Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068S9L2

Protein Details
Accession A0A068S9L2    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52LESPVPLKRGRGRPRKNPIPNDDETHydrophilic
54-77PQVTEKVKRGRGRPRKESKTDGMIBasic
86-155ADPSSQPKRGPGRPRKHPRPEDSDPVTAPIKRGRGRPRKHPRPDDLENGQPPVKRPRGRPRKHPIPENQEBasic
202-247STTSTIKRPRGRPRKNPLPENQESEPTTAPIKRPRGRPRKHPIPEDHydrophilic
252-276SSSTTPIKRGRGRPRKYPRPDDSETHydrophilic
279-300NEHQPIKRGRGRPRKYPPADDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
35-44KRGRGRPRKN
59-70KVKRGRGRPRKE
92-201PKRGPGRPRKHPRPEDSDPVTAPIKRGRGRPRKHPRPDDLENGQPPVKRPRGRPRKHPIPENQESGSTIVKRGRGRPRKNPLPEGQESASTTVKRPRGRPRKHPLPEDGG
205-219STIKRPRGRPRKNPL
230-244APIKRPRGRPRKHPI
257-270PIKRGRGRPRKYPR
285-293KRGRGRPRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MTTSPILSHPNPTDQQPPLENEMPNESLESPVPLKRGRGRPRKNPIPNDDETAPQVTEKVKRGRGRPRKESKTDGMISSTDSDIHADPSSQPKRGPGRPRKHPRPEDSDPVTAPIKRGRGRPRKHPRPDDLENGQPPVKRPRGRPRKHPIPENQESGSTIVKRGRGRPRKNPLPEGQESASTTVKRPRGRPRKHPLPEDGGSTTSTIKRPRGRPRKNPLPENQESEPTTAPIKRPRGRPRKHPIPEDGESASSSTTPIKRGRGRPRKYPRPDDSETTENEHQPIKRGRGRPRKYPPADDDVNIKDELPDEYDTPTMINQEPQEQHPPSNQAAADHAGESTIPIQANEITNNETISDAQVNIKVEKDNDQDRSCIIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.43
4 0.44
5 0.44
6 0.47
7 0.44
8 0.39
9 0.41
10 0.37
11 0.33
12 0.3
13 0.23
14 0.2
15 0.2
16 0.21
17 0.18
18 0.19
19 0.23
20 0.23
21 0.29
22 0.37
23 0.47
24 0.54
25 0.63
26 0.7
27 0.77
28 0.86
29 0.9
30 0.91
31 0.91
32 0.88
33 0.85
34 0.78
35 0.74
36 0.64
37 0.56
38 0.48
39 0.41
40 0.33
41 0.25
42 0.23
43 0.21
44 0.25
45 0.3
46 0.36
47 0.41
48 0.48
49 0.56
50 0.65
51 0.72
52 0.77
53 0.8
54 0.83
55 0.85
56 0.86
57 0.85
58 0.8
59 0.78
60 0.71
61 0.62
62 0.53
63 0.44
64 0.38
65 0.32
66 0.26
67 0.17
68 0.14
69 0.14
70 0.12
71 0.14
72 0.12
73 0.11
74 0.13
75 0.23
76 0.26
77 0.26
78 0.27
79 0.32
80 0.4
81 0.48
82 0.57
83 0.57
84 0.64
85 0.73
86 0.84
87 0.87
88 0.9
89 0.91
90 0.88
91 0.86
92 0.83
93 0.81
94 0.75
95 0.68
96 0.57
97 0.51
98 0.45
99 0.37
100 0.32
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.37
105 0.45
106 0.53
107 0.58
108 0.67
109 0.74
110 0.78
111 0.85
112 0.86
113 0.83
114 0.81
115 0.81
116 0.77
117 0.7
118 0.66
119 0.57
120 0.51
121 0.45
122 0.38
123 0.35
124 0.36
125 0.4
126 0.38
127 0.45
128 0.54
129 0.63
130 0.68
131 0.76
132 0.78
133 0.81
134 0.82
135 0.82
136 0.8
137 0.79
138 0.77
139 0.71
140 0.61
141 0.51
142 0.44
143 0.37
144 0.3
145 0.21
146 0.17
147 0.16
148 0.2
149 0.22
150 0.29
151 0.39
152 0.47
153 0.54
154 0.62
155 0.7
156 0.75
157 0.79
158 0.77
159 0.72
160 0.69
161 0.63
162 0.57
163 0.48
164 0.39
165 0.34
166 0.29
167 0.25
168 0.18
169 0.18
170 0.2
171 0.25
172 0.27
173 0.33
174 0.42
175 0.51
176 0.58
177 0.67
178 0.71
179 0.77
180 0.79
181 0.78
182 0.72
183 0.68
184 0.62
185 0.54
186 0.45
187 0.35
188 0.29
189 0.24
190 0.21
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.23
195 0.29
196 0.37
197 0.48
198 0.58
199 0.66
200 0.73
201 0.8
202 0.85
203 0.86
204 0.85
205 0.82
206 0.8
207 0.74
208 0.69
209 0.6
210 0.53
211 0.46
212 0.4
213 0.32
214 0.24
215 0.23
216 0.19
217 0.21
218 0.25
219 0.33
220 0.37
221 0.47
222 0.57
223 0.65
224 0.7
225 0.77
226 0.8
227 0.82
228 0.83
229 0.8
230 0.76
231 0.73
232 0.69
233 0.61
234 0.52
235 0.42
236 0.34
237 0.28
238 0.21
239 0.13
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.2
245 0.28
246 0.35
247 0.45
248 0.56
249 0.63
250 0.67
251 0.73
252 0.81
253 0.84
254 0.86
255 0.86
256 0.83
257 0.8
258 0.79
259 0.73
260 0.69
261 0.62
262 0.55
263 0.51
264 0.47
265 0.39
266 0.36
267 0.35
268 0.29
269 0.32
270 0.37
271 0.38
272 0.43
273 0.5
274 0.59
275 0.66
276 0.72
277 0.75
278 0.79
279 0.82
280 0.8
281 0.81
282 0.76
283 0.73
284 0.7
285 0.6
286 0.55
287 0.47
288 0.43
289 0.34
290 0.29
291 0.21
292 0.19
293 0.19
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.13
304 0.16
305 0.15
306 0.22
307 0.25
308 0.28
309 0.36
310 0.35
311 0.37
312 0.38
313 0.41
314 0.36
315 0.38
316 0.34
317 0.27
318 0.27
319 0.28
320 0.24
321 0.2
322 0.18
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.14
332 0.16
333 0.17
334 0.19
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.13
344 0.15
345 0.18
346 0.21
347 0.21
348 0.23
349 0.23
350 0.23
351 0.29
352 0.34
353 0.38
354 0.43
355 0.44
356 0.43