Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C2Q8

Protein Details
Accession Q6C2Q8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-467DKIKLAKTRRKYKLQCINNQTRAHydrophilic
622-644QHQPPPPPPQQQQQQQHQHQPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 10.5, cyto_pero 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0070822  C:Sin3-type complex  
GO:0042826  F:histone deacetylase binding  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG yli:YALI0F05896g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MTANDDDMVTSPLSELDSEAMLDLQQHDEDEAKELKDDVAEDHDTGTNGDTHTPTDKKTRSSPSPSTGATATSATATATAPPTATDTQSAGDKGSVTHPEHADSGIATVASIVSTDDMPLPTSNGRKASLLNPADLSDDSSELSELEDSEAETERLYLNDLVDEEEESFKRRRESSSEDHIRQMKRERDEEDDRDIKRAKVNGQTDENDDIGEEDTTARMDVDTTAKAEGEGGDVGPDTGLITASAIASALEEVPPPLPVPVEDIKPEVNHISEKEGEAVDESKEAEAKEGLKESETADVDNKDANETKDMPTPINQTEPSDNEHEEDKEEEVTKEDKDKEENEDEDEDEDEDEDEEKEVEDEGDEEGEGDDNDKEDSPADADKVDMRPAAMTSLAEIEVDFAKLRDFMFKEKLAAFEVEMGLCVKGTHPELHAVYEQISKMRDDKIKLAKTRRKYKLQCINNQTRASRVQIHQQFLKDQGDARSGLLLKTTEEWYRVNRERRAMDLMVPDYGYTIPESKSEQIHQRNAQVNEISLLSGISKYVGFPAAPVISQATEDETNEDLTALGLQRPPVPHAAFPVPPGIMQPMGVQPAPLQQVPQQQPPPPQTAQQQVHQQTPQQQHQPPPPPPQQQQQQQHQHQPTPPPMGQHRLNGHEQQHMPLPLGAPLMMQHPMYHQGPPIYGGYQYPAVPYYQGGNLLPPPQTMYGHPQMYGQVLPPPYMYQKREEEHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.14
17 0.18
18 0.19
19 0.17
20 0.18
21 0.18
22 0.18
23 0.17
24 0.17
25 0.14
26 0.17
27 0.19
28 0.18
29 0.19
30 0.2
31 0.2
32 0.19
33 0.19
34 0.15
35 0.14
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.23
40 0.24
41 0.26
42 0.34
43 0.38
44 0.41
45 0.49
46 0.56
47 0.58
48 0.65
49 0.69
50 0.65
51 0.67
52 0.62
53 0.56
54 0.48
55 0.4
56 0.32
57 0.25
58 0.2
59 0.14
60 0.14
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.2
76 0.2
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.18
82 0.23
83 0.23
84 0.28
85 0.28
86 0.29
87 0.3
88 0.29
89 0.24
90 0.18
91 0.16
92 0.11
93 0.09
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.05
102 0.06
103 0.08
104 0.08
105 0.1
106 0.1
107 0.13
108 0.16
109 0.2
110 0.23
111 0.24
112 0.25
113 0.25
114 0.28
115 0.29
116 0.35
117 0.32
118 0.3
119 0.28
120 0.27
121 0.28
122 0.25
123 0.24
124 0.15
125 0.14
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.18
156 0.19
157 0.23
158 0.25
159 0.28
160 0.32
161 0.4
162 0.44
163 0.52
164 0.59
165 0.56
166 0.6
167 0.63
168 0.58
169 0.55
170 0.57
171 0.53
172 0.5
173 0.52
174 0.49
175 0.5
176 0.56
177 0.55
178 0.54
179 0.53
180 0.48
181 0.49
182 0.48
183 0.41
184 0.38
185 0.38
186 0.36
187 0.38
188 0.42
189 0.42
190 0.45
191 0.45
192 0.44
193 0.42
194 0.37
195 0.28
196 0.23
197 0.18
198 0.13
199 0.11
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.1
248 0.12
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.15
283 0.14
284 0.13
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.11
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.2
297 0.21
298 0.19
299 0.2
300 0.23
301 0.21
302 0.23
303 0.21
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.17
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.18
326 0.19
