Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6W2

Protein Details
Accession Q6C6W2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50SSGFRHQKYKRLDYPKAPTLLHydrophilic
63-86TPPETFSVKRQGRNKAGRKQTTEMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
856-861KKGARK
Subcellular Location(s) mito 19, mito_nucl 12.833, cyto_mito 11.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009027  Ribosomal_L9/RNase_H1_N  
IPR011320  RNase_H1_N  
IPR037056  RNase_H1_N_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
KEGG yli:YALI0E05775g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01693  Cauli_VI  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
Amino Acid Sequences MSGFTTFHAMIRLRPLTIPIRIFIRNVSLSSGFRHQKYKRLDYPKAPTLLRDPPPEVRAVPQTPPETFSVKRQGRNKAGRKQTTEMYTFVSQKDALEFELAPSAVLRQTIEKRLASLSQEQRELKAEMETQIARAGGVFAVRKGLVPGIYLHWDKVVRETGKMSQSEWKKLETVQEAQEWMGMYHVSPEDVCYDPFASRISFLEHLLSDEAKLEPEKKRWFAVKKGRQPGVYSNWEEAADQVIGYSGAVYASFSTDKQACKFLGMSKKEYFEQLKQDPTETDKEMIRQKRLADEQLQAYKRERDRIKFSQYAEAKMYIAPPDGGSPNRVKQLLTKCLQIQAEINKMVSLDKMRKFHMQDIFDELDQMTEEEKQECLESLDNSHLVDAYNVFNNPEYWDFYREYLLTKENYLGYESTTCSKGRGDTLFKSEFRECGTTKSTTEELAATEVSQWRQKNETSVENDTVKLDTSSEGFFSSTQELSERTEDTVDKKLTQRQKRDSKRATLKALDKSISENIAAPDDVAIGIKENGTVRNQAKKTTFENWLDGFSEAEKHKPASKITLTGHFKNATPQMRREMLKARHETKMELVARTADPSTTVTLDMLAGLTCNCGEPVFVRNRDSSAAAPLIPRRQLYLSTNRYKNLHGDSGWTNHTFKHKQADFDINTTSFRDHHDHKLLRAFETNWRIMFNSLSKQLGPIAANHAGRYDDVEANVVYTDGSHNALPSPLLYNAGAAGWGVHFEKGLMPDACGRVPGEQTPGRAEILAMVMAIRIISRHMTYRSQKWEIRTDSLWTLRLLEHGWEGLEPTERMRSHPNYYLIKRLRALLYENQNISLRFIRSQHMHSGARIADKLAKKGARKKYSETAEQYGTDDEDIFIHDPALSAFFPSATVPSNLRSSMWTDNKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.33
4 0.39
5 0.38
6 0.32
7 0.35
8 0.35
9 0.36
10 0.32
11 0.34
12 0.3
13 0.28
14 0.3
15 0.29
16 0.28
17 0.31
18 0.38
19 0.37
20 0.38
21 0.47
22 0.46
23 0.52
24 0.6
25 0.66
26 0.67
27 0.71
28 0.77
29 0.76
30 0.82
31 0.81
32 0.78
33 0.68
34 0.61
35 0.58
36 0.59
37 0.55
38 0.52
39 0.49
40 0.5
41 0.51
42 0.51
43 0.45
44 0.4
45 0.42
46 0.39
47 0.39
48 0.4
49 0.42
50 0.4
51 0.41
52 0.4
53 0.36
54 0.35
55 0.38
56 0.42
57 0.44
58 0.51
59 0.56
60 0.63
61 0.69
62 0.78
63 0.8
64 0.79
65 0.84
66 0.84
67 0.84
68 0.78
69 0.75
70 0.71
71 0.64
72 0.55
73 0.5
74 0.46
75 0.41
76 0.37
77 0.33
78 0.26
79 0.24
80 0.25
81 0.2
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.14
86 0.17
87 0.16
88 0.13
89 0.12
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.15
95 0.21
96 0.27
97 0.32
98 0.31
99 0.32
100 0.34
101 0.36
102 0.34
103 0.38
104 0.4
105 0.4
106 0.47
107 0.46
108 0.45
109 0.46
110 0.43
111 0.34
112 0.29
113 0.26
114 0.21
115 0.25
116 0.23
117 0.2
118 0.2
119 0.19
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.08
124 0.11
125 0.11
126 0.09
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.14
135 0.14
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.25
143 0.3
144 0.26
145 0.27
146 0.3
147 0.33
148 0.37
149 0.38
150 0.35
151 0.35
152 0.39
153 0.46
154 0.44
155 0.4
156 0.35
157 0.37
158 0.42
159 0.39
160 0.38
161 0.33
162 0.33
163 0.32
164 0.3
165 0.3
166 0.23
167 0.18
168 0.14
169 0.1
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.12
180 0.14
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.17
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.16
201 0.19
202 0.27
203 0.34
204 0.35
205 0.4
206 0.48
207 0.52
208 0.57
209 0.64
210 0.66
211 0.69
212 0.76
213 0.76
214 0.69
215 0.67
216 0.64
217 0.6
218 0.57
219 0.49
220 0.41
221 0.38
222 0.36
223 0.32
224 0.25
225 0.2
226 0.13
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.11
242 0.14
243 0.16
244 0.18
245 0.21
246 0.2
247 0.21
248 0.22
249 0.25
250 0.32
251 0.33
252 0.37
253 0.37
254 0.39
255 0.38
256 0.42
257 0.39
258 0.35
259 0.39
260 0.37
261 0.4
262 0.38
263 0.39
264 0.35
265 0.34
266 0.34
267 0.28
268 0.26
269 0.22
270 0.26
271 0.32
272 0.37
273 0.36
274 0.35
275 0.35
276 0.39
277 0.42
278 0.42
279 0.37
280 0.36
281 0.37
282 0.42
283 0.42
284 0.37
285 0.37
286 0.39
287 0.38
288 0.43
289 0.43
290 0.42
291 0.49
292 0.54
293 0.59
294 0.57
295 0.57
296 0.57
297 0.53
298 0.5
299 0.44
300 0.37
301 0.29
302 0.25
303 0.24
304 0.15
305 0.14
306 0.11
307 0.09
308 0.1
309 0.12
310 0.12
311 0.14
312 0.17
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.21
317 0.26
318 0.34
319 0.39
320 0.37
321 0.37
322 0.35
323 0.39
324 0.39
325 0.33
326 0.28
327 0.24
328 0.26
329 0.24
330 0.23
331 0.18
332 0.18
333 0.17
334 0.15
335 0.15
336 0.18
337 0.22
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.35
342 0.4
343 0.43
344 0.38
345 0.34
346 0.38
347 0.37
348 0.31
349 0.29
350 0.22
351 0.15
352 0.13
353 0.12
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.13
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.18
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.16
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.14
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.12
407 0.12
408 0.14
409 0.17
410 0.2
411 0.2
412 0.26
413 0.29
414 0.29
415 0.32
416 0.29
417 0.26
418 0.24
419 0.25
420 0.2
421 0.2
422 0.23
423 0.2
424 0.2
425 0.22
426 0.21
427 0.17
428 0.17
429 0.14
430 0.11
431 0.1
432 0.1
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.09
437 0.13
438 0.13
439 0.13
440 0.16
441 0.16
442 0.19
443 0.21
444 0.25
445 0.26
446 0.28
447 0.3
448 0.28
449 0.28
450 0.24
451 0.21
452 0.16
453 0.12
454 0.09
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.1
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.13
475 0.19
476 0.18
477 0.19
478 0.21
479 0.27
480 0.35
481 0.43
482 0.49
483 0.53
484 0.63
485 0.7
486 0.78
487 0.77
488 0.78
489 0.8
490 0.77
491 0.72
492 0.68
493 0.64
494 0.59
495 0.56
496 0.47
497 0.37
498 0.34
499 0.3
500 0.24
501 0.19
502 0.15
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.09
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.05
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.06
516 0.06
517 0.08
518 0.09
519 0.15
520 0.17
521 0.25
522 0.26
523 0.3
524 0.32
525 0.34
526 0.37
527 0.36
528 0.4
529 0.33
530 0.36
531 0.32
532 0.31
533 0.28
534 0.24
535 0.2
536 0.13
537 0.16
538 0.12
539 0.14
540 0.14
541 0.14
542 0.18
543 0.21
544 0.21
545 0.24
546 0.25
547 0.29
548 0.3
549 0.38
550 0.39
551 0.38
552 0.41
553 0.35
554 0.34
555 0.33
556 0.38
557 0.36
558 0.34
559 0.35
560 0.37
561 0.41
562 0.42
563 0.4
564 0.43
565 0.43
566 0.48
567 0.53
568 0.51
569 0.51
570 0.51
571 0.48
572 0.41
573 0.43
574 0.36
575 0.29
576 0.26
577 0.23
578 0.22
579 0.23
580 0.21
581 0.11
582 0.1
583 0.11
584 0.12
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.07
591 0.06
592 0.05
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.06
602 0.12
603 0.19
604 0.21
605 0.23
606 0.24
607 0.25
608 0.27
609 0.27
610 0.22
611 0.19
612 0.17
613 0.16
614 0.17
615 0.19
616 0.22
617 0.22
618 0.22
619 0.21
620 0.21
621 0.24
622 0.27
623 0.34
624 0.39
625 0.45
626 0.48
627 0.49
628 0.49
629 0.47
630 0.47
631 0.42
632 0.37
633 0.28
634 0.29
635 0.29
636 0.31
637 0.32
638 0.29
639 0.25
640 0.24
641 0.32
642 0.3
643 0.3
644 0.37
645 0.36
646 0.38
647 0.42
648 0.49
649 0.42
650 0.42
651 0.43
652 0.33
653 0.32
654 0.29
655 0.26
656 0.17
657 0.19
658 0.22
659 0.23
660 0.3
661 0.38
662 0.4
663 0.42
664 0.49
665 0.46
666 0.43
667 0.43
668 0.37
669 0.35
670 0.39
671 0.38
672 0.32
673 0.31
674 0.3
675 0.27
676 0.28
677 0.23
678 0.22
679 0.22
680 0.23
681 0.22
682 0.22
683 0.22
684 0.22
685 0.19
686 0.16
687 0.19
688 0.23
689 0.23
690 0.23
691 0.22
692 0.2
693 0.19
694 0.2
695 0.19
696 0.14
697 0.14
698 0.16
699 0.15
700 0.14
701 0.14
702 0.11
703 0.07
704 0.06
705 0.07
706 0.07
707 0.08
708 0.08
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.09
713 0.09
714 0.11
715 0.1
716 0.12
717 0.11
718 0.11
719 0.11
720 0.11
721 0.1
722 0.07
723 0.07
724 0.04
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.09
731 0.11
732 0.17
733 0.15
734 0.16
735 0.2
736 0.22
737 0.22
738 0.21
739 0.2
740 0.16
741 0.18
742 0.19
743 0.22
744 0.22
745 0.24
746 0.26
747 0.27
748 0.25
749 0.23
750 0.21
751 0.16
752 0.14
753 0.12
754 0.09
755 0.07
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.05
760 0.04
761 0.05
762 0.08
763 0.09
764 0.14
765 0.18
766 0.27
767 0.34
768 0.42
769 0.49
770 0.55
771 0.57
772 0.58
773 0.64
774 0.61
775 0.6
776 0.53
777 0.49
778 0.47
779 0.47
780 0.43
781 0.34
782 0.31
783 0.26
784 0.26
785 0.23
786 0.18
787 0.16
788 0.14
789 0.14
790 0.12
791 0.13
792 0.12
793 0.15
794 0.13
795 0.14
796 0.21
797 0.21
798 0.24
799 0.32
800 0.36
801 0.39
802 0.46
803 0.51
804 0.53
805 0.56
806 0.64
807 0.6
808 0.61
809 0.56
810 0.54
811 0.49
812 0.42
813 0.44
814 0.43
815 0.46
816 0.48
817 0.47
818 0.45
819 0.45
820 0.42
821 0.41
822 0.37
823 0.31
824 0.27
825 0.28
826 0.32
827 0.34
828 0.37
829 0.41
830 0.44
831 0.43
832 0.4
833 0.44
834 0.4
835 0.4
836 0.36
837 0.31
838 0.31
839 0.33
840 0.36
841 0.39
842 0.42
843 0.46
844 0.55
845 0.63
846 0.65
847 0.67
848 0.71
849 0.73
850 0.74
851 0.76
852 0.73
853 0.68
854 0.62
855 0.58
856 0.52
857 0.44
858 0.37
859 0.28
860 0.22
861 0.16
862 0.13
863 0.14
864 0.14
865 0.12
866 0.11
867 0.11
868 0.1
869 0.11
870 0.13
871 0.1
872 0.1
873 0.1
874 0.1
875 0.11
876 0.11
877 0.13
878 0.13
879 0.15
880 0.16
881 0.19
882 0.23
883 0.23
884 0.23
885 0.23
886 0.25
887 0.33