FuNGI

Q6CB48

Protein Details

Accession

Q6CB48

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-38	VVKPKGPPSGPKPQYHKKKTPNNTGLGKT	Hydrophilic
675-700	AAQGTKKHFKGKKVKARNARSTNDNY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
16-28	PPSGPKPQYHKKK
680-692	KKHFKGKKVKARN

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13, cyto 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR030378 G_CP_dom IPR043358 GNL1-like IPR006073 GTP-bd IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0022625 C:cytosolic large ribosomal subunit GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly GO:0000054 P:ribosomal subunit export from nucleus
KEGG	yli:YALI0C21956g -
Pfam	View protein in Pfam PF01926 MMR_HSR1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51721 G_CP
CDD	cd01857 HSR1_MMR1

Amino Acid Sequences

MNKTPLHSDVVKPKGPPSGPKPQYHKKKTPNNTGLGKTLMNRKAKEGRVYVTDSGETRYTTEENKEAGWVKLRSVTQEKALDEFLATAELADTDFTAERRAHTTIINTHDNSNPYLLTKAEAEKLREKQLENAGKLTVPRRPVWTEDTTSTQLDREEKEAFLRWRRSLAELQENQDLLLTPFERNIEVWRQLWRVCERSDLVVQIVDGRNPLQFRSEDLELYVKEIDPRKRNLLLVNKADLMTEEQRQIWADYFKKHGIRYAFFSAAKAKEELEALEAREEAQATKKPAKKPVKNDDSDDEVSALERELAQFVPKEESEDEDEEEDEEDEEDDVEPSVTEIQEAVPANAHEEAKATDESKPDTENMHYSVMATPTSILSVDQLEQLFLAEAPAPMQPAPAGQEPRLNIGLVGYPNVGKSSTINALVGSNKVSVSATPGKTKHFQTILLSPKVMLCDCPGLVFPNFGNTNGELVCNGVLPIDQLREFTGPATLVSRRVPKYFLESVYGIKIYTRPVDEGGLGYPTATEFLVAYAKARGYMRGASQGNPDESRAARYVLKDYVNGKLLYCHPPPDYREDLDDEDAGILFNKGLYTLNQLPPSRQKQLLDAAVHSGIAREDFDLERDIDKLSFSQHATGAGGFGGKGFSSLGEHLDADYFGKNSSGGNMSTPFHQRGAAQGTKKHFKGKKVKARNARSTNDNYGGTYGDII

