Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RYT1

Protein Details
Accession A0A068RYT1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-138HQQSHPRMNNQQKWQKKRKGNFQNRHQTGEHydrophilic
197-216YNTPRDPRQRHPHAQRERFMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MANESTAQQQDNSFLLNLLAMCTNNNTPQTTTSNVTLPTPSRSWFFDMNTESKVPAPVSTTSSIPQHKPTAEFESSQANQTVPTSITTPLPSPPSSFHSSTPPYMKQDHQQSHPRMNNQQKWQKKRKGNFQNRHQTGESAHGSNRNDFNGYDSPSKKRQRYEASPAHTSSASMSSMPSIPTTSSAPENLQFKNERLYNTPRDPRQRHPHAQRERFMDTRQPHSSTSASTSIQGSRYSSPEQRNLQKPENNSKEHEEPLCSFISVGNCNKTNCPFRHEGDTIQLVCRHFKTNSCSKGAECTFLHDLSAEPCRFFHLGNCKLGDRCPYSHETPLTRELLVRLRSLTENCKYYHEKGYCTNGDECLFIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.11
6 0.12
7 0.1
8 0.11
9 0.14
10 0.17
11 0.2
12 0.23
13 0.24
14 0.24
15 0.28
16 0.31
17 0.32
18 0.32
19 0.3
20 0.31
21 0.29
22 0.29
23 0.29
24 0.27
25 0.28
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.28
30 0.31
31 0.31
32 0.31
33 0.33
34 0.36
35 0.37
36 0.38
37 0.36
38 0.31
39 0.28
40 0.29
41 0.22
42 0.18
43 0.19
44 0.17
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.28
50 0.31
51 0.31
52 0.34
53 0.35
54 0.35
55 0.37
56 0.39
57 0.4
58 0.38
59 0.36
60 0.32
61 0.35
62 0.34
63 0.33
64 0.29
65 0.22
66 0.2
67 0.19
68 0.2
69 0.12
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.21
81 0.25
82 0.3
83 0.3
84 0.29
85 0.33
86 0.35
87 0.38
88 0.41
89 0.39
90 0.37
91 0.39
92 0.4
93 0.4
94 0.46
95 0.47
96 0.48
97 0.54
98 0.55
99 0.61
100 0.64
101 0.61
102 0.61
103 0.65
104 0.66
105 0.67
106 0.71
107 0.71
108 0.76
109 0.82
110 0.82
111 0.81
112 0.82
113 0.83
114 0.85
115 0.87
116 0.87
117 0.87
118 0.88
119 0.82
120 0.79
121 0.68
122 0.58
123 0.48
124 0.45
125 0.36
126 0.27
127 0.25
128 0.24
129 0.25
130 0.27
131 0.28
132 0.22
133 0.2
134 0.18
135 0.22
136 0.21
137 0.23
138 0.25
139 0.26
140 0.3
141 0.38
142 0.46
143 0.45
144 0.46
145 0.51
146 0.53
147 0.58
148 0.64
149 0.62
150 0.6
151 0.59
152 0.56
153 0.49
154 0.4
155 0.33
156 0.24
157 0.18
158 0.13
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.13
174 0.16
175 0.15
176 0.17
177 0.17
178 0.17
179 0.21
180 0.23
181 0.21
182 0.23
183 0.29
184 0.33
185 0.39
186 0.44
187 0.45
188 0.53
189 0.56
190 0.61
191 0.65
192 0.67
193 0.7
194 0.73
195 0.77
196 0.78
197 0.81
198 0.77
199 0.72
200 0.68
201 0.6
202 0.52
203 0.5
204 0.43
205 0.42
206 0.41
207 0.38
208 0.34
209 0.35
210 0.34
211 0.27
212 0.28
213 0.23
214 0.2
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.17
221 0.16
222 0.19
223 0.21
224 0.26
225 0.29
226 0.35
227 0.41
228 0.46
229 0.53
230 0.56
231 0.6
232 0.58
233 0.6
234 0.63
235 0.64
236 0.59
237 0.54
238 0.53
239 0.49
240 0.49
241 0.44
242 0.37
243 0.31
244 0.3
245 0.28
246 0.22
247 0.18
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.21
252 0.23
253 0.25
254 0.27
255 0.3
256 0.34
257 0.39
258 0.36
259 0.4
260 0.4
261 0.4
262 0.47
263 0.46
264 0.41
265 0.38
266 0.42
267 0.36
268 0.34
269 0.34
270 0.27
271 0.29
272 0.29
273 0.28
274 0.24
275 0.28
276 0.33
277 0.4
278 0.44
279 0.46
280 0.45
281 0.42
282 0.49
283 0.45
284 0.44
285 0.34
286 0.34
287 0.33
288 0.31
289 0.31
290 0.21
291 0.21
292 0.18
293 0.26
294 0.21
295 0.18
296 0.18
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.27
301 0.29
302 0.35
303 0.39
304 0.42
305 0.4
306 0.41
307 0.43
308 0.44
309 0.39
310 0.35
311 0.35
312 0.39
313 0.4
314 0.46
315 0.48
316 0.45
317 0.44
318 0.48
319 0.45
320 0.39
321 0.36
322 0.33
323 0.36
324 0.34
325 0.32
326 0.27
327 0.28
328 0.31
329 0.34
330 0.39
331 0.38
332 0.39
333 0.39
334 0.45
335 0.47
336 0.48
337 0.54
338 0.5
339 0.47
340 0.5
341 0.58
342 0.55
343 0.53
344 0.5
345 0.44
346 0.42