Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C9S4

Protein Details
Accession Q6C9S4    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-151GTNVTSKKGKGKRTGPKLSREERQRRIQVHydrophilic
533-556IIKPGQICKKRKKMAKSRFRLDEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-146KKGKGKRTGPKLSREERQ
541-549KKRKKMAKS
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 10.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000111  C:nucleotide-excision repair factor 2 complex  
GO:0071942  C:XPC complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006298  P:mismatch repair  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG yli:YALI0D08756g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MGKRTVSQKDVTVTHFDMVREYQVTEKKRKIEPSAPVAKLPSRAKQEKGNTSSRPASVERASSQTTTFDLDADESSDEEDWEEVDIDPSASSTNAETGISVSFEPGASIAEESVIRGGWDTKGTNVTSKKGKGKRTGPKLSREERQRRIQVHQIHIMALLKHASIRNAWANDLLLQMQLRETVPATKLTGLTPDKTQTKMVRTAKFYESLKYLLQQWAKIWYTDSRGLHKRDFNELDDINPDSYDPPVTKAIFNKKVIRHRGSRDLKVQGFVALLRAVGVQARLVVSLQPLDFASNTIVSDLAAEKQPAEKASPSVLRKPKFSSTSGQSKSAQRSQSRMHYSESPTPVYWVEVFEPTGQKWVSLDPACEVNMEVVGKAGKSRIEPSLQDKLNTLTYALAFNKEGTVTDVTRRYSSAYNSRTRPARLTRYLAGSIWWNKLMGLYRPPITHASWAEEKFLRERVLAEGFPKNIQLFKNHPRYVLERHLRQDEVLKEKNPCGIMSMKTNSKPENVYPRSDVQQVKSANKWYQIGRIIKPGQICKKRKKMAKSRFRLDEEEDSPMYSFDQTEAYIPQPVVDGQVPRNGYGNVDLFTPFMMPPGGAHVRGKGAYMAAKSLGIDYANCVVGFDFTKGRQIKPRIDGVIVAEKYAKDVADVWSDMQEQTLAKEERNREVRALLRWRRYLTALKIRHRLDAEHGEVELESGEEEEEDEEVRVEEVNEEVKEKEENGVIIIDDNESDEPWYVPPSVLQPKLDQYLNKSAFRLDKPLNIVVDEPEEEKEEEIPREASTLASTPSSTPCLTPPPRDSTTPRENGADKTRPSQLQRASSVVSVGSTDTISSEEGNPLSELSSVIKSPVKIDYSSLAVADDSDSPDEMSESELYSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.33
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.23
8 0.22
9 0.27
10 0.31
11 0.39
12 0.45
13 0.5
14 0.53
15 0.59
16 0.66
17 0.68
18 0.69
19 0.7
20 0.71
21 0.74
22 0.69
23 0.64
24 0.6
25 0.55
26 0.55
27 0.52
28 0.5
29 0.5
30 0.54
31 0.55
32 0.61
33 0.67
34 0.69
35 0.7
36 0.71
37 0.65
38 0.66
39 0.67
40 0.59
41 0.54
42 0.46
43 0.46
44 0.41
45 0.41
46 0.37
47 0.37
48 0.38
49 0.34
50 0.33
51 0.28
52 0.26
53 0.24
54 0.21
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.2
110 0.21
111 0.28
112 0.3
113 0.34
114 0.38
115 0.44
116 0.51
117 0.54
118 0.62
119 0.64
120 0.71
121 0.76
122 0.79
123 0.83
124 0.8
125 0.83
126 0.84
127 0.81
128 0.8
129 0.8
130 0.8
131 0.77
132 0.81
133 0.79
134 0.74
135 0.73
136 0.73
137 0.71
138 0.67
139 0.66
140 0.56
141 0.48
142 0.46
143 0.41
144 0.33
145 0.25
146 0.19
147 0.13
148 0.15
149 0.15
150 0.15
151 0.13
152 0.18
153 0.24
154 0.24
155 0.25
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.18
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.1
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.16
172 0.17
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.24
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.29
181 0.3
182 0.31
183 0.36
184 0.34
185 0.36
186 0.44
187 0.49
188 0.5
189 0.51
190 0.54
191 0.52
192 0.52
193 0.48
194 0.42
195 0.36
196 0.32
197 0.29
198 0.26
199 0.26
200 0.27
201 0.28
202 0.26
203 0.25
204 0.29
205 0.29
206 0.28
207 0.27
208 0.24
209 0.27
210 0.32
211 0.33
212 0.34
213 0.4
214 0.44
215 0.48
216 0.49
217 0.47
218 0.49
219 0.5
220 0.45
221 0.44
222 0.39
223 0.34
224 0.32
225 0.31
226 0.22
227 0.18
228 0.16
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.15
235 0.16
236 0.19
237 0.25
238 0.34
239 0.4
240 0.44
241 0.49
242 0.52
243 0.61
244 0.67
245 0.67
246 0.65
247 0.63
248 0.69
249 0.69
250 0.68
251 0.65
252 0.64
253 0.59
254 0.53
255 0.47
256 0.37
257 0.3
258 0.23
259 0.18
260 0.1
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.17
300 0.23
301 0.25
302 0.32
303 0.39
304 0.39
305 0.41
306 0.45
307 0.48
308 0.45
309 0.45
310 0.42
311 0.41
312 0.49
313 0.48
314 0.48
315 0.44
316 0.46
317 0.49
318 0.49
319 0.49
320 0.41
321 0.43
322 0.44
323 0.49
324 0.5
325 0.46
326 0.43
327 0.42
328 0.44
329 0.46
330 0.45
331 0.38
332 0.32
333 0.31
334 0.28
335 0.24
336 0.2
337 0.14
338 0.12
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.13
343 0.12
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.16
350 0.15
351 0.16
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.08
368 0.11
369 0.13
370 0.15
371 0.17
372 0.22
373 0.3
374 0.29
375 0.29
376 0.27
377 0.26
378 0.25
379 0.23
380 0.18
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.1
393 0.1
394 0.13
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.2
402 0.26
403 0.28
404 0.33
405 0.35
406 0.39
407 0.4
408 0.4
409 0.41
410 0.39
411 0.41
412 0.4
413 0.42
414 0.39
415 0.4
416 0.39
417 0.33
418 0.27
419 0.24
420 0.22
421 0.19
422 0.18
423 0.14
424 0.13
425 0.15
426 0.15
427 0.13
428 0.13
429 0.14
430 0.16
431 0.16
432 0.18
433 0.19
434 0.18
435 0.2
436 0.17
437 0.19
438 0.22
439 0.22
440 0.23
441 0.22
442 0.22
443 0.2
444 0.22
445 0.19
446 0.15
447 0.15
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.16
456 0.14
457 0.14
458 0.15
459 0.16
460 0.2
461 0.28
462 0.38
463 0.38
464 0.39
465 0.39
466 0.42
467 0.44
468 0.47
469 0.45
470 0.39
471 0.42
472 0.44
473 0.41
474 0.38
475 0.37
476 0.32
477 0.33
478 0.32
479 0.31
480 0.3
481 0.3
482 0.33
483 0.28
484 0.24
485 0.19
486 0.18
487 0.18
488 0.21
489 0.23
490 0.24
491 0.26
492 0.29
493 0.28
494 0.27
495 0.28
496 0.27
497 0.34
498 0.33
499 0.33
500 0.33
501 0.35
502 0.35
503 0.39
504 0.37
505 0.28
506 0.32
507 0.33
508 0.32
509 0.33
510 0.35
511 0.31
512 0.32
513 0.32
514 0.27
515 0.29
516 0.33
517 0.35
518 0.32
519 0.37
520 0.36
521 0.36
522 0.38
523 0.39
524 0.42
525 0.47
526 0.54
527 0.56
528 0.65
529 0.71
530 0.74
531 0.78
532 0.8
533 0.8
534 0.83
535 0.82
536 0.8
537 0.81
538 0.78
539 0.71
540 0.65
541 0.61
542 0.52
543 0.47
544 0.38
545 0.31
546 0.26
547 0.23
548 0.18
549 0.12
550 0.1
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.09
556 0.09
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.12
565 0.12
566 0.16
567 0.17
568 0.17
569 0.18
570 0.16
571 0.15
572 0.16
573 0.16
574 0.12
575 0.12
576 0.12
577 0.1
578 0.1
579 0.11
580 0.08
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.12
586 0.13
587 0.14
588 0.14
589 0.15
590 0.17
591 0.17
592 0.18
593 0.12
594 0.11
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.11
599 0.11
600 0.11
601 0.1
602 0.1
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.19
617 0.21
618 0.24
619 0.31
620 0.37
621 0.42
622 0.44
623 0.5
624 0.44
625 0.43
626 0.41
627 0.36
628 0.39
629 0.32
630 0.28
631 0.23
632 0.2
633 0.21
634 0.21
635 0.17
636 0.08
637 0.1
638 0.12
639 0.14
640 0.15
641 0.14
642 0.15
643 0.16
644 0.15
645 0.14
646 0.13
647 0.09
648 0.1
649 0.17
650 0.16
651 0.17
652 0.24
653 0.27
654 0.34
655 0.4
656 0.41
657 0.34
658 0.38
659 0.41
660 0.42
661 0.5
662 0.49
663 0.51
664 0.54
665 0.55
666 0.53
667 0.53
668 0.52
669 0.5
670 0.52
671 0.53
672 0.56
673 0.62
674 0.61
675 0.62
676 0.56
677 0.49
678 0.46
679 0.46
680 0.42
681 0.35
682 0.33
683 0.28
684 0.26
685 0.24
686 0.17
687 0.09
688 0.05
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.1
705 0.1
706 0.12
707 0.12
708 0.13
709 0.14
710 0.14
711 0.15
712 0.13
713 0.13
714 0.13
715 0.13
716 0.11
717 0.11
718 0.11
719 0.09
720 0.08
721 0.09
722 0.08
723 0.08
724 0.09
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.12
729 0.11
730 0.11
731 0.12
732 0.18
733 0.25
734 0.28
735 0.29
736 0.3
737 0.33
738 0.38
739 0.4
740 0.34
741 0.33
742 0.41
743 0.44
744 0.43
745 0.39
746 0.39
747 0.43
748 0.43
749 0.45
750 0.37
751 0.37
752 0.41
753 0.44
754 0.41
755 0.35
756 0.34
757 0.28
758 0.27
759 0.23
760 0.19
761 0.16
762 0.18
763 0.17
764 0.17
765 0.19
766 0.19
767 0.19
768 0.21
769 0.2
770 0.18
771 0.19
772 0.18
773 0.16
774 0.14
775 0.14
776 0.13
777 0.13
778 0.14
779 0.14
780 0.17
781 0.2
782 0.19
783 0.18
784 0.19
785 0.28
786 0.33
787 0.39
788 0.42
789 0.46
790 0.49
791 0.54
792 0.57
793 0.56
794 0.61
795 0.59
796 0.56
797 0.53
798 0.52
799 0.53
800 0.56
801 0.55
802 0.48
803 0.47
804 0.52
805 0.53
806 0.56
807 0.58
808 0.57
809 0.56
810 0.57
811 0.55
812 0.5
813 0.45
814 0.4
815 0.32
816 0.24
817 0.17
818 0.14
819 0.11
820 0.09
821 0.09
822 0.08
823 0.09
824 0.09
825 0.11
826 0.11
827 0.14
828 0.14
829 0.15
830 0.15
831 0.14
832 0.14
833 0.13
834 0.12
835 0.12
836 0.14
837 0.13
838 0.16
839 0.19
840 0.19
841 0.21
842 0.26
843 0.27
844 0.25
845 0.27
846 0.27
847 0.28
848 0.28
849 0.25
850 0.2
851 0.16
852 0.16
853 0.15
854 0.14
855 0.12
856 0.13
857 0.13
858 0.13
859 0.13
860 0.13
861 0.12
862 0.13
863 0.11