Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RPR1

Protein Details
Accession A0A068RPR1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-45ISHQSMPPKRKADKGKQSQSKRSKADDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-36KRKADKGKQS
120-129AKLERKRKEA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPSQVAESGTDFFPLSPSISHQSMPPKRKADKGKQSQSKRSKADDEPTVDEKDNTSLDETNIASSSDNSNNDKNDAGSLNDKLQKFKELRRRRATEVEQGNRRDRNLEFQRSKENPRYEAKLERKRKEAEKLLEKQKAIEDGEDYERKLFWKFSAESVEAWEEKMAKKAERANVGFTDYNQLAHKKYQKLISELKPDLGQYAEKKLESIERAIRNGEDPSNIDAIANNVDYGSLDDKPSKEAIDRLVQGVKREIHTRETRSRERKEIQDDISWINEKNRVFNQKIARFYDKYTKEIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.11
4 0.16
5 0.2
6 0.21
7 0.22
8 0.24
9 0.34
10 0.42
11 0.49
12 0.53
13 0.56
14 0.59
15 0.68
16 0.74
17 0.75
18 0.76
19 0.8
20 0.83
21 0.84
22 0.89
23 0.91
24 0.91
25 0.89
26 0.84
27 0.8
28 0.76
29 0.73
30 0.71
31 0.68
32 0.63
33 0.59
34 0.56
35 0.53
36 0.47
37 0.4
38 0.34
39 0.29
40 0.24
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.15
45 0.18
46 0.17
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.16
53 0.18
54 0.21
55 0.23
56 0.26
57 0.27
58 0.28
59 0.27
60 0.23
61 0.21
62 0.19
63 0.18
64 0.17
65 0.18
66 0.22
67 0.27
68 0.27
69 0.27
70 0.28
71 0.33
72 0.33
73 0.4
74 0.46
75 0.51
76 0.61
77 0.68
78 0.72
79 0.71
80 0.76
81 0.73
82 0.71
83 0.7
84 0.68
85 0.65
86 0.64
87 0.64
88 0.57
89 0.53
90 0.47
91 0.37
92 0.39
93 0.41
94 0.46
95 0.44
96 0.44
97 0.53
98 0.54
99 0.6
100 0.58
101 0.53
102 0.48
103 0.49
104 0.52
105 0.46
106 0.51
107 0.55
108 0.57
109 0.62
110 0.62
111 0.64
112 0.64
113 0.66
114 0.65
115 0.63
116 0.61
117 0.6
118 0.64
119 0.66
120 0.65
121 0.6
122 0.53
123 0.45
124 0.4
125 0.32
126 0.24
127 0.16
128 0.14
129 0.19
130 0.18
131 0.17
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.09
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.2
142 0.2
143 0.19
144 0.21
145 0.21
146 0.16
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.09
151 0.14
152 0.14
153 0.13
154 0.17
155 0.22
156 0.26
157 0.32
158 0.32
159 0.3
160 0.3
161 0.32
162 0.29
163 0.24
164 0.24
165 0.17
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.2
171 0.27
172 0.26
173 0.3
174 0.35
175 0.37
176 0.41
177 0.47
178 0.48
179 0.49
180 0.46
181 0.44
182 0.38
183 0.35
184 0.3
185 0.23
186 0.2
187 0.13
188 0.18
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.19
193 0.22
194 0.2
195 0.23
196 0.25
197 0.26
198 0.27
199 0.28
200 0.28
201 0.25
202 0.26
203 0.23
204 0.17
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.12
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.18
229 0.21
230 0.25
231 0.26
232 0.26
233 0.31
234 0.31
235 0.31
236 0.35
237 0.33
238 0.29
239 0.33
240 0.33
241 0.36
242 0.42
243 0.48
244 0.51
245 0.57
246 0.65
247 0.69
248 0.74
249 0.74
250 0.74
251 0.75
252 0.73
253 0.72
254 0.66
255 0.61
256 0.58
257 0.51
258 0.48
259 0.41
260 0.35
261 0.31
262 0.31
263 0.27
264 0.3
265 0.36
266 0.4
267 0.41
268 0.47
269 0.55
270 0.57
271 0.63
272 0.64
273 0.64
274 0.57
275 0.59
276 0.62
277 0.55
278 0.53
279 0.54
280 0.53
281 0.52
282 0.57
283 0.59
284 0.58
285 0.57
286 0.55