Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A068RRF0

Protein Details
Accession A0A068RRF0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-279EQPSRRHALERKFKHPKRNSGTPKGACBasic
317-342QAQENKPRNNNQQHPKYQNRNQVRERHydrophilic
1017-1042EGENPQQLKNHKKKKNDNPITNDEENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-271SRRHALERKFKHPKRN
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001969  Aspartic_peptidase_AS  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR041577  RT_RNaseH_2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004190  F:aspartic-type endopeptidase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003964  F:RNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF13650  Asp_protease_2  
PF17919  RT_RNaseH_2  
PF00665  rve  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00141  ASP_PROTEASE  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MDPSRRFVISKIIYPNNPSFFSASTQFGQTSVGSAISQSSQQNQRPVKLPKDTPFLNTPSARHSDADARQKSLFNTAEEWANKVERVMNYNGYDKETTTFLWRRIVKYALDTKQHERLMTGLTNVEVLVDRDDYTWEQVRATIIKLFDTTAEQRRLHHQVLRCFQKDSETLSTFVQRFSDAVYQAKLPQQNAFIRDLMFDNMTESTKQLATDHVNLTCGADWLVDLEHFRHAFSNFNTLQKDDTIGSKRAHNEQPSRRHALERKFKHPKRNSGTPKGACSHCYNHEGKSVPFDNGKHVCPHDPRKFHPYTKCVKCIQAQENKPRNNNQQHPKYQNRNQVRERINRTAYIIEQADEMAQANDEKSTASSESGLDENDADADVAMAEASSNCKLQSRMATKNDTKSHADEITIPVMIENKRVLALLDSGANFSSIDTNFCKDLGIQIKHVKGNITLADSSIKLPRMGTTKKLEVSYNNIKVTHRFEVMSLARGHSVSIGTDLMQPFRIGFSGLVAKWDNQEPQVEEVEEKPPKPNASPAGSEKERKALFETIDPLLDANQAIPTNAFCTLPEAVVKLPTNGKTVHKKQYPIADKHLPMIQETISKWLNDGIIEKAPAEVYGRWNNPLTLAPKKDEHGNKTKHRLCLDPRALNIHLPDETYRLPLIDEIFRQVKHANVFTTLDLTQAFHRLPIYAPHRVHTTFTSPVDNQAYCFVSMPFGIKSTSSKFQRCMHVLLGELPYASAFVDDVVIFSANMQEHVQHVATVIQRLTNANLVLNRNKCVFAMRSVYLLGFCISEGGRKTLDPRKVANTQDWPTPQTGKDIERFLGVVNYFRAHIPRASTLTAPLDKLRKNKRLGKHWGPEQQEAFETIKAVLTQHPVLHQPFADRPFYVATDASDYGIGAVLYQLSKTGKKRFISFMARSLKPAERNYQITKKELLAIIFALNRFHNYLWGNKFTLYTDHQALVYLHSQENLNPMLTKWLDRILDYNFEIVYIKGILNTLPDRLSRLFPDAYSLGEGENPQQLKNHKKKKNDNPITNDEENEESIPTDDEDDDELNAIKDPVARAAQRIIRDYIEPPPEARHQLLLESHLLGHFGADAIVNDIHMKGMHWQHIKNDALRLTQSCAKCLQVNTIRRGYNPLRPISCEIAGDHWSIDLAGRLEKTKRGNEYLLIMVDICTRFCLLKPIPDKTATTIVTQLIDAFTTFGIPRIVSSDNGTEFSNELMDLFTKTVGIDHRLITPYHPRANGSAERWVQSAINGIKKSMEGAIPDWDLYVPATQLAFVMEQGQEIRNVCVCVYVCVSTKVRVKKIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.55
4 0.53
5 0.47
6 0.41
7 0.35
8 0.37
9 0.34
10 0.31
11 0.28
12 0.28
13 0.26
14 0.23
15 0.24
16 0.19
17 0.18
18 0.15
19 0.14
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.12
24 0.16
25 0.15
26 0.22
27 0.3
28 0.36
29 0.45
30 0.48
31 0.52
32 0.58
33 0.64
34 0.64
35 0.65
36 0.68
37 0.66
38 0.7
39 0.67
40 0.63
41 0.61
42 0.57
43 0.55
44 0.5
45 0.44
46 0.42
47 0.45
48 0.42
49 0.37
50 0.36
51 0.38
52 0.42
53 0.51
54 0.48
55 0.47
56 0.48
57 0.49
58 0.47
59 0.46
60 0.41
61 0.33
62 0.32
63 0.3
64 0.35
65 0.33
66 0.34
67 0.29
68 0.28
