Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CEC1

Protein Details
Accession Q6CEC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1114-1137QPEPKPASISSPKKKKNKKKGKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1123-1137SSPKKKKNKKKGKKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 9.499, cyto 7.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0019905  F:syntaxin binding  
GO:0006896  P:Golgi to vacuole transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG yli:YALI0B16822g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MSRLSVSSSRQSLQLGSEDLGPNAIGSLVEATEGYKPPTIKDIEQVKLPSIARVSQQKYNEYLQEVQQEYRQYCQLKRGGSDVPGDVNSSLDSVPQAFFEPDFRLDNQRIFDTVTEHKTDVTTYNILQEKLSYYIDTVEVNLIEEISKSSDSFFMAIDELKQIHSDTESAVEVVRDLRTQMQTLDQIHVERGLQMVQLQQQYAQVEELENGVTQLQEIVRLFQEAERLSEEQPQTNLLPCLELVDSTDALIHGDSEYLASTTVKMKTPISNLSPLTGLKPLRDSLLSLRVKVGHKIGKQFTLLLIDDLQSHGQAVPTGDTIVRLMQQFNRQRNRASPPEAVNTSFNDVDPAFRGKLASLLNQLLRAGQVQDAFKAYQDAIADYSRRLIKQHLPSSTDTNSMSSGLSGVSGVSSGSAASRSERGMALAGKLRALSASEFENTLAEIYASLSEFVRRLLTHQKLLLDLISSQPALLEQCGELAFGLRQVISGTVDKQLAYMTKIVNARREQTAQLPCDLFLNFYALNGIFVRECEQSVGVVSNPLQTTLVGHLKQFIQTLFNRADEHLLSELEKDKWKDTEISAQTQQKVDDIVAAATQDPIKWKELLFVNLMGGTPNNTDVPKEGKMRPKNVFVEAASFIIPNGTTHLVDGLVGFLQLVVIFPGQTPELVDVITSLIKRYNVSANELILQAGATRSAAKLAHISAKNLALVSQSLGFIVTLIPYMREYCRRHVTSQQIPAQFDRTKRDLLKHQDDIHTKLVSIMVERMVNHSRTLRRIDWSKPVTTANGVHEYMQQLISDTNTLSKSLKKVLASENYIGVAEESKLEIPTGVPPKDEAKDESKAEVSTAVSEPVPEVKKDVEGHQVESKDDAKKSQTEDVKETAMELNDTEMDSTNVEEKTKEASEEESREESKTGDVAVEETNSESQHVSDDIVPEGADAESVKVEPGPENADEVIASEPDTKEAVSGTKESEAQSTIDALDEAAVEEKERGDKVGDKVEDKVEDKVGDKVEEMKGEVEEGETGTTTELDAVNSENGAKENGTVKEEAKNEVEEVKEEVQAEPEKVADKPESADKDETKAESETTSTPDLSKETADEAKDDGKDDKDDSAPSLQPEPKPASISSPKKKKNKKKGKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.25
3 0.22
4 0.26
5 0.25
6 0.23
7 0.22
8 0.19
9 0.15
10 0.13
11 0.12
12 0.06
13 0.06
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.07
18 0.08
19 0.12
20 0.14
21 0.16
22 0.19
23 0.19
24 0.21
25 0.28
26 0.31
27 0.28
28 0.36
29 0.41
30 0.4
31 0.46
32 0.46
33 0.41
34 0.43
35 0.41
36 0.36
37 0.31
38 0.31
39 0.31
40 0.39
41 0.42
42 0.42
43 0.47
44 0.48
45 0.5
46 0.52
47 0.5
48 0.45
49 0.43
50 0.4
51 0.44
52 0.42
53 0.39
54 0.38
55 0.4
56 0.36
57 0.37
58 0.39
59 0.36
60 0.36
61 0.43
62 0.45
63 0.43
64 0.43
65 0.44
66 0.42
67 0.4
68 0.41
69 0.34
70 0.32
71 0.28
72 0.28
73 0.23
74 0.2
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.15
87 0.17
88 0.19
89 0.22
90 0.23
91 0.28
92 0.3
93 0.34
94 0.34
95 0.33
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.25
100 0.29
101 0.29
102 0.29
103 0.28
104 0.28
105 0.26
106 0.27
107 0.24
108 0.23
109 0.21
110 0.18
111 0.25
112 0.28
113 0.28
114 0.26
115 0.26
116 0.23
117 0.24
118 0.24
119 0.17
120 0.14
121 0.16
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.1
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.21
169 0.25
170 0.26
171 0.28
172 0.24
173 0.23
174 0.23
175 0.23
176 0.19
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.12
183 0.16
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.17
191 0.13
192 0.11
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.13
210 0.18
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.2
215 0.2
216 0.27
217 0.27
218 0.25
219 0.25
220 0.26
221 0.23
222 0.24
223 0.25
224 0.17
225 0.17
226 0.14
227 0.15
228 0.13
229 0.12
230 0.1
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.11
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.23
254 0.27
255 0.32
256 0.32
257 0.35
258 0.33
259 0.32
260 0.32
261 0.28
262 0.26
263 0.25
264 0.22
265 0.17
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.19
