Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CAS9

Protein Details
Accession Q6CAS9    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-77YSDVPLPKMKTRRSRSPRKAHATDILHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-69TRRSRSPR
343-349KRKREPK
364-365RK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
KEGG yli:YALI0D00253g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
CDD cd18727  PIN_Swt1-like  
Amino Acid Sequences MNQYWGSSPPKKPVTASTRPHSQPDYSDVPLPKMKLKIPRTTSRSSSPQEDYSDVPLPKMKTRRSRSPRKAHATDILGLEEISSITKATQEIRNQLDLDLEGHTGEPPALRFENRLLLIIDTNFAISHLSLLKELAALHEQYGHILIVPWAVIKELDGLKNSGKMEYRYQTGAVSTGDIDLDLSLGQRARMANAWIFEQLGARSQALFGQKVSERLGESTRGDDAILDCCRYFQHKADAFIVILSDDKNLCMKALIHEIMTVSYQERMTAETIARITADEYAKNMGEMMDTDTGAASHRSHVHLAPPIPPPQPTPPPRHVSPPSRPPPKHANVSTYIEVEPSKRKREPKTPSSAASDDRQQKSRKVAPGGLASRHARKLSTSGNSPPDTKSSTPTPQRPPDAPPRKMAPLPSRHNKGAVPKPAAVSYRPATPQPQSPPKPAPGPRKFEYIDDPKIESPDQLLPELEKVVFKVLRMAVAFQAPNHNIHRATSIGSISDIMEQLRPSELRQFQFPNLRSIQPGSNAPAPERLAFLRGLMHLSADMEKSFTGEYPKNYVDAVGWVLSLVN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.64
4 0.62
5 0.66
6 0.66
7 0.69
8 0.63
9 0.57
10 0.51
11 0.49
12 0.48
13 0.41
14 0.45
15 0.4
16 0.41
17 0.42
18 0.41
19 0.4
20 0.39
21 0.42
22 0.45
23 0.51
24 0.55
25 0.6
26 0.67
27 0.69
28 0.71
29 0.71
30 0.69
31 0.7
32 0.65
33 0.64
34 0.59
35 0.57
36 0.53
37 0.5
38 0.45
39 0.41
40 0.44
41 0.37
42 0.33
43 0.33
44 0.33
45 0.38
46 0.44
47 0.48
48 0.51
49 0.6
50 0.69
51 0.75
52 0.83
53 0.86
54 0.89
55 0.91
56 0.9
57 0.87
58 0.81
59 0.78
60 0.71
61 0.64
62 0.54
63 0.44
64 0.34
65 0.29
66 0.23
67 0.16
68 0.11
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.09
75 0.13
76 0.19
77 0.23
78 0.3
79 0.34
80 0.37
81 0.36
82 0.35
83 0.33
84 0.27
85 0.23
86 0.17
87 0.14
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.12
96 0.14
97 0.14
98 0.16
99 0.18
100 0.25
101 0.24
102 0.25
103 0.21
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.07
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.09
142 0.11
143 0.13
144 0.14
145 0.16
146 0.17
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.26
153 0.27
154 0.29
155 0.26
156 0.27
157 0.24
158 0.22
159 0.21
160 0.15
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.11
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.1
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.13
194 0.14
195 0.11
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.19
200 0.17
201 0.15
202 0.17
203 0.18
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.15
219 0.17
220 0.15
221 0.24
222 0.27
223 0.3
224 0.31
225 0.31
226 0.28
227 0.25
228 0.22
229 0.12
230 0.09
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.13
242 0.13
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.1
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.12
289 0.15
290 0.18
291 0.18
292 0.2
293 0.22
294 0.24
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.26
299 0.34
300 0.35
301 0.39
302 0.42
303 0.47
304 0.48
305 0.53
306 0.54
307 0.53
308 0.56
309 0.59
310 0.62
311 0.66
312 0.65
313 0.63
314 0.66
315 0.63
316 0.64
317 0.56
318 0.51
319 0.46
320 0.51
321 0.46
322 0.38
323 0.32
324 0.25
325 0.23
326 0.21
327 0.24
328 0.24
329 0.3
330 0.33
331 0.41
332 0.47
333 0.57
334 0.64
335 0.65
336 0.7
337 0.67
338 0.65
339 0.64
340 0.59
341 0.51
342 0.44
343 0.43
344 0.42
345 0.41
346 0.44
347 0.4
348 0.42
349 0.47
350 0.52
351 0.5
352 0.46
353 0.45
354 0.43
355 0.49
356 0.48
357 0.42
358 0.4
359 0.36
360 0.36
361 0.36
362 0.33
363 0.25
364 0.23
365 0.26
366 0.28
367 0.29
368 0.29
369 0.32
370 0.37
371 0.39
372 0.39
373 0.36
374 0.33
375 0.33
376 0.3
377 0.28
378 0.28
379 0.35
380 0.41
381 0.48
382 0.53
383 0.56
384 0.6
385 0.58
386 0.59
387 0.62
388 0.64
389 0.59
390 0.55
391 0.53
392 0.53
393 0.52
394 0.53
395 0.51
396 0.5
397 0.56
398 0.61
399 0.62
400 0.59
401 0.59
402 0.55
403 0.56
404 0.55
405 0.54
406 0.49
407 0.45
408 0.45
409 0.46
410 0.45
411 0.37
412 0.34
413 0.27
414 0.28
415 0.28
416 0.28
417 0.29
418 0.3
419 0.36
420 0.39
421 0.48
422 0.47
423 0.52
424 0.56
425 0.57
426 0.63
427 0.64
428 0.66
429 0.64
430 0.67
431 0.63
432 0.65
433 0.61
434 0.55
435 0.56
436 0.53
437 0.5
438 0.45
439 0.46
440 0.4
441 0.42
442 0.39
443 0.31
444 0.26
445 0.24
446 0.23
447 0.2
448 0.2
449 0.18
450 0.19
451 0.2
452 0.17
453 0.13
454 0.12
455 0.17
456 0.17
457 0.16
458 0.21
459 0.2
460 0.23
461 0.23
462 0.24
463 0.2
464 0.24
465 0.24
466 0.19
467 0.26
468 0.24
469 0.28
470 0.29
471 0.31
472 0.27
473 0.28
474 0.29
475 0.23
476 0.24
477 0.22
478 0.2
479 0.17
480 0.16
481 0.16
482 0.14
483 0.15
484 0.13
485 0.11
486 0.13
487 0.12
488 0.13
489 0.16
490 0.16
491 0.16
492 0.24
493 0.3
494 0.3
495 0.36
496 0.4
497 0.43
498 0.52
499 0.52
500 0.5
501 0.47
502 0.47
503 0.44
504 0.43
505 0.4
506 0.35
507 0.37
508 0.34
509 0.36
510 0.35
511 0.34
512 0.36
513 0.34
514 0.31
515 0.31
516 0.26
517 0.23
518 0.22
519 0.21
520 0.19
521 0.17
522 0.19
523 0.16
524 0.16
525 0.14
526 0.15
527 0.17
528 0.15
529 0.14
530 0.13
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.13
535 0.18
536 0.22
537 0.25
538 0.31
539 0.32
540 0.32
541 0.31
542 0.3
543 0.24
544 0.22
545 0.21
546 0.15
547 0.13