Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6W1

Protein Details
Accession Q6C6W1    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-286EARRQRDLKKFGKKVQHNKLQERAKBasic
360-388LSGFNQKRNNAPVKKRQQSRPGKSRRNRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-303KKASEEARRQRDLKKFGKKVQHNKLQERAKDKKETLEKIKSLKRKRA
330-350NHKRQAKDAKFGFGGKKRFRK
367-388RNNAPVKKRQQSRPGKSRRNRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008610  Ebp2  
Gene Ontology GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0000280  P:nuclear division  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG yli:YALI0E05797g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05890  Ebp2  
Amino Acid Sequences MGAPKLKDSLKAAKANDKAAKLTAKKGVLPKPKDLAVVAKQQIAHEDDGDDEEDEDDEEEDEEDEEDEEDEDKTPVLSRKEARKMKKLAAAAAAAEEDDDEEDDDEVPQLYDTTRLDLSESESEIENVENEVEDIPLSDVELDSDNDAIPYQKVTKNNKPALMQAKARISLPYAKMTFVDTLVHTSGAIELKDIYDDMEKELAFYKQGLDAAKVARKELLKAKVPFTRPLDYFAEMVKSDEHMEKLKQKLIEEATSKKASEEARRQRDLKKFGKKVQHNKLQERAKDKKETLEKIKSLKRKRAGQEMTSEEFDIAVEEAAADNHNIEGKNHKRQAKDAKFGFGGKKRFRKANTSESSGDLSGFNQKRNNAPVKKRQQSRPGKSRRNRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.63
4 0.55
5 0.49
6 0.47
7 0.52
8 0.46
9 0.49
10 0.48
11 0.44
12 0.47
13 0.53
14 0.58
15 0.6
16 0.62
17 0.62
18 0.6
19 0.6
20 0.56
21 0.49
22 0.48
23 0.43
24 0.47
25 0.42
26 0.4
27 0.38
28 0.36
29 0.39
30 0.34
31 0.3
32 0.21
33 0.19
34 0.17
35 0.18
36 0.18
37 0.15
38 0.12
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.11
62 0.16
63 0.18
64 0.24
65 0.3
66 0.39
67 0.5
68 0.58
69 0.62
70 0.67
71 0.7
72 0.71
73 0.71
74 0.63
75 0.56
76 0.51
77 0.44
78 0.35
79 0.29
80 0.22
81 0.15
82 0.13
83 0.09
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.08
99 0.08
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.16
106 0.15
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.07
138 0.1
139 0.14
140 0.22
141 0.29
142 0.38
143 0.47
144 0.52
145 0.54
146 0.52
147 0.54
148 0.53
149 0.5
150 0.43
151 0.38
152 0.36
153 0.33
154 0.33
155 0.27
156 0.22
157 0.23
158 0.22
159 0.23
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.21
164 0.2
165 0.15
166 0.14
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.11
198 0.13
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.23
206 0.27
207 0.32
208 0.34
209 0.38
210 0.41
211 0.43
212 0.46
213 0.44
214 0.43
215 0.36
216 0.38
217 0.36
218 0.32
219 0.3
220 0.25
221 0.22
222 0.17
223 0.17
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.16
231 0.21
232 0.24
233 0.27
234 0.27
235 0.26
236 0.3
237 0.31
238 0.33
239 0.31
240 0.31
241 0.33
242 0.33
243 0.33
244 0.27
245 0.28
246 0.27
247 0.33
248 0.4
249 0.45
250 0.51
251 0.57
252 0.6
253 0.64
254 0.68
255 0.69
256 0.68
257 0.68
258 0.67
259 0.7
260 0.77
261 0.79
262 0.81
263 0.82
264 0.82
265 0.8
266 0.8
267 0.81
268 0.79
269 0.75
270 0.73
271 0.71
272 0.68
273 0.68
274 0.62
275 0.62
276 0.63
277 0.65
278 0.65
279 0.66
280 0.63
281 0.63
282 0.7
283 0.7
284 0.71
285 0.72
286 0.72
287 0.72
288 0.74
289 0.77
290 0.75
291 0.7
292 0.69
293 0.66
294 0.61
295 0.53
296 0.47
297 0.36
298 0.29
299 0.24
300 0.17
301 0.11
302 0.07
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.2
315 0.27
316 0.37
317 0.45
318 0.5
319 0.5
320 0.58
321 0.69
322 0.69
323 0.71
324 0.64
325 0.63
326 0.6
327 0.62
328 0.61
329 0.58
330 0.58
331 0.58
332 0.65
333 0.65
334 0.71
335 0.71
336 0.72
337 0.73
338 0.74
339 0.71
340 0.68
341 0.64
342 0.58
343 0.57
344 0.47
345 0.4
346 0.29
347 0.23
348 0.27
349 0.27
350 0.29
351 0.3
352 0.33
353 0.39
354 0.48
355 0.57
356 0.56
357 0.64
358 0.7
359 0.77
360 0.83
361 0.86
362 0.87
363 0.88
364 0.89
365 0.9
366 0.9
367 0.9
368 0.92