Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C176

Protein Details
Accession Q6C176    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-96VDTTPKVKRGRGRPPKVRPEGEEPVVKRPRGRPRKSIDPNSGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-44GRGRP
58-88PKVKRGRGRPPKVRPEGEEPVVKRPRGRPRK
117-124RGRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG yli:YALI0F18612g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MRRQKKTGISPVFLHNDTTHNMSEEHTISQEVASPIVKRGRGRPPKVPTGTEVVDTTPKVKRGRGRPPKVRPEGEEPVVKRPRGRPRKSIDPNSGDPSTHGNAVNASGDPSVIVEKRGRGRPRKNPIVVAPAPLWPTPDLVQFGGADPYEEIDSFSAERIEEQAGQEGANLTHPEKLALIKRRLHAEAQDKDLLEALATNREDFFNADEAKDVYSQYSVLRHHIALLLQNYGDTDEGRVIKRNLSNLMGVLRYLRLKDNILSELLTIVPLIQDQDYTGAKNRIQALDGPWCIGTPSNREIRLRETQKWITGLVQLLEWSDGSYNGLYRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.4
3 0.35
4 0.33
5 0.34
6 0.27
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.24
11 0.22
12 0.21
13 0.18
14 0.18
15 0.16
16 0.16
17 0.19
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.16
22 0.2
23 0.25
24 0.29
25 0.27
26 0.35
27 0.44
28 0.53
29 0.59
30 0.64
31 0.66
32 0.73
33 0.75
34 0.69
35 0.61
36 0.58
37 0.53
38 0.45
39 0.37
40 0.29
41 0.27
42 0.25
43 0.26
44 0.23
45 0.28
46 0.29
47 0.33
48 0.4
49 0.46
50 0.57
51 0.65
52 0.71
53 0.76
54 0.84
55 0.89
56 0.9
57 0.84
58 0.78
59 0.76
60 0.72
61 0.65
62 0.62
63 0.53
64 0.54
65 0.55
66 0.51
67 0.47
68 0.48
69 0.55
70 0.6
71 0.65
72 0.64
73 0.66
74 0.77
75 0.82
76 0.82
77 0.8
78 0.76
79 0.74
80 0.7
81 0.63
82 0.51
83 0.42
84 0.38
85 0.3
86 0.26
87 0.22
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.11
93 0.11
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.1
101 0.1
102 0.15
103 0.21
104 0.29
105 0.37
106 0.44
107 0.54
108 0.62
109 0.71
110 0.76
111 0.73
112 0.7
113 0.65
114 0.64
115 0.55
116 0.48
117 0.38
118 0.31
119 0.29
120 0.25
121 0.23
122 0.14
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.13
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.12
164 0.17
165 0.23
166 0.28
167 0.3
168 0.33
169 0.36
170 0.38
171 0.36
172 0.36
173 0.38
174 0.35
175 0.35
176 0.36
177 0.32
178 0.3
179 0.29
180 0.23
181 0.14
182 0.12
183 0.08
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.12
205 0.12
206 0.15
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.15
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.07
221 0.07
222 0.09
223 0.12
224 0.13
225 0.17
226 0.18
227 0.23
228 0.25
229 0.27
230 0.27
231 0.27
232 0.27
233 0.23
234 0.24
235 0.19
236 0.17
237 0.15
238 0.14
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.18
244 0.21
245 0.24
246 0.23
247 0.22
248 0.21
249 0.18
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.08
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.1
262 0.11
263 0.13
264 0.18
265 0.21
266 0.22
267 0.27
268 0.31
269 0.28
270 0.29
271 0.3
272 0.29
273 0.34
274 0.34
275 0.3
276 0.26
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.2
282 0.25
283 0.31
284 0.35
285 0.38
286 0.4
287 0.44
288 0.51
289 0.52
290 0.53
291 0.54
292 0.55
293 0.58
294 0.57
295 0.51
296 0.43
297 0.4
298 0.36
299 0.27
300 0.23
301 0.18
302 0.17
303 0.17
304 0.15
305 0.12
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.11