Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068S886

Protein Details
Accession A0A068S886    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-66GAGPREKRRGGRQNGRPQRGRQBasic
176-195KDASKPKKSAEKPRKEKVVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-65APPKEQKKAEEPKAEKRNTKANGAGPREKRRGGRQNGRPQRGR
179-229SKPKKSAEKPRKEKVVVEIEQRFVEKPRGGFRGERRGGERRGRGNGRRGAK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSAFSNNIFDLLNEDGDIPKPVAPPKEQKKAEEPKAEKRNTKANGAGPREKRRGGRQNGRPQRGRQFDRHSGTGIADSEKKEKQGWGHPETAEAEAAKDSLSPKDPAAEEAAAAEAAEAEEKVKTLEEYLAEKANKSLKVSLPEARKANEGSDDKKWENAVAFVKEDEPEYFATNKDASKPKKSAEKPRKEKVVVEIEQRFVEKPRGGFRGERRGGERRGRGNGRRGAKNNGPAVNIQDAAAFPSLGASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.15
5 0.13
6 0.13
7 0.16
8 0.2
9 0.25
10 0.3
11 0.39
12 0.47
13 0.56
14 0.58
15 0.6
16 0.65
17 0.71
18 0.74
19 0.74
20 0.71
21 0.71
22 0.78
23 0.8
24 0.75
25 0.7
26 0.7
27 0.63
28 0.63
29 0.58
30 0.55
31 0.57
32 0.59
33 0.63
34 0.62
35 0.68
36 0.68
37 0.67
38 0.65
39 0.66
40 0.69
41 0.71
42 0.73
43 0.74
44 0.8
45 0.85
46 0.88
47 0.83
48 0.79
49 0.79
50 0.78
51 0.73
52 0.71
53 0.69
54 0.7
55 0.69
56 0.64
57 0.56
58 0.47
59 0.42
60 0.35
61 0.27
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.21
66 0.21
67 0.22
68 0.21
69 0.22
70 0.24
71 0.3
72 0.36
73 0.36
74 0.39
75 0.37
76 0.38
77 0.37
78 0.33
79 0.25
80 0.17
81 0.13
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.14
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.1
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.16
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.2
125 0.18
126 0.23
127 0.25
128 0.29
129 0.29
130 0.33
131 0.34
132 0.32
133 0.31
134 0.28
135 0.26
136 0.27
137 0.26
138 0.24
139 0.27
140 0.31
141 0.29
142 0.3
143 0.3
144 0.24
145 0.21
146 0.22
147 0.2
148 0.17
149 0.17
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.16
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.19
164 0.27
165 0.3
166 0.37
167 0.4
168 0.42
169 0.51
170 0.59
171 0.64
172 0.66
173 0.73
174 0.74
175 0.8
176 0.84
177 0.76
178 0.72
179 0.68
180 0.67
181 0.59
182 0.58
183 0.52
184 0.45
185 0.44
186 0.42
187 0.35
188 0.27
189 0.3
190 0.25
191 0.25
192 0.3
193 0.33
194 0.34
195 0.4
196 0.46
197 0.51
198 0.51
199 0.52
200 0.51
201 0.56
202 0.61
203 0.63
204 0.63
205 0.59
206 0.65
207 0.7
208 0.71
209 0.72
210 0.73
211 0.72
212 0.73
213 0.71
214 0.7
215 0.69
216 0.7
217 0.68
218 0.63
219 0.56
220 0.48
221 0.48
222 0.43
223 0.36
224 0.28
225 0.21
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.13
230 0.09