Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RRL4

Protein Details
Accession A0A068RRL4    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
477-497EGEDGKSKKKKKDKDGTGAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
458-471RKRKELLAERERRM
476-492GEGEDGKSKKKKKDKDG
591-618PRGRGRPRGRKTGDGLKRGAGRGRGAAG
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MADGDDQKQSNHLNFNLQEFLGDNSASDASFQSMVQNMSGQDGLPAELQQLLGGSNGTDLNLLGQGNTSGGTNSQPISPATTPQHAIQQQQQQTPSSSGSGGVPWVMPTSGSAAMPSNVHVMSMSMPSSQQPTPSPITSTAGNSVPVQSQPATNSTTLLENITSQLPPERKDQFFDLFRQLQNNVITPEQFLAQARSLLGQQQYQQLEDLKNKPNQDNKASEKRPISSAQNMTGIITPQMKRPKQEHIPPGMPMGPPISTPMTSSTFKTPAGLQIPRSAAATAVPGGGNMMRTATPTSSTPAPGGSGGGGGGDRIDYDTLTDVMGYAGVDLREEAEHFLKEGDGTGAILPDGVDRSKIQDFMNGDLLRSRVLELAQPLQISNVDQDFISYLALATQERLRGLVEQMVDASKHRVMSQAGSAAPPLDERTGHPLYRIVVQQDPRKQLLAIERAEREEERKRKELLAERERRMQMGEGEGEDGKSKKKKKDKDGTGAGGGPTSGGARGSGPGGASGDGSGKGGSTSETALIRAIGGVRKSWMLTGNKDTSTPGGGTPRSSGGGGGGSAAGATGAEGGPGGPGGSSGGLDDGSPRGRGRPRGRKTGDGLKRGAGRGRGAAGRDLRHDGLGLFLPPSTIGRTHRLGDPSMRKVTVRDAIFALEKDCQTTGRSGSKRTLLKSYNQWLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.41
3 0.4
4 0.35
5 0.3
6 0.25
7 0.26
8 0.19
9 0.17
10 0.13
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.17
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.12
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.06
57 0.07
58 0.09
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.2
65 0.2
66 0.24
67 0.27
68 0.3
69 0.31
70 0.31
71 0.39
72 0.36
73 0.39
74 0.4
75 0.45
76 0.48
77 0.5
78 0.52
79 0.45
80 0.45
81 0.44
82 0.38
83 0.3
84 0.23
85 0.2
86 0.18
87 0.16
88 0.14
89 0.12
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.16
116 0.15
117 0.17
118 0.17
119 0.22
120 0.26
121 0.27
122 0.28
123 0.26
124 0.28
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.21
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.17
135 0.14
136 0.15
137 0.15
138 0.17
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.16
143 0.17
144 0.16
145 0.15
146 0.13
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.16
153 0.18
154 0.19
155 0.25
156 0.31
157 0.3
158 0.34
159 0.37
160 0.38
161 0.38
162 0.4
163 0.41
164 0.39
165 0.39
166 0.38
167 0.35
168 0.33
169 0.32
170 0.3
171 0.25
172 0.21
173 0.2
174 0.18
175 0.18
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.15
187 0.14
188 0.16
189 0.21
190 0.22
191 0.22
192 0.23
193 0.22
194 0.24
195 0.28
196 0.32
197 0.32
198 0.36
199 0.39
200 0.43
201 0.47
202 0.5
203 0.5
204 0.51
205 0.52
206 0.59
207 0.58
208 0.58
209 0.54
210 0.5
211 0.47
212 0.44
213 0.41
214 0.38
215 0.39
216 0.35
217 0.34
218 0.32
219 0.3
220 0.27
221 0.22
222 0.16
223 0.18
224 0.16
225 0.2
226 0.29
227 0.3
228 0.34
229 0.36
230 0.44
231 0.47
232 0.55
233 0.57
234 0.55
235 0.56
236 0.52
237 0.52
238 0.45
239 0.36
240 0.28
241 0.22
242 0.14
243 0.12
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.12
248 0.14
249 0.17
250 0.18
251 0.2
252 0.21
253 0.21
254 0.21
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.23
259 0.24
260 0.21
261 0.24
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.19
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.09
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.16
348 0.17
349 0.24
350 0.21
351 0.2
352 0.19
353 0.19
354 0.16
355 0.15
356 0.13
357 0.07
358 0.07
359 0.09
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.09
368 0.09
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.12
401 0.13
402 0.14
403 0.15
404 0.16
405 0.15
406 0.14
407 0.14
408 0.12
409 0.11
410 0.1
411 0.09
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.16
416 0.19
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.2
421 0.23
422 0.23
423 0.19
424 0.2
425 0.25
426 0.32
427 0.37
428 0.4
429 0.37
430 0.37
431 0.34
432 0.33
433 0.35
434 0.34
435 0.3
436 0.3
437 0.3
438 0.3
439 0.32
440 0.29
441 0.27
442 0.3
443 0.36
444 0.38
445 0.42
446 0.43
447 0.43
448 0.5
449 0.54
450 0.55
451 0.58
452 0.61
453 0.59
454 0.66
455 0.63
456 0.57
457 0.49
458 0.4
459 0.31
460 0.25
461 0.23
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.15
466 0.15
467 0.14
468 0.16
469 0.23
470 0.29
471 0.37
472 0.46
473 0.56
474 0.65
475 0.75
476 0.8
477 0.83
478 0.84
479 0.79
480 0.72
481 0.64
482 0.53
483 0.42
484 0.31
485 0.21
486 0.13
487 0.09
488 0.06
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.07
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.09
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.1
516 0.09
517 0.09
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.14
524 0.14
525 0.15
526 0.2
527 0.21
528 0.25
529 0.32
530 0.35
531 0.35
532 0.35
533 0.34
534 0.29
535 0.27
536 0.23
537 0.18
538 0.19
539 0.2
540 0.2
541 0.21
542 0.22
543 0.21
544 0.2
545 0.18
546 0.13
547 0.13
548 0.11
549 0.1
550 0.08
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.04
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.07
575 0.09
576 0.11
577 0.13
578 0.14
579 0.2
580 0.26
581 0.37
582 0.46
583 0.54
584 0.6
585 0.69
586 0.74
587 0.75
588 0.76
589 0.76
590 0.74
591 0.7
592 0.65
593 0.59
594 0.59
595 0.54
596 0.52
597 0.46
598 0.39
599 0.35
600 0.37
601 0.35
602 0.32
603 0.35
604 0.36
605 0.35
606 0.36
607 0.38
608 0.35
609 0.32
610 0.31
611 0.24
612 0.22
613 0.2
614 0.17
615 0.12
616 0.11
617 0.11
618 0.11
619 0.13
620 0.13
621 0.15
622 0.18
623 0.24
624 0.27
625 0.3
626 0.35
627 0.37
628 0.38
629 0.43
630 0.49
631 0.5
632 0.53
633 0.51
634 0.46
635 0.45
636 0.49
637 0.47
638 0.4
639 0.35
640 0.3
641 0.32
642 0.34
643 0.32
644 0.27
645 0.24
646 0.23
647 0.23
648 0.22
649 0.21
650 0.2
651 0.24
652 0.28
653 0.33
654 0.36
655 0.39
656 0.44
657 0.51
658 0.55
659 0.55
660 0.59
661 0.53
662 0.57
663 0.63