272 0.28
273 0.28
274 0.26
275 0.27
276 0.3
277 0.31
278 0.32
279 0.34
280 0.31
281 0.34
282 0.41
283 0.43
284 0.41
285 0.4
286 0.38
287 0.32
288 0.29
289 0.26
290 0.19
291 0.16
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.15
313 0.24
314 0.31
315 0.4
316 0.48
317 0.48
318 0.5
319 0.55
320 0.58
321 0.57
322 0.55
323 0.51
324 0.47
325 0.5
326 0.49
327 0.45
328 0.39
329 0.33
330 0.31
331 0.25
332 0.21
333 0.17
334 0.15
335 0.14
336 0.15
337 0.16
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.17
346 0.19
347 0.19
348 0.2
349 0.2
350 0.15
351 0.15
352 0.13
353 0.1
354 0.09
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.12
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.19
375 0.26
376 0.35
377 0.41
378 0.41
379 0.42
380 0.44
381 0.48
382 0.45
383 0.39
384 0.3
385 0.25
386 0.21
387 0.18
388 0.16
389 0.11
390 0.1
391 0.07
392 0.06
393 0.05
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.05
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.09
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.07
442 0.1
443 0.19
444 0.22
445 0.24
446 0.26
447 0.26
448 0.25
449 0.25
450 0.22
451 0.14
452 0.11
453 0.09
454 0.09
455 0.08
456 0.07
457 0.06
458 0.07
459 0.06
460 0.06
461 0.05
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.09
487 0.13
488 0.17
489 0.19
490 0.24
491 0.25
492 0.26
493 0.26
494 0.28
495 0.25
496 0.29
497 0.33
498 0.28
499 0.28
500 0.26
501 0.23
502 0.23
503 0.22
504 0.15
505 0.09
506 0.11
507 0.08
508 0.08
509 0.09
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.05
515 0.06
516 0.09
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.09
528 0.08
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.09
533 0.11
534 0.15
535 0.12
536 0.12
537 0.14
538 0.14
539 0.15
540 0.15
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.16
545 0.15
546 0.16
547 0.16
548 0.15
549 0.17
550 0.13
551 0.14
552 0.11
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.11
557 0.11
558 0.14
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.15
565 0.23
566 0.22
567 0.25
568 0.29
569 0.31
570 0.31
571 0.31
572 0.3
573 0.21
574 0.19
575 0.15
576 0.11
577 0.08
578 0.07
579 0.06
580 0.06
581 0.05
582 0.06
583 0.06
584 0.05
585 0.07
586 0.09
587 0.1
588 0.11
589 0.11
590 0.15
591 0.17
592 0.19
593 0.17
594 0.16
595 0.15
596 0.14
597 0.14
598 0.1
599 0.08
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.08
607 0.12
608 0.15
609 0.2
610 0.24
611 0.32
612 0.38
613 0.44
614 0.46
615 0.5
616 0.48
617 0.46
618 0.43
619 0.34
620 0.32
621 0.26
622 0.23
623 0.16
624 0.13
625 0.11
626 0.09
627 0.09
628 0.05
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.03
641 0.03
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.04
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.06
656 0.06
657 0.05
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.06
662 0.08
663 0.09
664 0.09
665 0.11
666 0.16
667 0.16
668 0.2
669 0.21
670 0.2
671 0.2
672 0.2
673 0.18
674 0.12
675 0.11
676 0.07
677 0.06
678 0.05
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.06
683 0.06
684 0.07
685 0.08
686 0.1
687 0.17
688 0.17
689 0.19
690 0.19
691 0.2
692 0.19
693 0.18
694 0.17
695 0.1
696 0.09
697 0.09
698 0.08
699 0.07
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.05
704 0.05
705 0.04
706 0.04
707 0.04
708 0.05
709 0.06
710 0.08
711 0.1
712 0.18
713 0.21
714 0.27
715 0.36
716 0.39
717 0.42
718 0.47
719 0.54
720 0.53
721 0.58
722 0.58
723 0.53
724 0.51
725 0.49
726 0.48
727 0.43
728 0.38
729 0.36
730 0.32
731 0.34
732 0.35
733 0.39
734 0.41
735 0.47
736 0.52
737 0.52
738 0.53
739 0.55
740 0.55
741 0.54
742 0.5
743 0.41
744 0.33
745 0.28
746 0.25
747 0.18
748 0.16
749 0.13
750 0.1
751 0.11
752 0.12
753 0.15
754 0.18
755 0.18
756 0.19
757 0.24
758 0.25
759 0.28
760 0.34
761 0.32
762 0.34
763 0.38
764 0.41
765 0.45
766 0.45
767 0.43
768 0.39
769 0.39
770 0.34
771 0.32
772 0.31
773 0.25
774 0.25
775 0.24
776 0.23
777 0.23
778 0.23
779 0.21
780 0.19
781 0.14
782 0.1
783 0.1
784 0.1
785 0.09
786 0.08
787 0.1
788 0.1
789 0.11
790 0.12
791 0.14
792 0.17
793 0.21
794 0.25
795 0.23
796 0.27
797 0.32
798 0.37
799 0.38
800 0.37
801 0.32
802 0.29
803 0.28
804 0.24
805 0.17
806 0.12
807 0.08
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.14
816 0.2
817 0.2
818 0.19
819 0.21
820 0.25
821 0.27
822 0.28
823 0.25
824 0.24
825 0.29
826 0.3
827 0.3
828 0.28
829 0.26
830 0.24
831 0.22
832 0.17
833 0.15
834 0.14
835 0.13
836 0.11
837 0.11
838 0.11
839 0.16
840 0.17
841 0.15
842 0.16
843 0.15
844 0.2
845 0.22
846 0.24
847 0.27
848 0.27
849 0.3
850 0.33
851 0.33
852 0.29
853 0.31
854 0.32
855 0.28
856 0.27
857 0.26
858 0.25
859 0.28
860 0.31
861 0.36
862 0.38
863 0.37
864 0.41
865 0.4
866 0.38
867 0.34
868 0.32
869 0.26
870 0.21
871 0.17
872 0.13
873 0.12
874 0.11
875 0.11
876 0.1
877 0.08
878 0.09
879 0.08
880 0.09
881 0.12
882 0.12
883 0.12
884 0.12
885 0.12
886 0.16
887 0.17
888 0.17
889 0.14
890 0.19
891 0.24
892 0.27
893 0.3
894 0.29
895 0.29
896 0.29
897 0.29
898 0.25
899 0.2
900 0.18
901 0.14
902 0.1
903 0.09
904 0.1
905 0.1
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.11
910 0.11
911 0.12
912 0.1
913 0.09
914 0.1
915 0.1
916 0.11
917 0.11
918 0.12
919 0.12
920 0.12
921 0.12
922 0.1
923 0.1
924 0.08
925 0.07
926 0.06
927 0.06
928 0.06
929 0.07
930 0.07
931 0.07
932 0.08
933 0.09
934 0.11
935 0.13
936 0.13
937 0.15
938 0.15
939 0.15
940 0.13
941 0.13
942 0.12
943 0.09
944 0.1
945 0.11
946 0.11
947 0.12
948 0.13
949 0.11
950 0.11
951 0.12
952 0.13
953 0.12
954 0.14
955 0.14
956 0.16
957 0.18
958 0.19
959 0.2
960 0.19
961 0.17
962 0.16
963 0.15
964 0.13
965 0.12
966 0.11
967 0.09
968 0.07
969 0.07
970 0.07
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.08
975 0.09
976 0.12
977 0.12
978 0.13
979 0.14
980 0.19
981 0.23
982 0.31
983 0.33
984 0.32
985 0.35
986 0.38
987 0.4
988 0.36
989 0.35
990 0.29
991 0.28
992 0.28
993 0.29
994 0.28
995 0.24
996 0.23
997 0.25
998 0.25
999 0.24
1000 0.24
1001 0.21
1002 0.19
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.13
1006 0.11
1007 0.1
1008 0.09
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.07
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.08
1017 0.08
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.11
1022 0.1
1023 0.1
1024 0.11
1025 0.11
1026 0.12
1027 0.17
1028 0.19
1029 0.22
1030 0.23
1031 0.23
1032 0.29
1033 0.31
1034 0.32
1035 0.29
1036 0.28
1037 0.26
1038 0.28
1039 0.27
1040 0.22
1041 0.25
1042 0.23
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.21
1046 0.23
1047 0.24
1048 0.24
1049 0.2
1050 0.19
1051 0.19
1052 0.18
1053 0.22
1054 0.19
1055 0.18
1056 0.2
1057 0.27
1058 0.31
1059 0.34
1060 0.4
1061 0.38
1062 0.4
1063 0.43
1064 0.41
1065 0.36
1066 0.32
1067 0.28
1068 0.23
1069 0.24
1070 0.22
1071 0.22
1072 0.23
1073 0.21
1074 0.2
1075 0.21
1076 0.22
1077 0.21
1078 0.2
1079 0.17
1080 0.19
1081 0.23
1082 0.23
1083 0.22
1084 0.23
1085 0.27
1086 0.27
1087 0.28
1088 0.26
1089 0.25
1090 0.27
1091 0.27
1092 0.29
1093 0.26
1094 0.27
1095 0.28
1096 0.3
1097 0.29
1098 0.29
1099 0.35
1100 0.37
1101 0.36
1102 0.41
1103 0.44
1104 0.42
1105 0.43
1106 0.41
1107 0.42
1108 0.47
1109 0.56
1110 0.6
1111 0.65
1112 0.71
1113 0.79
1114 0.89
1115 0.91
1116 0.92
1117 0.93