Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074SNK2

Protein Details
Accession A0A074SNK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
516-550AQKTMNRPRNESKEDKKARKEAVRNQKQIRRAEKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
523-553PRNESKEDKKARKEAVRNQKQIRRAEKSIMK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MAPKSIWRQPGAQHFQLVHRSQRDPLIHDPEASTHVLKGFERENLVRKGKTRADLEQTLPDAKSERANVGEAAEYGVYFDDTDYDYMQHLRPVGMTADAVLLEAPNKDKGKGKNKEVVTLPGESLPSETELSLAAARDAMQSIPSELAGFNPNLDQHLRQTLEALEDDAFVGNNDVSGDHELEDLFGKLLGGGERGDGEKGEWNEWEFREEGVDSHATATMPNRPQDVNDDLAFRVAAFKQAQALDEISGEDDPEYSEGGDTIGRLPSLPPMSVVGGKRRRKGTGSDASGFSMSSSSMFRNEGLRGLDEQFDRMELLYNSDEDIRDSDRDHETNLSKDLTEDDSDEAPELLDTREDLEGMMDEFLEKYELVGNKLRPVLGGITPVEKLAALRHALTDNVDGDGGMLARTIIRKGKIPESAQNDTILEPYDIDAGYEQDRWDCETILSTYSNLENHPRLILARDRRPVPRIQLDPRTGLPSVTGDGDQHDVSSIHRSIPPGTAARNEVLGETAAEPAQKTMNRPRNESKEDKKARKEAVRNQKQIRRAEKSIMKEAFATERKAQQRKMGMGAPIGNIRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.57
4 0.54
5 0.52
6 0.49
7 0.49
8 0.47
9 0.53
10 0.51
11 0.48
12 0.52
13 0.52
14 0.48
15 0.46
16 0.44
17 0.38
18 0.38
19 0.35
20 0.27
21 0.19
22 0.2
23 0.22
24 0.21
25 0.23
26 0.22
27 0.23
28 0.28
29 0.31
30 0.36
31 0.42
32 0.48
33 0.48
34 0.48
35 0.54
36 0.54
37 0.57
38 0.55
39 0.54
40 0.56
41 0.57
42 0.57
43 0.55
44 0.51
45 0.47
46 0.42
47 0.35
48 0.3
49 0.26
50 0.27
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.22
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.08
91 0.09
92 0.15
93 0.16
94 0.18
95 0.25
96 0.34
97 0.44
98 0.52
99 0.57
100 0.59
101 0.6
102 0.64
103 0.6
104 0.57
105 0.49
106 0.42
107 0.36
108 0.29
109 0.28
110 0.21
111 0.19
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.09
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.2
145 0.21
146 0.2
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.17
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.06
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.11
187 0.13
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.2
211 0.19
212 0.2
213 0.24
214 0.26
215 0.22
216 0.19
217 0.2
218 0.18
219 0.18
220 0.17
221 0.12
222 0.11
223 0.08
224 0.11
225 0.1
226 0.1
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.14
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.15
262 0.21
263 0.29
264 0.34
265 0.39
266 0.4
267 0.42
268 0.4
269 0.44
270 0.44
271 0.43
272 0.44
273 0.41
274 0.39
275 0.37
276 0.35
277 0.3
278 0.21
279 0.12
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.14
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.13
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.19
319 0.19
320 0.2
321 0.21
322 0.18
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.09
356 0.1
357 0.12
358 0.17
359 0.18
360 0.2
361 0.22
362 0.21
363 0.17
364 0.18
365 0.17
366 0.14
367 0.16
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.14
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.08
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.14
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.06
396 0.08
397 0.11
398 0.13
399 0.18
400 0.22
401 0.28
402 0.34
403 0.37
404 0.42
405 0.46
406 0.49
407 0.45
408 0.42
409 0.37
410 0.31
411 0.28
412 0.22
413 0.14
414 0.1
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.1
422 0.11
423 0.1
424 0.1
425 0.11
426 0.14
427 0.15
428 0.14
429 0.12
430 0.14
431 0.15
432 0.15
433 0.16
434 0.13
435 0.13
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.19
440 0.18
441 0.19
442 0.19
443 0.18
444 0.17
445 0.2
446 0.27
447 0.3
448 0.37
449 0.42
450 0.46
451 0.5
452 0.54
453 0.55
454 0.55
455 0.55
456 0.55
457 0.57
458 0.61
459 0.6
460 0.6
461 0.56
462 0.52
463 0.44
464 0.36
465 0.29
466 0.21
467 0.19
468 0.17
469 0.15
470 0.12
471 0.13
472 0.16
473 0.14
474 0.13
475 0.12
476 0.11
477 0.12
478 0.17
479 0.17
480 0.17
481 0.19
482 0.2
483 0.21
484 0.24
485 0.27
486 0.24
487 0.26
488 0.27
489 0.27
490 0.26
491 0.26
492 0.23
493 0.19
494 0.17
495 0.15
496 0.13
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.16
504 0.17
505 0.22
506 0.32
507 0.4
508 0.44
509 0.52
510 0.6
511 0.65
512 0.71
513 0.75
514 0.73
515 0.75
516 0.82
517 0.84
518 0.83
519 0.82
520 0.83
521 0.83
522 0.84
523 0.84
524 0.84
525 0.86
526 0.86
527 0.87
528 0.85
529 0.83
530 0.82
531 0.82
532 0.79
533 0.73
534 0.73
535 0.71
536 0.71
537 0.73
538 0.65
539 0.57
540 0.49
541 0.47
542 0.46
543 0.43
544 0.41
545 0.36
546 0.43
547 0.51
548 0.58
549 0.59
550 0.58
551 0.63
552 0.62
553 0.62
554 0.59
555 0.52
556 0.49
557 0.48
558 0.43
559 0.42