FuNGI

Q6C0U3

Protein Details

Accession

Q6C0U3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-51	MPKPKAPTSKRTSTRLREGIKKKAAAHGRKQRKLAKKDVTWKSKNKKDLGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-47	KPKAPTSKRTSTRLREGIKKKAAAHGRKQRKLAKKDVTWKSKNKK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR014813 Gnl3_N_dom IPR006073 GTP-bd IPR023179 GTP-bd_ortho_bundle_sf IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	yli:YALI0F21725g -
Pfam	View protein in Pfam PF08701 GN3L_Grn1 PF01926 MMR_HSR1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP

Amino Acid Sequences

MPKPKAPTSKRTSTRLREGIKKKAAAHGRKQRKLAKKDVTWKSKNKKDLGIPNSFPYKEQLLQQLDAQKQAEVAEKERKKEEARQARAEARSRGEDVPDEEEFEDNPMAALLASARAAAEEYDGSDDEDEEMESEVTELDVKVNPGDDVFNESSRKAFDKIFKTVVDQADVILYVLDSRDPEGTRSRAVESAILSNPDKRLIFILNKVDLIPAENLQNWVNTLRLTFPTLPLRAANSGPVTGRQLCNKNVTQQSTSTALLDALKKYAKDSQLKRSVIVGVIGYPNVGKSSIINALTKIHGGGRACPVGAQAGVTTALREVKIDNKLKILDSPGIVFPSEKANKVQEQARLVLLNAIPAKQMVDQVPAVQLLLKRLTNDESLLQQFMEHYSIPPLSHANFKDFTTNVLIHVARKTGRLGKGGIPNLEAASKNIINDWRDGRILGWTQAPEYTEALADEENRPGISSSKSLKAPAKQQDTKTVVQEWAKEFDLGGLWTPGEDDEDVDM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.8
3	0.79
4	0.79
5	0.79
6	0.81
7	0.79
8	0.76
9	0.68
10	0.68
11	0.71
12	0.7
13	0.73
14	0.73
15	0.76
16	0.77
17	0.84
18	0.84
19	0.84
20	0.84
21	0.83
22	0.83
23	0.81
24	0.84
25	0.86
26	0.87
27	0.86
28	0.88
29	0.88
30	0.86
31	0.85
32	0.81
33	0.78
34	0.77
35	0.78
36	0.75
37	0.74
38	0.68
39	0.65
40	0.66
41	0.58
42	0.5
43	0.43
44	0.41
45	0.34
46	0.35
47	0.38
48	0.35
49	0.36
50	0.39
51	0.43
52	0.39
53	0.41
54	0.37
55	0.29
56	0.25
57	0.25
58	0.28
59	0.22
60	0.26
61	0.32
62	0.36
63	0.4
64	0.42
65	0.46
66	0.44
67	0.51
68	0.57
69	0.58
70	0.62
71	0.65
72	0.68
73	0.7
74	0.72
75	0.68
76	0.61
77	0.55
78	0.51
79	0.47
80	0.42
81	0.37
82	0.33
83	0.3
84	0.3
85	0.26
86	0.25
87	0.21
88	0.21
89	0.19
90	0.18
91	0.15
92	0.1
93	0.1
94	0.07
95	0.07
96	0.06
97	0.06
98	0.04
99	0.04
100	0.05
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.06
107	0.05
108	0.06
109	0.08
110	0.08
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.08
117	0.06
118	0.07
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.05
126	0.06
127	0.07
128	0.08
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.08
135	0.13
136	0.15
137	0.17
138	0.18
139	0.18
140	0.18
141	0.19
142	0.21
143	0.17
144	0.19
145	0.25
146	0.29
147	0.34
148	0.36
149	0.35
150	0.36
151	0.39
152	0.36
153	0.3
154	0.25
155	0.2
156	0.17
157	0.16
158	0.13
159	0.07
160	0.06
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.08
167	0.08
168	0.11
169	0.16
170	0.17
171	0.19
172	0.2
173	0.21
174	0.19
175	0.2
176	0.19
177	0.16
178	0.18
179	0.17
180	0.18
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.19
185	0.17
186	0.14
187	0.15
188	0.16
189	0.18
190	0.2
191	0.24
192	0.22
193	0.23
194	0.22
195	0.21
196	0.17
197	0.16
198	0.13
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.11
203	0.11
204	0.11
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.09
212	0.12
213	0.12
214	0.15
215	0.19
216	0.19
217	0.2
218	0.18
219	0.19
220	0.17
221	0.17
222	0.16
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.12
227	0.13
228	0.14
229	0.15
230	0.18
231	0.21
232	0.22
233	0.27
234	0.27
235	0.31
236	0.34
237	0.35
238	0.32
239	0.29
240	0.29
241	0.27
242	0.26
243	0.19
244	0.15
245	0.13
246	0.13
247	0.13
248	0.11
249	0.1
250	0.11
251	0.1
252	0.12
253	0.16
254	0.2
255	0.27
256	0.31
257	0.39
258	0.48
259	0.48
260	0.47
261	0.44
262	0.39
263	0.31
264	0.27
265	0.18
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.06
274	0.04
275	0.04
276	0.07
277	0.11
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.14
282	0.15
283	0.14
284	0.12
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.12
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.11
295	0.11
296	0.09
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.08
307	0.13
308	0.21
309	0.25
310	0.26
311	0.27
312	0.29
313	0.29
314	0.29
315	0.27
316	0.21
317	0.17
318	0.18
319	0.16
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.11
324	0.18
325	0.2
326	0.19
327	0.21
328	0.24
329	0.26
330	0.3
331	0.34
332	0.29
333	0.3
334	0.3
335	0.29
336	0.26
337	0.23
338	0.23
339	0.18
340	0.18
341	0.15
342	0.14
343	0.13
344	0.12
345	0.13
346	0.11
347	0.14
348	0.11
349	0.13
350	0.13
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.13
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.15
359	0.15
360	0.15
361	0.17
362	0.2
363	0.19
364	0.19
365	0.18
366	0.19
367	0.19
368	0.19
369	0.17
370	0.14
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.1
375	0.09
376	0.12
377	0.13
378	0.13
379	0.14
380	0.15
381	0.15
382	0.21
383	0.22
384	0.24
385	0.25
386	0.25
387	0.29
388	0.26
389	0.27
390	0.25
391	0.24
392	0.2
393	0.23
394	0.23
395	0.21
396	0.22
397	0.23
398	0.19
399	0.21
400	0.25
401	0.27
402	0.31
403	0.32
404	0.33
405	0.36
406	0.44
407	0.46
408	0.43
409	0.37
410	0.34
411	0.31
412	0.31
413	0.24
414	0.17
415	0.19
416	0.19
417	0.18
418	0.2
419	0.24
420	0.23
421	0.27
422	0.29
423	0.26
424	0.26
425	0.26
426	0.23
427	0.24
428	0.25
429	0.23
430	0.24
431	0.21
432	0.22
433	0.23
434	0.23
435	0.2
436	0.18
437	0.17
438	0.13
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.14
444	0.14
445	0.15
446	0.14
447	0.15
448	0.14
449	0.16
450	0.16
451	0.21
452	0.24
453	0.29
454	0.31
455	0.37
456	0.43
457	0.47
458	0.53
459	0.57
460	0.63
461	0.64
462	0.66
463	0.7
464	0.69
465	0.67
466	0.62
467	0.55
468	0.51
469	0.47
470	0.49
471	0.42
472	0.41
473	0.38
474	0.34
475	0.3
476	0.26
477	0.24
478	0.19
479	0.17
480	0.14
481	0.12
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.12
486	0.11

Q6C0U3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer