FuNGI

A0A068RVD6

Protein Details

Accession

A0A068RVD6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-184	GYSTRRSSLKTRETRRKSSTHYQRPEPSN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 9, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MTCYKYVVTAQKPTATHFTVKGPFTASTDVNLILGKGTRIEIYTLTPDGLKPTLEFSIYGTIRALDLYKPRGRDKASLFVLTSRRMFCILSYSERTQQIITEANGEIGPTGPPHLWSNRMFGLLDPTSRYFAIGLHERMISVLTHDAFTQIQAREGYSTRRSSLKTRETRRKSSTHYQRPEPSNQINLGLGEKKLVNMVFLHDAKEPTLAVLYDDPDRERFLQTFVLHTRSGEFFPDQLLISQLRADENDNLLIAIPSPIGGVLLIGETTIRYLKKDHNPKAVGIRNCSINCYTMINREGTRFLLGDRTMGHLYLLTLKVIDDGVDEINFIRLGQTSAPICLAYLDNDVVFVGSHVGDSQLVHINSSQTSSTDDILEVMEEFPNLAPIPDFCVVDLDKQGQAQLVTCSGAGQDSSLRIIRNGVGLNELAAIDITGVKGIWSLRPAFDSSHDDMIVFSFINQTSILQLRDYEMSQIHPYASFDISRRTLAAGNVVGNLIIQVTDQSVRLMETGVHGNLLDEWIPKDGAQITVASLNPTQCVLSTGHGRLFVLEVQDHRIMETGETQLNDEISCIDITPLDTSSPQKTSVVAIGVWQQVGVRLLSLPTMQVVAEEILAGTAMPRSILMAKFEDISYLLVALGDGQFYNFKLDTREGRLWDKKRSFLGKMPIALGTFSSNDTTHVFAASDKPSVIHSRNQKLIYSNVNLKDVRCVTSFNSSSFPDAVALTTKDGLIIGQMEEIQKLHITKIGTRDTQSRIVYQESSKTFGVITSRLIARKYESPNATTSAFEVHDDQTFKLIDRIYVKSHERIMSVVNAVFDNDGDEYYVLATGYTNDPYERDAIGRLVVYRITADRKLEFVNQLKVNGIADNLRLFQGKLLASVSQTIQLFRWELEVSGRGHLAPVCSCPIPSICESIATHGNMIVIGDMARAVVAMRYNPQKQTIEAVAHDKQPKEITAVEALGDDLYLAAEESGHLFVYKHTTTKVEEEGERAISGANGSANTTNMDQVEDRLDIVGQWHFGERIHSFRFGSLATNPPDPDTRPVAPSLIFCTANGSIGVLADLSEERFKLLLQMQSNLVKVVPSIGHLSHTDWRNIDVRDIRDKAVNFIDGDLIESFLDLTPQEMQNVVDGRNGGRRLESSVEDLCKVVEELMSVHS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.47
3	0.44
4	0.39
5	0.42
6	0.43
7	0.43
8	0.4
9	0.36
10	0.34
11	0.33
12	0.35
13	0.28
14	0.23
15	0.24
16	0.23
17	0.2
18	0.19
19	0.15
20	0.13
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.12
25	0.12
26	0.13
27	0.15
28	0.14
29	0.17
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.21
37	0.18
38	0.15
39	0.17
40	0.18
41	0.18
42	0.18
43	0.17
44	0.25
45	0.24
46	0.24
47	0.21
48	0.2
49	0.19
50	0.2
51	0.19
52	0.14
53	0.2
54	0.28
55	0.32
56	0.36
57	0.41
58	0.48
59	0.51
60	0.54
61	0.54
62	0.55
63	0.56
64	0.54
65	0.5
66	0.49
67	0.49
68	0.46
69	0.45
70	0.36
71	0.33
72	0.31
73	0.3
74	0.24
75	0.27
76	0.26
77	0.29
78	0.34
79	0.37
80	0.42
81	0.44
82	0.45
83	0.38
84	0.35
85	0.31
86	0.29
87	0.26
88	0.23
89	0.2
90	0.2
91	0.19
92	0.18
93	0.15
94	0.11
95	0.11
96	0.08
97	0.1
98	0.09
99	0.12
100	0.16
101	0.19
102	0.25
103	0.26
104	0.31
105	0.31
106	0.32
107	0.3
108	0.26
109	0.31
110	0.27
111	0.27
112	0.25
113	0.25
114	0.26
115	0.25
116	0.25
117	0.18
118	0.17
119	0.21
120	0.24
121	0.24
122	0.24
123	0.24
124	0.24
125	0.24
126	0.23
127	0.17
128	0.12
129	0.14
130	0.13
131	0.13
132	0.13
133	0.15
134	0.14
135	0.15
136	0.19
137	0.15
138	0.18
139	0.18
140	0.19
141	0.21
142	0.22
143	0.28
144	0.28
145	0.31
146	0.3
147	0.35
148	0.37
149	0.42
150	0.5
151	0.54
152	0.58
153	0.65
154	0.74
155	0.77
156	0.84
157	0.83
158	0.8
159	0.78
160	0.79
161	0.8
162	0.8
163	0.79
164	0.78
165	0.8
166	0.79
167	0.78
168	0.75
169	0.69
170	0.64
171	0.57
172	0.5
173	0.41
174	0.36
175	0.32
176	0.26
177	0.21
178	0.18
179	0.17
180	0.15
