FuNGI

A0A068SFN9

Protein Details

Accession

A0A068SFN9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
798-817	RLNSANTSTRKSKRPRSSRR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
796-798	RSR
803-817	NTSTRKSKRPRSSRR

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 8, mito 6, cyto 3.5, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MFRGCPFGLKPISSTFQRTMNSIFSKLPHVLTFVDDIIIFSNTLEEHAQHVAEAIERLTSVNLILNPNKCHFAQESVYLLGFCVSAKGIGLDPRKVANVQEWPVPRTGKDVQRFLGVINYFRESIPNAAERMAPLDKLRFEHRLDDLWKDSEQAAFLDLKRVLLHAPILSYPNLEHPFQVATDASNTGIGAVLYQVINGTTHHIAFMARSLSPSERKYSTTKRELLAIIFALNKFHQYLWGNHFTLCTDHKALVYLHTQKVANAMMVNWLDTILEYSFDVVHIPGLDNTLPDQLSRLFPTEKELAGGNVPDNKQTSTQNNAIHVKGKQDNNDSSDEQDDDLYFEPPELDRSQLLKDAHECKEMLKDAHAFGHFGAKAMVSQLQQDGLKWNNMHREAQEIVHACKKCQQNNIAKQGYQPLRPIHAFLPGDHWAIDLASGFDKSHNGNLYILVMVDVCTRFCVLHALPDKTSDTVVKAVIDTFCDYGFPRYLQSDNGTEFVNTLMYKLKNASGFDHRLTTPYHPRANGLAERFVQTSINTIRKCIDGATRGWDLYVKPTQLALNNKVASIHGSSPFALMFNRAMNGFRKYNNDDIPQPLTEQELMDRIDHMSNTVFPAISERAQALQKLKKGRHDAKYRMVHFPPNSKVMVKDMLRSKKMDPRYEGPYTVVRETPGGSYVLRDEQGLLAARNFAPSQLKMVSQDELVDVNELYEHEGQYYTIQSIVDHRQLAPGNYEYRVRWAGYSANDDTWEPPESFNSTQPIAEYWNKLGRISPRDSSIDGNITQHTDTGKHAHKRSRLNSANTSTRKSKRPRSSRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.37
3	0.4
4	0.4
5	0.4
6	0.38
7	0.4
8	0.41
9	0.37
10	0.37
11	0.32
12	0.36
13	0.36
14	0.35
15	0.28
16	0.26
17	0.24
18	0.24
19	0.25
20	0.2
21	0.18
22	0.15
23	0.15
24	0.14
25	0.14
26	0.12
27	0.09
28	0.1
29	0.09
30	0.11
31	0.11
32	0.1
33	0.12
34	0.14
35	0.14
36	0.12
37	0.13
38	0.12
39	0.12
40	0.13
41	0.1
42	0.08
43	0.09
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.11
49	0.13
50	0.18
51	0.23
52	0.28
53	0.32
54	0.35
55	0.37
56	0.34
57	0.35
58	0.32
59	0.33
60	0.31
61	0.31
62	0.32
63	0.3
64	0.3
65	0.26
66	0.24
67	0.18
68	0.15
69	0.1
70	0.08
71	0.07
72	0.06
73	0.07
74	0.08
75	0.09
76	0.17
77	0.21
78	0.23
79	0.24
80	0.26
81	0.28
82	0.28
83	0.27
84	0.27
85	0.3
86	0.3
87	0.35
88	0.36
89	0.36
90	0.4
91	0.4
92	0.34
93	0.33
94	0.38
95	0.4
96	0.44
97	0.47
98	0.44
99	0.47
100	0.47
101	0.4
102	0.4
103	0.32
104	0.27
105	0.25
106	0.26
107	0.23
108	0.22
109	0.24
110	0.18
111	0.2
112	0.21
113	0.21
114	0.19
115	0.19
116	0.2
117	0.18
118	0.22
119	0.2
120	0.18
121	0.17
122	0.21
123	0.22
124	0.25
125	0.29
126	0.29
127	0.3
128	0.34
129	0.34
130	0.37
131	0.37
132	0.39
133	0.38
134	0.35
135	0.33
136	0.3
137	0.28
138	0.22
139	0.2
140	0.15
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.18
145	0.17
146	0.17
147	0.16
148	0.17
149	0.16
150	0.14
151	0.16
152	0.11
153	0.12
154	0.13
155	0.15
156	0.14
157	0.15
158	0.14
159	0.2
160	0.22
161	0.21
162	0.19
163	0.19
164	0.2
165	0.19
166	0.2
167	0.12
168	0.1
169	0.12
170	0.12
171	0.11
172	0.1
173	0.1
174	0.08
175	0.08
176	0.07
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.13
194	0.1
195	0.09
196	0.1
197	0.13
198	0.16
