Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RPU0

Protein Details
Accession A0A068RPU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-88LIPAPKRRPKRDDHTKGTKRKWEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-85PKRRPKRDDHTKGTKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.833, cyto 7, cyto_pero 5.333, pero 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010304  SMN_Tudor  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
Amino Acid Sequences MYHDEATHNDNEEWEDPEQEDNTNDIEEEEYDEEDDWQDTNVIDYWQAAFKGYMSYHKKDADPAILIPAPKRRPKRDDHTKGTKRKWEDDEIEEQQQQDDEIEEEQQEEEQGYEEEAIEDTQWKDAEQQETTDQQYNDSYQYYNYYHQQQPHQGYAPGNVSGHGSAQQQQQPPPPPPPPFPGNPSFMAAQDNEAFANMIMAWYYSGYYTGYYQARRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.15
9 0.15
10 0.14
11 0.13
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.12
21 0.12
22 0.12
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.13
39 0.13
40 0.21
41 0.25
42 0.28
43 0.32
44 0.35
45 0.35
46 0.35
47 0.37
48 0.32
49 0.27
50 0.24
51 0.24
52 0.23
53 0.23
54 0.21
55 0.26
56 0.29
57 0.35
58 0.43
59 0.47
60 0.51
61 0.6
62 0.68
63 0.72
64 0.76
65 0.77
66 0.8
67 0.82
68 0.85
69 0.83
70 0.79
71 0.72
72 0.7
73 0.65
74 0.61
75 0.56
76 0.51
77 0.5
78 0.47
79 0.45
80 0.38
81 0.33
82 0.26
83 0.22
84 0.18
85 0.11
86 0.08
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.09
112 0.12
113 0.15
114 0.14
115 0.15
116 0.16
117 0.19
118 0.21
119 0.23
120 0.2
121 0.18
122 0.19
123 0.19
124 0.18
125 0.16
126 0.14
127 0.1
128 0.14
129 0.15
130 0.17
131 0.19
132 0.24
133 0.27
134 0.31
135 0.35
136 0.39
137 0.41
138 0.42
139 0.41
140 0.37
141 0.35
142 0.34
143 0.31
144 0.25
145 0.21
146 0.17
147 0.16
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.14
153 0.2
154 0.25
155 0.27
156 0.3
157 0.37
158 0.41
159 0.43
160 0.46
161 0.48
162 0.48
163 0.49
164 0.52
165 0.5
166 0.48
167 0.51
168 0.49
169 0.46
170 0.42
171 0.41
172 0.36
173 0.31
174 0.29
175 0.23
176 0.22
177 0.18
178 0.17
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.1
183 0.11
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.16
197 0.21