Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CDK6

Protein Details
Accession Q6CDK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
458-487SMAWNNLRQKLNKKRRKERMATRLQECQKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-476LNKKRRKER
Subcellular Location(s) cyto 9, nucl 8, pero 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033599  TAF1B/Rrn7  
IPR021752  TF_Rrn7_Zf  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG yli:YALI0B23210g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11781  zf-RRN7  
Amino Acid Sequences MNWEKGPVCGIDNCPSDLWRSAAGRTFCRYGHQRQDEYEYDNQDEGDLGGGRKVTIGSVSAMKDGEKEEQRWFGSRVYALRAQIFQEVLRFYTHWAMQKFDLDTDFEEVVKELWSVLIKYTDFGRSSYDLEGGVHSEPCDTGTSTPLLLSQKMAIEIMYLALVQVGYPISFIKILGWIMSGELPYDDVGARFTSKEARLHMSGSRSWCAWKKPPSSQSFGRGVLACAKALAREGVIISQPKIIPIMHTVEVLMLPLGIIDRTICLAKGCDIDEYCDMSTSGGFSSFMETASFVITAARIAYYKSWQSYDEDIKSPYWKLWSELAEIYFQDPLYTDEVDIPAWTDERYNEFLDIYHRSLMMNIEREPIPVQWKRVNDMFPLHTPSEEPLVTPTDLATILNEQVVPLPGPAPKEIESFKTTHKELFLQGPPLYMAVLESAAKAHNMSMRLVLKAVRETESMAWNNLRQKLNKKRRKERMATRLQECQKLENEKKSFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.32
4 0.3
5 0.28
6 0.25
7 0.25
8 0.26
9 0.32
10 0.35
11 0.37
12 0.39
13 0.4
14 0.35
15 0.42
16 0.45
17 0.47
18 0.55
19 0.59
20 0.58
21 0.58
22 0.65
23 0.6
24 0.59
25 0.55
26 0.48
27 0.42
28 0.38
29 0.34
30 0.27
31 0.24
32 0.18
33 0.15
34 0.12
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.09
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.18
52 0.24
53 0.25
54 0.27
55 0.3
56 0.35
57 0.37
58 0.39
59 0.39
60 0.33
61 0.32
62 0.33
63 0.31
64 0.31
65 0.33
66 0.31
67 0.32
68 0.31
69 0.29
70 0.28
71 0.26
72 0.21
73 0.2
74 0.19
75 0.17
76 0.17
77 0.16
78 0.16
79 0.2
80 0.23
81 0.26
82 0.26
83 0.28
84 0.28
85 0.32
86 0.31
87 0.28
88 0.25
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.13
105 0.12
106 0.13
107 0.15
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.21
112 0.19
113 0.21
114 0.21
115 0.2
116 0.16
117 0.16
118 0.16
119 0.13
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.12
181 0.14
182 0.17
183 0.19
184 0.22
185 0.22
186 0.24
187 0.26
188 0.24
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.2
193 0.22
194 0.24
195 0.27
196 0.32
197 0.37
198 0.4
199 0.47
200 0.55
201 0.57
202 0.59
203 0.57
204 0.56
205 0.51
206 0.46
207 0.4
208 0.32
209 0.28
210 0.27
211 0.24
212 0.18
213 0.14
214 0.13
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.1
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.07
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.05
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.09
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.18
294 0.23
295 0.27
296 0.27
297 0.27
298 0.27
299 0.27
300 0.28
301 0.25
302 0.21
303 0.19
304 0.17
305 0.18
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.24
310 0.23
311 0.21
312 0.2
313 0.18
314 0.15
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.12
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.18
339 0.21
340 0.18
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.2
350 0.21
351 0.22
352 0.22
353 0.21
354 0.25
355 0.25
356 0.29
357 0.31
358 0.33
359 0.36
360 0.39
361 0.39
362 0.34
363 0.36
364 0.35
365 0.33
366 0.36
367 0.33
368 0.28
369 0.27
370 0.25
371 0.24
372 0.2
373 0.17
374 0.14
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.14
379 0.11
380 0.12
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.08
388 0.09
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.13
395 0.14
396 0.16
397 0.17
398 0.2
399 0.22
400 0.25
401 0.27
402 0.27
403 0.32
404 0.35
405 0.35
406 0.34
407 0.35
408 0.32
409 0.32
410 0.38
411 0.36
412 0.35
413 0.34
414 0.32
415 0.29
416 0.27
417 0.24
418 0.15
419 0.12
420 0.07
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.21
433 0.23
434 0.23
435 0.24
436 0.25
437 0.24
438 0.27
439 0.29
440 0.24
441 0.23
442 0.25
443 0.27
444 0.33
445 0.31
446 0.3
447 0.31
448 0.33
449 0.39
450 0.44
451 0.46
452 0.46
453 0.54
454 0.62
455 0.71
456 0.76
457 0.8
458 0.83
459 0.88
460 0.93
461 0.93
462 0.93
463 0.93
464 0.94
465 0.92
466 0.86
467 0.86
468 0.81
469 0.78
470 0.69
471 0.63
472 0.6
473 0.62
474 0.64
475 0.64