Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CF00

Protein Details
Accession Q6CF00    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-249AHPHPHPHPHKHHHHHHHHHRSFRNBasic
454-473YVLRRNKRSRLNTWSDQQKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-235K
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
KEGG yli:YALI0B11484g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MNSESQASEPVETASSADKPTDVPTPMPAAVPTTTDGSASEATTETQPATSEAAAATTSTTETPAPAPVTTETGEVPAAQSETTSTAASAAPAVADKDTPSTEQKNSSPARMSLSFIQGDEPKKPEANDPAPSEDATPATSVPEAPTVAPNAAANAAAASAETTLASAEPVTSEPTVSAQESTAAAVSPSVTAPVDNADAATVAADDADAPGINPKEPKSLQKHAHPHPHPHPHKHHHHHHHHHRSFRNLKSKQDVNNKDVYSFVKATPFPKTDLGVLEYTTNLDTCLQGVLLPNLQLHVDCTIQVLIPRKHLRKESNILVQRREIWGTDIYTDDSDIVSVLYHTGVLPTRAQVDAFYSTLRAQEEGDADDTTDGHLEDEHPVTVGPNSHLVTSTSDNEQIYGDCLVTLRALPKLTEYTGCYRNGINSRSWKHHDGGSYAIQKVEFLKHDQAEYVLRRNKRSRLNTWSDQQKWAEWSSHKEVVLDFKDDQKGKKATVESLMS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.15
6 0.16
7 0.19
8 0.23
9 0.22
10 0.21
11 0.23
12 0.28
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.22
17 0.2
18 0.21
19 0.19
20 0.18
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.15
27 0.15
28 0.12
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.07
45 0.08
46 0.07
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.11
51 0.14
52 0.15
53 0.14
54 0.16
55 0.16
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.13
63 0.12
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.1
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.11
86 0.14
87 0.19
88 0.23
89 0.25
90 0.3
91 0.31
92 0.37
93 0.38
94 0.4
95 0.38
96 0.35
97 0.38
98 0.34
99 0.35
100 0.3
101 0.32
102 0.28
103 0.25
104 0.27
105 0.25
106 0.26
107 0.27
108 0.26
109 0.25
110 0.26
111 0.27
112 0.29
113 0.33
114 0.36
115 0.39
116 0.39
117 0.41
118 0.4
119 0.39
120 0.35
121 0.27
122 0.22
123 0.17
124 0.14
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.16
204 0.18
205 0.25
206 0.3
207 0.38
208 0.42
209 0.49
210 0.57
211 0.59
212 0.68
213 0.63
214 0.64
215 0.64
216 0.7
217 0.67
218 0.67
219 0.69
220 0.68
221 0.75
222 0.76
223 0.77
224 0.77
225 0.82
226 0.84
227 0.86
228 0.88
229 0.83
230 0.82
231 0.76
232 0.75
233 0.72
234 0.69
235 0.68
236 0.6
237 0.59
238 0.57
239 0.59
240 0.57
241 0.6
242 0.58
243 0.51
244 0.55
245 0.5
246 0.44
247 0.4
248 0.33
249 0.27
250 0.23
251 0.2
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.23
256 0.23
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.19
261 0.19
262 0.2
263 0.15
264 0.14
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.1
293 0.17
294 0.17
295 0.24
296 0.32
297 0.35
298 0.39
299 0.46
300 0.49
301 0.5
302 0.55
303 0.54
304 0.56
305 0.6
306 0.58
307 0.53
308 0.49
309 0.43
310 0.39
311 0.33
312 0.24
313 0.19
314 0.19
315 0.17
316 0.16
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.12
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.14
348 0.15
349 0.12
350 0.1
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.15
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.11
359 0.09
360 0.08
361 0.07
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.09
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.1
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.2
381 0.21
382 0.19
383 0.21
384 0.21
385 0.21
386 0.2
387 0.17
388 0.15
389 0.13
390 0.11
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.15
401 0.18
402 0.19
403 0.21
404 0.23
405 0.26
406 0.31
407 0.32
408 0.3
409 0.28
410 0.33
411 0.37
412 0.36
413 0.37
414 0.42
415 0.46
416 0.53
417 0.59
418 0.56
419 0.51
420 0.53
421 0.49
422 0.42
423 0.41
424 0.41
425 0.4
426 0.36
427 0.35
428 0.31
429 0.28
430 0.28
431 0.28
432 0.23
433 0.23
434 0.3
435 0.3
436 0.31
437 0.31
438 0.31
439 0.33
440 0.34
441 0.39
442 0.39
443 0.42
444 0.5
445 0.57
446 0.63
447 0.66
448 0.71
449 0.7
450 0.73
451 0.78
452 0.77
453 0.79
454 0.81
455 0.74
456 0.72
457 0.66
458 0.59
459 0.55
460 0.5
461 0.48
462 0.41
463 0.45
464 0.46
465 0.49
466 0.46
467 0.42
468 0.41
469 0.43
470 0.42
471 0.39
472 0.33
473 0.34
474 0.42
475 0.44
476 0.46
477 0.46
478 0.47
479 0.44
480 0.5
481 0.47
482 0.43