Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C469

Protein Details
Accession Q6C469    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-53TLSSSRATKAPHKSKFRPRSAATVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR008422  Homeobox_KN_domain  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG yli:YALI0E29271g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05920  Homeobox_KN  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MLLKMDKVDYGGSVSVQRGYHHNGPRALGTLSSSRATKAPHKSKFRPRSAATVLLHSQGHGLCQQGSFRDACMLLGQDKGSGAIVSPKDDLHLADTTYKAGAEHTVHVSLPSLYQILPEYRLRAEDGVTDGEGRSKNGDSIKGAMSKNSHNMYGYSWDASQSGYKNAPVSPNGNNNAHNHTGLNNHANHSLNSVSPVNAVNPITSASPVNHLGAHTANLSGSQSETPTPSNHNSTLNHSPLNNNTPGTTTPNNGMNTMPTINSSVPPSMHTMPASTSANMSGLNNLNRQPTLNGHYSQGLSPPKHTVAPQNVQYPQHIGVGYSTPYMAGTVNNGGLPHMNNYNQYALRRYVDTNVYPKQQQGYQPNQPQLQQPVQPGVPPQMHSQQSMQLPPPHGLHNGYRQYDMVQPQMEPQRYNPPEQQQPTGDKRRRGNLPKSVTSILREWLNDHISHPYPSEYEKSLLLQQTGLTMSQLSNWFINARRRQLPAMQQQGAEKKRLEEGERPISQKYH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.23
6 0.3
7 0.37
8 0.43
9 0.49
10 0.47
11 0.49
12 0.49
13 0.47
14 0.4
15 0.31
16 0.26
17 0.23
18 0.23
19 0.24
20 0.22
21 0.21
22 0.23
23 0.28
24 0.33
25 0.4
26 0.48
27 0.55
28 0.65
29 0.73
30 0.82
31 0.88
32 0.89
33 0.87
34 0.8
35 0.8
36 0.76
37 0.74
38 0.65
39 0.61
40 0.52
41 0.46
42 0.43
43 0.33
44 0.3
45 0.21
46 0.22
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.15
51 0.17
52 0.16
53 0.19
54 0.17
55 0.16
56 0.18
57 0.17
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.14
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.11
68 0.09
69 0.08
70 0.13
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.11
87 0.1
88 0.13
89 0.12
90 0.15
91 0.17
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.15
105 0.16
106 0.18
107 0.17
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.17
124 0.19
125 0.21
126 0.18
127 0.21
128 0.23
129 0.27
130 0.27
131 0.26
132 0.27
133 0.27
134 0.32
135 0.31
136 0.29
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.24
141 0.22
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.16
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.19
156 0.22
157 0.23
158 0.29
159 0.32
160 0.33
161 0.34
162 0.34
163 0.37
164 0.35
165 0.31
166 0.24
167 0.21
168 0.21
169 0.21
170 0.23
171 0.2
172 0.2
173 0.22
174 0.23
175 0.22
176 0.22
177 0.19
178 0.14
179 0.16
180 0.15
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.08
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.14
216 0.16
217 0.19
218 0.2
219 0.23
220 0.23
221 0.28
222 0.33
223 0.3
224 0.29
225 0.26
226 0.26
227 0.25
228 0.28
229 0.24
230 0.18
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.21
235 0.19
236 0.16
237 0.16
238 0.21
239 0.22
240 0.21
241 0.2
242 0.15
243 0.16
244 0.15
245 0.13
246 0.08
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.16
261 0.16
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.11
270 0.13
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.15
277 0.15
278 0.18
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.21
283 0.21
284 0.2
285 0.23
286 0.23
287 0.2
288 0.21
289 0.22
290 0.22
291 0.23
292 0.23
293 0.25
294 0.27
295 0.32
296 0.35
297 0.37
298 0.39
299 0.39
300 0.38
301 0.34
302 0.28
303 0.25
304 0.21
305 0.16
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.11
310 0.1
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.22
335 0.23
336 0.23
337 0.23
338 0.25
339 0.28
340 0.3
341 0.32
342 0.33
343 0.32
344 0.33
345 0.31
346 0.31
347 0.34
348 0.37
349 0.41
350 0.47
351 0.53
352 0.57
353 0.56
354 0.54
355 0.51
356 0.49
357 0.45
358 0.4
359 0.35
360 0.34
361 0.32
362 0.31
363 0.28
364 0.27
365 0.25
366 0.23
367 0.25
368 0.29
369 0.3
370 0.31
371 0.31
372 0.32
373 0.32
374 0.34
375 0.34
376 0.31
377 0.32
378 0.32
379 0.33
380 0.29
381 0.28
382 0.28
383 0.28
384 0.33
385 0.38
386 0.37
387 0.36
388 0.34
389 0.34
390 0.36
391 0.35
392 0.3
393 0.24
394 0.22
395 0.28
396 0.35
397 0.36
398 0.32
399 0.32
400 0.39
401 0.4
402 0.45
403 0.45
404 0.45
405 0.52
406 0.54
407 0.57
408 0.51
409 0.56
410 0.6
411 0.65
412 0.64
413 0.62
414 0.65
415 0.68
416 0.73
417 0.75
418 0.75
419 0.74
420 0.76
421 0.74
422 0.73
423 0.68
424 0.6
425 0.54
426 0.46
427 0.4
428 0.35
429 0.3
430 0.26
431 0.28
432 0.29
433 0.26
434 0.25
435 0.28
436 0.27
437 0.28
438 0.28
439 0.24
440 0.22
441 0.25
442 0.28
443 0.24
444 0.24
445 0.24
446 0.25
447 0.29
448 0.3
449 0.27
450 0.24
451 0.21
452 0.22
453 0.22
454 0.19
455 0.14
456 0.12
457 0.11
458 0.15
459 0.17
460 0.17
461 0.16
462 0.17
463 0.2
464 0.25
465 0.35
466 0.38
467 0.44
468 0.48
469 0.51
470 0.55
471 0.6
472 0.64
473 0.64
474 0.66
475 0.61
476 0.57
477 0.6
478 0.65
479 0.61
480 0.56
481 0.47
482 0.4
483 0.43
484 0.47
485 0.46
486 0.44
487 0.49
488 0.54
489 0.58
490 0.58