Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CD16

Protein Details
Accession Q6CD16    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-130TEEPTSGKSKKNKKGKEENAVPTTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-121GKSKKNKKGK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 8.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Gene Ontology GO:1990112  C:RQC complex  
GO:0072344  P:rescue of stalled ribosome  
GO:1990116  P:ribosome-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG yli:YALI0C04543g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSSAMRRMMGAKKAAQKQQAEAEVPADTASLAEQVQSLSVKDEPAEMSQSTPEPVPEPSAEPSSSSKSSSTSETSKQGPTEPIKPVQTKPAKSKAPKTAPASTGSTEEPTSGKSKKNKKGKEENAVPTTPLSVSPPLLNPEHEIKRIYGNIRLWDEDGTAENFTNQLTNNQKKNLEKLSRVWGGKDKRSVPGTTKKLTLVTIKPYWIPQIKSEMSVARLSADPGAFRFTHSDSYAEGEFQFVQRRAIGQDSADLFGQYPYNVSTLNQLAGNGINTGQASSESADLIERALYVFNRALLTSSQAVLGQSKFQFKYVENRQFYRTLYLYIDILARRGLWNTTLEFSKLIYSLDDADYDPYGCRYMMDHFAVQGGDTTAIKYMLEQKLAPQLGYSLALALLLDGKDAEAEQALRTAIKTFPWIGYTLAESLGTPHNHRFDSSGSDSAIEAQSQLYVLRNRTLWDDPKPKMLFTKVWDTVAFDYTRSKGPAHWYNMNESLKRHLVISGEPTLLKYAQPLAESDLYDDDPVPPREDVNVYSSGEFAASDVTLAGQNDGTDQAQDGELAPEVVAALAQIQQLCAEAGMDVMEAFQMVSMDVPEAMRGVLLTEVVNSFADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.61
4 0.6
5 0.62
6 0.61
7 0.54
8 0.46
9 0.41
10 0.33
11 0.3
12 0.25
13 0.17
14 0.1
15 0.08
16 0.07
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.2
33 0.17
34 0.18
35 0.19
36 0.2
37 0.2
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.18
44 0.2
45 0.22
46 0.26
47 0.25
48 0.26
49 0.28
50 0.31
51 0.31
52 0.29
53 0.27
54 0.26
55 0.28
56 0.29
57 0.31
58 0.3
59 0.33
60 0.35
61 0.38
62 0.39
63 0.38
64 0.38
65 0.4
66 0.4
67 0.42
68 0.43
69 0.45
70 0.48
71 0.51
72 0.5
73 0.53
74 0.56
75 0.57
76 0.6
77 0.64
78 0.66
79 0.69
80 0.76
81 0.77
82 0.77
83 0.78
84 0.76
85 0.74
86 0.67
87 0.64
88 0.59
89 0.49
90 0.43
91 0.36
92 0.31
93 0.23
94 0.22
95 0.18
96 0.17
97 0.21
98 0.22
99 0.28
100 0.35
101 0.45
102 0.54
103 0.64
104 0.7
105 0.75
106 0.83
107 0.85
108 0.87
109 0.86
110 0.85
111 0.8
112 0.72
113 0.63
114 0.51
115 0.43
116 0.33
117 0.24
118 0.18
119 0.14
120 0.14
121 0.15
122 0.17
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.21
127 0.27
128 0.3
129 0.3
130 0.3
131 0.27
132 0.31
133 0.34
134 0.33
135 0.32
136 0.31
137 0.35
138 0.36
139 0.36
140 0.32
141 0.28
142 0.27
143 0.21
144 0.19
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.14
154 0.22
155 0.3
156 0.34
157 0.39
158 0.44
159 0.45
160 0.52
161 0.55
162 0.52
163 0.48
164 0.48
165 0.51
166 0.53
167 0.51
168 0.47
169 0.46
170 0.47
171 0.49
172 0.52
173 0.46
174 0.45
175 0.47
176 0.47
177 0.45
178 0.49
179 0.49
180 0.45
181 0.44
182 0.4
183 0.38
184 0.37
185 0.37
186 0.3
187 0.31
188 0.3
189 0.29
190 0.29
191 0.28
192 0.32
193 0.31
194 0.29
195 0.25
196 0.3
197 0.3
198 0.3
199 0.31
200 0.27
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.12
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.13
216 0.16
217 0.17
218 0.17
219 0.14
220 0.17
221 0.16
222 0.14
223 0.13
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.16
234 0.15
235 0.11
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.15
296 0.15
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.26
301 0.32
302 0.4
303 0.39
304 0.41
305 0.42
306 0.43
307 0.42
308 0.37
309 0.28
310 0.21
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.13
315 0.15
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.09
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.1
350 0.13
351 0.15
352 0.15
353 0.14
354 0.15
355 0.14
356 0.13
357 0.11
358 0.07
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.24
372 0.24
373 0.24
374 0.16
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.13
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.08
400 0.09
401 0.09
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.13
406 0.14
407 0.13
408 0.13
409 0.14
410 0.12
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.1
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.2
419 0.23
420 0.23
421 0.24
422 0.24
423 0.2
424 0.26
425 0.27
426 0.25
427 0.22
428 0.22
429 0.22
430 0.22
431 0.21
432 0.13
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.08
438 0.1
439 0.13
440 0.15
441 0.17
442 0.18
443 0.19
444 0.23
445 0.28
446 0.29
447 0.35
448 0.42
449 0.4
450 0.49
451 0.49
452 0.46
453 0.44
454 0.44
455 0.39
456 0.35
457 0.43
458 0.36
459 0.37
460 0.36
461 0.35
462 0.32
463 0.31
464 0.27
465 0.18
466 0.19
467 0.19
468 0.23
469 0.22
470 0.2
471 0.2
472 0.28
473 0.36
474 0.4
475 0.45
476 0.43
477 0.47
478 0.55
479 0.56
480 0.49
481 0.42
482 0.42
483 0.38
484 0.36
485 0.31
486 0.25
487 0.22
488 0.22
489 0.26
490 0.23
491 0.22
492 0.21
493 0.21
494 0.22
495 0.2
496 0.18
497 0.15
498 0.15
499 0.16
500 0.16
501 0.17
502 0.19
503 0.22
504 0.22
505 0.22
506 0.2
507 0.18
508 0.18
509 0.18
510 0.16
511 0.2
512 0.21
513 0.22
514 0.2
515 0.2
516 0.23
517 0.25
518 0.24
519 0.21
520 0.23
521 0.22
522 0.22
523 0.21
524 0.19
525 0.16
526 0.14
527 0.1
528 0.08
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.08
537 0.08
538 0.09
539 0.11
540 0.11
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.06
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.07
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.07
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.08
593 0.09
594 0.1