Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C067

Protein Details
Accession Q6C067    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-61SQDQEETKDQPNKPKRGKKRGATEVSKEDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-52KPKRGKKRG
417-466RDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDFKPPTGPRGRGGDRPV
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0035925  F:mRNA 3'-UTR AU-rich region binding  
GO:0070935  P:3'-UTR-mediated mRNA stabilization  
KEGG yli:YALI0F27401g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
CDD cd22439  KH-I_PCBP_rpt3  
Amino Acid Sequences MPPRRSGRNKKKDEDVTMASADTDVKQEVPSSQDQEETKDQPNKPKRGKKRGATEVSKEDQVKTEAGTDETADVKQETTETSNETQAPVQETAETTVESEQTADEASVVAQVEEKLERINDKNDKLSEKRVSDKVLDQTKITLRLLMSRHATDKVDKTVKKTVEDAGMTIEVVDTVNAPENVILLQGPCTGLDTCIKALLDLDTALAPPGMITRRLRLLFEDQVLSEIPQINIATNQNLFASRPIDIVTGVHVSVGISTLPQSTDRSVVVSGHANAVIKAVREFLKMILFIQMDGLKANGNNTDAANYEIDSSTAISAPYISKLVTGVYGHPDTFVRQKENEKYVGSNTYITRRRRVEIPDIDLRNVPKGPAASASTYTNNGNSNSHGYNNHGGHNYNNHREGAGYHNSGGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDGPRDFKPPTGPRGRGGDRPVRQDARGPEIREFSPREASGQTTQQINVRKDMIGAIIGKGGSSISEIRKKSGTNIRVIDSEDPSQLERSVSITGTADGVKIAVRLIHQKIEQEKHMYRRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.74
3 0.67
4 0.58
5 0.51
6 0.4
7 0.32
8 0.26
9 0.19
10 0.15
11 0.12
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.18
17 0.22
18 0.25
19 0.25
20 0.3
21 0.3
22 0.35
23 0.39
24 0.39
25 0.43
26 0.48
27 0.51
28 0.56
29 0.65
30 0.7
31 0.75
32 0.8
33 0.83
34 0.85
35 0.91
36 0.9
37 0.91
38 0.91
39 0.91
40 0.88
41 0.84
42 0.81
43 0.75
44 0.71
45 0.62
46 0.53
47 0.46
48 0.4
49 0.33
50 0.26
51 0.26
52 0.21
53 0.21
54 0.2
55 0.17
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.13
66 0.14
67 0.18
68 0.19
69 0.23
70 0.23
71 0.24
72 0.23
73 0.22
74 0.25
75 0.21
76 0.2
77 0.17
78 0.17
79 0.19
80 0.18
81 0.16
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.15
105 0.17
106 0.25
107 0.31
108 0.34
109 0.39
110 0.42
111 0.47
112 0.47
113 0.52
114 0.52
115 0.48
116 0.52
117 0.5
118 0.49
119 0.46
120 0.48
121 0.48
122 0.47
123 0.44
124 0.38
125 0.39
126 0.39
127 0.4
128 0.35
129 0.29
130 0.22
131 0.27
132 0.28
133 0.28
134 0.28
135 0.26
136 0.28
137 0.28
138 0.29
139 0.28
140 0.3
141 0.34
142 0.39
143 0.38
144 0.41
145 0.46
146 0.47
147 0.45
148 0.43
149 0.38
150 0.35
151 0.34
152 0.29
153 0.23
154 0.2
155 0.18
156 0.16
157 0.12
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.04
162 0.04
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.07
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.2
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.26
206 0.25
207 0.26
208 0.24
209 0.19
210 0.19
211 0.19
212 0.16
213 0.12
214 0.11
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.11
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.17
322 0.19
323 0.19
324 0.21
325 0.27
326 0.33
327 0.36
328 0.38
329 0.34
330 0.33
331 0.32
332 0.32
333 0.27
334 0.24
335 0.21
336 0.26
337 0.32
338 0.34
339 0.39
340 0.38
341 0.4
342 0.42
343 0.46
344 0.47
345 0.46
346 0.49
347 0.5
348 0.49
349 0.47
350 0.44
351 0.4
352 0.33
353 0.28
354 0.22
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.14
359 0.16
360 0.14
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.19
365 0.19
366 0.18
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.16
371 0.19
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.21
376 0.27
377 0.27
378 0.29
379 0.26
380 0.26
381 0.26
382 0.34
383 0.37
384 0.35
385 0.36
386 0.33
387 0.31
388 0.31
389 0.31
390 0.28
391 0.27
392 0.23
393 0.21
394 0.23
395 0.24
396 0.24
397 0.23
398 0.2
399 0.18
400 0.19
401 0.2
402 0.23
403 0.28
404 0.32
405 0.33
406 0.37
407 0.4
408 0.42
409 0.42
410 0.45
411 0.45
412 0.45
413 0.45
414 0.45
415 0.45
416 0.45
417 0.45
418 0.45
419 0.45
420 0.45
421 0.45
422 0.45
423 0.45
424 0.45
425 0.45
426 0.45
427 0.45
428 0.45
429 0.45
430 0.45
431 0.45
432 0.47
433 0.47
434 0.46
435 0.43
436 0.47
437 0.47
438 0.44
439 0.48
440 0.48
441 0.55
442 0.58
443 0.57
444 0.53
445 0.6
446 0.6
447 0.56
448 0.58
449 0.58
450 0.54
451 0.58
452 0.62
453 0.57
454 0.54
455 0.54
456 0.51
457 0.49
458 0.51
459 0.46
460 0.42
461 0.43
462 0.43
463 0.42
464 0.42
465 0.37
466 0.38
467 0.35
468 0.34
469 0.31
470 0.35
471 0.33
472 0.34
473 0.33
474 0.28
475 0.29
476 0.31
477 0.38
478 0.36
479 0.36
480 0.33
481 0.3
482 0.28
483 0.28
484 0.24
485 0.19
486 0.18
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.12
492 0.11
493 0.08
494 0.09
495 0.13
496 0.18
497 0.26
498 0.28
499 0.31
500 0.35
501 0.36
502 0.42
503 0.48
504 0.46
505 0.47
506 0.5
507 0.5
508 0.48
509 0.51
510 0.46
511 0.4
512 0.37
513 0.3
514 0.28
515 0.26
516 0.26
517 0.24
518 0.2
519 0.17
520 0.16
521 0.17
522 0.15
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.15
527 0.15
528 0.13
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.11
536 0.19
537 0.23
538 0.29
539 0.3
540 0.37
541 0.45
542 0.49
543 0.53
544 0.54
545 0.57