Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C0U2

Protein Details
Accession Q6C0U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-79SVDPEVAPKKSRKRNSARLESPDDGSDDSAPRTRRKSRRLQGLDPEANHydrophilic
419-440NGTEPVKKTRRTRNSKLAEPEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-45KKSRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0034399  C:nuclear periphery  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:2000001  P:regulation of DNA damage checkpoint  
KEGG yli:YALI0F21747g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSELEQIRLANIERNKALLAALNLPTEAKKESVDPEVAPKKSRKRNSARLESPDDGSDDSAPRTRRKSRRLQGLDPEANALKQEDLGGSGELKRLMQQLNGGVKKERLSGDLSLKEMLTKTGLDEKEWSASLGQLFGDGSRVSQGDFFDEIVKKEEEDTKDIDIKQSRDNLSGLQLGKMSKVTKERIYITAVHPGTDKRIVLAGDKIGVLGIWDVDSDNEPLQLQLHHATIPALCFDQNSNDILYSASYDGSVRSLELKTGKSGDVLDLEAKKNASVGVSDVANPQPHLLYASTLCGHLIRKDLRTKSTEYETLILGEKKIGGFSVDPINTHLLATGSLDRSMRIWDLRATETARTIPGGEVIDTQFQMPHLQAIYNSRLSVSSTDWNLAGQIVCNGYDDTINIFNQSDYFLDMLNDGNGTEPVKKTRRTRNSKLAEPEISDQELPEIKKPSVRIKHNCQTGRWVTILKARWQQQPLDGVQKFAIANMNRYIDIYSGTGHQLAHLGDALMTAVPSALAFHPTQNWIAGGNSSGKMYWWE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.27
4 0.27
5 0.23
6 0.22
7 0.21
8 0.23
9 0.22
10 0.21
11 0.22
12 0.22
13 0.2
14 0.19
15 0.15
16 0.14
17 0.17
18 0.21
19 0.25
20 0.27
21 0.26
22 0.34
23 0.41
24 0.42
25 0.45
26 0.49
27 0.55
28 0.62
29 0.71
30 0.71
31 0.74
32 0.82
33 0.87
34 0.9
35 0.88
36 0.86
37 0.84
38 0.76
39 0.68
40 0.58
41 0.49
42 0.39
43 0.32
44 0.26
45 0.2
46 0.2
47 0.23
48 0.25
49 0.3
50 0.37
51 0.46
52 0.54
53 0.62
54 0.7
55 0.74
56 0.82
57 0.84
58 0.84
59 0.84
60 0.85
61 0.79
62 0.69
63 0.63
64 0.52
65 0.44
66 0.36
67 0.27
68 0.16
69 0.12
70 0.13
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.25
86 0.33
87 0.36
88 0.35
89 0.33
90 0.34
91 0.35
92 0.36
93 0.31
94 0.23
95 0.24
96 0.27
97 0.32
98 0.32
99 0.32
100 0.28
101 0.27
102 0.26
103 0.23
104 0.19
105 0.13
106 0.11
107 0.12
108 0.19
109 0.19
110 0.19
111 0.21
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.14
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.11
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.1
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.16
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.2
140 0.17
141 0.18
142 0.24
143 0.22
144 0.23
145 0.24
146 0.24
147 0.29
148 0.29
149 0.32
150 0.31
151 0.3
152 0.32
153 0.36
154 0.34
155 0.32
156 0.32
157 0.28
158 0.25
159 0.28
160 0.24
161 0.18
162 0.18
163 0.16
164 0.17
165 0.18
166 0.17
167 0.16
168 0.21
169 0.24
170 0.26
171 0.3
172 0.32
173 0.32
174 0.34
175 0.33
176 0.29
177 0.34
178 0.3
179 0.27
180 0.25
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.21
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.17
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.14
287 0.15
288 0.2
289 0.27
290 0.3
291 0.32
292 0.35
293 0.36
294 0.35
295 0.36
296 0.34
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.17
303 0.13
304 0.11
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.14
313 0.13
314 0.14
315 0.15
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.14
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.15
335 0.17
336 0.19
337 0.19
338 0.19
339 0.19
340 0.19
341 0.17
342 0.14
343 0.13
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.1
361 0.14
362 0.17
363 0.17
364 0.17
365 0.16
366 0.16
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.12
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.09
396 0.08
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.06
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.11
409 0.12
410 0.2
411 0.26
412 0.33
413 0.41
414 0.52
415 0.61
416 0.68
417 0.76
418 0.79
419 0.81
420 0.82
421 0.82
422 0.77
423 0.69
424 0.63
425 0.57
426 0.5
427 0.44
428 0.36
429 0.28
430 0.24
431 0.25
432 0.23
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.26
437 0.31
438 0.38
439 0.43
440 0.52
441 0.56
442 0.63
443 0.71
444 0.77
445 0.77
446 0.69
447 0.69
448 0.64
449 0.58
450 0.5
451 0.43
452 0.36
453 0.39
454 0.42
455 0.4
456 0.43
457 0.45
458 0.5
459 0.52
460 0.53
461 0.5
462 0.52
463 0.48
464 0.51
465 0.45
466 0.39
467 0.36
468 0.36
469 0.31
470 0.26
471 0.3
472 0.21
473 0.24
474 0.27
475 0.29
476 0.26
477 0.27
478 0.26
479 0.19
480 0.2
481 0.17
482 0.13
483 0.13
484 0.14
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.15
489 0.14
490 0.14
491 0.13
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.07
503 0.07
504 0.1
505 0.11
506 0.13
507 0.17
508 0.2
509 0.21
510 0.2
511 0.2
512 0.18
513 0.19
514 0.17
515 0.16
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.16