Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068SCM1

Protein Details
Accession A0A068SCM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-108AAKMKFKPTIPARRNKKEASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-105GAAKMKFKPTIPARRNKK
125-148RGSFRGRGDRGRGRGRGRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSDKPISPSVSKQTRRFAPNTRGRGRGLRPTRPSSEGDSAIKQEGGDSGEASLNGVPMPSKPIGHIRSDNTQEGRLPSVHDGQRTRGGAAKMKFKPTIPARRNKKEASSSAVDEALNAKNAEFGRGSFRGRGDRGRGRGRGRGRGRGRGDIVAESTASGFFSLGPSAMANRARGAFGGSGGYATFSGDSSSRADMYNDKDSDMIHLFGDNHDDTLPIVFKHISRTAGELDPSDLTSAGPKVPWLRTVSKARTNIKNASSKDQEKAKVKDEPSNEERSMSDIKMDVDDEQEENVPDISSLPPVMMDADAPAQYLFGLDENEQIVSVADDELLFFQLPSILPQFEKVDDEPVEVADDKDKQLPPAAKKSTLESAMASLSLGDMPQGQVGSLVVYKSGKMKLKIGDVLFDITQGMQSSFLENAMMVDTLSEDKKKVIELGNLTQKFVCMPDMDALLEDQNIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.73
3 0.74
4 0.73
5 0.74
6 0.75
7 0.79
8 0.76
9 0.72
10 0.68
11 0.71
12 0.67
13 0.67
14 0.66
15 0.66
16 0.68
17 0.7
18 0.72
19 0.67
20 0.64
21 0.61
22 0.58
23 0.53
24 0.49
25 0.45
26 0.42
27 0.4
28 0.37
29 0.29
30 0.23
31 0.2
32 0.18
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.11
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.13
46 0.13
47 0.13
48 0.16
49 0.25
50 0.28
51 0.34
52 0.39
53 0.38
54 0.45
55 0.5
56 0.53
57 0.46
58 0.45
59 0.41
60 0.38
61 0.37
62 0.29
63 0.27
64 0.25
65 0.31
66 0.32
67 0.35
68 0.35
69 0.36
70 0.43
71 0.41
72 0.38
73 0.35
74 0.35
75 0.37
76 0.39
77 0.44
78 0.42
79 0.46
80 0.48
81 0.43
82 0.49
83 0.52
84 0.59
85 0.57
86 0.63
87 0.67
88 0.75
89 0.81
90 0.76
91 0.75
92 0.72
93 0.67
94 0.64
95 0.58
96 0.51
97 0.45
98 0.42
99 0.34
100 0.26
101 0.25
102 0.19
103 0.17
104 0.14
105 0.12
106 0.15
107 0.15
108 0.17
109 0.15
110 0.14
111 0.19
112 0.21
113 0.23
114 0.22
115 0.25
116 0.29
117 0.31
118 0.36
119 0.37
120 0.42
121 0.48
122 0.53
123 0.57
124 0.55
125 0.6
126 0.6
127 0.62
128 0.61
129 0.63
130 0.61
131 0.64
132 0.63
133 0.62
134 0.58
135 0.5
136 0.46
137 0.37
138 0.33
139 0.24
140 0.2
141 0.13
142 0.11
143 0.09
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.17
183 0.23
184 0.22
185 0.21
186 0.21
187 0.2
188 0.22
189 0.2
190 0.16
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.13
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.11
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.16
212 0.18
213 0.18
214 0.18
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.17
231 0.19
232 0.25
233 0.33
234 0.38
235 0.42
236 0.48
237 0.51
238 0.54
239 0.56
240 0.55
241 0.52
242 0.54
243 0.49
244 0.49
245 0.49
246 0.45
247 0.44
248 0.44
249 0.45
250 0.45
251 0.46
252 0.44
253 0.45
254 0.44
255 0.46
256 0.43
257 0.44
258 0.41
259 0.44
260 0.4
261 0.34
262 0.33
263 0.3
264 0.3
265 0.23
266 0.19
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.11
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.07
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.15
329 0.14
330 0.17
331 0.16
332 0.19
333 0.19
334 0.2
335 0.18
336 0.16
337 0.17
338 0.15
339 0.14
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.25
347 0.32
348 0.35
349 0.43
350 0.46
351 0.44
352 0.45
353 0.48
354 0.48
355 0.43
356 0.38
357 0.29
358 0.26
359 0.22
360 0.21
361 0.16
362 0.1
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.14
381 0.21
382 0.26
383 0.28
384 0.33
385 0.36
386 0.42
387 0.48
388 0.44
389 0.4
390 0.35
391 0.36
392 0.3
393 0.25
394 0.2
395 0.13
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.09
400 0.09
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.1
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.15
417 0.17
418 0.18
419 0.22
420 0.25
421 0.29
422 0.34
423 0.42
424 0.51
425 0.51
426 0.51
427 0.46
428 0.41
429 0.34
430 0.3
431 0.23
432 0.14
433 0.15
434 0.17
435 0.18
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.16