FuNGI

Q6C378

Protein Details

Accession

Q6C378

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
632-653	ISDPSRAKKEKKEKESNPESTV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
733-740	RNKRSRPA
745-755	SKDRFVPRKRK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.5, nucl 12.5, cyto 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR034350 NUCL_RRM2 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR034398 Prp24_RRM2 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032991 C:protein-containing complex GO:0019843 F:rRNA binding GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	yli:YALI0F01969g -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd12451 RRM2_NUCLs cd12297 RRM2_Prp24

Amino Acid Sequences

MDLETALERIEKDVYDIEAHNSALKELQELGEQESLLGLLAQSYANVYVDPKFVSLPESADDESVEQLKQIFASPPPTSLLWHIKYIQLLSLVGDSTALLNAFKRLFTWHYRPRGARMLWEEVAAHFTKRLDVDSDKQLFREAYEFVLGLPHFQHELTFSEYKDFLHNQFNETAPKNQAYKAAVKLIGKIEQDGGEYMVSQRFYNNQNDAKLVLGCMMESAEDVAFDPRACEQVLQYLGHVDLRKLKLFKGINIHMAMKEVATLAVRFFPRDGKSWFNAALVTPSTDVEVVLQAPIYEEPSNDTYIDWSWLVRARLLHLDSGGVDLVEGFISTVETAQSGDVSVEKAIIGYYLRVGQSVEFIRDKFKQLTRFKPYSLDLWLMWIDWERRYPKDTNSIQQVYQQALKQVSNGDFEDGKPIVESYQNYLSGEGATAVHSLSSNYFNAGFFVDDRAEKEEPHSMEVDSVATPAEHTDAPVKSTVAEPTRDREHLTVIMAKLPEGTTEEQINTFFSECGEPRNSILNLPFAVIEFSSHDEKLAALTRDHKKLGDQEVRVTDGYHTTVYVTNFAVDDNEQTLREQFGAFGEIASVRLPSLSVHKHRRFCYIQFTTSAAAEAAVQFGKDNDSGIVVEISDPSRAKKEKKEKESNPESTVYISRLNYDTSADEIEAAFGEFGKVTNLTIPNKGQDLGTKKNLGFAFLSFSTVEAAKESLILNGSDILGKNLLVSIADKPRNKRSRPALVSVSKDRFVPRKRKVLGASRDARGSQGGASPSESTVVSSSVSGNRSTEAKPEGASAPKSNSDFRSFLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.2
4	0.21
5	0.22
6	0.22
7	0.23
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.18
12	0.17
13	0.16
14	0.17
15	0.17
16	0.18
17	0.21
18	0.2
19	0.19
20	0.17
21	0.16
22	0.15
23	0.11
24	0.1
25	0.06
26	0.04
27	0.05
28	0.05
29	0.05
30	0.06
31	0.07
32	0.07
33	0.08
34	0.09
35	0.11
36	0.13
37	0.14
38	0.14
39	0.13
40	0.13
41	0.16
42	0.15
43	0.15
44	0.15
45	0.18
46	0.18
47	0.18
48	0.18
49	0.16
50	0.17
51	0.17
52	0.15
53	0.12
54	0.12
55	0.12
56	0.12
57	0.13
58	0.14
59	0.14
60	0.21
61	0.22
62	0.23
63	0.25
64	0.25
65	0.25
66	0.29
67	0.35
68	0.31
69	0.34
70	0.34
71	0.34
72	0.35
73	0.34
74	0.3
75	0.22
76	0.19
77	0.16
78	0.16
79	0.14
80	0.11
81	0.1
82	0.08
83	0.07
84	0.08
85	0.07
86	0.06
87	0.07
88	0.11
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.15
93	0.2
94	0.28
95	0.37
96	0.43
97	0.51
98	0.59
99	0.61
100	0.64
101	0.68
102	0.6
103	0.58
104	0.55
105	0.53
106	0.46
107	0.44
108	0.38
109	0.29
110	0.32
111	0.25
112	0.2
113	0.14
114	0.14
115	0.16
116	0.16
117	0.18
118	0.18
119	0.22
120	0.26
121	0.34
122	0.4
123	0.38
124	0.37
125	0.38
126	0.34
127	0.31
128	0.28
129	0.19
130	0.15
131	0.15
132	0.15
133	0.12
134	0.16
135	0.14
136	0.13
137	0.13
138	0.13
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.1
143	0.13
