Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C9N2

Protein Details
Accession Q6C9N2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-412QKREMERDRSSRRLKRESARMAEBasic
416-439VDLDSLYSRKRRRRFDEDSRSGSPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 8.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016586  C:RSC-type complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:1900461  P:positive regulation of pseudohyphal growth by positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter  
KEGG yli:YALI0D09779g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MGEKPNRIGRANISYINHDHIFLPSFQPSYPSRQLHPLISSQNKVHSSIVHLPKVASPSSPETQQHSQAPLFITHIMSGLPQALASGFAARVREGGTTLYINTTPMLRSARHNTAVNYAEFEEDFDANDFEDDDDDDQSQRESRDGSEEAEGDEDGTKKEEQDKFAGLKAPLVSNEPKRAAPPVRPVMYPQEVLEELSQVKEPTLIPIRVAVENIDVFRVQDFFLWDADEKILTPEQFATLTCADLDVPIGYSAQMSAQIKKQLAEYTAAPALPKDVEVHVIVELAVTVDKIVYEDKFEWDLSGEYATPQEFARTVVQDLGLGQEFYPAITYQLYETLGKLQKAWLERSIPLDVDNRAAFGLEAGLRVDQDNLGESWVPRVEEMTPEEMQKREMERDRSSRRLKRESARMAEVPYVDLDSLYSRKRRRRFDEDSRSGSPMW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.46
3 0.48
4 0.41
5 0.34
6 0.3
7 0.27
8 0.27
9 0.23
10 0.24
11 0.21
12 0.22
13 0.2
14 0.24
15 0.24
16 0.3
17 0.38
18 0.38
19 0.38
20 0.45
21 0.49
22 0.49
23 0.5
24 0.47
25 0.47
26 0.5
27 0.51
28 0.45
29 0.49
30 0.47
31 0.46
32 0.41
33 0.33
34 0.34
35 0.4
36 0.45
37 0.41
38 0.4
39 0.38
40 0.39
41 0.41
42 0.35
43 0.26
44 0.23
45 0.26
46 0.28
47 0.33
48 0.32
49 0.36
50 0.4
51 0.44
52 0.44
53 0.42
54 0.39
55 0.37
56 0.36
57 0.3
58 0.27
59 0.23
60 0.2
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.1
92 0.13
93 0.15
94 0.15
95 0.2
96 0.27
97 0.33
98 0.37
99 0.39
100 0.37
101 0.41
102 0.42
103 0.37
104 0.32
105 0.26
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.14
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.24
150 0.27
151 0.26
152 0.28
153 0.32
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.2
158 0.17
159 0.19
160 0.22
161 0.21
162 0.26
163 0.25
164 0.25
165 0.25
166 0.3
167 0.3
168 0.3
169 0.35
170 0.37
171 0.38
172 0.37
173 0.39
174 0.39
175 0.39
176 0.34
177 0.26
178 0.21
179 0.19
180 0.19
181 0.17
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.1
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.16
195 0.18
196 0.17
197 0.17
198 0.13
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.14
246 0.18
247 0.18
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.19
252 0.19
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.1
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.11
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.07
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.07
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.11
324 0.18
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.22
329 0.24
330 0.27
331 0.3
332 0.27
333 0.27
334 0.28
335 0.32
336 0.32
337 0.28
338 0.27
339 0.27
340 0.23
341 0.23
342 0.21
343 0.18
344 0.16
345 0.15
346 0.13
347 0.1
348 0.11
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.15
368 0.14
369 0.17
370 0.2
371 0.22
372 0.21
373 0.24
374 0.27
375 0.26
376 0.27
377 0.27
378 0.28
379 0.32
380 0.39
381 0.44
382 0.49
383 0.58
384 0.65
385 0.7
386 0.77
387 0.76
388 0.78
389 0.8
390 0.81
391 0.8
392 0.82
393 0.82
394 0.79
395 0.78
396 0.71
397 0.65
398 0.6
399 0.5
400 0.41
401 0.32
402 0.26
403 0.19
404 0.16
405 0.13
406 0.14
407 0.18
408 0.23
409 0.3
410 0.37
411 0.47
412 0.57
413 0.67
414 0.72
415 0.78
416 0.82
417 0.85
418 0.88
419 0.87
420 0.86
421 0.8