Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A068SHK6

Protein Details
Accession A0A068SHK6    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-61RRLCILKGIYPRQPKNHKKANKGSSAPAHydrophilic
486-506GDDEKKKKKSAGKKRSATEIDBasic
518-556MMSIKQKKLYKIMKATNQRKADETAKLERKKRALKKSKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
490-500KKKKKSAGKKR
536-556RKADETAKLERKKRALKKSKN
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR010613  PES  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF16589  BRCT_2  
PF06732  Pescadillo_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
CDD cd17709  BRCT_pescadillo_like  
Amino Acid Sequences MAKIQKKGKKGAAATYITRQQALKKLQISLADFRRLCILKGIYPRQPKNHKKANKGSSAPATFYYVKDIQYLMHEPLLDKFRQYKTFARKLNKVLHKGDYSTAKSLEENHRPVYTLDHIVKERYPTFVDALRDLDDAISMLFLFSKMPADNKIKSRVVHDCQRLIAEFQAYVMKSRSLRKVFFSIKGIYYQAEIKGQTITWIVPYQFSQSTPTDVDFRVMLTFLEFYITLMGFVNFRLYNELNISYPPKLEASSGSIQLDNVPASLKQADDEEAAGADATTTLDEFKTVGSNANEEEEENEDAGAATLRQIQEHSQEVSSLRNLFSKCVFFLSRETPRYALEFMITSCGGQVSWDETVGANPPYPESDERITHHICDRPTVNNRVLSRAYIQPQWVADCINRRKLVRPSLYEPGKELPPHLSPFVEVKEGDYVPDDIEDDTAEQGTEEKENAAATNEATKNEDEIYEEELKAEAEGVTFSEYKGDGDDEKKKKKSAGKKRSATEIDEDAEQKEMAMGMMSIKQKKLYKIMKATNQRKADETAKLERKKRALKKSKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.6
3 0.59
4 0.52
5 0.5
6 0.43
7 0.4
8 0.43
9 0.46
10 0.46
11 0.43
12 0.46
13 0.47
14 0.51
15 0.5
16 0.5
17 0.49
18 0.51
19 0.47
20 0.44
21 0.49
22 0.44
23 0.4
24 0.39
25 0.36
26 0.33
27 0.43
28 0.5
29 0.5
30 0.6
31 0.66
32 0.69
33 0.77
34 0.81
35 0.81
36 0.85
37 0.85
38 0.85
39 0.89
40 0.88
41 0.87
42 0.81
43 0.77
44 0.76
45 0.7
46 0.61
47 0.52
48 0.48
49 0.4
50 0.36
51 0.36
52 0.29
53 0.27
54 0.26
55 0.25
56 0.2
57 0.23
58 0.26
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.25
64 0.28
65 0.24
66 0.23
67 0.28
68 0.33
69 0.38
70 0.42
71 0.46
72 0.51
73 0.6
74 0.65
75 0.67
76 0.68
77 0.71
78 0.76
79 0.76
80 0.74
81 0.7
82 0.68
83 0.63
84 0.57
85 0.54
86 0.52
87 0.47
88 0.42
89 0.39
90 0.33
91 0.3
92 0.35
93 0.39
94 0.4
95 0.4
96 0.39
97 0.39
98 0.39
99 0.38
100 0.37
101 0.32
102 0.3
103 0.29
104 0.3
105 0.31
106 0.32
107 0.33
108 0.33
109 0.3
110 0.26
111 0.25
112 0.23
113 0.24
114 0.26
115 0.26
116 0.23
117 0.24
118 0.22
119 0.2
120 0.18
121 0.16
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.16
136 0.21
137 0.27
138 0.31
139 0.39
140 0.4
141 0.4
142 0.44
143 0.47
144 0.48
145 0.51
146 0.52
147 0.47
148 0.44
149 0.44
150 0.4
151 0.32
152 0.27
153 0.19
154 0.14
155 0.12
156 0.15
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.17
162 0.23
163 0.31
164 0.33
165 0.34
166 0.37
167 0.44
168 0.45
169 0.46
170 0.45
171 0.39
172 0.35
173 0.35
174 0.32
175 0.24
176 0.21
177 0.19
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.1
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.14
228 0.15
229 0.12
230 0.14
231 0.16
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.13
240 0.15
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.09
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.07
258 0.08
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.03
293 0.03
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.11
300 0.14
301 0.15
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.14
306 0.15
307 0.14
308 0.12
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.18
316 0.18
317 0.15
318 0.18
319 0.24
320 0.29
321 0.3
322 0.31
323 0.29
324 0.29
325 0.3
326 0.27
327 0.2
328 0.14
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.09
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.1
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.12
352 0.13
353 0.15
354 0.18
355 0.2
356 0.22
357 0.27
358 0.27
359 0.26
360 0.29
361 0.29
362 0.26
363 0.27
364 0.28
365 0.29
366 0.35
367 0.39
368 0.38
369 0.41
370 0.41
371 0.42
372 0.41
373 0.35
374 0.32
375 0.31
376 0.31
377 0.27
378 0.27
379 0.24
380 0.24
381 0.24
382 0.21
383 0.17
384 0.17
385 0.24
386 0.28
387 0.34
388 0.37
389 0.37
390 0.43
391 0.5
392 0.57
393 0.55
394 0.56
395 0.54
396 0.6
397 0.63
398 0.56
399 0.51
400 0.45
401 0.41
402 0.35
403 0.31
404 0.26
405 0.26
406 0.28
407 0.26
408 0.23
409 0.21
410 0.23
411 0.24
412 0.22
413 0.18
414 0.16
415 0.2
416 0.19
417 0.18
418 0.17
419 0.16
420 0.13
421 0.14
422 0.13
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.17
443 0.18
444 0.19
445 0.21
446 0.21
447 0.2
448 0.2
449 0.2
450 0.14
451 0.14
452 0.19
453 0.2
454 0.19
455 0.18
456 0.18
457 0.18
458 0.15
459 0.14
460 0.09
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.13
472 0.14
473 0.2
474 0.31
475 0.38
476 0.47
477 0.52
478 0.54
479 0.6
480 0.66
481 0.71
482 0.72
483 0.74
484 0.76
485 0.79
486 0.81
487 0.84
488 0.79
489 0.72
490 0.66
491 0.59
492 0.5
493 0.44
494 0.4
495 0.31
496 0.28
497 0.23
498 0.17
499 0.13
500 0.11
501 0.08
502 0.08
503 0.07
504 0.07
505 0.13
506 0.19
507 0.22
508 0.23
509 0.3
510 0.35
511 0.4
512 0.49
513 0.52
514 0.56
515 0.63
516 0.71
517 0.74
518 0.8
519 0.84
520 0.84
521 0.82
522 0.75
523 0.68
524 0.65
525 0.6
526 0.57
527 0.55
528 0.55
529 0.59
530 0.65
531 0.68
532 0.71
533 0.74
534 0.77
535 0.8
536 0.81