Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RTF3

Protein Details
Accession A0A068RTF3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-253ASKTSKSSGKSEKRKKLQTKAAFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-245KSEKRKK
Subcellular Location(s) extr 20, cyto 2, vacu 2, nucl 1, mito 1, E.R. 1, mito_nucl 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MLLQQAISLATLGLIAFTSNQLTVSAEPLAVVHGISGPPIKLSANYLAAFDDENAPDVDFELVDNTGDVSSKLISLKKRGPSCAQYYTVSSGDTCESIAKDYGLSTSEFIDLNSQINSGCGNLHINKKYCVEKGSGSSDSGSSSKDSSSGCSEKHKVSGSDTCESIAKKYGISVNKFYDLNPKVHRGSCDNLDNGKSYCVAGGSSSSKSSGSSSSNDHDDDVSDKLSGLASKTSKSSGKSEKRKKLQTKAAFTYYWIAQSEDYKGGSKVAIKTCNGKTIAKVNENYADALVMEGTGVVNDKIVNLGGCSCSNYKCFEEIDRSDEPYGITAYGSALRPYVSIAANDLDKGSKIYVPQLDGWKLPNSNKKHNGCLLVDDQSWSFESHHIDFYVFEQSNYDKLDKEHRVTKVDIYEGGSCKLLNYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.05
4 0.06
5 0.08
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.11
10 0.11
11 0.13
12 0.13
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.09
18 0.09
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.09
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.15
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.21
35 0.21
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.13
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.09
59 0.12
60 0.15
61 0.19
62 0.26
63 0.33
64 0.41
65 0.45
66 0.49
67 0.53
68 0.56
69 0.59
70 0.58
71 0.54
72 0.48
73 0.46
74 0.45
75 0.38
76 0.31
77 0.24
78 0.2
79 0.17
80 0.15
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.07
106 0.07
107 0.06
108 0.1
109 0.14
110 0.22
111 0.27
112 0.29
113 0.32
114 0.36
115 0.39
116 0.37
117 0.36
118 0.31
119 0.28
120 0.3
121 0.33
122 0.3
123 0.26
124 0.25
125 0.23
126 0.22
127 0.2
128 0.16
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.18
136 0.2
137 0.2
138 0.26
139 0.29
140 0.28
141 0.32
142 0.32
143 0.27
144 0.29
145 0.34
146 0.32
147 0.31
148 0.3
149 0.26
150 0.26
151 0.25
152 0.22
153 0.2
154 0.16
155 0.14
156 0.16
157 0.21
158 0.24
159 0.27
160 0.3
161 0.28
162 0.3
163 0.3
164 0.29
165 0.33
166 0.3
167 0.31
168 0.3
169 0.32
170 0.32
171 0.34
172 0.35
173 0.29
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.28
178 0.27
179 0.26
180 0.25
181 0.22
182 0.19
183 0.15
184 0.12
185 0.1
186 0.08
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.11
199 0.12
200 0.15
201 0.16
202 0.18
203 0.18
204 0.17
205 0.15
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.16
222 0.18
223 0.24
224 0.31
225 0.4
226 0.5
227 0.6
228 0.67
229 0.73
230 0.81
231 0.83
232 0.83
233 0.83
234 0.81
235 0.79
236 0.74
237 0.69
238 0.59
239 0.51
240 0.45
241 0.35
242 0.29
243 0.21
244 0.17
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.15
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.22
257 0.26
258 0.26
259 0.33
260 0.33
261 0.38
262 0.38
263 0.33
264 0.3
265 0.34
266 0.39
267 0.37
268 0.37
269 0.33
270 0.34
271 0.34
272 0.32
273 0.24
274 0.18
275 0.13
276 0.12
277 0.09
278 0.05
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.11
296 0.13
297 0.14
298 0.16
299 0.19
300 0.2
301 0.21
302 0.22
303 0.23
304 0.29
305 0.29
306 0.33
307 0.31
308 0.33
309 0.31
310 0.3
311 0.26
312 0.2
313 0.19
314 0.13
315 0.11
316 0.08
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.11
325 0.14
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.14
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.12
339 0.18
340 0.2
341 0.22
342 0.27
343 0.32
344 0.32
345 0.32
346 0.34
347 0.34
348 0.34
349 0.39
350 0.43
351 0.44
352 0.53
353 0.61
354 0.63
355 0.65
356 0.67
357 0.66
358 0.59
359 0.57
360 0.5
361 0.45
362 0.41
363 0.35
364 0.29
365 0.25
366 0.24
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.21
371 0.21
372 0.24
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.22
377 0.27
378 0.23
379 0.2
380 0.2
381 0.21
382 0.25
383 0.28
384 0.28
385 0.2
386 0.23
387 0.33
388 0.38
389 0.43
390 0.47
391 0.48
392 0.52
393 0.52
394 0.56
395 0.51
396 0.46
397 0.43
398 0.38
399 0.4
400 0.37
401 0.36
402 0.31
403 0.25