144	0.18
145	0.19
146	0.18
147	0.21
148	0.21
149	0.22
150	0.25
151	0.25
152	0.22
153	0.29
154	0.29
155	0.29
156	0.31
157	0.32
158	0.33
159	0.33
160	0.35
161	0.29
162	0.32
163	0.31
164	0.3
165	0.33
166	0.31
167	0.33
168	0.32
169	0.34
170	0.34
171	0.32
172	0.35
173	0.32
174	0.34
175	0.3
176	0.27
177	0.23
178	0.2
179	0.2
180	0.17
181	0.15
182	0.1
183	0.1
184	0.1
185	0.11
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.15
190	0.19
191	0.24
192	0.3
193	0.31
194	0.32
195	0.33
196	0.32
197	0.3
198	0.26
199	0.2
200	0.15
201	0.11
202	0.09
203	0.08
204	0.08
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.04
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.08
215	0.07
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.14
221	0.16
222	0.16
223	0.15
224	0.15
225	0.15
226	0.17
227	0.18
228	0.13
229	0.18
230	0.21
231	0.25
232	0.25
233	0.25
234	0.3
235	0.32
236	0.35
237	0.36
238	0.36
239	0.36
240	0.37
241	0.38
242	0.29
243	0.29
244	0.25
245	0.16
246	0.14
247	0.09
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.16
257	0.18
258	0.22
259	0.25
260	0.26
261	0.28
262	0.3
263	0.3
264	0.25
265	0.24
266	0.2
267	0.19
268	0.14
269	0.13
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.1
287	0.12
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.13
294	0.1
295	0.08
296	0.09
297	0.12
298	0.13
299	0.13
300	0.13
301	0.14
302	0.18
303	0.19
304	0.18
305	0.14
306	0.14
307	0.13
308	0.13
309	0.11
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.03
316	0.02
317	0.02
318	0.03
319	0.03
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.1
345	0.11
346	0.13
347	0.12
348	0.13
349	0.16
350	0.18
351	0.21
352	0.22
353	0.25
354	0.32
355	0.38
356	0.46
357	0.51
358	0.52
359	0.5
360	0.49
361	0.46
362	0.39
363	0.34
364	0.27
365	0.19
366	0.18
367	0.17
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.1
372	0.1
373	0.14
374	0.14
375	0.16
376	0.2
377	0.22
378	0.23
379	0.32
380	0.33
381	0.33
382	0.38
383	0.39
384	0.35
385	0.37
386	0.36
387	0.27
388	0.27
389	0.24
390	0.19
391	0.18
392	0.18
393	0.15
394	0.16
395	0.15
396	0.15
397	0.15
398	0.13
399	0.12
400	0.12
401	0.15
402	0.13
403	0.11
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.1
408	0.11
409	0.1
410	0.13
411	0.14
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.11
416	0.11
417	0.08
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.06
426	0.08
427	0.07
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.06
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.09
439	0.13
440	0.13
441	0.13
442	0.14
443	0.18
444	0.18
445	0.19
446	0.19
447	0.14
448	0.14
449	0.14
450	0.13
451	0.08
452	0.08
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.05
459	0.06
460	0.1
461	0.1
462	0.11
463	0.12
464	0.12
465	0.11
466	0.12
467	0.16
468	0.14
469	0.17
470	0.17
471	0.21
472	0.24
473	0.25
474	0.26
475	0.22
476	0.22
477	0.2
478	0.21
479	0.2
480	0.16
481	0.18
482	0.16
483	0.16
484	0.14
485	0.12
486	0.11
487	0.11
488	0.12
489	0.11
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.11
496	0.1
497	0.08
498	0.08
499	0.1
500	0.1
501	0.14
502	0.15
503	0.15
504	0.15
505	0.21
506	0.2
507	0.2
508	0.21
509	0.19
510	0.17
511	0.17
512	0.15
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.07
518	0.1
519	0.12
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.12
525	0.16
526	0.14
527	0.13
528	0.22
529	0.27
530	0.31
531	0.32
532	0.3
533	0.28
534	0.33
535	0.42
536	0.41
537	0.37
538	0.38
539	0.39
540	0.41
541	0.38
542	0.33
543	0.24
544	0.18
545	0.18
546	0.13
547	0.11
548	0.1
549	0.13
550	0.13
551	0.14
552	0.13
553	0.12
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.08
558	0.09
559	0.09
560	0.1
561	0.1
562	0.11
563	0.12
564	0.11
565	0.12
566	0.1
567	0.09
568	0.08
569	0.1
570	0.09
571	0.08
572	0.08
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.12
582	0.19
583	0.28
584	0.38
585	0.46
586	0.54
587	0.55
588	0.63
589	0.62
590	0.58
591	0.6
592	0.54
593	0.49
594	0.44
595	0.44
596	0.37
597	0.32
598	0.29
599	0.18
600	0.13
601	0.11
602	0.09
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.08
609	0.08
610	0.09
611	0.07
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.11
621	0.11
622	0.12
623	0.2
624	0.25
625	0.31
626	0.4
627	0.5
628	0.58
629	0.68
630	0.78
631	0.79
632	0.84
633	0.88
634	0.84
635	0.76
636	0.68
637	0.58
638	0.5
639	0.44
640	0.35
641	0.3
642	0.24
643	0.23
644	0.22
645	0.22
646	0.2
647	0.19
648	0.18
649	0.15
650	0.16
651	0.13
652	0.13
653	0.11
654	0.11
655	0.09
656	0.09
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.12
666	0.17
667	0.19
668	0.24
669	0.25
670	0.26
671	0.28
672	0.28
673	0.24
674	0.26
675	0.3
676	0.33
677	0.37
678	0.4
679	0.38
680	0.45
681	0.44
682	0.39
683	0.34
684	0.27
685	0.27
686	0.22
687	0.24
688	0.17
689	0.17
690	0.17
691	0.16
692	0.16
693	0.1
694	0.11
695	0.09
696	0.1
697	0.1
698	0.1
699	0.11
700	0.1
701	0.1
702	0.1
703	0.11
704	0.12
705	0.12
706	0.12
707	0.11
708	0.11
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.08
713	0.09
714	0.14
715	0.22
716	0.3
717	0.35
718	0.41
719	0.52
720	0.61
721	0.64
722	0.67
723	0.68
724	0.72
725	0.73
726	0.74
727	0.73
728	0.71
729	0.74
730	0.73
731	0.68
732	0.58
733	0.54
734	0.53
735	0.53
736	0.55
737	0.59
738	0.59
739	0.64
740	0.66
741	0.72
742	0.75
743	0.76
744	0.75
745	0.75
746	0.73
747	0.66
748	0.66
749	0.58
750	0.51
751	0.42
752	0.34
753	0.25
754	0.23
755	0.22
756	0.19
757	0.21
758	0.21
759	0.19
760	0.2
761	0.18
762	0.15
763	0.14
764	0.14
765	0.12
766	0.11
767	0.14
768	0.17
769	0.19
770	0.19
771	0.19
772	0.2
773	0.23
774	0.23
775	0.26
776	0.25
777	0.25
778	0.25
779	0.27
780	0.3
781	0.33
782	0.36
783	0.34
784	0.35
785	0.4
786	0.42
787	0.44
788	0.45
789	0.45

Q6C378

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer