FuNGI

A0A068S7H8

Protein Details

Accession

A0A068S7H8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-73	GALPPRLIQRRPPPPRQQQQPINIPYNDFQLMSCKKRGKHHVMDFKTNKP	Hydrophilic
76-96	FNNFARPVKLQRKDNNNHGFG	Hydrophilic
565-590	LTTKEFLMHFRKRIKKNEKNREIITG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
436-479	KTAVPPKKKGPAPSSKTAAIKKSHASKIKKEGLSRPIGRPGSPS
509-515	APVKKRK
575-583	RKRIKKNEK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSIYNTSHSRRAGAARSPNTQHAGALPPRLIQRRPPPPRQQQQPINIPYNDFQLMSCKKRGKHHVMDFKTNKPVDFNNFARPVKLQRKDNNNHGFGRMHRMANGGNGTPNASQGSSSNSAAGSSQDAAGSSSQQQQQHQQQHGPKTGADTSLIAPLGGATRNKQMLFKKRTKQIYLAKEDARELKEQEHKPWILEDYDGQNSYTGSYEGSQRSDYVFFVVSGNDFKVVPVDRWYKFQQKRNVATFTLEEAEEQLKNLQKREQSRWMMLDRNKAMADAESQSQSSQGAKSRFKKTDHGESFGGGSDDEGGGSGRRDRHDSDIDDLDFDDVFQDDEEGGGEHEMEDEDTRESKERLKRETKGYAPGGDEEAVETMDDDSNRLTSEGKQIRKLVRTLEKNGAYESDEDKDPYASSEEEMESDAEKEESKSEAENSQQKKTAVPPKKKGPAPSSKTAAIKKSHASKIKKEGLSRPIGRPGSPSLQQGKASPPPAQRATSPIHQRMREISPGAAPVKKRKSDEGDHGETKRPKSTAASPPPFASATSPGGGDDSLITEDEVIQTLRGKKLTTKEFLMHFRKRIKKNEKNREIITGLLKKVARHNTSEQDPTKRVLELRPDLQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.51
3	0.57
4	0.59
5	0.6
6	0.58
7	0.52
8	0.44
9	0.37
10	0.39
11	0.35
12	0.35
13	0.31
14	0.3
15	0.37
16	0.43
17	0.42
18	0.44
19	0.51
20	0.57
21	0.66
22	0.72
23	0.76
24	0.81
25	0.88
26	0.89
27	0.9
28	0.88
29	0.88
30	0.88
31	0.84
32	0.8
33	0.71
34	0.64
35	0.55
36	0.5
37	0.42
38	0.32
39	0.25
40	0.27
41	0.33
42	0.35
43	0.41
44	0.43
45	0.47
46	0.56
47	0.67
48	0.67
49	0.71
50	0.77
51	0.8
52	0.8
53	0.86
54	0.81
55	0.77
56	0.76
57	0.67
58	0.57
59	0.5
60	0.49
61	0.45
62	0.48
63	0.45
64	0.45
65	0.51
66	0.5
67	0.48
68	0.46
69	0.48
70	0.51
71	0.56
72	0.56
73	0.57
74	0.68
75	0.73
76	0.81
77	0.8
78	0.75
79	0.69
80	0.63
81	0.58
82	0.49
83	0.51
84	0.46
85	0.37
86	0.32
87	0.33
88	0.3
89	0.32
90	0.33
91	0.24
92	0.21
93	0.2
94	0.22
95	0.2
96	0.2
97	0.17
98	0.14
99	0.13
100	0.12
101	0.18
102	0.19
103	0.19
104	0.18
105	0.17
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.13
110	0.1
111	0.1
112	0.09
113	0.09
114	0.1
115	0.1
116	0.11
117	0.12
118	0.17
119	0.22
120	0.25
121	0.27
122	0.34
123	0.43
124	0.5
125	0.52
126	0.53
127	0.55
128	0.59
129	0.62
130	0.55
131	0.46
132	0.42
133	0.4
134	0.34
135	0.28
136	0.22
137	0.17
138	0.19
139	0.19
140	0.14
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.16
148	0.2
149	0.2
150	0.26
151	0.32
152	0.4
153	0.48
154	0.56
155	0.59
156	0.65
157	0.72
158	0.7
159	0.71
160	0.7
161	0.71
162	0.69
163	0.66
164	0.61
165	0.54
166	0.53
167	0.49
168	0.42
169	0.35
170	0.29
171	0.29
172	0.36
173	0.37
174	0.39
175	0.41
176	0.39
177	0.37
178	0.38
179	0.33
180	0.25
181	0.23
182	0.21
183	0.17
184	0.19
185	0.19
186	0.18
187	0.16
188	0.15
189	0.15
190	0.13
191	0.09
192	0.07
193	0.08
194	0.12
195	0.14
196	0.15
197	0.15
198	0.15
199	0.17
200	0.17
201	0.16
202	0.13
203	0.12
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.1
214	0.11
215	0.11
216	0.16
217	0.22
218	0.22
219	0.27
220	0.32
221	0.39
222	0.45
223	0.53
224	0.56
225	0.59
226	0.65
227	0.66
228	0.65
229	0.55
230	0.5
231	0.43
232	0.36
233	0.28
234	0.2
235	0.15
236	0.12
237	0.13
238	0.11
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.15
243	0.17
244	0.2
245	0.23
246	0.29
247	0.36
248	0.43
249	0.43
250	0.44
251	0.46
252	0.45
253	0.48
254	0.45
255	0.46
256	0.37
257	0.36
258	0.33
259	0.29
260	0.26
261	0.19
262	0.18
263	0.12
264	0.12
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.13
273	0.18
274	0.25
275	0.32
276	0.39
277	0.44
278	0.46
279	0.51
280	0.51
281	0.57
282	0.53
283	0.5
284	0.43
285	0.38
286	0.36
287	0.29
288	0.24
289	0.12
290	0.09
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.07
299	0.09
300	0.1
301	0.13
302	0.14
303	0.19
304	0.24
305	0.25
306	0.26
307	0.26
308	0.25
309	0.23
310	0.21
311	0.17
312	0.12
313	0.1
314	0.07
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.03
320	0.03
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.03
325	0.04
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.09
336	0.1
337	0.16
338	0.22
339	0.27
340	0.34
341	0.41
342	0.45
343	0.5
344	0.56
345	0.53
346	0.54
347	0.51
348	0.45
349	0.39
350	0.35
351	0.3
352	0.23
353	0.19
354	0.12
355	0.1
356	0.08
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.18
370	0.24
371	0.27
372	0.31
373	0.36
374	0.41
375	0.43
376	0.44
377	0.41
378	0.43
379	0.46
380	0.47
381	0.5
382	0.48
383	0.45
384	0.44
385	0.38
386	0.3
387	0.26
388	0.23
389	0.18
390	0.15
391	0.15
392	0.15
393	0.14
394	0.13
395	0.12
396	0.12
397	0.1
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.08
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.12
415	0.14
416	0.19
417	0.26
418	0.29
419	0.32
420	0.36
421	0.35
422	0.35
423	0.41
424	0.46
425	0.48
426	0.54
427	0.58
428	0.64
429	0.72
430	0.74
431	0.74
432	0.72
433	0.73
434	0.7
435	0.69
436	0.64
437	0.6
438	0.63
439	0.59
440	0.56
441	0.49
442	0.46
443	0.45
444	0.49
445	0.52
446	0.55
447	0.56
448	0.58
449	0.65
450	0.7
451	0.68
452	0.65
453	0.65
454	0.64
455	0.67
456	0.63
457	0.57
458	0.57
459	0.54
460	0.49
461	0.45
462	0.42
463	0.38
464	0.37
465	0.38
466	0.35
467	0.37
468	0.38
469	0.37
470	0.38
471	0.38
472	0.38
473	0.39
474	0.38
475	0.41
476	0.44
477	0.44
478	0.38
479	0.37
480	0.4
481	0.42
482	0.47
483	0.48
484	0.52
485	0.51
486	0.52
487	0.53
488	0.52
489	0.49
490	0.42
491	0.34
492	0.29
493	0.32
494	0.33
495	0.31
496	0.3
497	0.35
498	0.42
499	0.47
500	0.48
501	0.51
502	0.56
503	0.6
504	0.67
505	0.66
506	0.64
507	0.65
508	0.64
509	0.65
510	0.63
511	0.59
512	0.54
513	0.46
514	0.4
515	0.4
516	0.46
517	0.48
518	0.54
519	0.57
520	0.53
521	0.54
522	0.55
523	0.5
524	0.41
525	0.33
526	0.27
527	0.23
528	0.22
529	0.21
530	0.18
531	0.18
532	0.17
533	0.14
534	0.1
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.08
540	0.09
541	0.09
542	0.1
543	0.08
544	0.08
545	0.13
546	0.18
547	0.21
548	0.23
549	0.24
550	0.29
551	0.38
552	0.45
553	0.46
554	0.46
555	0.48
556	0.52
557	0.6
558	0.64
559	0.62
560	0.62
561	0.66
562	0.71
563	0.75
564	0.79
565	0.81
566	0.82
567	0.86
568	0.9
569	0.9
570	0.89
571	0.83
572	0.8
573	0.7
574	0.64
575	0.62
576	0.57
577	0.48
578	0.46
579	0.44
580	0.4
581	0.47
582	0.52
583	0.47
584	0.46
585	0.53
586	0.55
587	0.59
588	0.66
589	0.63
590	0.62
591	0.61
592	0.58
593	0.53
594	0.48
595	0.45
596	0.42
597	0.45

A0A068S7H8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer