Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RT82

Protein Details
Accession A0A068RT82    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-69LVAKKDISKLSKRKQKQALAERAEHydrophilic
343-366ATKGSKASGDKKARHRKALNVFEGHydrophilic
372-391STGNKFKIGKTSSNKKQKRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-67SKLSKRKQKQALAER
73-89IKARELSSLPPLKRKRK
329-391GRRLRKKEGSKATNATKGSKASGDKKARHRKALNVFEGARASKSTGNKFKIGKTSSNKKQKRH
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034221  RBM34_RRM2  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
cd12395  RRM2_RBM34  
Amino Acid Sequences MDDSKSLTKALLKGDTTNVDSTLDNLFKSSAGPTKQATAPSPAAPLVAKKDISKLSKRKQKQALAERAEQAAIKARELSSLPPLKRKRKADVLETSEEKPEEEEEKKADSMSQERKVVDEKEKNERTVFVGNVPVACCEEKSKSRALKRAFATYGAIESMRFRSTAFSETLPRKAAFIAKKFHDNRSVTNAYIVYKTKESADKALAMNGQVFMEKHLRVDNAANPKPHDRKRSVFVGSLPFDAEEEELWKFFADCGAIDNVRLIRDKKTNIGKGIGYVQFTRRAAVDLALALDDKPLRDNHTLRIQRCKDQIPKPAAAVAAAATAEAAGRRLRKKEGSKATNATKGSKASGDKKARHRKALNVFEGARASKSTGNKFKIGKTSSNKKQKRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.38
4 0.36
5 0.31
6 0.26
7 0.24
8 0.23
9 0.24
10 0.21
11 0.17
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.16
16 0.18
17 0.19
18 0.21
19 0.25
20 0.25
21 0.3
22 0.33
23 0.36
24 0.34
25 0.34
26 0.34
27 0.32
28 0.33
29 0.28
30 0.26
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.3
38 0.36
39 0.42
40 0.49
41 0.54
42 0.59
43 0.68
44 0.75
45 0.79
46 0.81
47 0.83
48 0.83
49 0.84
50 0.84
51 0.8
52 0.78
53 0.7
54 0.61
55 0.53
56 0.43
57 0.33
58 0.31
59 0.25
60 0.21
61 0.2
62 0.19
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.23
67 0.31
68 0.32
69 0.39
70 0.48
71 0.56
72 0.64
73 0.68
74 0.67
75 0.7
76 0.74
77 0.73
78 0.74
79 0.71
80 0.68
81 0.65
82 0.58
83 0.51
84 0.45
85 0.36
86 0.27
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.22
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.25
98 0.31
99 0.34
100 0.35
101 0.35
102 0.36
103 0.39
104 0.4
105 0.41
106 0.41
107 0.4
108 0.47
109 0.5
110 0.51
111 0.47
112 0.44
113 0.38
114 0.35
115 0.31
116 0.22
117 0.21
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.16
122 0.13
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.16
127 0.19
128 0.21
129 0.28
130 0.34
131 0.4
132 0.47
133 0.49
134 0.52
135 0.5
136 0.54
137 0.48
138 0.42
139 0.37
140 0.29
141 0.26
142 0.19
143 0.16
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.25
159 0.23
160 0.21
161 0.21
162 0.25
163 0.25
164 0.27
165 0.29
166 0.29
167 0.38
168 0.4
169 0.42
170 0.45
171 0.41
172 0.38
173 0.41
174 0.41
175 0.32
176 0.32
177 0.29
178 0.21
179 0.23
180 0.21
181 0.15
182 0.13
183 0.14
184 0.14
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.16
207 0.19
208 0.25
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.37
213 0.44
214 0.48
215 0.5
216 0.46
217 0.47
218 0.51
219 0.55
220 0.51
221 0.45
222 0.41
223 0.4
224 0.36
225 0.32
226 0.27
227 0.21
228 0.18
229 0.16
230 0.13
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.07
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.13
249 0.16
250 0.15
251 0.18
252 0.24
253 0.26
254 0.32
255 0.4
256 0.44
257 0.44
258 0.45
259 0.4
260 0.36
261 0.4
262 0.35
263 0.28
264 0.24
265 0.24
266 0.27
267 0.27
268 0.25
269 0.2
270 0.2
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.07
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.16
285 0.22
286 0.24
287 0.29
288 0.39
289 0.45
290 0.46
291 0.56
292 0.55
293 0.55
294 0.59
295 0.62
296 0.6
297 0.61
298 0.67
299 0.63
300 0.61
301 0.56
302 0.52
303 0.44
304 0.35
305 0.27
306 0.18
307 0.12
308 0.1
309 0.08
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.09
316 0.15
317 0.21
318 0.25
319 0.32
320 0.41
321 0.49
322 0.58
323 0.66
324 0.67
325 0.7
326 0.74
327 0.75
328 0.73
329 0.67
330 0.6
331 0.53
332 0.48
333 0.43
334 0.4
335 0.4
336 0.41
337 0.49
338 0.54
339 0.58
340 0.67
341 0.76
342 0.78
343 0.82
344 0.8
345 0.79
346 0.81
347 0.83
348 0.77
349 0.73
350 0.66
351 0.59
352 0.58
353 0.49
354 0.39
355 0.31
356 0.28
357 0.26
358 0.32
359 0.39
360 0.44
361 0.48
362 0.53
363 0.56
364 0.6
365 0.64
366 0.62
367 0.62
368 0.62
369 0.69
370 0.72
371 0.79