Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CH27

Protein Details
Accession Q6CH27    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-24TRTKVTKKPATTKAVSKKQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-72KKPATTKAVSKKQSAKTAKVNGVKAAAAKQELEKKTVKEEKPIPAAKAPSRLRLSAIQRKHK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009091  RCC1/BLIP-II  
IPR000408  Reg_chr_condens  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
KEGG yli:YALI0A13299g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00415  RCC1  
PF13540  RCC1_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00625  RCC1_1  
PS00626  RCC1_2  
PS50012  RCC1_3  
Amino Acid Sequences MVRLTRTKVTKKPATTKAVSKKQSAKTAKVNGVKAAAAKQELEKKTVKEEKPIPAAKAPSRLRLSAIQRKHKHSPTLLPLPSINKVDCEVFAFGTGDMCELGLGPEKASTVKRPRLSPYLSKEIVDIAVGGQHGLVLDSQGRVWSWGGNDLGALGRDTSGHEVLKDMDADESDDEDDPKLNPAESIPALVDTDQRFVKIEASDSLSLALTAEGDVWAWGSFRNSQGTMGFSDKVKVQNRPVKIEELSNIAAIAAGRDHVLALTQWGTVHTWGDSENFRLGWKSNRSTLSPRELGLKNIVYVGAGEFHSFAIDTDGKVLAWGLNQYGQCGILGQSDNAAVDGPTYVDALDGKDIVAVTGGEHHSLALSKDGTVYSFGRYDYHQIGFTTKDLPEGTVRDDKGNPRFLPVPSPLSLGGEDDDEKLPKMRFIACGAHHSLIIDVDGRVWTWGFSSSFQTGHAEEDDVETPRKIMNTAIKPIDVKMAGGGGQFSVVAGVRKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.79
4 0.8
5 0.81
6 0.77
7 0.75
8 0.75
9 0.74
10 0.79
11 0.76
12 0.73
13 0.72
14 0.77
15 0.77
16 0.75
17 0.69
18 0.62
19 0.57
20 0.51
21 0.43
22 0.38
23 0.33
24 0.27
25 0.26
26 0.28
27 0.35
28 0.36
29 0.38
30 0.39
31 0.37
32 0.46
33 0.54
34 0.5
35 0.51
36 0.56
37 0.6
38 0.65
39 0.67
40 0.61
41 0.57
42 0.62
43 0.56
44 0.59
45 0.54
46 0.53
47 0.53
48 0.5
49 0.48
50 0.49
51 0.54
52 0.54
53 0.6
54 0.62
55 0.65
56 0.72
57 0.78
58 0.77
59 0.75
60 0.72
61 0.71
62 0.7
63 0.72
64 0.66
65 0.58
66 0.54
67 0.5
68 0.48
69 0.42
70 0.33
71 0.25
72 0.25
73 0.24
74 0.22
75 0.21
76 0.18
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.11
94 0.13
95 0.16
96 0.23
97 0.28
98 0.37
99 0.41
100 0.45
101 0.5
102 0.56
103 0.6
104 0.6
105 0.58
106 0.59
107 0.55
108 0.51
109 0.46
110 0.39
111 0.33
112 0.24
113 0.17
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.12
171 0.11
172 0.12
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.13
178 0.1
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.16
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.08
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.07
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.2
221 0.22
222 0.24
223 0.3
224 0.35
225 0.38
226 0.42
227 0.41
228 0.37
229 0.35
230 0.33
231 0.26
232 0.23
233 0.21
234 0.16
235 0.14
236 0.11
237 0.1
238 0.08
239 0.07
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.17
268 0.22
269 0.23
270 0.28
271 0.3
272 0.33
273 0.37
274 0.4
275 0.4
276 0.36
277 0.34
278 0.35
279 0.33
280 0.32
281 0.31
282 0.26
283 0.2
284 0.19
285 0.18
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.06
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.15
365 0.19
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.2
370 0.22
371 0.22
372 0.22
373 0.21
374 0.17
375 0.18
376 0.17
377 0.18
378 0.19
379 0.19
380 0.23
381 0.26
382 0.27
383 0.28
384 0.32
385 0.37
386 0.41
387 0.47
388 0.43
389 0.41
390 0.44
391 0.41
392 0.43
393 0.4
394 0.38
395 0.31
396 0.33
397 0.29
398 0.27
399 0.26
400 0.21
401 0.17
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.16
406 0.15
407 0.15
408 0.18
409 0.18
410 0.18
411 0.2
412 0.2
413 0.21
414 0.25
415 0.31
416 0.3
417 0.35
418 0.38
419 0.36
420 0.33
421 0.3
422 0.26
423 0.19
424 0.18
425 0.13
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.12
435 0.12
436 0.14
437 0.19
438 0.2
439 0.2
440 0.21
441 0.23
442 0.2
443 0.22
444 0.21
445 0.17
446 0.15
447 0.18
448 0.2
449 0.19
450 0.21
451 0.18
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.16
456 0.2
457 0.27
458 0.32
459 0.4
460 0.42
461 0.43
462 0.43
463 0.44
464 0.45
465 0.35
466 0.28
467 0.21
468 0.2
469 0.18
470 0.17
471 0.17
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.08
476 0.08
477 0.08
478 0.1