Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068SB18

Protein Details
Accession A0A068SB18    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-39SPTSSAPDEKPQRSKKRSKSLARELQYLVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-27KKR
90-112KGKRRGAALLARQQMERSKGKKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031824  RNF220_mid  
IPR040178  RNF220_RING  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF15926  RNF220  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16563  RING-HC_RNF220  
Amino Acid Sequences MSSPPSTLPESPTSSAPDEKPQRSKKRSKSLARELQYLVDNNGKRAKRDLAKCPICQHRIEPTQWEQHYQLELQRLNQLDSDAYEDPLHKGKRRGAALLARQQMERSKGKKKQPASAYDELLGKVQKNREHRREALARLDPTYQDTEEAISQAIMEQETGVQRCFICNDTLHGDSEAINLHIDRCLASFDSSSQQQPSTTSNSSDQGAWDEYEWAGQTRVRATAMMEGGYGGAGFATASKREEDEDEEDLDVEDDGDDEYGAIQYSERDIVFDPQDEDASALREMVSGASPSTTPRTPDNGHRSGYEETVSDEGWRRTTSEDVQTGHSRLVIESLKSRIQQLEITSRSAPRCLICLEPYKTPVTSIVCWHVHCEQCWLHTLGSKKLCPQCQKITTPSDLRRIYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.4
3 0.38
4 0.42
5 0.46
6 0.52
7 0.6
8 0.66
9 0.73
10 0.78
11 0.86
12 0.87
13 0.89
14 0.91
15 0.92
16 0.92
17 0.92
18 0.92
19 0.86
20 0.81
21 0.71
22 0.65
23 0.59
24 0.49
25 0.41
26 0.39
27 0.35
28 0.33
29 0.4
30 0.37
31 0.35
32 0.39
33 0.45
34 0.46
35 0.53
36 0.59
37 0.62
38 0.68
39 0.7
40 0.73
41 0.74
42 0.69
43 0.63
44 0.58
45 0.57
46 0.56
47 0.54
48 0.53
49 0.49
50 0.55
51 0.53
52 0.52
53 0.44
54 0.41
55 0.4
56 0.35
57 0.33
58 0.31
59 0.31
60 0.29
61 0.32
62 0.3
63 0.28
64 0.27
65 0.24
66 0.17
67 0.17
68 0.2
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.17
74 0.24
75 0.28
76 0.28
77 0.33
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.46
82 0.45
83 0.49
84 0.53
85 0.55
86 0.54
87 0.48
88 0.45
89 0.44
90 0.42
91 0.4
92 0.4
93 0.38
94 0.43
95 0.5
96 0.59
97 0.65
98 0.66
99 0.69
100 0.69
101 0.72
102 0.7
103 0.67
104 0.59
105 0.53
106 0.5
107 0.41
108 0.35
109 0.28
110 0.21
111 0.2
112 0.23
113 0.26
114 0.35
115 0.45
116 0.51
117 0.57
118 0.58
119 0.63
120 0.64
121 0.63
122 0.61
123 0.56
124 0.49
125 0.44
126 0.42
127 0.34
128 0.3
129 0.29
130 0.21
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.12
135 0.12
136 0.1
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.04
144 0.06
145 0.08
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.13
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.18
192 0.16
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.03
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.03
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.13
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.14
238 0.1
239 0.07
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.14
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.1
266 0.11
267 0.1
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.13
280 0.13
281 0.15
282 0.18
283 0.24
284 0.27
285 0.36
286 0.44
287 0.44
288 0.44
289 0.43
290 0.44
291 0.4
292 0.38
293 0.29
294 0.2
295 0.17
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.23
306 0.25
307 0.28
308 0.31
309 0.3
310 0.35
311 0.38
312 0.37
313 0.33
314 0.3
315 0.23
316 0.19
317 0.22
318 0.19
319 0.17
320 0.2
321 0.24
322 0.26
323 0.27
324 0.29
325 0.26
326 0.26
327 0.27
328 0.28
329 0.34
330 0.32
331 0.35
332 0.35
333 0.38
334 0.37
335 0.36
336 0.33
337 0.25
338 0.26
339 0.25
340 0.26
341 0.26
342 0.34
343 0.36
344 0.38
345 0.4
346 0.4
347 0.38
348 0.35
349 0.35
350 0.31
351 0.3
352 0.3
353 0.34
354 0.34
355 0.34
356 0.37
357 0.39
358 0.38
359 0.37
360 0.39
361 0.34
362 0.33
363 0.37
364 0.35
365 0.3
366 0.3
367 0.33
368 0.35
369 0.4
370 0.41
371 0.45
372 0.51
373 0.58
374 0.63
375 0.67
376 0.68
377 0.69
378 0.73
379 0.72
380 0.7
381 0.7
382 0.71
383 0.69
384 0.69