181	0.17
182	0.16
183	0.14
184	0.12
185	0.16
186	0.2
187	0.2
188	0.22
189	0.21
190	0.22
191	0.22
192	0.22
193	0.19
194	0.12
195	0.13
196	0.11
197	0.1
198	0.11
199	0.12
200	0.14
201	0.15
202	0.17
203	0.16
204	0.2
205	0.2
206	0.21
207	0.2
208	0.2
209	0.25
210	0.23
211	0.28
212	0.28
213	0.3
214	0.27
215	0.27
216	0.27
217	0.23
218	0.24
219	0.21
220	0.19
221	0.15
222	0.16
223	0.17
224	0.15
225	0.13
226	0.14
227	0.12
228	0.11
229	0.12
230	0.12
231	0.11
232	0.12
233	0.14
234	0.14
235	0.15
236	0.15
237	0.14
238	0.14
239	0.13
240	0.12
241	0.1
242	0.08
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.05
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.13
261	0.22
262	0.32
263	0.43
264	0.5
265	0.57
266	0.58
267	0.6
268	0.67
269	0.66
270	0.6
271	0.55
272	0.5
273	0.46
274	0.45
275	0.44
276	0.36
277	0.29
278	0.26
279	0.26
280	0.24
281	0.23
282	0.25
283	0.24
284	0.24
285	0.25
286	0.25
287	0.22
288	0.22
289	0.17
290	0.15
291	0.17
292	0.16
293	0.16
294	0.15
295	0.18
296	0.17
297	0.17
298	0.16
299	0.11
300	0.12
301	0.15
302	0.15
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.1
308	0.1
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.07
321	0.07
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.12
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.08
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.08
347	0.12
348	0.12
349	0.13
350	0.14
351	0.14
352	0.14
353	0.16
354	0.14
355	0.08
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.12
360	0.11
361	0.1
362	0.1
363	0.1
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.05
368	0.06
369	0.05
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.1
379	0.13
380	0.13
381	0.15
382	0.16
383	0.13
384	0.12
385	0.12
386	0.13
387	0.11
388	0.11
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.07
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.08
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.11
406	0.11
407	0.13
408	0.13
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.09
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.03
419	0.04
420	0.04
421	0.03
422	0.03
423	0.03
424	0.04
425	0.05
426	0.06
427	0.08
428	0.09
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.12
433	0.15
434	0.2
435	0.21
436	0.22
437	0.21
438	0.19
439	0.18
440	0.18
441	0.15
442	0.09
443	0.07
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.08
450	0.11
451	0.11
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.1
459	0.11
460	0.12
461	0.12
462	0.11
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.11
467	0.11
468	0.1
469	0.14
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.14
474	0.15
475	0.14
476	0.16
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.11
481	0.09
482	0.08
483	0.07
484	0.04
485	0.03
486	0.03
487	0.03
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.06
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.06
511	0.07
512	0.08
513	0.08
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.08
525	0.06
526	0.08
527	0.08
528	0.09
529	0.12
530	0.13
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.12
535	0.12
536	0.11
537	0.09
538	0.09
539	0.08
540	0.11
541	0.13
542	0.12
543	0.11
544	0.11
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.09
549	0.09
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.07
556	0.06
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.05
563	0.05
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.08
568	0.1
569	0.11
570	0.12
571	0.12
572	0.12
573	0.12
574	0.12
575	0.11
576	0.09
577	0.09
578	0.11
579	0.11
580	0.1
581	0.09
582	0.08
583	0.08
584	0.09
585	0.08
586	0.05
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.05
597	0.04
598	0.04
599	0.04
600	0.04
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.02
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.06
611	0.07
612	0.08
613	0.1
614	0.1
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.09
619	0.09
620	0.07
621	0.06
622	0.05
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.03
628	0.03
629	0.04
630	0.04
631	0.05
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.09
636	0.12
637	0.15
638	0.21
639	0.23
640	0.24
641	0.31
642	0.39
643	0.41
644	0.48
645	0.48
646	0.45
647	0.48
648	0.5
649	0.46
650	0.43
651	0.47
652	0.41
653	0.39
654	0.37
655	0.32
656	0.28
657	0.24
658	0.19
659	0.12
660	0.1
661	0.09
662	0.09
663	0.08
664	0.1
665	0.11
666	0.12
667	0.1
668	0.1
669	0.09
670	0.09
671	0.12
672	0.12
673	0.12
674	0.11
675	0.11
676	0.12
677	0.16
678	0.18
679	0.2
680	0.27
681	0.32
682	0.38
683	0.39
684	0.38
685	0.36
686	0.38
687	0.37
688	0.33
689	0.33
690	0.29
691	0.32
692	0.31
693	0.29
694	0.31
695	0.28
696	0.27
697	0.21
698	0.21
699	0.19
700	0.26
701	0.27
702	0.23
703	0.24
704	0.22
705	0.23
706	0.22
707	0.2
708	0.13
709	0.12
710	0.11
711	0.1
712	0.1
713	0.09
714	0.09
715	0.08
716	0.08
717	0.07
718	0.07
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.06
724	0.06
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.08
729	0.08
730	0.08
731	0.1
732	0.11
733	0.13
734	0.2
735	0.24
736	0.25
737	0.26
738	0.31
739	0.32
740	0.37
741	0.36
742	0.31
743	0.28
744	0.29
745	0.29
746	0.25
747	0.28
748	0.23
749	0.26
750	0.24
751	0.22
752	0.2
753	0.18
754	0.19
755	0.14
756	0.13
757	0.13
758	0.15
759	0.17
760	0.18
761	0.17
762	0.18
763	0.25
764	0.28
765	0.33
766	0.32
767	0.33
768	0.34
769	0.36
770	0.33
771	0.26
772	0.22
773	0.17
774	0.15
775	0.14
776	0.15
777	0.13
778	0.15
779	0.17
780	0.16
781	0.16
782	0.16
783	0.16
784	0.16
785	0.15
786	0.15
787	0.18
788	0.2
789	0.21
790	0.26
791	0.28
792	0.29
793	0.33
794	0.31
795	0.28
796	0.26
797	0.25
798	0.22
799	0.21
800	0.18
801	0.15
802	0.13
803	0.13
804	0.12
805	0.1
806	0.09
807	0.07
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.06
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.06
818	0.07
819	0.08
820	0.09
821	0.09
822	0.1
823	0.11
824	0.13
825	0.12
826	0.11
827	0.11
828	0.11
829	0.12
830	0.12
831	0.11
832	0.1
833	0.1
834	0.09
835	0.09
836	0.11
837	0.15
838	0.17
839	0.19
840	0.18
841	0.2
842	0.22
843	0.25
844	0.28
845	0.29
846	0.34
847	0.33
848	0.33
849	0.31
850	0.3
851	0.27
852	0.21
853	0.17
854	0.11
855	0.11
856	0.11
857	0.11
858	0.12
859	0.12
860	0.11
861	0.11
862	0.14
863	0.13
864	0.13
865	0.13
866	0.13
867	0.13
868	0.15
869	0.14
870	0.14
871	0.14
872	0.14
873	0.14
874	0.15
875	0.15
876	0.14
877	0.16
878	0.12
879	0.12
880	0.14
881	0.17
882	0.16
883	0.17
884	0.17
885	0.14
886	0.15
887	0.16
888	0.15
889	0.12
890	0.13
891	0.15
892	0.15
893	0.15
894	0.15
895	0.16
896	0.18
897	0.18
898	0.2
899	0.17
900	0.21
901	0.21
902	0.23
903	0.26
904	0.23
905	0.22
906	0.18
907	0.18
908	0.14
909	0.14
910	0.1
911	0.06
912	0.05
913	0.05
914	0.04
915	0.04
916	0.04
917	0.03
918	0.04
919	0.05
920	0.06
921	0.07
922	0.13
923	0.2
924	0.24
925	0.26
926	0.32
927	0.32
928	0.32
929	0.36
930	0.35
931	0.31
932	0.29
933	0.33
934	0.3
935	0.35
936	0.39
937	0.34
938	0.33
939	0.33
940	0.31
941	0.28
942	0.27
943	0.23
944	0.22
945	0.21
946	0.19
947	0.16
948	0.16
949	0.12
950	0.11
951	0.07
952	0.04
953	0.04
954	0.03
955	0.03
956	0.03
957	0.03
958	0.03
959	0.05
960	0.06
961	0.06
962	0.06
963	0.07
964	0.08
965	0.15
966	0.16
967	0.16
968	0.18
969	0.2
970	0.23
971	0.27
972	0.3
973	0.28
974	0.28
975	0.29
976	0.3
977	0.28
978	0.25
979	0.21
980	0.17
981	0.12
982	0.12
983	0.1
984	0.08
985	0.07
986	0.09
987	0.1
988	0.1
989	0.12
990	0.12
991	0.13
992	0.12
993	0.14
994	0.13
995	0.14
996	0.16
997	0.15
998	0.14
999	0.13
1000	0.12
1001	0.1
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.1
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.17
1010	0.17
1011	0.22
1012	0.24
1013	0.26
1014	0.26
1015	0.26
1016	0.27
1017	0.23
1018	0.24
1019	0.21
1020	0.25
1021	0.26
1022	0.29
1023	0.29
1024	0.3
1025	0.33
1026	0.32
1027	0.33
1028	0.33
1029	0.32
1030	0.3
1031	0.31
1032	0.31
1033	0.29
1034	0.28
1035	0.28
1036	0.26
1037	0.24
1038	0.21
1039	0.25
1040	0.23
1041	0.23
1042	0.21
1043	0.17
1044	0.12
1045	0.12
1046	0.12
1047	0.06
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.07
1051	0.08
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.15
1058	0.19
1059	0.23
1060	0.24
1061	0.27
1062	0.31
1063	0.34
1064	0.35
1065	0.3
1066	0.25
1067	0.2
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.14
1071	0.12
1072	0.15
1073	0.15
1074	0.18
1075	0.19
1076	0.23
1077	0.27
1078	0.3
1079	0.32
1080	0.29
1081	0.32
1082	0.35
1083	0.35
1084	0.39
1085	0.38
1086	0.4
1087	0.45
1088	0.47
1089	0.46
1090	0.46
1091	0.46
1092	0.43
1093	0.4
1094	0.37
1095	0.29
1096	0.27
1097	0.27
1098	0.2
1099	0.22
1100	0.18
1101	0.14
1102	0.12
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.08
1106	0.09
1107	0.07
1108	0.08
1109	0.12
1110	0.13
1111	0.14
1112	0.14
1113	0.14
1114	0.19
1115	0.21
1116	0.2
1117	0.19
1118	0.19
1119	0.21
1120	0.27
1121	0.29
1122	0.25
1123	0.25
1124	0.25
1125	0.28
1126	0.31
1127	0.31
1128	0.28
1129	0.32
1130	0.34
1131	0.32
1132	0.31
1133	0.26
1134	0.23
1135	0.22
1136	0.18
1137	0.12
1138	0.1

A0A068RVD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer