
224 0.33
225 0.28
226 0.29
227 0.27
228 0.2
229 0.2
230 0.16
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.2
239 0.23
240 0.3
241 0.34
242 0.4
243 0.47
244 0.51
245 0.54
246 0.57
247 0.63
248 0.64
249 0.67
250 0.65
251 0.61
252 0.58
253 0.56
254 0.48
255 0.43
256 0.36
257 0.3
258 0.31
259 0.28
260 0.25
261 0.24