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.22
331 0.21
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.12
336 0.09
337 0.08
338 0.06
339 0.05
340 0.06
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.1
394 0.11
395 0.14
396 0.18
397 0.19
398 0.21
399 0.21
400 0.22
401 0.19
402 0.18
403 0.14
404 0.12
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.04
413 0.06
414 0.08
415 0.09
416 0.1
417 0.13
418 0.14
419 0.16
420 0.16
421 0.15
422 0.14
423 0.15
424 0.15
425 0.13
426 0.13
427 0.12
428 0.13
429 0.19
430 0.21
431 0.21
432 0.28
433 0.36
434 0.42
435 0.48
436 0.57
437 0.59
438 0.65
439 0.73
440 0.74
441 0.75
442 0.75
443 0.79
444 0.79
445 0.8
446 0.8
447 0.79
448 0.81
449 0.78
450 0.75
451 0.65
452 0.58
453 0.52
454 0.46
455 0.42
456 0.34
457 0.35
458 0.37
459 0.4
460 0.4
461 0.39
462 0.37
463 0.35
464 0.35
465 0.26
466 0.23
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.18
471 0.17
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.13
476 0.11
477 0.13
478 0.15
479 0.13
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.27
484 0.34
485 0.39
486 0.41
487 0.46
488 0.46
489 0.48
490 0.51
491 0.43
492 0.38
493 0.35
494 0.31
495 0.26
496 0.24
497 0.2
498 0.15
499 0.14
500 0.11
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.1
505 0.13
506 0.15
507 0.18
508 0.21
509 0.29
510 0.34
511 0.41
512 0.43
513 0.48
514 0.53
515 0.52
516 0.51
517 0.43
518 0.36
519 0.3
520 0.27
521 0.19
522 0.12
523 0.1
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.05
528 0.05
529 0.05
530 0.07
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.11
545 0.13
546 0.13
547 0.13
548 0.12
549 0.12
550 0.09
551 0.08
552 0.09
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.11
557 0.14
558 0.15
559 0.17
560 0.22
561 0.23
562 0.22
563 0.25
564 0.29
565 0.26
566 0.26
567 0.27
568 0.21
569 0.2
570 0.2
571 0.17
572 0.13
573 0.13
574 0.13
575 0.12
576 0.15
577 0.15
578 0.14
579 0.12
580 0.17
581 0.19
582 0.18
583 0.17
584 0.19
585 0.29
586 0.33
587 0.41
588 0.41
589 0.43
590 0.5
591 0.53
592 0.55
593 0.47
594 0.48
595 0.46
596 0.51
597 0.5
598 0.48
599 0.54
600 0.51
601 0.55
602 0.52
603 0.5
604 0.49
605 0.53
606 0.55
607 0.54
608 0.56
609 0.57
610 0.65
611 0.7
612 0.68
613 0.69
614 0.71
615 0.71
616 0.72
617 0.74
618 0.74
619 0.74
620 0.77
621 0.79
622 0.8
623 0.79
624 0.84
625 0.81
626 0.77
627 0.73
628 0.71
629 0.67
630 0.64
631 0.58
632 0.54
633 0.53
634 0.54
635 0.53
636 0.53
637 0.52
638 0.49
639 0.53
640 0.54
641 0.52
642 0.52
643 0.49
644 0.44
645 0.45
646 0.4
647 0.36
648 0.31
649 0.28
650 0.22
651 0.21
652 0.18
653 0.12
654 0.12
655 0.12
656 0.13
657 0.13
658 0.11
659 0.13
660 0.19
661 0.2
662 0.21
663 0.22
664 0.22
665 0.23
666 0.25
667 0.25
668 0.2
669 0.19
670 0.18
671 0.18
672 0.19
673 0.18
674 0.17
675 0.16
676 0.16
677 0.16
678 0.16
679 0.16
680 0.15
681 0.18
682 0.16
683 0.19
684 0.21
685 0.24
686 0.24
687 0.22
688 0.23
689 0.23
690 0.24
691 0.24
692 0.3
693 0.34
694 0.35
695 0.34
696 0.32
697 0.32
698 0.32
699 0.3
700 0.23
701 0.21
702 0.21
703 0.21
704 0.21
705 0.23
706 0.29
707 0.36
708 0.38
709 0.39
710 0.46