199	0.22
200	0.24
201	0.26
202	0.26
203	0.29
204	0.36
205	0.43
206	0.49
207	0.52
208	0.54
209	0.5
210	0.52
211	0.5
212	0.44
213	0.36
214	0.27
215	0.2
216	0.17
217	0.16
218	0.14
219	0.12
220	0.13
221	0.12
222	0.11
223	0.15
224	0.16
225	0.21
226	0.27
227	0.33
228	0.33
229	0.32
230	0.33
231	0.27
232	0.28
233	0.24
234	0.22
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.19
239	0.18
240	0.19
241	0.23
242	0.24
243	0.24
244	0.26
245	0.26
246	0.24
247	0.27
248	0.24
249	0.19
250	0.13
251	0.12
252	0.13
253	0.13
254	0.13
255	0.1
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.07
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.06
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.08
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.1
281	0.12
282	0.13
283	0.15
284	0.14
285	0.14
286	0.19
287	0.2
288	0.18
289	0.17
290	0.16
291	0.14
292	0.14
293	0.14
294	0.11
295	0.13
296	0.14
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.17
301	0.2
302	0.23
303	0.23
304	0.29
305	0.29
306	0.33
307	0.35
308	0.33
309	0.33
310	0.3
311	0.3
312	0.31
313	0.32
314	0.31
315	0.34
316	0.36
317	0.36
318	0.39
319	0.34
320	0.29
321	0.28
322	0.23
323	0.18
324	0.16
325	0.12
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.12
338	0.13
339	0.18
340	0.18
341	0.16
342	0.21
343	0.25
344	0.26
345	0.26
346	0.25
347	0.21
348	0.24
349	0.25
350	0.2
351	0.17
352	0.17
353	0.15
354	0.18
355	0.18
356	0.14
357	0.12
358	0.17
359	0.15
360	0.14
361	0.13
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.13
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.12
373	0.11
374	0.14
375	0.14
376	0.16
377	0.2
378	0.22
379	0.23
380	0.2
381	0.23
382	0.21
383	0.21
384	0.22
385	0.18
386	0.17
387	0.22
388	0.22
389	0.18
390	0.24
391	0.29
392	0.29
393	0.34
394	0.4
395	0.44
396	0.52
397	0.61
398	0.57
399	0.51
400	0.48
401	0.51
402	0.45
403	0.37
404	0.33
405	0.25
406	0.27
407	0.27
408	0.28
409	0.2
410	0.24
411	0.22
412	0.18
413	0.22
414	0.2
415	0.21
416	0.19
417	0.18
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.06
422	0.04
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.07
428	0.07
429	0.1
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.12
435	0.1
436	0.1
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.06
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.09
448	0.08
449	0.15
450	0.2
451	0.22
452	0.22
453	0.24
454	0.25
455	0.22
456	0.23
457	0.16
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.1
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.1
466	0.1
467	0.09
468	0.08
469	0.09
470	0.09
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.11
475	0.12
476	0.13
477	0.14
478	0.16
479	0.16
480	0.16
481	0.17
482	0.16
483	0.14
484	0.13
485	0.12
486	0.11
487	0.08
488	0.07
489	0.11
490	0.11
491	0.12
492	0.13
493	0.16
494	0.17
495	0.18
496	0.21
497	0.23
498	0.26
499	0.27
500	0.29
501	0.26
502	0.25
503	0.26
504	0.28
505	0.3
506	0.33
507	0.36
508	0.33
509	0.35
510	0.35
511	0.38
512	0.37
513	0.3
514	0.27
515	0.24
516	0.26
517	0.25
518	0.23
519	0.19
520	0.14
521	0.17
522	0.19
523	0.25
524	0.23
525	0.23
526	0.24
527	0.24
528	0.24
529	0.21
530	0.21
531	0.17
532	0.18
533	0.22
534	0.22
535	0.21
536	0.21
537	0.21
538	0.17
539	0.19
540	0.22
541	0.18
542	0.16
543	0.18
544	0.2
545	0.23
546	0.29
547	0.27
548	0.31
549	0.31
550	0.3
551	0.29
552	0.28
553	0.24
554	0.21
555	0.2
556	0.14
557	0.15
558	0.15
559	0.16
560	0.15
561	0.14
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.1
568	0.12
569	0.15
570	0.19
571	0.21
572	0.22
573	0.28
574	0.31
575	0.37
576	0.4
577	0.41
578	0.38
579	0.4
580	0.4
581	0.34
582	0.31
583	0.25
584	0.22
585	0.19
586	0.16
587	0.13
588	0.13
589	0.13
590	0.13
591	0.13
592	0.13
593	0.14
594	0.13
595	0.13
596	0.11
597	0.11
598	0.12
599	0.12
600	0.11
601	0.09
602	0.13
603	0.14
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.16
608	0.17
609	0.21
610	0.23
611	0.27
612	0.31
613	0.39
614	0.42
615	0.47
616	0.56
617	0.62
618	0.65
619	0.7
620	0.72
621	0.74
622	0.79
623	0.75
624	0.72
625	0.66
626	0.64
627	0.58
628	0.59
629	0.53
630	0.47
631	0.46
632	0.39
633	0.37
634	0.33
635	0.37
636	0.3
637	0.33
638	0.38
639	0.44
640	0.46
641	0.48
642	0.49
643	0.49
644	0.57
645	0.57
646	0.55
647	0.52
648	0.56
649	0.57
650	0.54
651	0.48
652	0.46
653	0.42
654	0.38
655	0.34
656	0.27
657	0.24
658	0.24
659	0.22
660	0.18
661	0.15
662	0.13
663	0.13
664	0.15
665	0.17
666	0.16
667	0.15
668	0.14
669	0.13
670	0.16
671	0.17
672	0.15
673	0.13
674	0.15
675	0.15
676	0.16
677	0.16
678	0.15
679	0.18
680	0.17
681	0.21
682	0.2
683	0.22
684	0.23
685	0.25
686	0.24
687	0.2
688	0.2
689	0.17
690	0.16
691	0.15
692	0.13
693	0.1
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.11
698	0.12
699	0.11
700	0.11
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.15
705	0.12
706	0.11
707	0.11
708	0.11
709	0.16
710	0.21
711	0.24
712	0.24
713	0.24
714	0.28
715	0.31
716	0.32
717	0.31
718	0.29
719	0.27
720	0.28
721	0.31
722	0.26
723	0.3
724	0.31
725	0.28
726	0.24
727	0.24
728	0.26
729	0.27
730	0.33
731	0.29
732	0.28
733	0.28
734	0.29
735	0.28
736	0.26
737	0.25
738	0.2
739	0.18
740	0.19
741	0.24
742	0.25
743	0.27
744	0.28
745	0.27
746	0.26
747	0.26
748	0.25
749	0.25
750	0.28
751	0.28
752	0.29
753	0.34
754	0.34
755	0.34
756	0.38
757	0.4
758	0.43
759	0.45
760	0.43
761	0.42
762	0.45
763	0.46
764	0.45
765	0.41
766	0.39
767	0.34
768	0.32
769	0.29
770	0.28
771	0.26
772	0.24
773	0.21
774	0.18
775	0.19
776	0.25
777	0.33
778	0.39
779	0.47
780	0.54
781	0.6
782	0.69
783	0.73
784	0.76
785	0.76
786	0.74
787	0.76
788	0.76
789	0.78
790	0.72
791	0.73
792	0.71
793	0.7
794	0.72
795	0.73
796	0.76
797	0.77

A0A068SFN9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer