Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068SC21

Protein Details
Accession A0A068SC21    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-439RSSTTAKRTPTKKKRPFEFNVHAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MASTNQQQCSSKPESSSPPWSMSSRGSSQSSNGKSDSFRNGDPRNSYRDLRSDWQRPTKDMLESHNRILFLIAKLTGSRVQVSVKDGSKYEGILYSGTSQGELGIVLNDPHKVYDPITVSPPSSRVQTAAASPSILIMNKDLVSIMSSIMDDDLIVDNENCCGDQVEFGEQRELHECDDDKVAGDLIFLDDDDDDDTSFNNKPFEIKTTFEDDDEPPTGFLERAEYEYGEFERYAKGIEQHEKSSAMDIHGSLVEYDQSVDEDRMDEEKNRYSVAPTRPARAPSDYFIDHKVEVFPAMDQDFIYYSTHFDESTIPHFVAPSPMTNHICTCEKRKEKVEQPVSRPLRHYSRVMRGKLYVEKYAQKMDDKEKHLEELVRFHQTFKLNFPIPADIEPLLSKQNQSTFTLDNEVFAQLYERSSTTAKRTPTKKKRPFEFNVHAEEFIPDPEIQEFLSARNRGSAASLSFLFPRDNRSTLKNADTRHLTLDEVFKHPFSKNGVEISAHAIGPTWPFGTTQYNMQFRDDAFEQLFTPSYNHIQYQYPHRYTTPSMNPTTPTTHEHSSTHATTDPQLGRNNFTSPAFTAIRSVTGTKTPLNSQYSPEPYNTAFLYTPLLPENDAPSAISHPSPSHNEDFHQQREPHEYQSYYVVNGSPPLLSPYFVPETIYPNHQIPPPTEDTRIQPMSPQPYYTGSEYSYWRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.5
3 0.57
4 0.53
5 0.51
6 0.51
7 0.49
8 0.46
9 0.43
10 0.42
11 0.38
12 0.4
13 0.39
14 0.37
15 0.4
16 0.46
17 0.45
18 0.43
19 0.39
20 0.37
21 0.36
22 0.41
23 0.44
24 0.4
25 0.4
26 0.45
27 0.49
28 0.53
29 0.58
30 0.57
31 0.56
32 0.57
33 0.56
34 0.52
35 0.54
36 0.54
37 0.54
38 0.59
39 0.6
40 0.64
41 0.7
42 0.68
43 0.64
44 0.65
45 0.61
46 0.57
47 0.53
48 0.52
49 0.52
50 0.53
51 0.55
52 0.51
53 0.46
54 0.4
55 0.38
56 0.34
57 0.24
58 0.23
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.19
63 0.21
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.2
68 0.22
69 0.26
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.28
74 0.3
75 0.28
76 0.26
77 0.24
78 0.19
79 0.17
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.19
102 0.21
103 0.22
104 0.26
105 0.27
106 0.25
107 0.26
108 0.27
109 0.22
110 0.22
111 0.21
112 0.18
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.2
118 0.18
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.13
124 0.1
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.16
154 0.18
155 0.18
156 0.22
157 0.21
158 0.22
159 0.25
160 0.25
161 0.19
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.21
166 0.19
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.11
171 0.1
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.13
190 0.15
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.29
196 0.3
197 0.28
198 0.3
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.22
203 0.15
204 0.15
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.17
225 0.24
226 0.26
227 0.27
228 0.29
229 0.29
230 0.28
231 0.27
232 0.23
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.12
254 0.14
255 0.18
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.24
261 0.27
262 0.34
263 0.32
264 0.35
265 0.37
266 0.4
267 0.4
268 0.37
269 0.34
270 0.26
271 0.3
272 0.27
273 0.26
274 0.26
275 0.25
276 0.2
277 0.19
278 0.17
279 0.13
280 0.12
281 0.11
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.07
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.19
313 0.19
314 0.22
315 0.22
316 0.26
317 0.31
318 0.35
319 0.38
320 0.44
321 0.49
322 0.52
323 0.61
324 0.65
325 0.62
326 0.61
327 0.67
328 0.66
329 0.6
330 0.55
331 0.48
332 0.44
333 0.4
334 0.4
335 0.36
336 0.42
337 0.48
338 0.47
339 0.44
340 0.4
341 0.4
342 0.41
343 0.38
344 0.31
345 0.26
346 0.29
347 0.29
348 0.3
349 0.28
350 0.24
351 0.25
352 0.3
353 0.35
354 0.35
355 0.37
356 0.34
357 0.34
358 0.33
359 0.33
360 0.25
361 0.23
362 0.22
363 0.24
364 0.24
365 0.23
366 0.27
367 0.27
368 0.28
369 0.26
370 0.29
371 0.25
372 0.25
373 0.26
374 0.23
375 0.2
376 0.2
377 0.19
378 0.13
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.14
387 0.16
388 0.18
389 0.2
390 0.19
391 0.2
392 0.23
393 0.21
394 0.18
395 0.16
396 0.14
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.12
407 0.17
408 0.21
409 0.25
410 0.32
411 0.4
412 0.5
413 0.6
414 0.69
415 0.74
416 0.78
417 0.83
418 0.85
419 0.83
420 0.82
421 0.79
422 0.73
423 0.7
424 0.62
425 0.53
426 0.44
427 0.38
428 0.29
429 0.2
430 0.17
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.16
440 0.16
441 0.16
442 0.17
443 0.17
444 0.16
445 0.17
446 0.17
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.13
452 0.14
453 0.14
454 0.12
455 0.19
456 0.2
457 0.22
458 0.23
459 0.27
460 0.31
461 0.33
462 0.4
463 0.37
464 0.35
465 0.38
466 0.4
467 0.37
468 0.35
469 0.32
470 0.26
471 0.23
472 0.27
473 0.24
474 0.23
475 0.22
476 0.2
477 0.22
478 0.21
479 0.23
480 0.23
481 0.24
482 0.23
483 0.24
484 0.25
485 0.23
486 0.24
487 0.25
488 0.22
489 0.18
490 0.15
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.09
496 0.08
497 0.08
498 0.11
499 0.15
500 0.15
501 0.21
502 0.27
503 0.32
504 0.33
505 0.34
506 0.33
507 0.29
508 0.33
509 0.28
510 0.23
511 0.19
512 0.18
513 0.17
514 0.17
515 0.18
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.15
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.21
524 0.24
525 0.33
526 0.4
527 0.39
528 0.39
529 0.39
530 0.41
531 0.41
532 0.47
533 0.46
534 0.42
535 0.43
536 0.43
537 0.45
538 0.44
539 0.45
540 0.39
541 0.34
542 0.33
543 0.33
544 0.34
545 0.32
546 0.33
547 0.35
548 0.32
549 0.3
550 0.27
551 0.25
552 0.24
553 0.31
554 0.3
555 0.28
556 0.34
557 0.33
558 0.35
559 0.36
560 0.37
561 0.31
562 0.29
563 0.27
564 0.22
565 0.26
566 0.23
567 0.21
568 0.21
569 0.19
570 0.21
571 0.2
572 0.2
573 0.17
574 0.19
575 0.21
576 0.21
577 0.24
578 0.26
579 0.31
580 0.36
581 0.35
582 0.36
583 0.41
584 0.45
585 0.44
586 0.41
587 0.38
588 0.32
589 0.34
590 0.3
591 0.25
592 0.19
593 0.18
594 0.2
595 0.17
596 0.18
597 0.17
598 0.17
599 0.15
600 0.16
601 0.19
602 0.16
603 0.16
604 0.15
605 0.14
606 0.16
607 0.17
608 0.16
609 0.15
610 0.15
611 0.2
612 0.25
613 0.3
614 0.33
615 0.32
616 0.34
617 0.4
618 0.45
619 0.45
620 0.49
621 0.45
622 0.43
623 0.51
624 0.51
625 0.49
626 0.48
627 0.44
628 0.37
629 0.42
630 0.39
631 0.31
632 0.3
633 0.25
634 0.2
635 0.2
636 0.19
637 0.13
638 0.13
639 0.16
640 0.15
641 0.15
642 0.15
643 0.2
644 0.23
645 0.23
646 0.25
647 0.22
648 0.26
649 0.29
650 0.32
651 0.29
652 0.28
653 0.31
654 0.32
655 0.34
656 0.32
657 0.36
658 0.39
659 0.39
660 0.41
661 0.4
662 0.42
663 0.48
664 0.48
665 0.41
666 0.39
667 0.43
668 0.48
669 0.47
670 0.43
671 0.37
672 0.38
673 0.42
674 0.39
675 0.35
676 0.28
677 0.3