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.51
3	0.53
4	0.5
5	0.54
6	0.58
7	0.65
8	0.71
9	0.73
10	0.81
11	0.83
12	0.86
13	0.85
14	0.88
15	0.9
16	0.92
17	0.9
18	0.87
19	0.85
20	0.78
21	0.71
22	0.64
23	0.55
24	0.49
25	0.5
26	0.48
27	0.48
28	0.45
29	0.5
30	0.55
31	0.59
32	0.63
33	0.58
34	0.55
35	0.53
36	0.57
37	0.52
38	0.45
39	0.42
40	0.34
41	0.33
42	0.3
43	0.25
44	0.2
45	0.21
46	0.21
47	0.22
48	0.26
49	0.26
50	0.26
51	0.26
52	0.29
53	0.28
54	0.29
55	0.33
56	0.29
57	0.27
58	0.32
59	0.32
60	0.34
61	0.38
62	0.39
63	0.38
64	0.43
65	0.42
66	0.38
67	0.38
68	0.31
69	0.25
70	0.23
71	0.16
72	0.11
73	0.1
74	0.07
75	0.07
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.05
80	0.06
81	0.08
82	0.08
83	0.11
84	0.12
85	0.14
86	0.18
87	0.19
88	0.19
89	0.2
90	0.25
91	0.27
92	0.33
93	0.38
94	0.35
95	0.36
96	0.39
97	0.39
98	0.35
99	0.31
100	0.25
101	0.2
102	0.2
103	0.17
104	0.15
105	0.16
106	0.17
107	0.22
108	0.25
109	0.29
110	0.35
111	0.39
112	0.46
113	0.47
114	0.46
115	0.46
116	0.52
117	0.56
118	0.5
119	0.47
120	0.4
121	0.37
122	0.39
123	0.36
124	0.3
125	0.26
126	0.26
127	0.3
128	0.32
129	0.35
130	0.38
131	0.41
132	0.41
133	0.39
134	0.43
135	0.4
136	0.38
137	0.34
138	0.29
139	0.26
140	0.25
141	0.24
142	0.22
143	0.21
144	0.2
145	0.22
146	0.28
147	0.31
148	0.36
149	0.4
150	0.38
151	0.4
152	0.42
153	0.43
154	0.43
155	0.43
156	0.45
157	0.42
158	0.44
159	0.44
160	0.42
161	0.37
162	0.32
163	0.26
164	0.16
165	0.16
166	0.14
167	0.1
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.12
172	0.16
173	0.19
174	0.21
175	0.22
176	0.26
177	0.27
178	0.28
179	0.34
180	0.35
181	0.33
182	0.31
183	0.34
184	0.31
185	0.32
186	0.32
187	0.27
188	0.23
189	0.19
190	0.18
191	0.19
192	0.18
193	0.14
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.13
200	0.12
201	0.15
202	0.2
203	0.2
204	0.18
205	0.19
206	0.22
207	0.18
208	0.2
209	0.17
210	0.12
211	0.15
212	0.22
213	0.28
214	0.3
215	0.35
216	0.38
217	0.4
218	0.42
219	0.45
220	0.48
221	0.49
222	0.47
223	0.45
224	0.41
225	0.38
226	0.36
227	0.3
228	0.25
229	0.19
230	0.17
231	0.16
232	0.15
233	0.16
234	0.17
235	0.17
236	0.15
237	0.18
238	0.18
239	0.19
240	0.23
241	0.27
242	0.3
243	0.29
244	0.32
245	0.31
246	0.31
247	0.34
248	0.34
249	0.33
250	0.3
251	0.3
252	0.3
253	0.27
254	0.27
255	0.22
256	0.17
257	0.15
258	0.15
259	0.14
260	0.12
261	0.12
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.08
269	0.1
270	0.13
271	0.17
272	0.25
273	0.3
274	0.34
275	0.44
276	0.54
277	0.58
278	0.64
279	0.71
280	0.73
281	0.7
282	0.7
283	0.63
284	0.59
285	0.52
286	0.43
287	0.32
288	0.22
289	0.19
290	0.16
291	0.13
292	0.06
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.12
303	0.11
304	0.13
305	0.16
306	0.16
307	0.16
308	0.14
309	0.14
310	0.12
311	0.12
312	0.1
313	0.07
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.09
335	0.11
336	0.1
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.1
342	0.1
343	0.1
344	0.12
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.13
352	0.14
353	0.14
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.13
358	0.11
359	0.09
360	0.07
361	0.06
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.04
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.08
386	0.11
387	0.13
388	0.13
389	0.16
390	0.17
391	0.2
392	0.2
393	0.17
394	0.13
395	0.12
396	0.13
397	0.1
398	0.11
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.06
405	0.07
406	0.09
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.12
412	0.13
413	0.13
414	0.1
415	0.09
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.07
420	0.12
421	0.19
422	0.19
423	0.24
424	0.25
425	0.28
426	0.33
427	0.35
428	0.35
429	0.29
430	0.3
431	0.28
432	0.34
433	0.38
434	0.35
435	0.33
436	0.27
437	0.27
438	0.26
439	0.23
440	0.16
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.13
449	0.11
450	0.15
451	0.15
452	0.15
453	0.17
454	0.15
455	0.16
456	0.15
457	0.15
458	0.09
459	0.09
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.05
466	0.06
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.11
478	0.11
479	0.13
480	0.16
481	0.23
482	0.25
483	0.26
484	0.27
485	0.26
486	0.32
487	0.34
488	0.32
489	0.29
490	0.27
491	0.27
492	0.28
493	0.27
494	0.19
495	0.15
496	0.15
497	0.14
498	0.16
499	0.16
500	0.15
501	0.16
502	0.17
503	0.17
504	0.16
505	0.14
506	0.12
507	0.11
508	0.09
509	0.08
510	0.07
511	0.07
512	0.06
513	0.05
514	0.04
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.08
519	0.09
520	0.09
521	0.12
522	0.13
523	0.13
524	0.14
525	0.17
526	0.18
527	0.25
528	0.26
529	0.25
530	0.3
531	0.32
532	0.33
533	0.31
534	0.3
535	0.25
536	0.24
537	0.26
538	0.22
539	0.21
540	0.2
541	0.21
542	0.24
543	0.26
544	0.27
545	0.27
546	0.27
547	0.3
548	0.32
549	0.3
550	0.26
551	0.26
552	0.29
553	0.32
554	0.31
555	0.3
556	0.29
557	0.34
558	0.37
559	0.4
560	0.41
561	0.36
562	0.38
563	0.38
564	0.38
565	0.35
566	0.32
567	0.25
568	0.2
569	0.18
570	0.15
571	0.11
572	0.08
573	0.06
574	0.06
575	0.05
576	0.05
577	0.07
578	0.08
579	0.15
580	0.22
581	0.27
582	0.34
583	0.34
584	0.39
585	0.47
586	0.53
587	0.52
588	0.5
589	0.46
590	0.44
591	0.51
592	0.52
593	0.45
594	0.39
595	0.36
596	0.32
597	0.31
598	0.26
599	0.19
600	0.12
601	0.11
602	0.1
603	0.08
604	0.1
605	0.1
606	0.12
607	0.14
608	0.15
609	0.15
610	0.15
611	0.16
612	0.14
613	0.14
614	0.13
615	0.14
616	0.17
617	0.17
618	0.19
619	0.18
620	0.19
621	0.2
622	0.19
623	0.16
624	0.12
625	0.11
626	0.08
627	0.08
628	0.07
629	0.06
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.09
634	0.1
635	0.12
636	0.12
637	0.13
638	0.13
639	0.14
640	0.14
641	0.12
642	0.13
643	0.12
644	0.1
645	0.11
646	0.11
647	0.1
648	0.13
649	0.15
650	0.14
651	0.16
652	0.19
653	0.2
654	0.25
655	0.3
656	0.29
657	0.27
658	0.28
659	0.25
660	0.29
661	0.36
662	0.38
663	0.38
664	0.42
665	0.49
666	0.57
667	0.59
668	0.63
669	0.6
670	0.63
671	0.69
672	0.74
673	0.77
674	0.79
675	0.87
676	0.87
677	0.93
678	0.93
679	0.91
680	0.86
681	0.83
682	0.8
683	0.77
684	0.73
685	0.63
686	0.53
687	0.45
688	0.4

Q6CB48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer