Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RW78

Protein Details
Accession A0A068RW78    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-50GLETRGHKPELKKRLRKAKKKLNAASESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-42GHKPELKKRLRKAKKK
284-287RARK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047201  ERI-1_3'hExo-like  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50800  SAP  
CDD cd06133  ERI-1_3'hExo_like  
Amino Acid Sequences MSDEQTKSTTVESLRKALADLGLETRGHKPELKKRLRKAKKKLNAASESSTKTTATTTTTTTTASDQSNPAITKKQQPLDYYLFFDVEATCEENGGFEYPNEIIEFPIVLVDGKSFEKVDEFRSYVKPSINPVLSAFCKQLTGISQETVDDSPDFIQVLNDFQEFMAKYSVFQDKTAAFVTDGPFDIRDFVTKQCKHSKIKLPLYFEKPWVNIRKLFKDFYKQKEAKNIARMLETLDMTFDGREHSGLDDARNLHRIAQRMVADGCIFKTNMFWGPKMRAQQRRARKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.32
4 0.29
5 0.27
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.18
11 0.2
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.27
16 0.33
17 0.4
18 0.51
19 0.6
20 0.66
21 0.73
22 0.82
23 0.88
24 0.9
25 0.92
26 0.92
27 0.91
28 0.92
29 0.9
30 0.89
31 0.84
32 0.78
33 0.73
34 0.67
35 0.61
36 0.53
37 0.46
38 0.35
39 0.29
40 0.25
41 0.21
42 0.19
43 0.16
44 0.16
45 0.18
46 0.18
47 0.18
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.17
55 0.21
56 0.21
57 0.21
58 0.24
59 0.25
60 0.32
61 0.38
62 0.43
63 0.42
64 0.43
65 0.48
66 0.49
67 0.48
68 0.42
69 0.35
70 0.3
71 0.25
72 0.24
73 0.17
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.05
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.09
105 0.1
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.21
111 0.24
112 0.24
113 0.25
114 0.23
115 0.22
116 0.27
117 0.25
118 0.22
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.18
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.1
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.09
155 0.1
156 0.13
157 0.18
158 0.16
159 0.16
160 0.18
161 0.16
162 0.18
163 0.19
164 0.16
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.15
178 0.24
179 0.26
180 0.32
181 0.4
182 0.47
183 0.51
184 0.58
185 0.64
186 0.64
187 0.72
188 0.72
189 0.7
190 0.71
191 0.72
192 0.66
193 0.59
194 0.53
195 0.45
196 0.48
197 0.47
198 0.43
199 0.43
200 0.46
201 0.51
202 0.51
203 0.53
204 0.49
205 0.52
206 0.57
207 0.58
208 0.62
209 0.58
210 0.58
211 0.64
212 0.67
213 0.64
214 0.64
215 0.6
216 0.51
217 0.49
218 0.45
219 0.37
220 0.34
221 0.27
222 0.19
223 0.16
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.18
237 0.2
238 0.23
239 0.25
240 0.24
241 0.27
242 0.29
243 0.32
244 0.3
245 0.35
246 0.33
247 0.33
248 0.34
249 0.3
250 0.27
251 0.24
252 0.24
253 0.2
254 0.18
255 0.15
256 0.16
257 0.17
258 0.23
259 0.25
260 0.25
261 0.28
262 0.35
263 0.4
264 0.48
265 0.55
266 0.57
267 0.62
268 0.7