FuNGI

Q6CHP9

Protein Details

Accession

Q6CHP9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
583-607	PSEMKTYSARQKKPQRYDLQTQFSP	Hydrophilic
661-680	VERGKWRKSDAYKNKYRTEA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 3, extr 3, pero 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR033443 PPR_long IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003729 F:mRNA binding GO:0006397 P:mRNA processing GO:0008380 P:RNA splicing
KEGG	yli:YALI0A06611g -
Pfam	View protein in Pfam PF01535 PPR PF17177 PPR_long
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR

Amino Acid Sequences

MLRARLLVPLVRPALVHRLDRCYSTALGSRFRKSNAVRSELKFDFPDVPVKEELFVQETPDKPLKENKTHVSDEDIDSLFDSLMSDHKAAEATEQHKELPPAEQERPSGANTHTAPIKHDTKSPMEYLAKSKLTPHVSRQVAKAMAGSPTQLLLATPASHHISTPAYQNDLWKHVISTLNTSKFQIPDFNSLMTTIPVDIRAQFLPQIEEWISQRGVKPSAITYGQVMLGYAEDGNVEKVEERFRQMIDNNITPTVHTYAHRLKACDKRGDLKQAMEIFDDLKLAQQLYGIRPNQVIFTTLISTSLRNHKVELASQIFEYMKYASLETQPTAHTYNSLITASAIRSNTERALDLFEEMKQKSVANVRTYQSLILACLRQEKYHLKAWELLLELREQHSESFYSRHTLVVVFQAAAVTGDLVFLRSLYKQLCMSPETYPDAILTQLLMQAYARYDTRTKPVASSALRATWGRLYGGNAQEMMRGFLFPDIEGMVQLNEEHPGMIPPFLPTNTIESLSFDRKKIIAESRAIFQFLKNNKPQLLDNIAATDYLKAGARHRDFPEFLRRYNEVSVGAGEAEGAVISPSEMKTYSARQKKPQRYDLQTQFSPAPRSDAHFFIALNAVQADCIADASERDPNLNHPLRRLTPQEMTDRLEFSQDVWVERGKWRKSDAYKNKYRTEAQQISADYNFALKIINALAALKQLGEAAAILSATPATFNWKKHDLAFFHNVAQAFYHEEAMKQIHKAVSRSKHLDEVIRNPDSEKSAEFDVFSI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.38
4	0.35
5	0.41
6	0.42
7	0.44
8	0.43
9	0.38
10	0.34
11	0.32
12	0.35
13	0.31
14	0.39
15	0.42
16	0.46
17	0.47
18	0.48
19	0.53
20	0.51
21	0.57
22	0.55
23	0.57
24	0.59
25	0.58
26	0.64
27	0.57
28	0.56
29	0.47
30	0.42
31	0.39
32	0.33
33	0.38
34	0.31
35	0.34
36	0.32
37	0.32
38	0.3
39	0.26
40	0.27
41	0.22
42	0.2
43	0.21
44	0.25
45	0.25
46	0.31
47	0.36
48	0.35
49	0.34
50	0.44
51	0.48
52	0.51
53	0.58
54	0.59
55	0.6
56	0.62
57	0.6
58	0.58
59	0.52
60	0.46
61	0.43
62	0.36
63	0.28
64	0.26
65	0.25
66	0.18
67	0.14
68	0.11
69	0.07
70	0.09
71	0.12
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.13
77	0.16
78	0.2
79	0.21
80	0.26
81	0.27
82	0.28
83	0.3
84	0.32
85	0.29
86	0.27
87	0.3
88	0.32
89	0.35
90	0.37
91	0.35
92	0.37
93	0.39
94	0.35
95	0.32
96	0.26
97	0.29
98	0.27
99	0.3
100	0.29
101	0.27
102	0.3
103	0.33
104	0.38
105	0.32
106	0.36
107	0.37
108	0.39
109	0.42
110	0.4
111	0.4
112	0.39
113	0.4
114	0.39
115	0.42
116	0.38
117	0.35
118	0.37
119	0.37
120	0.41
121	0.42
122	0.43
123	0.45
124	0.49
125	0.52
126	0.51
127	0.5
128	0.43
129	0.4
130	0.35
131	0.27
132	0.24
133	0.21
134	0.2
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.1
139	0.08
140	0.08
141	0.09
142	0.08
143	0.08
144	0.11
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.16
150	0.17
151	0.23
152	0.21
153	0.21
154	0.22
155	0.27
156	0.28
157	0.29
158	0.3
159	0.25
160	0.23
161	0.24
162	0.28
163	0.24
164	0.29
165	0.33
166	0.35
167	0.36
168	0.37
169	0.36
170	0.33
171	0.33
172	0.32
173	0.28
174	0.3
175	0.31
176	0.29
177	0.27
178	0.26
179	0.26
180	0.19
181	0.16
182	0.1
183	0.08
184	0.09
185	0.09
186	0.09
187	0.11
188	0.11
189	0.11
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.17
195	0.15
196	0.17
197	0.17
198	0.18
199	0.18
200	0.18
201	0.2
202	0.21
203	0.22
204	0.2
205	0.21
206	0.18
207	0.22
208	0.21
209	0.19
210	0.16
211	0.15
212	0.15
213	0.14
214	0.12
215	0.08
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.07
227	0.12
228	0.13
229	0.17
230	0.18
231	0.18
232	0.22
233	0.22
234	0.29
235	0.29
236	0.31
237	0.29
238	0.28
239	0.28
240	0.23
241	0.25
242	0.19
243	0.17
244	0.14
245	0.19
246	0.24
247	0.32
248	0.34
249	0.33
250	0.38
251	0.45
252	0.51
253	0.51
254	0.47
255	0.47
256	0.5
257	0.57
258	0.52
259	0.44
260	0.43
261	0.39
262	0.37
263	0.31
264	0.26
265	0.18
266	0.16
267	0.15
268	0.1
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.07
273	0.08
274	0.1
275	0.12
276	0.19
277	0.19
278	0.19
279	0.2
280	0.2
281	0.2
282	0.18
283	0.17
284	0.11
285	0.11
286	0.12
287	0.11
288	0.12
289	0.11
290	0.11
291	0.13
292	0.2
293	0.23
294	0.22
295	0.23
296	0.24
297	0.25
298	0.26
299	0.29
300	0.23
301	0.2
302	0.2
303	0.21
304	0.17
305	0.16
306	0.15
307	0.1
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.11
313	0.13
314	0.12
315	0.13
316	0.12
317	0.13
318	0.15
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.12
325	0.1
326	0.08
327	0.09
328	0.09
329	0.12
330	0.11
331	0.1
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.12
336	0.12
337	0.09
338	0.12
339	0.11
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.15
344	0.15
345	0.15
346	0.13
347	0.13
348	0.14
349	0.2
350	0.23
351	0.22
352	0.26
353	0.26
354	0.27
355	0.28
356	0.25
357	0.2
358	0.16
359	0.14
360	0.11
361	0.11
362	0.09
363	0.15
364	0.15
365	0.14
366	0.18
367	0.21
368	0.23
369	0.29
370	0.29
371	0.24
372	0.28
373	0.28
374	0.27
375	0.24
376	0.21
377	0.15
378	0.15
379	0.14
380	0.11
381	0.11
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.07
413	0.08
414	0.1
415	0.1
416	0.12
417	0.14
418	0.14
419	0.16
420	0.15
421	0.17
422	0.19
423	0.18
424	0.17
425	0.15
426	0.14
427	0.12
428	0.1
429	0.08
430	0.05
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.1
441	0.12
442	0.17
443	0.2
444	0.2
445	0.2
446	0.22
447	0.26
448	0.25
449	0.27
450	0.24
451	0.21
452	0.22
453	0.21
454	0.2
455	0.16
456	0.15
457	0.13
458	0.12
459	0.14
460	0.17
461	0.19
462	0.18
463	0.17
464	0.16
465	0.17
466	0.17
467	0.16
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.09
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.09
493	0.09
494	0.11
495	0.1
496	0.14
497	0.15
498	0.16
499	0.15
500	0.15
501	0.19
502	0.25
503	0.27
504	0.23
505	0.24
506	0.24
507	0.25
508	0.27
509	0.3
510	0.27
511	0.3
512	0.31
513	0.33
514	0.34
515	0.34
516	0.29
517	0.24
518	0.26
519	0.26
520	0.32
521	0.33
522	0.36
523	0.37
524	0.39
525	0.39
526	0.37
527	0.37
528	0.3
529	0.26
530	0.23
531	0.21
532	0.19
533	0.18
534	0.13
535	0.08
536	0.08
537	0.09
538	0.09
539	0.12
540	0.22
541	0.24
542	0.3
543	0.33
544	0.37
545	0.37
546	0.4
547	0.48
548	0.42
549	0.41
550	0.41
551	0.39
552	0.37
553	0.38
554	0.35
555	0.25
556	0.23
557	0.21
558	0.16
559	0.14
560	0.1
561	0.08
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.02
568	0.03
569	0.04
570	0.05
571	0.06
572	0.07
573	0.09
574	0.11
575	0.19
576	0.29
577	0.37
578	0.43
579	0.52
580	0.62
581	0.71
582	0.78
583	0.81
584	0.81
585	0.79
586	0.84
587	0.83
588	0.81
589	0.71
590	0.64
591	0.58
592	0.52
593	0.48
594	0.38
595	0.33
596	0.26
597	0.31
598	0.31
599	0.28
600	0.26
601	0.24
602	0.23
603	0.2
604	0.22
605	0.17
606	0.14
607	0.13
608	0.11
609	0.09
610	0.09
611	0.08
612	0.05
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.06
617	0.08
618	0.12
619	0.12
620	0.13
621	0.14
622	0.17
623	0.27
624	0.33
625	0.33
626	0.33
627	0.4
628	0.42
629	0.47
630	0.49
631	0.45
632	0.44
633	0.47
634	0.5
635	0.46
636	0.47
637	0.44
638	0.4
639	0.35
640	0.31
641	0.26
642	0.2
643	0.23
644	0.2
645	0.2
646	0.2
647	0.21
648	0.22
649	0.27
650	0.36
651	0.32
652	0.36
653	0.39
654	0.46
655	0.53
656	0.62
657	0.67
658	0.69
659	0.75
660	0.79
661	0.8
662	0.77
663	0.73
664	0.69
665	0.69
666	0.65
667	0.58
668	0.56
669	0.51
670	0.48
671	0.45
672	0.37
673	0.26
674	0.2
675	0.17
676	0.11
677	0.11
678	0.07
679	0.08
680	0.08
681	0.09
682	0.08
683	0.09
684	0.09
685	0.11
686	0.11
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.07
691	0.07
692	0.06
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.13
703	0.18
704	0.22
705	0.28
706	0.33
707	0.35
708	0.4
709	0.48
710	0.43
711	0.47
712	0.51
713	0.46
714	0.44
715	0.45
716	0.41
717	0.33
718	0.3
719	0.24
720	0.21
721	0.2
722	0.21
723	0.18
724	0.18
725	0.21
726	0.24
727	0.26
728	0.22
729	0.26
730	0.26
731	0.3
732	0.35
733	0.41
734	0.46
735	0.52
736	0.57
737	0.56
738	0.58
739	0.57
740	0.6
741	0.58
742	0.58
743	0.57
744	0.53
745	0.51
746	0.45
747	0.46
748	0.41
749	0.37
750	0.29
751	0.24
752	0.25
753	0.26

Q6CHP9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer