FuNGI

A0A068SHI4

Protein Details

Accession

A0A068SHI4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-103	LYGRPFPRSRHQRQYSSYSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 10, cyto 4.5, mito 3, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C IPR019515 VPS54_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54 PF10475 Vps54_N

Amino Acid Sequences

MQPRSHAGTPEQDDKKHNHYRSSSWTPSTKHSLPSTAWPSPSSVASPISELPRSPRLAQHARERSWHYGITPTATASGGGSAPLYGRPFPRSRHQRQYSSYSNYSSMSDTDLPWTTADIGFNAISGVLNDPANRTPTFTRPSKADVPPAPHVSIPKPKLSDFNEYLSEIEPLFEQYQQNRRDQTEHEMMTTPDTTTTTTAALDVPAAERSGRNPYGQVLSSESLIMDETDSSASHIIEQLVPLDTVPDVFFDPEFTLENPRTFDMVYEGSDITGNLSLLQEKLPYYLDTVEQHLVREIDKRSDSFFEASSNLQALHQETLECVDQIRSLRDMMQSIQKSACDDGLQVTRLQIRQRNLEHLYTSIRAVKDIIESQHEIQKLVSQGNYFEALDLINQTRTKKQQINGNIHALGSISSQLDEMESTIGNTMQQDFLSILLSDISYHQETAESTISLTESPPEKIELQEDVDLRQSLEPSVKGLLRTDTLKTTLDDYQQYLLREVKSIVRQRYPTTNEDDSAVARQLRTMPFDSFFRMLVDVMTALLKVILRVVVHQHTLISLVPEDSKRLAMDIVFTAADSAHAQCAKLLSFRSEQNARLNPHDFYRLLAVSRGFIQNSDTLCFGRACLGLRGTLLSQQKAFVENFHMERMKQQLQLIDNEPWVVSEVPADFQDIVDRICSNTPIKDVTAMVNNTNDKNTDTKTSSSKRLIVDGKSYFVVGCSLLMIKLLEDYLKCTAGLENMATDVMQKLFELLKLFNARICQAILGAGAMKTAGLKNISAKHLALASQSISIMTALIPALKRGVERYLPPKHTVLLNEFDRTIADYDEHRREIYAKLVSIMQERLLYHIQAMNDIDWDAAGHDNTDDQHVNVYMEVLVKETLTLHKVLNKYLSHSELHDIMVDIFALFNKQLSQDIRKLPIHTESGKSRLSKDVTYFIRRLSSLPGIDPPSKDIVDVVDSISIEPSSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.6
3	0.61
4	0.6
5	0.59
6	0.58
7	0.61
8	0.66
9	0.7
10	0.67
11	0.64
12	0.66
13	0.6
14	0.62
15	0.65
16	0.59
17	0.56
18	0.53
19	0.51
20	0.46
21	0.53
22	0.54
23	0.5
24	0.48
25	0.42
26	0.41
27	0.38
28	0.38
29	0.3
30	0.25
31	0.23
32	0.21
33	0.23
34	0.24
35	0.26
36	0.26
37	0.25
38	0.28
39	0.33
40	0.36
41	0.36
42	0.38
43	0.43
44	0.5
45	0.55
46	0.6
47	0.63
48	0.62
49	0.66
50	0.67
51	0.64
52	0.6
53	0.55
54	0.45
55	0.42
56	0.41
57	0.38
58	0.32
59	0.26
60	0.23
61	0.22
62	0.2
63	0.14
64	0.14
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.07
69	0.08
70	0.11
71	0.13
72	0.15
73	0.18
74	0.24
75	0.29
76	0.34
77	0.44
78	0.52
79	0.59
80	0.67
81	0.73
82	0.76
83	0.77
84	0.81
85	0.79
86	0.76
87	0.71
88	0.63
89	0.56
90	0.48
91	0.43
92	0.36
93	0.28
94	0.24
95	0.22
96	0.19
97	0.22
98	0.22
99	0.21
100	0.2
101	0.2
102	0.17
103	0.17
104	0.17
105	0.13
106	0.13
107	0.12
108	0.12
109	0.11
110	0.09
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.08
115	0.1
116	0.1
117	0.13
118	0.15
119	0.19
120	0.18
121	0.21
122	0.23
123	0.29
124	0.36
125	0.37
126	0.38
127	0.38
128	0.45
129	0.49
130	0.49
131	0.51
132	0.49
133	0.52
134	0.55
135	0.56
136	0.51
137	0.44
138	0.43
139	0.41
140	0.46
141	0.43
142	0.42
143	0.41
144	0.41
145	0.47
146	0.48
147	0.51
148	0.44
149	0.45
150	0.41
151	0.39
152	0.38
153	0.31
154	0.28
155	0.18
156	0.16
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.14
161	0.17
162	0.22
163	0.3
164	0.34
165	0.39
166	0.41
167	0.42
168	0.43
169	0.43
170	0.45
171	0.45
172	0.42
173	0.39
174	0.36
175	0.34
176	0.33
177	0.3
178	0.22
179	0.15
180	0.15
181	0.14
182	0.13
183	0.14
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.1
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.11
197	0.19
198	0.2
199	0.2
200	0.2
201	0.22
202	0.26
203	0.26
204	0.25
205	0.21
206	0.21
207	0.2
208	0.19
209	0.16
210	0.12
211	0.12
212	0.1
213	0.06
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.09
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.11
242	0.11
243	0.16
244	0.17
245	0.19
246	0.19
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.17
251	0.15
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.13
256	0.12
257	0.13
258	0.12
259	0.1
260	0.09
261	0.08
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.14
275	0.14
276	0.17
277	0.19
278	0.18
279	0.17
280	0.18
281	0.17
282	0.15
283	0.19
284	0.18
285	0.21
286	0.22
287	0.23
288	0.23
289	0.25
290	0.27
291	0.23
292	0.22
293	0.18
294	0.18
295	0.17
296	0.16
297	0.14
298	0.12
299	0.1
300	0.11
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.1
312	0.11
313	0.13
314	0.11
315	0.12
316	0.14
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.22
321	0.21
322	0.22
323	0.22
324	0.21
325	0.21
326	0.2
327	0.19
328	0.11
329	0.11
330	0.12
331	0.14
332	0.14
333	0.13
334	0.14
335	0.16
336	0.18
337	0.22
338	0.24
339	0.25
340	0.31
341	0.33
342	0.39
343	0.39
344	0.38
345	0.34
346	0.31
347	0.3
348	0.24
349	0.23
350	0.2
351	0.17
352	0.16
353	0.15
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.15
358	0.15
359	0.17
360	0.18
361	0.21
362	0.21
363	0.19
364	0.16
365	0.18
366	0.16
367	0.16
368	0.16
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.15
373	0.11
374	0.1
375	0.09
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.11
382	0.12
383	0.17
384	0.21
385	0.27
386	0.31
387	0.34
388	0.39
389	0.46
390	0.53
391	0.53
392	0.53
393	0.46
394	0.4
395	0.37
396	0.29
397	0.21
398	0.12
399	0.09
400	0.06
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.08
428	0.07
429	0.07
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.08
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.08
441	0.07
442	0.08
443	0.08
444	0.09
445	0.11
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.11
450	0.12
451	0.14
452	0.14
453	0.13
454	0.14
455	0.13
456	0.12
457	0.11
458	0.1
459	0.08
460	0.09
461	0.08
462	0.08
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.11
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.15
476	0.15
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.16
481	0.18
482	0.18
483	0.17
484	0.17
485	0.15
486	0.15
487	0.15
488	0.16
489	0.21
490	0.27
491	0.29
492	0.31
493	0.32
494	0.34
495	0.41
496	0.42
497	0.37
498	0.38
499	0.35
500	0.31
501	0.31
502	0.29
503	0.22
504	0.18
505	0.17
506	0.11
507	0.09
508	0.1
509	0.12
510	0.12
511	0.15
512	0.16
513	0.15
514	0.16
515	0.18
516	0.2
517	0.17
518	0.16
519	0.14
520	0.12
521	0.11
522	0.09
523	0.09
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.06
536	0.09
537	0.1
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.1
542	0.11
543	0.1
544	0.08
545	0.06
546	0.06
547	0.08
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.07
556	0.08
557	0.07
558	0.08
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.07
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.09
571	0.09
572	0.1
573	0.11
574	0.12
575	0.14
576	0.16
577	0.21
578	0.23
579	0.26
580	0.31
581	0.36
582	0.35
583	0.36
584	0.37
585	0.33
586	0.32
587	0.33
588	0.26
589	0.2
590	0.22
591	0.18
592	0.16
593	0.17
594	0.16
595	0.12
596	0.15
597	0.15
598	0.12
599	0.11
600	0.13
601	0.14
602	0.15
603	0.15
604	0.14
605	0.12
606	0.14
607	0.14
608	0.12
609	0.11
610	0.12
611	0.12
612	0.13
613	0.14
614	0.13
615	0.13
616	0.14
617	0.11
618	0.16
619	0.17
620	0.16
621	0.16
622	0.17
623	0.17
624	0.19
625	0.19
626	0.14
627	0.16
628	0.17
629	0.18
630	0.21
631	0.21
632	0.19
633	0.21
634	0.27
635	0.26
636	0.26
637	0.26
638	0.27
639	0.28
640	0.31
641	0.32
642	0.27
643	0.23
644	0.21
645	0.19
646	0.15
647	0.15
648	0.11
649	0.08
650	0.08
651	0.08
652	0.09
653	0.09
654	0.1
655	0.08
656	0.08
657	0.1
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.1
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.15
668	0.15
669	0.16
670	0.16
671	0.16
672	0.16
673	0.2
674	0.2
675	0.2
676	0.22
677	0.24
678	0.23
679	0.23
680	0.22
681	0.17
682	0.19
683	0.2
684	0.22
685	0.22
686	0.24
687	0.32
688	0.36
689	0.42
690	0.43
691	0.46
692	0.41
693	0.46
694	0.47
695	0.41
696	0.44
697	0.38
698	0.36
699	0.31
700	0.3
701	0.23
702	0.18
703	0.16
704	0.09
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.06
709	0.07
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.07
715	0.07
716	0.1
717	0.11
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.13
722	0.12
723	0.14
724	0.11
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.08
735	0.08
736	0.1
737	0.12
738	0.11
739	0.17
740	0.2
741	0.2
742	0.2
743	0.21
744	0.21
745	0.2
746	0.2
747	0.14
748	0.11
749	0.11
750	0.1
751	0.08
752	0.08
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.05
757	0.06
758	0.06
759	0.08
760	0.09
761	0.1
762	0.15
763	0.2
764	0.23
765	0.24
766	0.24
767	0.23
768	0.23
769	0.23
770	0.19
771	0.15
772	0.14
773	0.12
774	0.12
775	0.11
776	0.1
777	0.09
778	0.08
779	0.06
780	0.06
781	0.05
782	0.08
783	0.08
784	0.08
785	0.1
786	0.11
787	0.11
788	0.13
789	0.18
790	0.19
791	0.25
792	0.33
793	0.42
794	0.45
795	0.48
796	0.47
797	0.44
798	0.44
799	0.42
800	0.38
801	0.36
802	0.35
803	0.33
804	0.32
805	0.3
806	0.26
807	0.25
808	0.21
809	0.14
810	0.13
811	0.15
812	0.22
813	0.28
814	0.29
815	0.27
816	0.27
817	0.28
818	0.29
819	0.31
820	0.28
821	0.23
822	0.23
823	0.24
824	0.25
825	0.27
826	0.26
827	0.21
828	0.2
829	0.19
830	0.22
831	0.22
832	0.21
833	0.19
834	0.21
835	0.2
836	0.19
837	0.21
838	0.16
839	0.15
840	0.15
841	0.13
842	0.1
843	0.1
844	0.08
845	0.08
846	0.08
847	0.08
848	0.08
849	0.09
850	0.1
851	0.14
852	0.14
853	0.12
854	0.15
855	0.15
856	0.16
857	0.15
858	0.15
859	0.11
860	0.12
861	0.12
862	0.11
863	0.1
864	0.1
865	0.1
866	0.11
867	0.13
868	0.13
869	0.15
870	0.15
871	0.21
872	0.23
873	0.26
874	0.32
875	0.3
876	0.33
877	0.37
878	0.38
879	0.34
880	0.35
881	0.35
882	0.29
883	0.29
884	0.24
885	0.2
886	0.17
887	0.15
888	0.13
889	0.09
890	0.08
891	0.07
892	0.08
893	0.07
894	0.08
895	0.09
896	0.1
897	0.15
898	0.2
899	0.27
900	0.33
901	0.39
902	0.46
903	0.48
904	0.49
905	0.47
906	0.48
907	0.48
908	0.45
909	0.45
910	0.44
911	0.46
912	0.49
913	0.47
914	0.44
915	0.46
916	0.46
917	0.44
918	0.43
919	0.46
920	0.48
921	0.53
922	0.52
923	0.46
924	0.47
925	0.43
926	0.4
927	0.38
928	0.37
929	0.32
930	0.33
931	0.36
932	0.37
933	0.4
934	0.4
935	0.37
936	0.36
937	0.34
938	0.31
939	0.25
940	0.22
941	0.21
942	0.21
943	0.18
944	0.15
945	0.15
946	0.16
947	0.16

A0A068SHI4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer