FuNGI

A0A068SH41

Protein Details

Accession

A0A068SH41

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
367-393	DQGVPAEEKKPKRKRHVRKLSVALPQK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
375-385	KKPKRKRHVRK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 11, cyto 9, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0004519 F:endonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF13975 gag-asp_proteas PF03732 Retrotrans_gag PF17919 RT_RNaseH_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MPQDQDTGVSNYPTFKPEASLSKFLAKPKHFKGDDDENPLRWLKRINRIRKGVPMGDQQCLTMAGSYLTGAAESWWEMVEDKVATWAQFEEMFRTRFAGKDKHHIWWNKVEGRKQMTGETVDEVANDLKEYFELLDVSDDGIRVRHLLKALRESISYELEQRAVLGKYEDVVQEARKLEVVQNKYGRAGAGASTIGASSSTVVRGHAGSDITPSESASANAVQGGNLSSQISALANEIQALKINMVDVRRSRVLRCWGCGKRQWVPLKEVGGAQEHVNPPDNKAGVNLLHGVKVYAQKRGRQQVSENGSAVGAAAVVKKKGRVDADGANAGGTNDGGNVNQGIAGAFGVSGGGQVQVAQHTQAMEVDQGVPAEEKKPKRKRHVRKLSVALPQKDVWERLKHIDAGLSMADWLALSKHAAKDVQDGIRYLHGRRSKKSVGDATQRQSQSTSVPVNYVDLHEHDLTDSSDEWADSDDDEGTFRSDSSEVGSDVFGVVDDDDGGYDSDDTQYEYPYNLEKMRESAPLQAPITIHGHLVQAVFDSGAGVSVISKNLAQKVGLTTNGDQLVVEAFGDNALPAGGISVAVPVRAAGKLRPEHMTIQDVKGDVCLLGTSWHRQYGVRVDHKTGTIHIPTGHGKGMVLLQGRYPRSDQEHDNMVLAVSVTGSRSSSMLDVNGDHKDGALDLRREEAEKDTQLLHRYVDEVLDDKEHGDEDMPLEIKEVVDSYACCFVEVSGLGRVKGVEHTIPTTTDKAIRTSPYRLSWEEQDHLREELDRLLELGLIKPSDGQWTSPILFVKKKDGSLRLCVDYRKLNDITVKDAFPLPNIDELLDSVGGSRYFSTLDAASGYWQIPLAKDSIAKSGFTTKWGTYTWQAMPFGLCSAPQTFQRAVTNILPPYIGDFAYVFIDDIIVCSKTLEEHKVHLVKVLEACQAANLRLKRSKCIFGRTQVEYLGHVITADGLLPNDRNTEKIMKMPIPKNAKEVKTWLGTTGYYRRHIKGYAQLARPLNRLLQKDVAFVWNEEQQLAFEALKQALITPPVLAYPDRNQVQILTTDASTLGLGAVLSQSPTGDAKDERVIAYASRSLRNSEYNYAATHLEALAVVWAVEHYRHFLSGRRFILYTDHAALPYVFQQTRPSVKLTRWASSLMEYDFVARYRPGRANPADALSRLLPVVDVEEELSDMKEEWE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.21
3	0.23
4	0.26
5	0.35
6	0.38
7	0.41
8	0.41
9	0.48
10	0.51
11	0.53
12	0.57
13	0.55
14	0.57
15	0.6
16	0.68
17	0.61
18	0.6
19	0.62
20	0.63
21	0.64
22	0.65
23	0.61
24	0.52
25	0.54
26	0.55
27	0.48
28	0.4
29	0.41
30	0.39
31	0.46
32	0.55
33	0.62
34	0.68
35	0.76
36	0.79
37	0.79
38	0.79
39	0.73
40	0.69
41	0.69
42	0.62
43	0.59
44	0.53
45	0.44
46	0.37
47	0.33
48	0.26
49	0.17
50	0.13
51	0.1
52	0.09
53	0.09
54	0.09
55	0.07
56	0.07
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.08
64	0.08
65	0.09
66	0.11
67	0.11
68	0.1
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.15
74	0.14
75	0.17
76	0.17
77	0.2
78	0.24
79	0.26
80	0.25
81	0.27
82	0.26
83	0.26
84	0.32
85	0.35
86	0.34
87	0.44
88	0.47
89	0.52
90	0.59
91	0.62
92	0.61
93	0.62
94	0.66
95	0.64
96	0.67
97	0.65
98	0.65
99	0.65
100	0.65
101	0.57
102	0.51
103	0.47
104	0.44
105	0.39
106	0.33
107	0.28
108	0.23
109	0.21
110	0.19
111	0.16
112	0.14
113	0.13
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.1
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.1
123	0.1
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.11
132	0.13
133	0.16
134	0.21
135	0.26
136	0.33
137	0.37
138	0.37
139	0.37
140	0.36
141	0.35
142	0.34
143	0.29
144	0.25
145	0.22
146	0.21
147	0.2
148	0.18
149	0.19
150	0.16
151	0.16
152	0.14
153	0.13
154	0.13
155	0.16
156	0.15
157	0.13
158	0.15
159	0.15
160	0.19
161	0.2
162	0.19
163	0.18
164	0.19
165	0.22
166	0.28
167	0.31
168	0.35
169	0.38
170	0.39
171	0.39
172	0.38
173	0.33
174	0.26
175	0.23
176	0.15
177	0.13
178	0.11
179	0.1
180	0.09
181	0.09
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.06
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.1
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.13
200	0.13
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.07
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.11
232	0.12
233	0.17
234	0.17
235	0.23
236	0.28
237	0.3
238	0.31
239	0.36
240	0.45
241	0.44
242	0.46
243	0.51
244	0.51
245	0.56
246	0.6
247	0.59
248	0.56
249	0.61
250	0.65
251	0.6
252	0.59
253	0.57
254	0.53
255	0.48
256	0.42
257	0.35
258	0.29
259	0.26
260	0.21
261	0.23
262	0.21
263	0.22
264	0.27
265	0.25
266	0.25
267	0.29
268	0.29
269	0.22
270	0.22
271	0.23
272	0.18
273	0.19
274	0.21
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.16
279	0.15
280	0.22
281	0.22
282	0.26
283	0.29
284	0.34
285	0.42
286	0.52
287	0.54
288	0.5
289	0.53
290	0.54
291	0.57
292	0.55
293	0.47
294	0.37
295	0.33
296	0.29
297	0.24
298	0.15
299	0.08
300	0.05
301	0.07
302	0.08
303	0.1
304	0.11
305	0.13
306	0.15
307	0.2
308	0.22
309	0.22
310	0.25
311	0.29
312	0.33
313	0.32
314	0.3
315	0.25
316	0.23
317	0.2
318	0.15
319	0.1
320	0.06
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.11
360	0.17
361	0.24
362	0.34
363	0.44
364	0.53
365	0.64
366	0.75
367	0.82
368	0.87
369	0.91
370	0.9
371	0.9
372	0.88
373	0.84
374	0.82
375	0.79
376	0.69
377	0.61
378	0.53
379	0.46
380	0.41
381	0.36
382	0.32
383	0.29
384	0.29
385	0.3
386	0.32
387	0.3
388	0.28
389	0.26
390	0.21
391	0.18
392	0.15
393	0.11
394	0.08
395	0.07
396	0.07
397	0.05
398	0.05
399	0.03
400	0.04
401	0.05
402	0.08
403	0.08
404	0.1
405	0.11
406	0.12
407	0.16
408	0.21
409	0.23
410	0.21
411	0.21
412	0.21
413	0.25
414	0.26
415	0.22
416	0.24
417	0.28
418	0.32
419	0.34
420	0.41
421	0.41
422	0.43
423	0.48
424	0.49
425	0.48
426	0.54
427	0.57
428	0.53
429	0.55
430	0.52
431	0.46
432	0.4
433	0.33
434	0.25
435	0.24
436	0.22
437	0.15
438	0.16
439	0.15
440	0.16
441	0.15
442	0.15
443	0.11
444	0.1
445	0.13
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.11
452	0.1
453	0.07
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.06
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.08
478	0.07
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.03
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.11
502	0.12
503	0.12
504	0.14
505	0.16
506	0.18
507	0.17
508	0.22
509	0.23
510	0.26
511	0.25
512	0.24
513	0.22
514	0.21
515	0.22
516	0.16
517	0.14
518	0.11
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.08
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.06
538	0.08
539	0.09
540	0.08
541	0.09
542	0.11
543	0.12
544	0.13
545	0.13
546	0.13
547	0.15
548	0.15
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.09
553	0.07
554	0.07
555	0.04
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.02
561	0.02
562	0.02
563	0.02
564	0.02
565	0.02
566	0.02
567	0.02
568	0.04
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.12
578	0.14
579	0.16
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.22
584	0.25
585	0.2
586	0.2
587	0.19
588	0.17
589	0.15
590	0.13
591	0.12
592	0.08
593	0.06
594	0.05
595	0.03
596	0.05
597	0.06
598	0.09
599	0.1
600	0.11
601	0.12
602	0.12
603	0.14
604	0.2
605	0.27
606	0.31
607	0.32
608	0.33
609	0.34
610	0.34
611	0.33
612	0.27
613	0.22
614	0.16
615	0.15
616	0.13
617	0.14
618	0.15
619	0.16
620	0.15
621	0.12
622	0.11
623	0.1
624	0.11
625	0.11
626	0.1
627	0.09
628	0.1
629	0.15
630	0.16
631	0.17
632	0.17
633	0.16
634	0.21
635	0.24
636	0.24
637	0.22
638	0.26
639	0.26
640	0.25
641	0.23
642	0.17
643	0.14
644	0.12
645	0.08
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.07
657	0.07
658	0.08
659	0.1
660	0.1
661	0.1
662	0.09
663	0.09
664	0.08
665	0.08
666	0.09
667	0.11
668	0.11
669	0.11
670	0.13
671	0.14
672	0.14
673	0.15
674	0.16
675	0.15
676	0.15
677	0.16
678	0.16
679	0.18
680	0.2
681	0.2
682	0.17
683	0.14
684	0.14
685	0.13
686	0.12
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.09
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.07
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.08
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.08
706	0.07
707	0.05
708	0.06
709	0.06
710	0.07
711	0.12
712	0.12
713	0.11
714	0.11
715	0.11
716	0.12
717	0.12
718	0.12
719	0.12
720	0.13
721	0.13
722	0.13
723	0.13
724	0.12
725	0.13
726	0.13
727	0.09
728	0.1
729	0.11
730	0.12
731	0.13
732	0.15
733	0.15
734	0.14
735	0.18
736	0.18
737	0.18
738	0.2
739	0.22
740	0.24
741	0.27
742	0.3
743	0.3
744	0.33
745	0.33
746	0.33
747	0.35
748	0.36
749	0.34
750	0.32
751	0.31
752	0.28
753	0.26
754	0.24
755	0.19
756	0.16
757	0.15
758	0.14
759	0.11
760	0.1
761	0.09
762	0.1
763	0.09
764	0.1
765	0.09
766	0.08
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.12
774	0.16
775	0.17
776	0.19
777	0.2
778	0.19
779	0.22
780	0.22
781	0.29
782	0.28
783	0.31
784	0.33
785	0.39
786	0.39
787	0.43
788	0.46
789	0.42
790	0.41
791	0.39
792	0.37
793	0.36
794	0.35
795	0.34
796	0.3
797	0.28
798	0.31
799	0.31
800	0.33
801	0.29
802	0.27
803	0.22
804	0.24
805	0.22
806	0.18
807	0.19
808	0.15
809	0.15
810	0.15
811	0.14
812	0.12
813	0.12
814	0.12
815	0.1
816	0.08
817	0.06
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.08
822	0.07
823	0.07
824	0.08
825	0.09
826	0.08
827	0.08
828	0.09
829	0.09
830	0.09
831	0.1
832	0.1
833	0.08
834	0.09
835	0.09
836	0.09
837	0.09
838	0.1
839	0.09
840	0.11
841	0.12
842	0.17
843	0.18
844	0.18
845	0.18
846	0.24
847	0.24
848	0.24
849	0.26
850	0.21
851	0.23
852	0.23
853	0.25
854	0.21
855	0.25
856	0.26
857	0.27
858	0.27
859	0.25
860	0.24
861	0.22
862	0.2
863	0.15
864	0.12
865	0.09
866	0.11
867	0.13
868	0.14
869	0.19
870	0.18
871	0.21
872	0.24
873	0.24
874	0.25
875	0.27
876	0.3
877	0.25
878	0.25
879	0.22
880	0.19
881	0.2
882	0.17
883	0.14
884	0.09
885	0.09
886	0.1
887	0.1
888	0.11
889	0.08
890	0.06
891	0.07
892	0.06
893	0.06
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.07
898	0.07
899	0.1
900	0.13
901	0.18
902	0.18
903	0.2
904	0.29
905	0.32
906	0.32
907	0.33
908	0.31
909	0.28
910	0.29
911	0.29
912	0.23
913	0.2
914	0.2
915	0.19
916	0.19
917	0.18
918	0.22
919	0.21
920	0.26
921	0.32
922	0.33
923	0.38
924	0.42
925	0.49
926	0.48
927	0.54
928	0.54
929	0.56
930	0.62
931	0.58
932	0.55
933	0.48
934	0.44
935	0.37
936	0.32
937	0.24
938	0.17
939	0.12
940	0.1
941	0.08
942	0.07
943	0.06
944	0.05
945	0.05
946	0.07
947	0.08
948	0.09
949	0.12
950	0.13
951	0.14
952	0.17
953	0.22
954	0.22
955	0.26
956	0.31
957	0.33
958	0.42
959	0.45
960	0.5
961	0.53
962	0.53
963	0.56
964	0.59
965	0.56
966	0.5
967	0.51
968	0.48
969	0.44
970	0.43
971	0.37
972	0.31
973	0.29
974	0.31
975	0.34
976	0.34
977	0.36
978	0.4
979	0.4
980	0.41
981	0.43
982	0.43
983	0.43
984	0.48
985	0.5
986	0.49
987	0.54
988	0.56
989	0.57
990	0.55
991	0.48
992	0.44
993	0.41
994	0.41
995	0.38
996	0.4
997	0.38
998	0.37
999	0.37
1000	0.34
1001	0.29
1002	0.27
1003	0.26
1004	0.22
1005	0.22
1006	0.2
1007	0.18
1008	0.15
1009	0.16
1010	0.17
1011	0.14
1012	0.11
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.14
1016	0.13
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.11
1022	0.11
1023	0.11
1024	0.13
1025	0.13
1026	0.15
1027	0.18
1028	0.27
1029	0.28
1030	0.28
1031	0.28
1032	0.27
1033	0.29
1034	0.26
1035	0.24
1036	0.17
1037	0.15
1038	0.15
1039	0.15
1040	0.14
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.07
1044	0.05
1045	0.05
1046	0.05
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.07
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.12
1056	0.13
1057	0.16
1058	0.21
1059	0.22
1060	0.21
1061	0.22
1062	0.22
1063	0.19
1064	0.22
1065	0.24
1066	0.22
1067	0.26
1068	0.27
1069	0.29
1070	0.31
1071	0.37
1072	0.38
1073	0.38
1074	0.39
1075	0.36
1076	0.36
1077	0.34
1078	0.31
1079	0.25
1080	0.21
1081	0.16
1082	0.12
1083	0.1
1084	0.09
1085	0.07
1086	0.07
1087	0.06
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.06
1091	0.07
1092	0.08
1093	0.11
1094	0.12
1095	0.15
1096	0.16
1097	0.22
1098	0.3
1099	0.37
1100	0.39
1101	0.39
1102	0.38
1103	0.37
1104	0.42
1105	0.4
1106	0.37
1107	0.32
1108	0.31
1109	0.27
1110	0.28
1111	0.28
1112	0.23
1113	0.22
1114	0.24
1115	0.2
1116	0.2
1117	0.25
1118	0.31
1119	0.38
1120	0.39
1121	0.4
1122	0.38
1123	0.4
1124	0.49
1125	0.48
1126	0.47
1127	0.42
1128	0.42
1129	0.38
1130	0.38
1131	0.39
1132	0.3
1133	0.27
1134	0.22
1135	0.22
1136	0.22
1137	0.2
1138	0.19
1139	0.17
1140	0.18
1141	0.24
1142	0.3
1143	0.32
1144	0.4
1145	0.43
1146	0.47
1147	0.48
1148	0.52
1149	0.48
1150	0.42
1151	0.42
1152	0.33
1153	0.3
1154	0.24
1155	0.2
1156	0.15
1157	0.12
1158	0.14
1159	0.11
1160	0.11
1161	0.1
1162	0.1
1163	0.11
1164	0.11
1165	0.12
1166	0.1

A0A068SH41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer