Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CBW1

Protein Details
Accession Q6CBW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-34STRAILRQAGKSKRSKPFKPRKTEPLLREQYPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-24AGKSKRSKPFKPRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR001900  RNase_II/R  
Gene Ontology GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006402  P:mRNA catabolic process  
KEGG yli:YALI0C15048g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00773  RNB  
Amino Acid Sequences MRSTRAILRQAGKSKRSKPFKPRKTEPLLREQYPATKDGLFRQASYVDRLKMYLEMRIEDPLLAEKRAGLEYAWKLAFDTNYVPLPKRKHKASSLSSVVSISQKERDLEEGLMALANQQDPGENFRKIRDELALPSYQAQWVGMAITTYEAEEAIKPYRRVPEGWTREKNLVSRDHTFVKSSPTIEDINRPPRVGDLIDVSIKKNLSEIGIIGEVLSSGGFNVIMISGECRHIEGGVAFKMPFTNPAIMEQFSITVDDTQMTHVGIRPALVQEMTEFLRRANLAKTRVLDILQKTVISQRVITLNDLVERMSPHVALHDSPLTPAMMYYATYLAVRSIPARWVIGPGQDSAIQLLYINALDVAASETAINTIREGGLTLDKIISRFEDVLAGTVTLDSLLLTPQERAILLLVKRFALSEVSHNDMAAKANVGVFMRKLEDYGQVIITQTLCMEFLRRLGYIPDDINPWKKAFKLQIPYQGSSEQQDEIQTMYDRLTSSDFTEDLSEKAREDWVGEKKRPFSHFYCIDGPDAHEIDDGVALESRSDGSKYVHVLVADPASYFGVSSDVAHAAQSRVTTAYYPSGVVGMLPQVVQEFGLLQKGAVRSLVISAKLNDKAAAKDPIDMNSVEIRLTKVDGGVGLTYEHVESVLNGSQESEHKSDIKDLHALSSRLRKHRIESGAVNLDVPKVRLNTETGQLDHVSERNPEATLLVSELMILANSLVASFGAKHKIPLMYRYQNMEEENKGTLESRDPVTGVIPFREGVSMWSTIEMAYISADPKPHFSLAIPMYAQSTSPLRRYGDLLNHFQLHAHLQGQNPPFSHSDVQKIIPHVFARQRTVKKGQEDMESYRLKEWLLKRLKSGELYPINWTGLVLEPRRQEMVRVMVMELGMIADYHLTNPDVELGDMLKIGKIVDIDLMERQVEVAEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.81
4 0.82
5 0.84
6 0.87
7 0.89
8 0.9
9 0.9
10 0.9
11 0.9
12 0.9
13 0.86
14 0.85
15 0.83
16 0.75
17 0.69
18 0.62
19 0.59
20 0.52
21 0.46
22 0.38
23 0.34
24 0.33
25 0.35
26 0.41
27 0.35
28 0.33
29 0.34
30 0.36
31 0.35
32 0.39
33 0.39
34 0.33
35 0.32
36 0.32
37 0.3
38 0.31
39 0.3
40 0.29
41 0.25
42 0.25
43 0.25
44 0.27
45 0.26
46 0.21
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.2
51 0.19
52 0.18
53 0.2
54 0.2
55 0.2
56 0.13
57 0.18
58 0.2
59 0.27
60 0.26
61 0.23
62 0.23
63 0.26
64 0.26
65 0.21
66 0.21
67 0.18
68 0.23
69 0.26
70 0.28
71 0.32
72 0.41
73 0.48
74 0.54
75 0.58
76 0.61
77 0.67
78 0.74
79 0.75
80 0.75
81 0.72
82 0.65
83 0.59
84 0.51
85 0.44
86 0.37
87 0.32
88 0.25
89 0.23
90 0.24
91 0.24
92 0.25
93 0.26
94 0.26
95 0.24
96 0.22
97 0.18
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.1
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.18
109 0.22
110 0.24
111 0.25
112 0.28
113 0.34
114 0.33
115 0.35
116 0.33
117 0.31
118 0.31
119 0.35
120 0.33
121 0.28
122 0.29
123 0.27
124 0.23
125 0.2
126 0.16
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.1
141 0.15
142 0.21
143 0.22
144 0.26
145 0.33
146 0.34
147 0.35
148 0.39
149 0.44
150 0.48
151 0.57
152 0.59
153 0.56
154 0.59
155 0.6
156 0.58
157 0.52
158 0.5
159 0.46
160 0.44
161 0.45
162 0.46
163 0.44
164 0.43
165 0.38
166 0.37
167 0.35
168 0.31
169 0.28
170 0.26
171 0.27
172 0.26
173 0.32
174 0.33
175 0.39
176 0.4
177 0.39
178 0.36
179 0.35
180 0.36
181 0.29
182 0.23
183 0.18
184 0.18
185 0.22
186 0.23
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.21
191 0.17
192 0.15
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.12
223 0.11
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.15
232 0.14
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.15
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.1
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.14
266 0.14
267 0.16
268 0.19
269 0.23
270 0.25
271 0.28
272 0.3
273 0.29
274 0.3
275 0.3
276 0.29
277 0.25
278 0.26
279 0.23
280 0.21
281 0.19
282 0.22
283 0.24
284 0.2
285 0.18
286 0.16
287 0.19
288 0.2
289 0.21
290 0.18
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.11
296 0.1
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.1
329 0.13
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.08
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.09
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.1
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.1
404 0.1
405 0.12
406 0.14
407 0.17
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.15
412 0.15
413 0.11
414 0.09
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.1
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.1
431 0.11
432 0.11
433 0.09
434 0.07
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.16
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.16
457 0.19
458 0.21
459 0.26
460 0.3
461 0.32
462 0.41
463 0.44
464 0.45
465 0.42
466 0.39
467 0.33
468 0.28
469 0.25
470 0.16
471 0.12
472 0.11
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.08
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.12
492 0.11
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.1
498 0.15
499 0.22
500 0.28
501 0.31
502 0.34
503 0.38
504 0.44
505 0.45
506 0.45
507 0.39
508 0.41
509 0.41
510 0.42
511 0.41
512 0.37
513 0.35
514 0.3
515 0.28
516 0.22
517 0.19
518 0.15
519 0.11
520 0.09
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.1
535 0.11
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.13
542 0.11
543 0.09
544 0.08
545 0.07
546 0.07
547 0.06
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.08
557 0.07
558 0.08
559 0.08
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.09
565 0.1
566 0.1
567 0.1
568 0.09
569 0.09
570 0.08
571 0.08
572 0.06
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.09
587 0.09
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.07
592 0.1
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.13
597 0.17
598 0.18
599 0.19
600 0.18
601 0.17
602 0.18
603 0.21
604 0.25
605 0.21
606 0.23
607 0.24
608 0.24
609 0.24
610 0.22
611 0.2
612 0.17
613 0.17
614 0.13
615 0.13
616 0.12
617 0.1
618 0.11
619 0.1
620 0.08
621 0.08
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.04
634 0.07
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.1
640 0.13
641 0.17
642 0.16
643 0.15
644 0.17
645 0.18
646 0.23
647 0.24
648 0.24
649 0.24
650 0.22
651 0.25
652 0.28
653 0.28
654 0.26
655 0.33
656 0.38
657 0.4
658 0.46
659 0.43
660 0.43
661 0.51
662 0.52
663 0.49
664 0.45
665 0.45
666 0.44
667 0.42
668 0.39
669 0.3
670 0.27
671 0.23
672 0.21
673 0.17
674 0.13
675 0.14
676 0.15
677 0.19
678 0.19
679 0.24
680 0.26
681 0.23
682 0.24
683 0.23
684 0.23
685 0.21
686 0.2
687 0.16
688 0.15
689 0.15
690 0.14
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.11
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.05
703 0.05
704 0.03
705 0.03
706 0.03
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.04
711 0.05
712 0.08
713 0.13
714 0.13
715 0.14
716 0.18
717 0.23
718 0.24
719 0.29
720 0.35
721 0.38
722 0.41
723 0.45
724 0.44
725 0.43
726 0.44
727 0.42
728 0.35
729 0.3
730 0.28
731 0.23
732 0.21
733 0.19
734 0.17
735 0.17
736 0.17
737 0.17
738 0.16
739 0.16
740 0.16
741 0.17
742 0.19
743 0.17
744 0.16
745 0.15
746 0.14
747 0.14
748 0.15
749 0.13
750 0.12
751 0.13
752 0.13
753 0.12
754 0.13
755 0.12
756 0.11
757 0.12
758 0.1
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.08
763 0.09
764 0.12
765 0.12
766 0.16
767 0.19
768 0.18
769 0.18
770 0.18
771 0.25
772 0.23
773 0.27
774 0.24
775 0.21
776 0.22
777 0.22
778 0.21
779 0.15
780 0.2
781 0.19
782 0.22
783 0.26
784 0.26
785 0.27
786 0.31
787 0.34
788 0.38
789 0.41
790 0.44
791 0.44
792 0.43
793 0.41
794 0.39
795 0.34
796 0.27
797 0.24
798 0.2
799 0.19
800 0.19
801 0.27
802 0.3
803 0.32
804 0.3
805 0.31
806 0.3
807 0.31
808 0.35
809 0.3
810 0.34
811 0.33
812 0.37
813 0.37
814 0.39
815 0.36
816 0.35
817 0.34
818 0.34
819 0.38
820 0.39
821 0.42
822 0.48
823 0.53
824 0.57
825 0.64
826 0.64
827 0.63
828 0.66
829 0.63
830 0.61
831 0.6
832 0.58
833 0.57
834 0.53
835 0.49
836 0.43
837 0.39
838 0.32
839 0.34
840 0.33
841 0.35
842 0.42
843 0.43
844 0.46
845 0.51
846 0.55
847 0.52
848 0.5
849 0.5
850 0.46
851 0.46
852 0.45
853 0.42
854 0.38
855 0.34
856 0.31
857 0.22
858 0.22
859 0.27
860 0.25
861 0.28
862 0.3
863 0.33
864 0.37
865 0.36
866 0.33
867 0.32
868 0.36
869 0.34
870 0.33
871 0.3
872 0.28
873 0.27
874 0.24
875 0.18
876 0.11
877 0.07
878 0.06
879 0.05
880 0.05
881 0.06
882 0.07
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.1
887 0.13
888 0.13
889 0.13
890 0.13
891 0.12
892 0.12
893 0.13
894 0.13
895 0.1
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.09
900 0.09
901 0.11
902 0.12
903 0.13
904 0.15
905 0.17
906 0.15
907 0.15
908 0.14