69 0.26
70 0.24
71 0.28
72 0.23
73 0.28
74 0.3
75 0.32
76 0.33
77 0.39
78 0.39
79 0.38
80 0.36
81 0.32
82 0.3
83 0.25
84 0.23
85 0.26
86 0.3
87 0.28
88 0.36
89 0.39
90 0.4
91 0.44
92 0.46
93 0.39
94 0.43
95 0.5
96 0.48
97 0.52
98 0.54
99 0.55
100 0.59
101 0.6
102 0.52
103 0.43
104 0.38
105 0.35
106 0.32
107 0.28
108 0.2
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.14
120 0.15
121 0.19
122 0.23
123 0.21
124 0.21
125 0.21
126 0.24
127 0.23
128 0.24
129 0.22
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.16
135 0.2
136 0.24
137 0.28
138 0.35
139 0.35
140 0.36
141 0.44
142 0.49
143 0.48
144 0.49
145 0.47
146 0.5
147 0.59
148 0.66
149 0.6
150 0.56
151 0.52
152 0.52
153 0.48
154 0.45
155 0.44
156 0.37
157 0.36
158 0.35
159 0.42
160 0.36
161 0.34
162 0.28
163 0.2
164 0.18
165 0.2
166 0.23
167 0.19
168 0.21
169 0.21
170 0.22
171 0.24
172 0.3
173 0.3
174 0.26
175 0.27
176 0.32
177 0.35
178 0.36
179 0.36
180 0.32
181 0.29
182 0.29
183 0.27
184 0.23
185 0.19
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.16
197 0.2
198 0.25
199 0.27
200 0.25
201 0.25
202 0.25
203 0.26
204 0.21
205 0.17
206 0.12
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.09
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.16
218 0.16
219 0.21
220 0.21
221 0.29
222 0.26
223 0.31
224 0.32
225 0.3
226 0.31
227 0.27
228 0.28
229 0.2
230 0.24
231 0.24
232 0.28
233 0.28
234 0.32
235 0.35
236 0.41
237 0.46
238 0.48
239 0.53
240 0.57
241 0.66
242 0.68
243 0.72
244 0.66
245 0.67
246 0.67
247 0.67
248 0.69
249 0.66
250 0.7
251 0.74
252 0.78
253 0.8
254 0.82
255 0.83
256 0.8
257 0.84
258 0.83
259 0.82
260 0.86
261 0.79
262 0.76
263 0.7
264 0.63
265 0.56
266 0.51
267 0.47
268 0.41
269 0.44
270 0.4
271 0.37
272 0.41
273 0.4
274 0.35
275 0.37
276 0.34
277 0.3
278 0.32
279 0.3
280 0.33
281 0.34
282 0.36
283 0.32
284 0.33
285 0.37
286 0.41
287 0.51
288 0.52
289 0.54
290 0.57
291 0.62
292 0.66
293 0.67
294 0.68
295 0.66
296 0.67
297 0.7
298 0.71
299 0.65
300 0.63
301 0.61
302 0.61
303 0.62
304 0.61
305 0.62
306 0.66
307 0.72
308 0.74
309 0.74
310 0.73
311 0.74
312 0.74
313 0.76
314 0.75
315 0.76
316 0.79
317 0.82
318 0.84
319 0.84
320 0.83
321 0.83
322 0.82
323 0.82
324 0.78
325 0.78
326 0.77
327 0.76
328 0.75
329 0.74
330 0.67
331 0.59
332 0.55
333 0.48
334 0.41
335 0.36
336 0.28
337 0.2
338 0.17
339 0.16
340 0.14
341 0.11
342 0.11
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.1
378 0.11
379 0.14
380 0.23
381 0.27
382 0.35
383 0.4
384 0.48
385 0.5
386 0.58
387 0.59
388 0.54
389 0.51
390 0.45
391 0.45
392 0.37
393 0.34
394 0.27
395 0.25
396 0.22
397 0.19
398 0.16
399 0.12
400 0.15
401 0.14
402 0.14
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.09
409 0.1
410 0.08
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.08
418 0.1
419 0.08
420 0.11
421 0.12
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.14
426 0.1
427 0.16
428 0.22
429 0.23
430 0.25
431 0.3
432 0.34
433 0.34
434 0.35
435 0.3
436 0.23
437 0.24
438 0.21
439 0.19
440 0.15
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.15
445 0.15
446 0.15
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.2
451 0.22
452 0.27
453 0.29
454 0.33
455 0.35
456 0.36
457 0.35
458 0.3
459 0.36
460 0.4
461 0.4
462 0.37
463 0.36
464 0.35
465 0.36
466 0.39
467 0.34
468 0.27
469 0.21
470 0.2
471 0.25
472 0.26
473 0.26
474 0.22
475 0.2
476 0.19
477 0.18
478 0.18
479 0.12
480 0.11
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.1
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.1
497 0.1
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.17
503 0.16
504 0.13
505 0.15
506 0.14
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.19
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.21
517 0.22
518 0.22
519 0.25
520 0.24
521 0.26
522 0.29
523 0.3
524 0.35
525 0.36
526 0.38
527 0.33
528 0.35
529 0.32
530 0.29
531 0.29
532 0.25
533 0.23
534 0.23
535 0.25
536 0.19
537 0.18
538 0.17
539 0.14
540 0.11
541 0.1
542 0.08
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.07
550 0.08
551 0.08
552 0.06
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.09
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.13
563 0.15
564 0.16
565 0.18
566 0.23
567 0.29
568 0.35
569 0.43
570 0.44
571 0.45
572 0.46
573 0.53
574 0.56
575 0.51
576 0.52
577 0.48
578 0.45
579 0.44
580 0.43
581 0.33
582 0.26
583 0.23
584 0.17
585 0.13
586 0.13
587 0.16
588 0.14
589 0.14
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.11
594 0.12
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.1
599 0.09
600 0.09
601 0.08
602 0.09
603 0.08
604 0.11
605 0.17
606 0.18
607 0.19
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.21
612 0.21
613 0.2
614 0.22
615 0.22
616 0.23
617 0.24
618 0.3
619 0.31
620 0.33
621 0.37
622 0.44
623 0.48
624 0.56
625 0.6
626 0.58
627 0.55
628 0.55
629 0.5
630 0.53
631 0.53
632 0.46
633 0.42
634 0.42
635 0.4
636 0.36
637 0.32
638 0.22
639 0.16
640 0.13
641 0.13
642 0.11
643 0.11
644 0.11
645 0.1
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.1
650 0.09
651 0.09
652 0.11
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.14
657 0.15
658 0.15
659 0.17
660 0.14
661 0.14
662 0.15
663 0.14
664 0.16
665 0.13
666 0.11
667 0.1
668 0.1
669 0.09
670 0.1
671 0.1
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.09
676 0.14
677 0.18
678 0.24
679 0.24
680 0.25
681 0.28
682 0.28
683 0.29
684 0.24
685 0.24
686 0.2
687 0.21
688 0.23
689 0.2
690 0.22
691 0.24
692 0.22
693 0.18
694 0.17
695 0.17
696 0.14
697 0.14
698 0.11
699 0.09
700 0.09
701 0.1
702 0.08
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.1
707 0.13
708 0.2
709 0.24
710 0.26
711 0.3
712 0.34
713 0.4
714 0.4
715 0.39
716 0.33
717 0.3
718 0.28
719 0.26
720 0.22
721 0.16
722 0.13
723 0.1
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.04
728 0.03
729 0.03
730 0.04
731 0.04
732 0.04
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.04
737 0.07
738 0.06
739 0.07
740 0.07
741 0.07
742 0.08
743 0.1
744 0.1
745 0.07
746 0.08
747 0.1
748 0.1
749 0.12
750 0.11
751 0.1
752 0.1
753 0.11
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.13
759 0.16
760 0.21
761 0.22
762 0.23
763 0.22
764 0.22
765 0.21
766 0.21
767 0.2
768 0.17
769 0.21
770 0.19
771 0.19
772 0.19
773 0.19
774 0.16
775 0.15
776 0.11
777 0.07
778 0.06
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.09
783 0.1
784 0.11
785 0.11
786 0.16
787 0.22
788 0.28
789 0.29
790 0.31
791 0.35
792 0.4
793 0.42
794 0.42
795 0.42
796 0.39
797 0.41
798 0.39
799 0.35
800 0.32
801 0.32
802 0.27
803 0.24
804 0.25
805 0.23
806 0.25
807 0.25
808 0.23
809 0.21
810 0.21
811 0.17
812 0.17
813 0.14
814 0.12
815 0.11
816 0.11
817 0.11
818 0.12
819 0.13
820 0.11
821 0.13
822 0.14
823 0.16
824 0.18
825 0.19
826 0.18
827 0.19
828 0.22
829 0.21
830 0.2
831 0.2
832 0.23
833 0.25
834 0.34
835 0.42
836 0.46
837 0.52
838 0.59
839 0.64
840 0.69
841 0.75
842 0.76
843 0.75
844 0.75
845 0.75
846 0.71
847 0.68
848 0.59
849 0.5
850 0.41
851 0.36
852 0.29
853 0.21
854 0.17
855 0.12
856 0.12
857 0.11
858 0.11
859 0.1
860 0.12
861 0.13
862 0.13
863 0.15
864 0.18
865 0.19
866 0.19
867 0.18
868 0.17
869 0.2
870 0.23
871 0.23
872 0.19
873 0.19
874 0.2
875 0.2
876 0.18
877 0.14
878 0.12
879 0.14
880 0.14
881 0.13
882 0.11
883 0.1
884 0.09
885 0.09
886 0.08
887 0.04
888 0.04
889 0.04
890 0.04
891 0.04
892 0.06
893 0.08
894 0.13
895 0.18
896 0.26
897 0.33
898 0.35
899 0.4
900 0.43
901 0.49
902 0.53
903 0.51
904 0.51
905 0.52
906 0.5
907 0.48
908 0.47
909 0.44
910 0.41
911 0.42
912 0.39
913 0.37
914 0.42
915 0.48
916 0.52
917 0.5
918 0.47
919 0.45
920 0.4
921 0.38
922 0.34
923 0.28
924 0.2
925 0.18
926 0.17
927 0.16
928 0.15
929 0.13
930 0.12
931 0.13
932 0.14
933 0.13
934 0.16
935 0.16
936 0.23
937 0.26
938 0.29
939 0.29
940 0.28
941 0.28
942 0.25
943 0.27
944 0.24
945 0.23
946 0.22
947 0.22
948 0.21
949 0.22
950 0.21
951 0.19
952 0.18
953 0.17
954 0.15
955 0.15
956 0.15
957 0.14
958 0.18
959 0.16
960 0.14
961 0.12
962 0.12
963 0.17
964 0.17
965 0.17
966 0.15
967 0.19
968 0.19
969 0.19
970 0.22
971 0.19
972 0.23
973 0.22
974 0.22
975 0.17
976 0.16
977 0.16
978 0.14
979 0.12
980 0.09
981 0.08
982 0.08
983 0.08
984 0.08
985 0.11
986 0.12
987 0.12
988 0.13
989 0.13
990 0.17
991 0.18
992 0.21
993 0.19
994 0.23
995 0.22
996 0.2
997 0.25
998 0.21
999 0.2
1000 0.19
1001 0.17
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.14
1005 0.11
1006 0.16
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.18
1010 0.25
1011 0.34
1012 0.44
1013 0.53
1014 0.56
1015 0.66
1016 0.76
1017 0.83
1018 0.88
1019 0.88
1020 0.87
1021 0.85
1022 0.85
1023 0.83
1024 0.74
1025 0.63
1026 0.54
1027 0.44
1028 0.36
1029 0.28
1030 0.21
1031 0.13
1032 0.12
1033 0.12
1034 0.1
1035 0.1
1036 0.09
1037 0.09
1038 0.11
1039 0.11
1040 0.1
1041 0.1
1042 0.1
1043 0.09
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.08
1047 0.09
1048 0.1
1049 0.13
1050 0.17
1051 0.17
1052 0.18
1053 0.25
1054 0.28
1055 0.29
1056 0.32
1057 0.31
1058 0.28
1059 0.29
1060 0.3
1061 0.31
1062 0.31
1063 0.29
1064 0.27
1065 0.29
1066 0.32
1067 0.34
1068 0.33
1069 0.29
1070 0.25
1071 0.27
1072 0.28
1073 0.26
1074 0.23
1075 0.2
1076 0.19
1077 0.15
1078 0.15
1079 0.12
1080 0.1
1081 0.07
1082 0.06
1083 0.05
1084 0.05
1085 0.05
1086 0.07
1087 0.07
1088 0.08
1089 0.08
1090 0.08
1091 0.08
1092 0.08
1093 0.09
1094 0.12
1095 0.17
1096 0.25
1097 0.29
1098 0.31
1099 0.35
1100 0.43
1101 0.46
1102 0.43
1103 0.44
1104 0.38
1105 0.36
1106 0.37
1107 0.35
1108 0.32
1109 0.35
1110 0.33
1111 0.3
1112 0.29
1113 0.29
1114 0.3
1115 0.3
1116 0.35
1117 0.37
1118 0.44
1119 0.48
1120 0.53
1121 0.52
1122 0.49
1123 0.56
1124 0.51
1125 0.5
1126 0.5
1127 0.51
1128 0.46
1129 0.49
1130 0.53
1131 0.5
1132 0.46
1133 0.39
1134 0.33
1135 0.29
1136 0.29
1137 0.25
1138 0.21
1139 0.15
1140 0.14
1141 0.12
1142 0.12
1143 0.1
1144 0.09
1145 0.11
1146 0.13
1147 0.16
1148 0.19
1149 0.24
1150 0.31
1151 0.35
1152 0.4
1153 0.43
1154 0.44
1155 0.43
1156 0.45
1157 0.42
1158 0.36
1159 0.3
1160 0.24
1161 0.19
1162 0.2
1163 0.19
1164 0.15
1165 0.12
1166 0.13
1167 0.13
1168 0.13
1169 0.22
1170 0.2
1171 0.28
1172 0.35
1173 0.4
1174 0.43
1175 0.46
1176 0.47
1177 0.43
1178 0.49
1179 0.41
1180 0.36
1181 0.33
1182 0.3
1183 0.28
1184 0.26
1185 0.22
1186 0.14
1187 0.13
1188 0.11
1189 0.09
1190 0.08
1191 0.09
1192 0.09
1193 0.1
1194 0.11
1195 0.1
1196 0.11
1197 0.14
1198 0.16
1199 0.15
1200 0.19
1201 0.22
1202 0.22
1203 0.24
1204 0.24
1205 0.21
1206 0.2
1207 0.19
1208 0.16
1209 0.11
1210 0.09
1211 0.09
1212 0.09
1213 0.1
1214 0.1
1215 0.09
1216 0.09
1217 0.09
1218 0.12
1219 0.14
1220 0.18
1221 0.19
1222 0.2
1223 0.25
1224 0.27
1225 0.27
1226 0.29
1227 0.36
1228 0.39
1229 0.43
1230 0.44
1231 0.4
1232 0.41
1233 0.48
1234 0.51
1235 0.44
1236 0.46
1237 0.42
1238 0.42
1239 0.41
1240 0.4
1241 0.32
1242 0.26
1243 0.31
1244 0.28
1245 0.32
1246 0.31
1247 0.31
1248 0.3
1249 0.3
1250 0.31
1251 0.26
1252 0.23
1253 0.17
1254 0.19
1255 0.23
1256 0.23
1257 0.23
1258 0.22
1259 0.19
1260 0.17
1261 0.15
1262 0.15
1263 0.1
1264 0.1
1265 0.1
1266 0.09
1267 0.1
1268 0.11
1269 0.1
1270 0.09
1271 0.11
1272 0.1
1273 0.11
1274 0.13
1275 0.14
1276 0.16
1277 0.17
1278 0.19
1279 0.19
1280 0.2
1281 0.19
1282 0.22
1283 0.21
1284 0.21
1285 0.23
1286 0.24
1287 0.23
1288 0.28
1289 0.31
1290 0.33
1291 0.4
1292 0.46