Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CEW5

Protein Details
Accession Q6CEW5    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-105WAKTPLRETRRRRRSLDRGSAKRRSRBasic
119-143LSPERRRSRSPERRRSRSPERRQSQBasic
147-167GGRSRSPERGRSRRNERRDFSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-164RETRRRRRSLDRGSAKRRSRMSNGNSDRSRSRSLSPERRRSRSPERRRSRSPERRQSQSPDGGRSRSPERGRSRRNERR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, mito_nucl 12.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG yli:YALI0B12364g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MARRTLYVTGFAPEISARELAYEFEEIGNIFRCDVISPARSGRQHGYAFVEFENARDAEYAYRDMHNLRIASGDILHIEWAKTPLRETRRRRRSLDRGSAKRRSRMSNGNSDRSRSRSLSPERRRSRSPERRRSRSPERRQSQSPDGGRSRSPERGRSRRNERRDFSESPERKPGSNVCDNEDGERTESRFDQTSSQHDPSQHDSTHTPNESDATMVGSGHNSVDGKDSAEAETAPYNCGDEPQLEAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.12
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.12
13 0.1
14 0.12
15 0.14
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.13
22 0.16
23 0.15
24 0.18
25 0.21
26 0.28
27 0.29
28 0.32
29 0.34
30 0.36
31 0.35
32 0.35
33 0.37
34 0.32
35 0.33
36 0.29
37 0.29
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.11
46 0.14
47 0.16
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.21
54 0.19
55 0.16
56 0.16
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.11
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.19
72 0.28
73 0.38
74 0.46
75 0.55
76 0.64
77 0.71
78 0.75
79 0.78
80 0.8
81 0.81
82 0.82
83 0.81
84 0.8
85 0.81
86 0.85
87 0.79
88 0.75
89 0.69
90 0.63
91 0.59
92 0.58
93 0.55
94 0.56
95 0.57
96 0.59
97 0.55
98 0.53
99 0.5
100 0.44
101 0.44
102 0.35
103 0.32
104 0.31
105 0.39
106 0.48
107 0.55
108 0.61
109 0.64
110 0.67
111 0.67
112 0.67
113 0.69
114 0.69
115 0.71
116 0.72
117 0.75
118 0.78
119 0.82
120 0.83
121 0.83
122 0.83
123 0.83
124 0.83
125 0.79
126 0.77
127 0.74
128 0.72
129 0.67
130 0.64
131 0.56
132 0.52
133 0.49
134 0.45
135 0.41
136 0.38
137 0.35
138 0.36
139 0.36
140 0.39
141 0.46
142 0.54
143 0.61
144 0.67
145 0.74
146 0.75
147 0.82
148 0.83
149 0.77
150 0.75
151 0.75
152 0.68
153 0.64
154 0.66
155 0.58
156 0.53
157 0.58
158 0.51
159 0.44
160 0.45
161 0.42
162 0.38
163 0.44
164 0.4
165 0.36
166 0.4
167 0.4
168 0.39
169 0.36
170 0.3
171 0.24
172 0.24
173 0.21
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.21
180 0.23
181 0.29
182 0.34
183 0.36
184 0.36
185 0.37
186 0.4
187 0.42
188 0.44
189 0.38
190 0.34
191 0.33
192 0.35
193 0.41
194 0.38
195 0.32
196 0.27
197 0.28
198 0.25
199 0.24
200 0.19
201 0.12
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.1
207 0.09
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.13
212 0.13
213 0.14
214 0.15
215 0.16
216 0.15
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.17
227 0.16
228 0.12