Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CDK5

Protein Details
Accession Q6CDK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-56RSDRDRGDKKTANKWKRPEPSPTHARHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-46RGDKKTANKWKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0010494  C:cytoplasmic stress granule  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0034063  P:stress granule assembly  
KEGG yli:YALI0B23232g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MAEIKKNQSGSRQRKSVGGDRSDRSDRLDRSDRDRGDKKTANKWKRPEPSPTHARHMHDRLLFLLAKSVGEHVTVTTASGDSIHGLLEGACTEGDLGVSMRFADSGAKQLVFQPEDIVDVAVALSAPLQVDQRKFRTDTDISGRRAVAERELERWTPDADSATSALTLEESGTGSWDQFAVNADRFGVPSTYDEHLYTTRINTEGPDYQAKMRRAQRLADEIEGQTGGNAHQREERGDTVDDSGMDEEDKYSGVDRTKTYVPPSQRAELPHDPAIISAGGLRKPNPTSSQPDIMSRLEQKLVDSAAVPKRNRIPGLPLNDPSATAAPSASKKPGFEKELASRYQKFIDLERNRMVSQKEAAKTHHDTARLNDLRKFSQDYKINTPVPEDLRPILAKDKSRDVSETTSPEAANAHLDRVASPMFDSLSSKLSSIQMSREADKSSEKSSSPAAADKNGGTAADNKPEPVAKSSPSKPKFKMNFKAPEFKPFTPKDTNAQLATAAAPEPSSPAFFSSTPKTDRAPLSTLFNPFKKPKAENTPFPRAFETHPTWHTVEAAADSSVLFPPLEQLTMQRPFLHNAMSPQRGGAVMMPFYQMPQGVPPMMYQYGPQFVQQPFGPPGYRVPMPPGQPPQGYMRYQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.69
3 0.68
4 0.66
5 0.64
6 0.62
7 0.58
8 0.64
9 0.63
10 0.57
11 0.55
12 0.55
13 0.49
14 0.5
15 0.57
16 0.53
17 0.57
18 0.65
19 0.63
20 0.64
21 0.69
22 0.65
23 0.66
24 0.69
25 0.67
26 0.69
27 0.75
28 0.76
29 0.78
30 0.81
31 0.81
32 0.84
33 0.83
34 0.83
35 0.81
36 0.8
37 0.81
38 0.78
39 0.76
40 0.72
41 0.72
42 0.71
43 0.68
44 0.66
45 0.58
46 0.54
47 0.46
48 0.45
49 0.41
50 0.31
51 0.3
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.15
57 0.14
58 0.14
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.09
92 0.14
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.21
97 0.27
98 0.25
99 0.25
100 0.21
101 0.19
102 0.2
103 0.2
104 0.16
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.08
116 0.12
117 0.17
118 0.24
119 0.28
120 0.32
121 0.34
122 0.35
123 0.4
124 0.38
125 0.4
126 0.43
127 0.47
128 0.45
129 0.46
130 0.44
131 0.38
132 0.39
133 0.34
134 0.29
135 0.28
136 0.27
137 0.27
138 0.31
139 0.29
140 0.28
141 0.29
142 0.25
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.07
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.09
176 0.09
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.15
191 0.16
192 0.18
193 0.2
194 0.2
195 0.25
196 0.32
197 0.34
198 0.38
199 0.42
200 0.47
201 0.46
202 0.47
203 0.46
204 0.45
205 0.46
206 0.39
207 0.35
208 0.27
209 0.25
210 0.22
211 0.18
212 0.11
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.14
219 0.15
220 0.17
221 0.2
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.13
230 0.12
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.1
241 0.12
242 0.13
243 0.17
244 0.2
245 0.21
246 0.24
247 0.28
248 0.29
249 0.34
250 0.37
251 0.36
252 0.35
253 0.36
254 0.4
255 0.38
256 0.39
257 0.34
258 0.3
259 0.27
260 0.24
261 0.23
262 0.15
263 0.11
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.14
270 0.15
271 0.18
272 0.2
273 0.22
274 0.27
275 0.31
276 0.35
277 0.33
278 0.33
279 0.34
280 0.31
281 0.29
282 0.24
283 0.22
284 0.18
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.09
291 0.13
292 0.17
293 0.23
294 0.23
295 0.25
296 0.29
297 0.32
298 0.33
299 0.28
300 0.3
301 0.3
302 0.35
303 0.35
304 0.32
305 0.31
306 0.3
307 0.29
308 0.23
309 0.18
310 0.12
311 0.09
312 0.08
313 0.07
314 0.09
315 0.11
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.17
320 0.23
321 0.24
322 0.25
323 0.28
324 0.31
325 0.35
326 0.37
327 0.37
328 0.33
329 0.31
330 0.31
331 0.28
332 0.23
333 0.21
334 0.29
335 0.28
336 0.32
337 0.33
338 0.34
339 0.32
340 0.34
341 0.32
342 0.23
343 0.24
344 0.25
345 0.26
346 0.26
347 0.27
348 0.3
349 0.33
350 0.35
351 0.34
352 0.3
353 0.28
354 0.29
355 0.38
356 0.36
357 0.34
358 0.33
359 0.33
360 0.32
361 0.33
362 0.36
363 0.28
364 0.32
365 0.37
366 0.38
367 0.42
368 0.47
369 0.47
370 0.42
371 0.41
372 0.37
373 0.34
374 0.31
375 0.26
376 0.19
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.21
381 0.22
382 0.24
383 0.25
384 0.31
385 0.31
386 0.32
387 0.32
388 0.3
389 0.31
390 0.31
391 0.31
392 0.25
393 0.25
394 0.23
395 0.22
396 0.19
397 0.15
398 0.15
399 0.13
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.13
405 0.13
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.1
412 0.09
413 0.12
414 0.12
415 0.12
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.15
420 0.16
421 0.2
422 0.21
423 0.23
424 0.24
425 0.23
426 0.23
427 0.26
428 0.26
429 0.23
430 0.24
431 0.22
432 0.22
433 0.23
434 0.24
435 0.21
436 0.23
437 0.22
438 0.2
439 0.22
440 0.2
441 0.19
442 0.16
443 0.15
444 0.12
445 0.15
446 0.16
447 0.19
448 0.19
449 0.18
450 0.19
451 0.22
452 0.22
453 0.22
454 0.22
455 0.2
456 0.27
457 0.34
458 0.44
459 0.47
460 0.54
461 0.52
462 0.6
463 0.67
464 0.69
465 0.72
466 0.71
467 0.75
468 0.73
469 0.8
470 0.7
471 0.71
472 0.68
473 0.61
474 0.6
475 0.53
476 0.54
477 0.51
478 0.52
479 0.48
480 0.47
481 0.49
482 0.41
483 0.38
484 0.32
485 0.26
486 0.23
487 0.18
488 0.12
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.1
497 0.13
498 0.14
499 0.18
500 0.23
501 0.27
502 0.3
503 0.32
504 0.32
505 0.35
506 0.38
507 0.39
508 0.36
509 0.33
510 0.36
511 0.37
512 0.42
513 0.42
514 0.41
515 0.43
516 0.43
517 0.47
518 0.48
519 0.47
520 0.5
521 0.56
522 0.61
523 0.65
524 0.69
525 0.74
526 0.69
527 0.68
528 0.62
529 0.53
530 0.49
531 0.48
532 0.46
533 0.42
534 0.41
535 0.44
536 0.41
537 0.39
538 0.36
539 0.28
540 0.23
541 0.17
542 0.17
543 0.12
544 0.11
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.08
550 0.07
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.11
555 0.13
556 0.2
557 0.25
558 0.27
559 0.27
560 0.28
561 0.31
562 0.32
563 0.33
564 0.28
565 0.31
566 0.37
567 0.37
568 0.35
569 0.32
570 0.31
571 0.28
572 0.26
573 0.22
574 0.18
575 0.16
576 0.17
577 0.18
578 0.17
579 0.17
580 0.18
581 0.15
582 0.12
583 0.13
584 0.16
585 0.16
586 0.16
587 0.17
588 0.2
589 0.21
590 0.2
591 0.19
592 0.19
593 0.23
594 0.23
595 0.24
596 0.26
597 0.25
598 0.29
599 0.28
600 0.3
601 0.29
602 0.32
603 0.32
604 0.27
605 0.31
606 0.33
607 0.34
608 0.3
609 0.33
610 0.36
611 0.38
612 0.45
613 0.48
614 0.48
615 0.47
616 0.49
617 0.5
618 0.51