FuNGI

A0A068SBV6

Protein Details

Accession

A0A068SBV6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
779-808	HEEAVPVPKKERRRRDGRRRDREHRLEGLI	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
785-802	VPKKERRRRDGRRRDREH

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5, plas 4, mito 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028802 SMG8 IPR019354 SMG8/SMG9
Gene Ontology	GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF10220 Smg8_Smg9

Amino Acid Sequences

MKEVNELLKDTRLESIQDAGLAIVSIFGNDGFRTPSAYSSGKLTNLNVTVANRIVGRQVFVPKYQTLPSCTVELAEGLQMYVDESSRTAYIFMDATIDTHHLAEECCHDQQQDVKSHLMEDQSKTMRGLLLMFLVSHLVIPILPPCLLPSDFMSELTNLAQVKHGIYTHLAQLQSACWKYWDIDVPSALFERKEIENRRERERINTNLMGWWGPAKGVPLMVFVAADVTIPHADKITRSKLSVAMKRMQEVVQARVKNIFRAFHLIPLAEGGSGREPVEVRSLFTLPTTTQPFVHVVPSTPFAAISSFSDSNNMDTFSFDRPVSISTWLHDNNDDNIEGFNGKRKETKQQTTESILDDCGNKLLRNFVAHWIRAATTRHPMHLQMITSSGPRKGGDPKQSIPLPNGLQFASALLVLRSLLFGSGAKDEMGDGDFRKGVIASSPGARGMIQQIEVILRKKIRDTVEIERVFSKSHSLEIMRKCVETYLQDSPPCYTRQYHLWKRENVLRLYATLSRGPCAAEFATRLERECDLIWKQGRQSCEKISLTGRVCRLKAGHEDADQEHVIKHTRDMDGTKHSSGCSFFHACTCGKVQKLREDPFDLEEANIGFYTRFTCCLADGRMAIDIQKSKFGAEDQQQLHTDNEHIPHFESALLYLGPASVYRNSIGLEKCEGFMSNTNYLLPWILAKVSDIQKKEQAALKNGSSSADKKAIDANEWPLPGKSPEIKSKSTSSPLTNLEAFPALGTVTTTTTSTRASTSNIVTAPVNTVSSSLPETKRHEEAVPVPKKERRRRDGRRRDREHRLEGLIRGYVGAEYECPHGHRFLSCGDGRICKIGHKGHPKDHGNYFVHQDVPLYVPCPCNFATPKSTTASPEIISQLQRLYVVTPDSTAVTVSMKPRIKIVDSEDQTFEFDLGFEDAFTLPRNSLHVLRLPYIYTTPSGDVIPNGPEVSQRLKNAVLLKECFQIHEQLGQQQQRQQHQEAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.25
3	0.21
4	0.2
5	0.19
6	0.15
7	0.13
8	0.11
9	0.09
10	0.07
11	0.06
12	0.06
13	0.06
14	0.06
15	0.07
16	0.07
17	0.09
18	0.1
19	0.11
20	0.15
21	0.15
22	0.17
23	0.21
24	0.23
25	0.23
26	0.25
27	0.29
28	0.28
29	0.3
30	0.3
31	0.31
32	0.3
33	0.31
34	0.29
35	0.26
36	0.26
37	0.25
38	0.25
39	0.19
40	0.18
41	0.21
42	0.19
43	0.2
44	0.21
45	0.28
46	0.29
47	0.32
48	0.36
49	0.33
50	0.35
51	0.39
52	0.38
53	0.35
54	0.37
55	0.36
56	0.34
57	0.32
58	0.29
59	0.24
60	0.21
61	0.17
62	0.13
63	0.11
64	0.09
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.07
70	0.06
71	0.07
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.1
76	0.09
77	0.11
78	0.11
79	0.1
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.1
89	0.1
90	0.12
91	0.15
92	0.18
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.21
97	0.27
98	0.32
99	0.34
100	0.33
101	0.34
102	0.33
103	0.34
104	0.34
105	0.33
106	0.31
107	0.28
108	0.33
109	0.34
110	0.35
111	0.34
112	0.33
113	0.28
114	0.24
115	0.22
116	0.15
117	0.13
118	0.12
119	0.11
120	0.1
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.05
126	0.05
127	0.05
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.13
134	0.14
135	0.15
136	0.16
137	0.2
138	0.2
139	0.21
140	0.22
141	0.18
142	0.19
143	0.18
144	0.18
145	0.12
146	0.12
147	0.14
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.15
152	0.13
153	0.15
154	0.17
155	0.18
156	0.22
157	0.21
158	0.18
159	0.19
160	0.2
161	0.25
162	0.24
163	0.2
164	0.17
165	0.19
166	0.2
167	0.23
168	0.29
169	0.25
170	0.27
171	0.28
172	0.27
173	0.28
174	0.28
175	0.24
176	0.17
177	0.13
178	0.14
179	0.17
180	0.25
181	0.3
182	0.38
183	0.46
184	0.5
185	0.58
186	0.61
187	0.59
188	0.59
189	0.6
190	0.58
191	0.57
192	0.56
193	0.49
194	0.44
195	0.43
196	0.35
197	0.27
198	0.21
199	0.13
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.08
211	0.08
212	0.06
213	0.06
214	0.04
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.09
220	0.09
221	0.12
222	0.19
223	0.24
224	0.26
225	0.26
226	0.28
227	0.33
228	0.42
229	0.45
230	0.44
231	0.43
232	0.43
233	0.43
234	0.44
235	0.37
236	0.35
237	0.31
238	0.32
239	0.32
240	0.31
241	0.3
242	0.35
243	0.35
244	0.35
245	0.35
246	0.3
247	0.25
248	0.32
249	0.31
250	0.28
251	0.29
252	0.24
253	0.21
254	0.2
255	0.18
256	0.11
257	0.11
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.17
266	0.16
267	0.15
268	0.17
269	0.17
270	0.16
271	0.16
272	0.17
273	0.11
274	0.16
275	0.2
276	0.18
277	0.18
278	0.2
279	0.21
280	0.21
281	0.22
282	0.18
283	0.15
284	0.16
285	0.18
286	0.17
287	0.14
288	0.13
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.1
293	0.14
294	0.14
295	0.14
296	0.17
297	0.16
298	0.18
299	0.18
300	0.17
301	0.12
302	0.12
303	0.14
304	0.14
305	0.16
306	0.14
307	0.14
308	0.13
309	0.14
310	0.15
311	0.17
312	0.15
313	0.13
314	0.19
315	0.2
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.19
320	0.2
321	0.2
322	0.14
323	0.13
324	0.13
325	0.12
326	0.1
327	0.15
328	0.15
329	0.16
330	0.21
331	0.23
332	0.33
333	0.42
334	0.5
335	0.49
336	0.53
337	0.56
338	0.56
339	0.55
340	0.47
341	0.38
342	0.3
343	0.25
344	0.21
345	0.16
346	0.14
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.14
351	0.14
352	0.15
353	0.16
354	0.22
355	0.26
356	0.25
357	0.26
358	0.23
359	0.23
360	0.24
361	0.25
362	0.19
363	0.23
364	0.24
365	0.25
366	0.26
367	0.26
368	0.25
369	0.26
370	0.24
371	0.16
372	0.16
373	0.15
374	0.16
375	0.16
376	0.14
377	0.13
378	0.13
379	0.15
380	0.21
381	0.27
382	0.34
383	0.38
384	0.39
385	0.44
386	0.46
387	0.45
388	0.39
389	0.37
390	0.29
391	0.26
392	0.26
393	0.2
394	0.17
395	0.16
396	0.15
397	0.1
398	0.08
399	0.06
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.03
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.06
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.06
418	0.06
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.08
427	0.07
428	0.09
429	0.09
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.12
445	0.14
446	0.19
447	0.2
448	0.22
449	0.26
450	0.3
451	0.39
452	0.39
453	0.39
454	0.34
455	0.33
456	0.29
457	0.24
458	0.2
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.13
463	0.18
464	0.2
465	0.25
466	0.23
467	0.23
468	0.22
469	0.21
470	0.2
471	0.16
472	0.18
473	0.17
474	0.19
475	0.2
476	0.2
477	0.21
478	0.22
479	0.21
480	0.19
481	0.15
482	0.14
483	0.22
484	0.32
485	0.39
486	0.47
487	0.53
488	0.54
489	0.56
490	0.6
491	0.58
492	0.48
493	0.43
494	0.33
495	0.27
496	0.27
497	0.25
498	0.2
499	0.17
500	0.17
501	0.14
502	0.14
503	0.14
504	0.11
505	0.12
506	0.1
507	0.08
508	0.09
509	0.11
510	0.15
511	0.15
512	0.16
513	0.15
514	0.15
515	0.15
516	0.15
517	0.17
518	0.14
519	0.19
520	0.21
521	0.21
522	0.24
523	0.25
524	0.28
525	0.28
526	0.31
527	0.27
528	0.33
529	0.31
530	0.3
531	0.29
532	0.33
533	0.31
534	0.31
535	0.33
536	0.3
537	0.3
538	0.29
539	0.28
540	0.24
541	0.27
542	0.28
543	0.26
544	0.24
545	0.27
546	0.25
547	0.28
548	0.25
549	0.2
550	0.15
551	0.13
552	0.14
553	0.12
554	0.13
555	0.13
556	0.14
557	0.15
558	0.17
559	0.19
560	0.23
561	0.26
562	0.26
563	0.23
564	0.22
565	0.22
566	0.22
567	0.2
568	0.18
569	0.17
570	0.16
571	0.16
572	0.19
573	0.18
574	0.18
575	0.21
576	0.2
577	0.2
578	0.25
579	0.27
580	0.33
581	0.41
582	0.43
583	0.43
584	0.43
585	0.42
586	0.39
587	0.37
588	0.28
589	0.2
590	0.17
591	0.13
592	0.1
593	0.09
594	0.07
595	0.05
596	0.05
597	0.07
598	0.07
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.1
603	0.14
604	0.15
605	0.15
606	0.15
607	0.14
608	0.14
609	0.13
610	0.13
611	0.12
612	0.15
613	0.13
614	0.16
615	0.15
616	0.15
617	0.15
618	0.16
619	0.19
620	0.19
621	0.27
622	0.26
623	0.29
624	0.3
625	0.31
626	0.3
627	0.25
628	0.23
629	0.16
630	0.18
631	0.15
632	0.15
633	0.14
634	0.14
635	0.14
636	0.12
637	0.1
638	0.08
639	0.09
640	0.07
641	0.06
642	0.06
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.07
647	0.07
648	0.08
649	0.08
650	0.09
651	0.1
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.17
656	0.17
657	0.17
658	0.17
659	0.17
660	0.14
661	0.18
662	0.21
663	0.2
664	0.2
665	0.19
666	0.19
667	0.18
668	0.17
669	0.12
670	0.08
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.07
675	0.12
676	0.19
677	0.24
678	0.25
679	0.27
680	0.31
681	0.32
682	0.35
683	0.35
684	0.33
685	0.33
686	0.36
687	0.34
688	0.32
689	0.31
690	0.29
691	0.27
692	0.24
693	0.23
694	0.24
695	0.23
696	0.22
697	0.27
698	0.26
699	0.25
700	0.26
701	0.26
702	0.24
703	0.24
704	0.24
705	0.2
706	0.21
707	0.2
708	0.21
709	0.23
710	0.24
711	0.33
712	0.37
713	0.4
714	0.41
715	0.45
716	0.46
717	0.46
718	0.45
719	0.39
720	0.39
721	0.39
722	0.39
723	0.35
724	0.31
725	0.26
726	0.23
727	0.2
728	0.14
729	0.12
730	0.08
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.08
737	0.08
738	0.1
739	0.11
740	0.12
741	0.13
742	0.13
743	0.15
744	0.18
745	0.19
746	0.21
747	0.21
748	0.21
749	0.2
750	0.19
751	0.19
752	0.16
753	0.15
754	0.11
755	0.12
756	0.1
757	0.12
758	0.14
759	0.18
760	0.2
761	0.25
762	0.31
763	0.35
764	0.38
765	0.39
766	0.37
767	0.35
768	0.41
769	0.46
770	0.47
771	0.46
772	0.48
773	0.51
774	0.61
775	0.67
776	0.69
777	0.68
778	0.72
779	0.8
780	0.87
781	0.92
782	0.93
783	0.94
784	0.93
785	0.93
786	0.93
787	0.91
788	0.86
789	0.81
790	0.75
791	0.68
792	0.61
793	0.54
794	0.44
795	0.34
796	0.27
797	0.21
798	0.15
799	0.11
800	0.09
801	0.07
802	0.08
803	0.11
804	0.12
805	0.14
806	0.15
807	0.16
808	0.17
809	0.17
810	0.18
811	0.17
812	0.23
813	0.21
814	0.24
815	0.26
816	0.29
817	0.29
818	0.31
819	0.3
820	0.26
821	0.32
822	0.35
823	0.42
824	0.49
825	0.55
826	0.58
827	0.68
828	0.7
829	0.69
830	0.67
831	0.67
832	0.59
833	0.55
834	0.52
835	0.44
836	0.4
837	0.34
838	0.29
839	0.22
840	0.21
841	0.2
842	0.16
843	0.16
844	0.19
845	0.19
846	0.22
847	0.21
848	0.26
849	0.28
850	0.32
851	0.36
852	0.36
853	0.39
854	0.39
855	0.4
856	0.36
857	0.37
858	0.35
859	0.29
860	0.28
861	0.28
862	0.28
863	0.27
864	0.26
865	0.22
866	0.2
867	0.2
868	0.17
869	0.15
870	0.14
871	0.15
872	0.14
873	0.14
874	0.14
875	0.14
876	0.14
877	0.13
878	0.11
879	0.11
880	0.14
881	0.16
882	0.24
883	0.27
884	0.27
885	0.31
886	0.34
887	0.35
888	0.37
889	0.41
890	0.43
891	0.42
892	0.46
893	0.44
894	0.4
895	0.39
896	0.34
897	0.27
898	0.16
899	0.13
900	0.11
901	0.1
902	0.1
903	0.08
904	0.09
905	0.09
906	0.1
907	0.12
908	0.12
909	0.11
910	0.13
911	0.16
912	0.18
913	0.21
914	0.24
915	0.28
916	0.31
917	0.33
918	0.33
919	0.32
920	0.3
921	0.29
922	0.27
923	0.22
924	0.21
925	0.2
926	0.2
927	0.2
928	0.18
929	0.18
930	0.18
931	0.19
932	0.17
933	0.16
934	0.15
935	0.16
936	0.19
937	0.24
938	0.28
939	0.28
940	0.3
941	0.31
942	0.35
943	0.4
944	0.43
945	0.42
946	0.4
947	0.41
948	0.44
949	0.42
950	0.41
951	0.36
952	0.35
953	0.3
954	0.33
955	0.32
956	0.33
957	0.42
958	0.45
959	0.47
960	0.46
961	0.52
962	0.55
963	0.59

A0A068SBV6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer