FuNGI

Q6C709

Protein Details

Accession

Q6C709

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-38	NEPSRNIRRAQKLREFQNLE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13, cyto 12, nucl 10, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR045241 Prp46/PLRG1-like IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	yli:YALI0E04697g -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MPVAKDLFPEYGTLATGENEPSRNIRRAQKLREFQNLELPPYLAKQVAAKMAEKGLAVEATGGVAVQRIAGGSQSGQKALMGASSSALTKHTPSASQPTTHDSLTNLGANLTQSKPAWHAPWEIYRVITGHQGWVRSVCVEPENQWFATGSADKTIKIWDLATGKLRLTLTGHIMGVRALGVSPRHPYMFSGGEDKMVKCWDLETNKVVRHYHGHLSAVYSLDIHPTLDVLVSAGRDAVARVWDIRTRDPVVVLSGHKSTINRVKFQASEPQVITASADETVRLWNLQAGKTMTTLTHHKKSVRGLTLHPEEFTFSTASANSSKQWKCPEGDLVLNYDDQNAIINTLSVNQDNVMFSGGDNGSIGFYDWKTGHMFQSTQSIPIPGSIESENGIFDSSFDKTGLRLITCEADKSIKMWREKPNATAESDPGLEWKPKIYQTY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.13
4	0.15
5	0.17
6	0.17
7	0.19
8	0.25
9	0.3
10	0.34
11	0.39
12	0.45
13	0.53
14	0.62
15	0.7
16	0.74
17	0.77
18	0.79
19	0.83
20	0.79
21	0.7
22	0.71
23	0.63
24	0.56
25	0.48
26	0.41
27	0.32
28	0.28
29	0.28
30	0.18
31	0.16
32	0.16
33	0.18
34	0.23
35	0.25
36	0.24
37	0.25
38	0.26
39	0.26
40	0.23
41	0.2
42	0.16
43	0.14
44	0.12
45	0.1
46	0.09
47	0.07
48	0.07
49	0.06
50	0.04
51	0.04
52	0.04
53	0.04
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.05
58	0.06
59	0.07
60	0.12
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.14
65	0.14
66	0.13
67	0.14
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.11
75	0.1
76	0.11
77	0.14
78	0.15
79	0.16
80	0.19
81	0.27
82	0.29
83	0.31
84	0.31
85	0.33
86	0.34
87	0.33
88	0.31
89	0.23
90	0.22
91	0.22
92	0.21
93	0.16
94	0.13
95	0.13
96	0.13
97	0.16
98	0.14
99	0.14
100	0.13
101	0.14
102	0.18
103	0.2
104	0.22
105	0.21
106	0.24
107	0.24
108	0.3
109	0.32
110	0.29
111	0.26
112	0.25
113	0.23
114	0.2
115	0.21
116	0.16
117	0.18
118	0.19
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.19
123	0.16
124	0.16
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.14
129	0.19
130	0.21
131	0.2
132	0.2
133	0.19
134	0.17
135	0.19
136	0.18
137	0.13
138	0.14
139	0.15
140	0.14
141	0.14
142	0.16
143	0.14
144	0.13
145	0.12
146	0.12
147	0.13
148	0.15
149	0.19
150	0.19
151	0.18
152	0.21
153	0.2
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.16
158	0.16
159	0.16
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.1
164	0.08
165	0.06
166	0.04
167	0.05
168	0.06
169	0.07
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.18
179	0.16
180	0.19
181	0.2
182	0.2
183	0.17
184	0.15
185	0.15
186	0.1
187	0.12
188	0.14
189	0.15
190	0.17
191	0.19
192	0.22
193	0.24
194	0.27
195	0.27
196	0.23
197	0.24
198	0.25
199	0.26
200	0.23
201	0.23
202	0.2
203	0.21
204	0.2
205	0.17
206	0.14
207	0.1
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.06
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.04
216	0.04
217	0.03
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.08
230	0.1
231	0.12
232	0.14
233	0.17
234	0.19
235	0.19
236	0.19
237	0.18
238	0.16
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.12
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.17
247	0.23
248	0.25
249	0.25
250	0.27
251	0.29
252	0.29
253	0.31
254	0.35
255	0.3
256	0.32
257	0.29
258	0.29
259	0.26
260	0.25
261	0.23
262	0.14
263	0.11
264	0.08
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.15
276	0.15
277	0.15
278	0.16
279	0.17
280	0.14
281	0.15
282	0.22
283	0.25
284	0.3
285	0.33
286	0.35
287	0.38
288	0.45
289	0.5
290	0.48
291	0.44
292	0.41
293	0.46
294	0.51
295	0.47
296	0.41
297	0.33
298	0.29
299	0.26
300	0.25
301	0.17
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.12
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.22
310	0.24
311	0.28
312	0.34
313	0.35
314	0.35
315	0.37
316	0.4
317	0.35
318	0.37
319	0.33
320	0.3
321	0.27
322	0.26
323	0.23
324	0.18
325	0.15
326	0.11
327	0.11
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.09
334	0.11
335	0.09
336	0.1
337	0.1
338	0.11
339	0.11
340	0.12
341	0.1
342	0.09
343	0.08
344	0.14
345	0.13
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.1
351	0.11
352	0.08
353	0.08
354	0.11
355	0.11
356	0.13
357	0.17
358	0.19
359	0.21
360	0.22
361	0.23
362	0.2
363	0.29
364	0.28
365	0.26
366	0.25
367	0.23
368	0.2
369	0.21
370	0.22
371	0.13
372	0.16
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.12
378	0.11
379	0.11
380	0.08
381	0.08
382	0.1
383	0.11
384	0.12
385	0.12
386	0.12
387	0.12
388	0.16
389	0.19
390	0.17
391	0.17
392	0.18
393	0.24
394	0.24
395	0.26
396	0.23
397	0.23
398	0.23
399	0.24
400	0.3
401	0.31
402	0.37
403	0.43
404	0.51
405	0.58
406	0.61
407	0.65
408	0.66
409	0.63
410	0.6
411	0.56
412	0.48
413	0.41
414	0.39
415	0.33
416	0.26
417	0.26
418	0.25
419	0.23
420	0.24
421	0.26

Q6C709

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer