Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068RTA9

Protein Details
Accession A0A068RTA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-286VSAQQEKRTRAKKRSKNQPKQKRQKKIGAIDERAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-279KRTRAKKRSKNQPKQKRQKKI
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MAPKRRSSASSEQRQLKSQKRSSGSTSEDVAEHVEIVKKVEAVVIPKLELSNGATSSSQPKSAVSARHSYKQQRQLLEQSEEGQDETADDEQVELVVQVEDIEDMEEENANDEENNDEDVDEEEDNDDEVDDDEVDDDEEHSEDDNEEDGDEEDNEEDGDEDDKKQTSQPKLVVNSSISGQHDVEHDDTYQSTLPMSALAARRLARQRQSEQQQPDSMDDQEQDDSNLESTPQLDMDVSEGSPATDIEPTTTVSAQQEKRTRAKKRSKNQPKQKRQKKIGAIDERAISIFNPCSANVSSFNSNGEQYLAIGLQENESIVFLGKALIAVYCGAVSIMGATLTADKECLDFYPVFALKSHALPRIEPTAETSNVSTRTTDIHEDRQPFLNAFGRLENFAAVIVIKSMEWCGFDDVEGVFSHAKDMARIEGYRGHRLMSGIAGFYPILEPTPGIRALDIPSTWSGNANVAIQDEKERGSPIVSIVCGTKDSGKSTFNRYLVNRLLNSHKRVAYLETDVGQTEFTPAGIIALHVLESPILGPPCTHQNIASRRSHYFGAATVRDDPNYYMRIVRQLTSTWQQHYNQEPDIDMIDQVPLVVNTHGWVKGLGYDLLVGLVDMVGPTNVFATHGSTPSFPPTFATDILPSSDGNVQPKLHYIENPVRGSRIVSKYLATDLRALAFVSYMYQDLTHFGQPNKPWWNFKTSLVERLPWSLDWRTGLDTGIWMLSQDIKLNHLLYALNVSIVALISSDSPPDDGNDAQVQDMDQDSSHSIMEEESKSSITPPKYLPASEYPPPDPEYTHCRGLAIVRAIDPSEHALLMLTPEVRSTLNEVSGLVRGSMDIPLSCMLDRNQGRGTGIAGVPWRQVPYMTEDAIAGAGGSALRIRRINKRAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.77
3 0.76
4 0.76
5 0.73
6 0.73
7 0.69
8 0.71
9 0.69
10 0.69
11 0.65
12 0.58
13 0.53
14 0.46
15 0.4
16 0.35
17 0.31
18 0.23
19 0.17
20 0.15
21 0.17
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.19
28 0.19
29 0.18
30 0.23
31 0.22
32 0.21
33 0.22
34 0.22
35 0.2
36 0.19
37 0.18
38 0.17
39 0.16
40 0.18
41 0.17
42 0.19
43 0.25
44 0.26
45 0.25
46 0.22
47 0.21
48 0.25
49 0.31
50 0.35
51 0.34
52 0.41
53 0.44
54 0.51
55 0.58
56 0.62
57 0.67
58 0.7
59 0.72
60 0.68
61 0.7
62 0.71
63 0.7
64 0.65
65 0.57
66 0.5
67 0.45
68 0.4
69 0.34
70 0.25
71 0.18
72 0.13
73 0.14
74 0.12
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.13
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.09
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.18
153 0.25
154 0.3
155 0.35
156 0.39
157 0.44
158 0.48
159 0.49
160 0.49
161 0.42
162 0.37
163 0.31
164 0.3
165 0.24
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.18
170 0.19
171 0.2
172 0.17
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.11
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.18
189 0.25
190 0.31
191 0.38
192 0.41
193 0.46
194 0.5
195 0.56
196 0.63
197 0.65
198 0.64
199 0.63
200 0.59
201 0.53
202 0.51
203 0.43
204 0.37
205 0.3
206 0.24
207 0.21
208 0.18
209 0.16
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.08
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.2
242 0.22
243 0.29
244 0.35
245 0.39
246 0.48
247 0.56
248 0.62
249 0.65
250 0.73
251 0.76
252 0.79
253 0.85
254 0.88
255 0.9
256 0.93
257 0.93
258 0.94
259 0.95
260 0.95
261 0.95
262 0.92
263 0.91
264 0.89
265 0.86
266 0.85
267 0.83
268 0.76
269 0.68
270 0.6
271 0.5
272 0.41
273 0.32
274 0.22
275 0.15
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.16
284 0.2
285 0.2
286 0.19
287 0.21
288 0.18
289 0.18
290 0.16
291 0.14
292 0.1
293 0.08
294 0.09
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.16
342 0.14
343 0.18
344 0.21
345 0.2
346 0.2
347 0.2
348 0.22
349 0.25
350 0.24
351 0.21
352 0.22
353 0.21
354 0.21
355 0.22
356 0.2
357 0.18
358 0.19
359 0.2
360 0.16
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.18
365 0.17
366 0.22
367 0.26
368 0.28
369 0.3
370 0.31
371 0.3
372 0.26
373 0.26
374 0.24
375 0.2
376 0.19
377 0.18
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.13
382 0.08
383 0.07
384 0.07
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.08
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.11
414 0.15
415 0.18
416 0.21
417 0.21
418 0.2
419 0.19
420 0.2
421 0.19
422 0.13
423 0.11
