Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RTH1

Protein Details
Accession A0A068RTH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-214DKQRQAKEATKAKKKGKPQLAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-78KPKKELPPVRKKVPLAQKIAEKKAAEEEKKKALEAKKA
199-210KEATKAKKKGKP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.5, pero 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MSDWEDEQEINVTIPKKSKWDDEDVEDDVKDDWEESDEEEKPKKELPPVRKKVPLAQKIAEKKAAEEEKKKALEAKKAAIRANDDSETEEDAFERKQRMRQLELEADLNSATDLFSGVSVSKDDKEKPIEEVKPKTRVEFEAYAKRLGAMIVANSKSINYGAFLDTLVREIAAPCKDMDIRKAASSLTAMANDKQRQAKEATKAKKKGKPQLAAAGKSAALDDSTSYRDVYDDFDDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.28
4 0.31
5 0.38
6 0.4
7 0.47
8 0.49
9 0.5
10 0.53
11 0.49
12 0.47
13 0.39
14 0.34
15 0.25
16 0.21
17 0.16
18 0.11
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.16
24 0.18
25 0.22
26 0.26
27 0.27
28 0.27
29 0.31
30 0.31
31 0.36
32 0.42
33 0.49
34 0.55
35 0.63
36 0.68
37 0.71
38 0.7
39 0.7
40 0.72
41 0.69
42 0.64
43 0.61
44 0.62
45 0.62
46 0.64
47 0.6
48 0.5
49 0.43
50 0.45
51 0.48
52 0.46
53 0.44
54 0.44
55 0.46
56 0.47
57 0.46
58 0.44
59 0.41
60 0.44
61 0.42
62 0.45
63 0.41
64 0.45
65 0.46
66 0.42
67 0.41
68 0.36
69 0.36
70 0.3
71 0.25
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.18
76 0.15
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.14
83 0.19
84 0.25
85 0.29
86 0.32
87 0.35
88 0.38
89 0.38
90 0.37
91 0.34
92 0.28
93 0.24
94 0.19
95 0.15
96 0.1
97 0.06
98 0.05
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.09
110 0.1
111 0.13
112 0.16
113 0.17
114 0.2
115 0.26
116 0.29
117 0.34
118 0.4
119 0.42
120 0.47
121 0.46
122 0.44
123 0.4
124 0.37
125 0.36
126 0.35
127 0.34
128 0.35
129 0.36
130 0.35
131 0.33
132 0.31
133 0.25
134 0.2
135 0.16
136 0.07
137 0.07
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.06
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.17
164 0.18
165 0.21
166 0.21
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.21
171 0.19
172 0.18
173 0.18
174 0.13
175 0.15
176 0.15
177 0.17
178 0.25
179 0.26
180 0.31
181 0.34
182 0.34
183 0.34
184 0.38
185 0.42
186 0.44
187 0.51
188 0.56
189 0.61
190 0.69
191 0.75
192 0.77
193 0.8
194 0.81
195 0.82
196 0.79
197 0.75
198 0.77
199 0.76
200 0.71
201 0.63
202 0.55
203 0.45
204 0.37
205 0.31
206 0.21
207 0.13
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.17
218 0.18