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.09
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.07
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.09
464 0.08
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.1
473 0.1
474 0.13
475 0.14
476 0.17
477 0.19
478 0.25
479 0.3
480 0.29
481 0.32
482 0.31
483 0.35
484 0.36
485 0.37
486 0.31
487 0.28
488 0.35
489 0.36
490 0.39
491 0.37
492 0.34
493 0.31
494 0.32
495 0.31
496 0.26
497 0.23
498 0.2
499 0.16
500 0.16
501 0.15
502 0.14
503 0.12
504 0.09
505 0.08
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.07
526 0.13
527 0.15
528 0.16
529 0.15
530 0.23
531 0.3
532 0.36
533 0.4
534 0.37
535 0.37
536 0.39
537 0.37
538 0.3
539 0.24
540 0.21
541 0.21
542 0.19
543 0.19
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.21
548 0.2
549 0.17
550 0.17
551 0.17
552 0.14
553 0.14
554 0.2
555 0.2
556 0.2
557 0.18
558 0.18
559 0.22
560 0.27
561 0.3
562 0.27
563 0.3
564 0.31
565 0.35
566 0.39
567 0.38
568 0.33
569 0.3
570 0.27
571 0.23
572 0.23
573 0.18
574 0.12
575 0.09
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.04
581 0.05
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.09
591 0.11
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.05
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.02
603 0.03
604 0.02
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.04
610 0.05
611 0.08
612 0.1
613 0.12
614 0.13
615 0.14
616 0.15
617 0.19
618 0.19
619 0.16
620 0.16
621 0.18
622 0.19
623 0.19
624 0.2
625 0.16
626 0.17
627 0.18
628 0.17
629 0.14
630 0.13
631 0.16
632 0.16
633 0.17
634 0.19
635 0.19
636 0.18
637 0.22
638 0.24
639 0.22
640 0.21
641 0.26
642 0.31
643 0.38
644 0.4
645 0.37
646 0.35
647 0.34
648 0.35
649 0.36
650 0.32
651 0.28
652 0.26
653 0.26
654 0.27
655 0.31
656 0.3
657 0.23
658 0.21
659 0.18
660 0.18
661 0.17
662 0.16
663 0.12
664 0.1
665 0.09
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.09
673 0.12
674 0.15
675 0.18
676 0.19
677 0.24
678 0.26
679 0.34
680 0.4
681 0.41
682 0.44
683 0.43
684 0.5
685 0.46
686 0.49
687 0.52
688 0.46
689 0.51
690 0.47
691 0.47
692 0.4
693 0.41
694 0.38
695 0.28
696 0.31
697 0.24
698 0.24
699 0.23
700 0.23
701 0.23
702 0.21
703 0.21
704 0.17
705 0.15
706 0.14
707 0.12
708 0.1
709 0.07
710 0.07
711 0.09
712 0.1
713 0.13
714 0.12
715 0.14
716 0.17
717 0.17
718 0.17
719 0.15
720 0.15
721 0.12
722 0.15
723 0.13
724 0.1
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.08
729 0.07
730 0.04
731 0.04
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.07
736 0.08
737 0.08
738 0.1
739 0.12
740 0.11
741 0.14
742 0.16
743 0.17
744 0.16
745 0.16
746 0.15
747 0.13
748 0.14
749 0.11
750 0.08
751 0.09
752 0.1
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.09
757 0.09
758 0.14
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.15
763 0.15
764 0.17
765 0.24
766 0.21
767 0.24
768 0.25
769 0.31
770 0.34
771 0.34
772 0.36
773 0.36
774 0.41
775 0.42
776 0.45
777 0.4
778 0.41
779 0.43
780 0.4
781 0.34
782 0.32
783 0.35
784 0.35
785 0.37
786 0.33
787 0.31
788 0.31
789 0.31
790 0.34
791 0.31
792 0.27
793 0.24
794 0.25
795 0.25
796 0.24
797 0.23
798 0.19
799 0.16
800 0.14
801 0.13
802 0.12
803 0.11
804 0.13
805 0.14
806 0.11
807 0.09
808 0.1
809 0.11
810 0.12
811 0.13
812 0.16
813 0.17
814 0.17
815 0.18
816 0.18
817 0.19
818 0.2
819 0.2
820 0.15
821 0.12
822 0.11
823 0.11
824 0.12
825 0.12
826 0.1
827 0.11
828 0.12
829 0.14
830 0.14
831 0.16
832 0.16
833 0.24
834 0.26
835 0.29
836 0.3
837 0.3
838 0.31
839 0.29
840 0.3
841 0.25
842 0.23
843 0.22
844 0.21
845 0.21
846 0.22
847 0.24
848 0.24
849 0.19
850 0.2
851 0.19
852 0.24
853 0.27
854 0.26
855 0.24
856 0.22
857 0.22
858 0.21
859 0.19
860 0.11
861 0.06
862 0.05
863 0.05
864 0.05
865 0.07
866 0.08
867 0.13
868 0.17
869 0.22
870 0.32